More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmz1t_4030 on replicon NC_011662
Organism: Thauera sp. MZ1T



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008781  Pnap_2108  major facilitator superfamily transporter  70.18 
 
 
454 aa  667    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0152433  normal  0.3868 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4030  DNA-cytosine methyltransferase  100 
 
 
455 aa  897    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5312  major facilitator superfamily MFS_1  68.94 
 
 
458 aa  653    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.104662  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4515  major facilitator transporter  66.37 
 
 
454 aa  608  1e-173  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1368  major facilitator superfamily MFS_1  67.51 
 
 
439 aa  593  1e-168  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.00531865  normal  0.175653 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1432  major facilitator superfamily MFS_1  67.28 
 
 
439 aa  589  1e-167  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.528546  normal  0.24074 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3938  major facilitator transporter  70.87 
 
 
456 aa  573  1.0000000000000001e-162  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.718892  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1353  major facilitator transporter  64.59 
 
 
448 aa  559  1e-158  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.418078 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1099  major facilitator superfamily aromatic acid/H(+) symporter  60.68 
 
 
461 aa  526  1e-148  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0863734  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3658  aromatic compound MFS transporter, putative  56.91 
 
 
450 aa  498  1e-140  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.691847  normal  0.164035 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5941  hypothetical protein  58.66 
 
 
456 aa  499  1e-140  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.00787806  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6028  major facilitator transporter  54.32 
 
 
452 aa  501  1e-140  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.672209  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2072  major facilitator transporter  57.11 
 
 
450 aa  499  1e-140  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1618  major facilitator transporter  61.56 
 
 
458 aa  496  1e-139  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5784  major facilitator transporter  54.55 
 
 
452 aa  496  1e-139  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6046  major facilitator transporter  58.7 
 
 
446 aa  485  1e-136  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7161  major facilitator transporter  57.74 
 
 
456 aa  484  1e-135  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2637  major facilitator superfamily MFS_1  55.16 
 
 
455 aa  459  9.999999999999999e-129  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08630  benzoate transporter  57.14 
 
 
443 aa  455  1e-127  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.866353  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3587  major facilitator transporter  54.33 
 
 
445 aa  440  9.999999999999999e-123  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.472801 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0647  major facilitator superfamily MFS_1  54.63 
 
 
451 aa  441  9.999999999999999e-123  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1257  major facilitator transporter  52.11 
 
 
454 aa  437  1e-121  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.281321  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3165  major facilitator transporter  53.6 
 
 
442 aa  428  1e-119  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.660067 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2706  major facilitator transporter  55.37 
 
 
440 aa  431  1e-119  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.728097  normal  0.300526 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2684  major facilitator transporter  53.83 
 
 
442 aa  427  1e-118  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2550  major facilitator transporter  53.6 
 
 
442 aa  428  1e-118  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2964  hypothetical protein  53.63 
 
 
446 aa  423  1e-117  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.83907  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1181  major facilitator transporter  48.94 
 
 
443 aa  365  1e-100  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.383013  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2316  major facilitator superfamily MFS_1  44.47 
 
 
446 aa  362  1e-98  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1895  major facilitator transporter  44.25 
 
 
451 aa  358  9.999999999999999e-98  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.004098  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64750  putative MFS transporter  45.88 
 
 
446 aa  355  1e-96  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5623  MFS family transporter  45.81 
 
 
446 aa  352  7e-96  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3052  benzoate MFS transporter  38.96 
 
 
452 aa  340  2.9999999999999998e-92  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2281  major facilitator superfamily MFS_1  38.72 
 
 
450 aa  337  1.9999999999999998e-91  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1856  major facilitator superfamily MFS_1  35.81 
 
 
435 aa  293  4e-78  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0464  benzoate transport protein, putative  39.46 
 
 
433 aa  285  1.0000000000000001e-75  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0460  putative benzoate transport protein  39.46 
 
 
433 aa  285  2.0000000000000002e-75  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0398  putative benzoate transport protein  38.73 
 
 
433 aa  283  5.000000000000001e-75  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0349  benzoate transport protein  38.73 
 
 
436 aa  283  6.000000000000001e-75  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0344  major facilitator transporter  39.71 
 
 
433 aa  283  6.000000000000001e-75  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0364  benzoate transport protein  38.73 
 
 
433 aa  282  1e-74  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0412  putative benzoate transport protein  39.71 
 
 
433 aa  281  1e-74  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0335  sugar transporter; benzoate transport protein  38.26 
 
 
436 aa  281  2e-74  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4906  putative benzoate transport protein  39.22 
 
 
433 aa  279  9e-74  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0340  major facilitator transporter  38.16 
 
 
436 aa  262  8.999999999999999e-69  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0788  major facilitator transporter  37.74 
 
 
453 aa  261  2e-68  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0700  major facilitator transporter  37.97 
 
 
453 aa  259  5.0000000000000005e-68  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0819  major facilitator transporter  37.5 
 
 
452 aa  259  9e-68  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.138145  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0336  major facilitator transporter  37.5 
 
 
452 aa  259  9e-68  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0717  major facilitator transporter  37.88 
 
