More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_A1618 on replicon NC_007347
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007347  Reut_A1618  major facilitator transporter  100 
 
 
458 aa  912    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5312  major facilitator superfamily MFS_1  63.55 
 
 
458 aa  561  1.0000000000000001e-159  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.104662  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2108  major facilitator superfamily transporter  62.36 
 
 
454 aa  560  1e-158  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0152433  normal  0.3868 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1368  major facilitator superfamily MFS_1  63.99 
 
 
439 aa  535  1e-151  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.00531865  normal  0.175653 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4515  major facilitator transporter  60.09 
 
 
454 aa  535  1e-151  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1432  major facilitator superfamily MFS_1  63.99 
 
 
439 aa  536  1e-151  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.528546  normal  0.24074 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4030  DNA-cytosine methyltransferase  61.56 
 
 
455 aa  513  1e-144  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1353  major facilitator transporter  60.49 
 
 
448 aa  513  1e-144  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.418078 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3938  major facilitator transporter  61.56 
 
 
456 aa  507  9.999999999999999e-143  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.718892  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1099  major facilitator superfamily aromatic acid/H(+) symporter  55.53 
 
 
461 aa  478  1e-133  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0863734  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3658  aromatic compound MFS transporter, putative  52.29 
 
 
450 aa  468  9.999999999999999e-131  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.691847  normal  0.164035 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2072  major facilitator transporter  52.29 
 
 
450 aa  463  1e-129  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6028  major facilitator transporter  51.69 
 
 
452 aa  456  1e-127  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.672209  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2637  major facilitator superfamily MFS_1  54.77 
 
 
455 aa  454  1.0000000000000001e-126  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5941  hypothetical protein  52.03 
 
 
456 aa  454  1.0000000000000001e-126  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.00787806  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6046  major facilitator transporter  55.27 
 
 
446 aa  454  1.0000000000000001e-126  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5784  major facilitator transporter  51.69 
 
 
452 aa  454  1.0000000000000001e-126  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7161  major facilitator transporter  53.93 
 
 
456 aa  440  9.999999999999999e-123  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08630  benzoate transporter  52.59 
 
 
443 aa  412  1e-114  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.866353  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0647  major facilitator superfamily MFS_1  50 
 
 
451 aa  413  1e-114  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1257  major facilitator transporter  46.15 
 
 
454 aa  402  1e-111  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.281321  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3587  major facilitator transporter  50 
 
 
445 aa  401  9.999999999999999e-111  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.472801 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2964  hypothetical protein  50.71 
 
 
446 aa  398  9.999999999999999e-111  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.83907  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2684  major facilitator transporter  51.42 
 
 
442 aa  392  1e-108  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3165  major facilitator transporter  51.42 
 
 
442 aa  391  1e-107  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.660067 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2706  major facilitator transporter  50.46 
 
 
440 aa  391  1e-107  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.728097  normal  0.300526 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2550  major facilitator transporter  51.42 
 
 
442 aa  391  1e-107  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1895  major facilitator transporter  41.31 
 
 
451 aa  343  2.9999999999999997e-93  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.004098  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2316  major facilitator superfamily MFS_1  41.84 
 
 
446 aa  342  1e-92  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1181  major facilitator transporter  45.48 
 
 
443 aa  337  1.9999999999999998e-91  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.383013  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64750  putative MFS transporter  41.1 
 
 
446 aa  317  2e-85  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5623  MFS family transporter  40.91 
 
 
446 aa  314  1.9999999999999998e-84  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3052  benzoate MFS transporter  36.28 
 
 
452 aa  299  6e-80  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2281  major facilitator superfamily MFS_1  37.27 
 
 
450 aa  295  1e-78  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1856  major facilitator superfamily MFS_1  33.8 
 
 
435 aa  283  5.000000000000001e-75  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0464  benzoate transport protein, putative  37.38 
 
 
433 aa  279  7e-74  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0460  putative benzoate transport protein  37.38 
 
 
433 aa  278  1e-73  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0344  major facilitator transporter  37.13 
 
 
433 aa  275  1.0000000000000001e-72  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0364  benzoate transport protein  36.71 
 
 
433 aa  274  2.0000000000000002e-72  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0412  putative benzoate transport protein  36.74 
 
 
433 aa  274  3e-72  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0349  benzoate transport protein  36.71 
 
 
436 aa  274  3e-72  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4906  putative benzoate transport protein  37.25 
 
 
433 aa  272  8.000000000000001e-72  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0335  sugar transporter; benzoate transport protein  36.23 
 
 
436 aa  269  8e-71  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0398  putative benzoate transport protein  36.23 
 
 
433 aa  268  1e-70  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1823  major facilitator transporter  36.55 
 
 
442 aa  261  1e-68  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.112408  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0340  major facilitator transporter  37.56 
 
 
436 aa  250  3e-65  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7272  major facilitator transporter  35.68 
 
