More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcryo_1257 on replicon NC_007969
Organism: Psychrobacter cryohalolentis K5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007969  Pcryo_1257  major facilitator transporter  100 
 
 		 454 aa  907    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.281321  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2108  major facilitator superfamily transporter  51.89 
 
 		 454 aa  480  1e-134  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0152433  normal  0.3868 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0647  major facilitator superfamily MFS_1  59.44 
 
 		 451 aa  473  1e-132  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5312  major facilitator superfamily MFS_1  51.82 
 
 		 458 aa  468  1.0000000000000001e-131  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.104662  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08630  benzoate transporter  56.97 
 
 		 443 aa  450  1e-125  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.866353  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2684  major facilitator transporter  57.45 
 
 		 442 aa  444  1e-123  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4030  DNA-cytosine methyltransferase  52.32 
 
 		 455 aa  443  1e-123  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3165  major facilitator transporter  57.21 
 
 		 442 aa  439  9.999999999999999e-123  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.660067 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1432  major facilitator superfamily MFS_1  50.94 
 
 		 439 aa  440  9.999999999999999e-123  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.528546  normal  0.24074 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4515  major facilitator transporter  48.36 
 
 		 454 aa  438  9.999999999999999e-123  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1368  major facilitator superfamily MFS_1  50.94 
 
 		 439 aa  441  9.999999999999999e-123  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.00531865  normal  0.175653 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2550  major facilitator transporter  57.21 
 
 		 442 aa  441  9.999999999999999e-123  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2964  hypothetical protein  51.7 
 
 		 446 aa  435  1e-121  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.83907  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2706  major facilitator transporter  56.26 
 
 		 440 aa  435  1e-120  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.728097  normal  0.300526 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2072  major facilitator transporter  46.36 
 
 		 450 aa  427  1e-118  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3658  aromatic compound MFS transporter, putative  45.8 
 
 		 450 aa  424  1e-117  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.691847  normal  0.164035 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3938  major facilitator transporter  53.06 
 
 		 456 aa  423  1e-117  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.718892  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3587  major facilitator transporter  52.38 
 
 		 445 aa  421  1e-116  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.472801 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5941  hypothetical protein  44.72 
 
 		 456 aa  417  9.999999999999999e-116  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.00787806  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1353  major facilitator transporter  49.2 
 
 		 448 aa  418  9.999999999999999e-116  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.418078 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7161  major facilitator transporter  46.14 
 
 		 456 aa  402  1e-111  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5784  major facilitator transporter  43.54 
 
 		 452 aa  396  1e-109  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6046  major facilitator transporter  47.63 
 
 		 446 aa  396  1e-109  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6028  major facilitator transporter  43.31 
 
 		 452 aa  396  1e-109  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.672209  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1181  major facilitator transporter  50.46 
 
 		 443 aa  389  1e-107  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.383013  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1618  major facilitator transporter  47.57 
 
 		 458 aa  387  1e-106  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1099  major facilitator superfamily aromatic acid/H(+) symporter  45.35 
 
 		 461 aa  386  1e-106  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0863734  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2637  major facilitator superfamily MFS_1  45.88 
 
 		 455 aa  377  1e-103  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2316  major facilitator superfamily MFS_1  44.84 
 
 		 446 aa  362  7.0000000000000005e-99  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1895  major facilitator transporter  41.72 
 
 		 451 aa  345  1e-93  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.004098  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3052  benzoate MFS transporter  39.56 
 
 		 452 aa  342  1e-92  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5623  MFS family transporter  41.72 
 
 		 446 aa  332  6e-90  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2281  major facilitator superfamily MFS_1  39.91 
 
 		 450 aa  331  1e-89  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64750  putative MFS transporter  42.09 
 
 		 446 aa  331  2e-89  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0344  major facilitator transporter  40.98 
 
 		 433 aa  298  2e-79  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4906  putative benzoate transport protein  40.34 
 
 		 433 aa  296  5e-79  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0349  benzoate transport protein  40.59 
 
 		 436 aa  296  7e-79  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0412  putative benzoate transport protein  40.59 
 
 		 433 aa  296  7e-79  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0364  benzoate transport protein  40.59 
 
 		 433 aa  295  8e-79  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0335  sugar transporter; benzoate transport protein  40.34 
 
 		 436 aa  294  2e-78  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0398  putative benzoate transport protein  40.34 
 
 		 433 aa  294  2e-78  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0464  benzoate transport protein, putative  39.85 
 
 		 433 aa  291  2e-77  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0460  putative benzoate transport protein  39.85 
 
 		 433 aa  291  2e-77  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1093  4-hydroxybenzoate transporter  37.73 
 
 		 454 aa  281  1e-74  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.818104 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0340  major facilitator transporter  40.34 
 
 		 436 aa  278  2e-73  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1856  major facilitator superfamily MFS_1  37.68 
 
 		 435 aa  272  8.000000000000001e-72  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2126  major facilitator superfamily MFS_1  36.14 
 
 		 444 aa  254  2.0000000000000002e-66  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.647931  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7272  major facilitator transporter  34.99 
 
 		 437 aa  253  6e-66  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0741  major facilitator transporter  34.43 
 
 		 438 aa  252  8.000000000000001e-66  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0470116 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1823  major facilitator transporter  35.59 
 
 		 442 aa  247  4e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.112408  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3708  major facilitator superfamily transporter  34.14 
 