 
453 aa  258  1e-67  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.231958  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5722  major facilitator superfamily MFS_1  40.15 
 
 
433 aa  248  1e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.731406  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7483  major facilitator transporter  38.46 
 
 
428 aa  248  2e-64  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7272  major facilitator transporter  36.3 
 
 
437 aa  246  4.9999999999999997e-64  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3912  major facilitator transporter  37.26 
 
 
453 aa  245  9.999999999999999e-64  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1823  major facilitator transporter  35.29 
 
 
442 aa  244  3e-63  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.112408  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1093  4-hydroxybenzoate transporter  33.7 
 
 
454 aa  238  2e-61  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.818104 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2564  major facilitator transporter  35.75 
 
 
450 aa  238  2e-61  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0741  major facilitator transporter  33.18 
 
 
438 aa  237  3e-61  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.0470116 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3229  4-hydroxybenzoate transporter  34.34 
 
 
451 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3214  4-hydroxybenzoate transporter  34.34 
 
 
451 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4077  4-hydroxybenzoate transporter  33.1 
 
 
475 aa  233  5e-60  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0892005  normal  0.387821 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0855  putative 4-hydroxyphenylacetate transporter  34.34 
 
 
451 aa  233  5e-60  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1922  4-hydroxybenzoate transporter  34.34 
 
 
451 aa  233  5e-60  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2057  4-hydroxyphenylacetate transporter, putative  34.34 
 
 
451 aa  233  5e-60  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2687  putative 4-hydroxyphenylacetate transporter  34.34 
 
 
451 aa  233  5e-60  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3175  4-hydroxybenzoate transporter  34.34 
 
 
451 aa  232  9e-60  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.902434  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3708  major facilitator superfamily transporter  34.56 
 
 
441 aa  232  1e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0245193 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0726  4-hydroxybenzoate transporter  35.63 
 
 
455 aa  229  9e-59  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0913  general substrate transporter  35.7 
 
 
465 aa  227  4e-58  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2097  major facilitator transporter  35.9 
 
 
459 aa  227  4e-58  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.201063 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6376  major facilitator transporter  32.66 
 
 
449 aa  226  5.0000000000000005e-58  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000765522  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2718  major facilitator superfamily aromatic acid transporter  36 
 
 
445 aa  226  7e-58  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0133806  normal  0.187148 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5027  major facilitator transporter  34.59 
 
 
457 aa  226  9e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1396  4-hydroxybenzoate transporter  34.36 
 
 
579 aa  226  9e-58  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6040  major facilitator transporter  31.46 
 
 
449 aa  224  4e-57  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.489761  normal  0.189475 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4009  major facilitator transporter  36.34 
 
 
454 aa  222  9.999999999999999e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3425  major facilitator superfamily MFS_1  35.94 
 
 
436 aa  221  1.9999999999999999e-56  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3370  major facilitator transporter  35.66 
 
 
453 aa  221  3e-56  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.278479  normal  0.891983 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2375  major facilitator superfamily MFS_1  35.9 
 
 
451 aa  219  5e-56  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.661624  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1376  benzoate transport  34.16 
 
 
448 aa  218  1e-55  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.282947 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0149  major facilitator superfamily transporter  38.5 
 
 
441 aa  219  1e-55  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00293447 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3901  major facilitator superfamily 4- hydroxybenzoate transporter  35.92 
 
 
454 aa  218  2e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.112817 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2913  major facilitator transporter  35.53 
 
 
454 aa  218  2e-55  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4347  benzoate transport  34.16 
 
 
448 aa  217  4e-55  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0793736  normal  0.0224677 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1885  major facilitator transporter  35.9 
 
 
453 aa  216  5e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.211239 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0051  4-hydroxybenzoate transporter  37.39 
 
 
452 aa  216  7e-55  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4149  major facilitator transporter  35.9 
 
 
453 aa  216  8e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0152976  normal  0.117223 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4217  major facilitator transporter  35.9 
 
 
453 aa  216  8e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.344742  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3199  major facilitator transporter  35 
 
 
449 aa  215  9.999999999999999e-55  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.105283  normal  0.0955769 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1266  benzoate transport  33.64 
 
 
448 aa  215  9.999999999999999e-55  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0779  major facilitator superfamily MFS_1  36.19 
 
 
454 aa  214  2.9999999999999995e-54  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2507  benzoate transport  35.05 
 
 
451 aa  214  2.9999999999999995e-54  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31240  Major facilitator superfamily protein  35.36 
 
 
446 aa  212  1e-53  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0259  major facilitator transporter  33.26 
 
 
449 aa  211  2e-53  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4438  benzoate transport  34.55 
 
 
448 aa  210  4e-53  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00260043 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5481  major facilitator transporter  33.18 
 
 
468 aa  210  5e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1254  major facilitator superfamily MFS_1  33.58 
 
 
444 aa  209  7e-53  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.477296  normal  0.01739 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7571  major facilitator transporter  32.96 
 
 
450 aa  207  3e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.749151  normal  0.898059 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5860  major facilitator transporter  35.68 
 
 
447 aa  207  4e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4438  major facilitator transporter  33.41 
 
 
453 aa  207  4e-52  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.456474  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>