 		 441 aa  243  6e-63  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0245193 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5481  major facilitator transporter  33.78 
 
 		 468 aa  242  7.999999999999999e-63  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0726  4-hydroxybenzoate transporter  33.1 
 
 		 455 aa  241  1e-62  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7483  major facilitator transporter  36.29 
 
 		 428 aa  241  2e-62  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5722  major facilitator superfamily MFS_1  37.5 
 
 		 433 aa  240  4e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.731406  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2375  major facilitator superfamily MFS_1  35.28 
 
 		 451 aa  239  5e-62  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.661624  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2097  major facilitator transporter  33.63 
 
 		 459 aa  238  2e-61  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.201063 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0700  major facilitator transporter  31.84 
 
 		 453 aa  238  2e-61  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0819  major facilitator transporter  31.77 
 
 		 452 aa  236  7e-61  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.138145  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0717  major facilitator transporter  32.13 
 
 		 453 aa  236  7e-61  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.231958  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0336  major facilitator transporter  31.77 
 
 		 452 aa  236  7e-61  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3425  major facilitator superfamily MFS_1  35.88 
 
 		 436 aa  236  8e-61  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4260  putative hydroxybenzoate transporter  33.04 
 
 		 461 aa  235  1.0000000000000001e-60  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.932507 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0788  major facilitator transporter  31.33 
 
 		 453 aa  235  1.0000000000000001e-60  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4077  4-hydroxybenzoate transporter  32.67 
 
 		 475 aa  235  1.0000000000000001e-60  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0892005  normal  0.387821 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4011  major facilitator transporter  36.08 
 
 		 435 aa  233  6e-60  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.46849  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1137  major facilitator transporter  34.08 
 
 		 457 aa  233  8.000000000000001e-60  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5860  major facilitator transporter  35.14 
 
 		 447 aa  231  2e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3370  major facilitator transporter  34.49 
 
 		 453 aa  231  2e-59  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.278479  normal  0.891983 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3271  transporter, major facilitator family  34.83 
 
 		 452 aa  228  1e-58  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.557085 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2564  major facilitator transporter  32.44 
 
 		 450 aa  228  2e-58  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1885  major facilitator transporter  33.33 
 
 		 453 aa  228  2e-58  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.211239 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4149  major facilitator transporter  34.72 
 
 		 453 aa  228  2e-58  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0152976  normal  0.117223 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4217  major facilitator transporter  34.72 
 
 		 453 aa  228  2e-58  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.344742  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6040  major facilitator transporter  31.76 
 
 		 449 aa  227  3e-58  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.489761  normal  0.189475 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4009  major facilitator transporter  31.79 
 
 		 454 aa  226  5.0000000000000005e-58  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2523  major facilitator superfamily aromatic acid/H(+) symporter  33.1 
 
 		 461 aa  226  5.0000000000000005e-58  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.108392 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2434  major facilitator transporter  34.36 
 
 		 452 aa  226  7e-58  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6376  major facilitator transporter  33.63 
 
 		 449 aa  226  8e-58  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000765522  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0149  major facilitator superfamily transporter  37 
 
 		 441 aa  224  2e-57  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00293447 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2913  major facilitator transporter  32.88 
 
 		 454 aa  224  2e-57  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0051  4-hydroxybenzoate transporter  33.64 
 
 		 452 aa  224  3e-57  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4438  major facilitator transporter  34.35 
 
 		 453 aa  223  4.9999999999999996e-57  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.456474  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3199  major facilitator transporter  35 
 
 		 449 aa  223  4.9999999999999996e-57  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.105283  normal  0.0955769 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1376  benzoate transport  31.21 
 
 		 448 aa  223  6e-57  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.282947 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3912  major facilitator transporter  31.61 
 
 		 453 aa  222  9e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5027  major facilitator transporter  33.18 
 
 		 457 aa  222  9.999999999999999e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0259  major facilitator transporter  31.05 
 
 		 449 aa  220  3e-56  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0913  general substrate transporter  33.18 
 
 		 465 aa  219  8.999999999999998e-56  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3214  4-hydroxybenzoate transporter  31.45 
 
 		 451 aa  218  1e-55  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3229  4-hydroxybenzoate transporter  31.45 
 
 		 451 aa  218  1e-55  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0937  major facilitator superfamily MFS_1  32.69 
 
 		 448 aa  218  1e-55  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.699917  n/a   
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6469  benzoate transport  33.18 
 
 		 460 aa  218  2e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4347  benzoate transport  31.12 
 
 		 448 aa  218  2e-55  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0793736  normal  0.0224677 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1396  4-hydroxybenzoate transporter  32.58 
 
 		 579 aa  218  2e-55  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2057  4-hydroxyphenylacetate transporter, putative  31.45 
 
 		 451 aa  217  2.9999999999999998e-55  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0855  putative 4-hydroxyphenylacetate transporter  31.45 
 
 		 451 aa  217  2.9999999999999998e-55  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1922  4-hydroxybenzoate transporter  31.45 
 
 		 451 aa  217  2.9999999999999998e-55  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3798  major facilitator transporter  29.91 
 
 		 452 aa  217  2.9999999999999998e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.120406  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3175  4-hydroxybenzoate transporter  31.45 
 
 		 451 aa  217  2.9999999999999998e-55  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.902434  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>