 
437 aa  233  6e-60  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4077  4-hydroxybenzoate transporter  31.28 
 
 
475 aa  226  5.0000000000000005e-58  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0892005  normal  0.387821 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5722  major facilitator superfamily MFS_1  36.34 
 
 
433 aa  225  1e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.731406  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0741  major facilitator transporter  31.58 
 
 
438 aa  221  3e-56  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.0470116 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2523  major facilitator superfamily aromatic acid/H(+) symporter  33.49 
 
 
461 aa  219  6e-56  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.108392 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0788  major facilitator transporter  31.69 
 
 
453 aa  217  2.9999999999999998e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2126  major facilitator superfamily MFS_1  33.41 
 
 
444 aa  217  4e-55  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.647931  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7483  major facilitator transporter  34.01 
 
 
428 aa  216  5.9999999999999996e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0700  major facilitator transporter  32.14 
 
 
453 aa  216  9.999999999999999e-55  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0717  major facilitator transporter  32.3 
 
 
453 aa  213  4.9999999999999996e-54  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.231958  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0819  major facilitator transporter  30.67 
 
 
452 aa  212  1e-53  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.138145  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0336  major facilitator transporter  30.67 
 
 
452 aa  212  1e-53  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1093  4-hydroxybenzoate transporter  31.92 
 
 
454 aa  211  2e-53  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.818104 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6040  major facilitator transporter  32.15 
 
 
449 aa  211  2e-53  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.489761  normal  0.189475 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0726  4-hydroxybenzoate transporter  32.95 
 
 
455 aa  208  2e-52  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2564  major facilitator transporter  30.96 
 
 
450 aa  206  9e-52  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2718  major facilitator superfamily aromatic acid transporter  32.48 
 
 
445 aa  203  6e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0133806  normal  0.187148 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5860  major facilitator transporter  32.94 
 
 
447 aa  202  7e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2913  major facilitator transporter  29.32 
 
 
454 aa  201  1.9999999999999998e-50  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3708  major facilitator superfamily transporter  28.82 
 
 
441 aa  200  3.9999999999999996e-50  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0245193 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3912  major facilitator transporter  30.79 
 
 
453 aa  200  5e-50  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6226  major facilitator transporter  32.1 
 
 
460 aa  200  5e-50  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3214  4-hydroxybenzoate transporter  31.07 
 
 
451 aa  198  2.0000000000000003e-49  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6628  major facilitator transporter  31.87 
 
 
460 aa  198  2.0000000000000003e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.990266 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3229  4-hydroxybenzoate transporter  31.07 
 
 
451 aa  198  2.0000000000000003e-49  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6395  major facilitator transporter  31.87 
 
 
460 aa  198  2.0000000000000003e-49  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3370  major facilitator transporter  31.93 
 
 
453 aa  197  3e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.278479  normal  0.891983 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1922  4-hydroxybenzoate transporter  30.94 
 
 
451 aa  197  4.0000000000000005e-49  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2057  4-hydroxyphenylacetate transporter, putative  30.94 
 
 
451 aa  197  4.0000000000000005e-49  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2687  putative 4-hydroxyphenylacetate transporter  30.94 
 
 
451 aa  197  4.0000000000000005e-49  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3175  4-hydroxybenzoate transporter  31.07 
 
 
451 aa  197  4.0000000000000005e-49  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.902434  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0855  putative 4-hydroxyphenylacetate transporter  30.94 
 
 
451 aa  197  4.0000000000000005e-49  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0913  general substrate transporter  33.89 
 
 
465 aa  195  1e-48  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4063  major facilitator superfamily MFS_1  31.13 
 
 
461 aa  195  1e-48  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4009  major facilitator transporter  29.65 
 
 
454 aa  195  1e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4011  major facilitator transporter  30.86 
 
 
435 aa  194  2e-48  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.46849  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6376  major facilitator transporter  28.8 
 
 
449 aa  195  2e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000765522  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2375  major facilitator superfamily MFS_1  31.32 
 
 
451 aa  193  4e-48  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.661624  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4030  major facilitator superfamily MFS_1  30.77 
 
 
463 aa  194  4e-48  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7571  major facilitator transporter  32.29 
 
 
450 aa  193  5e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.749151  normal  0.898059 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1885  major facilitator transporter  32.17 
 
 
453 aa  192  8e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.211239 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1396  4-hydroxybenzoate transporter  30.66 
 
 
579 aa  191  2.9999999999999997e-47  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0149  major facilitator superfamily transporter  35.15 
 
 
441 aa  191  2.9999999999999997e-47  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00293447 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1029  major facilitator superfamily aromatic acid/H(+) symporter  31.41 
 
 
452 aa  190  4e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.000542182  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0937  major facilitator superfamily MFS_1  31.44 
 
 
448 aa  189  5.999999999999999e-47  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.699917  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3425  major facilitator superfamily MFS_1  31.43 
 
 
436 aa  189  9e-47  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2097  major facilitator transporter  30.16 
 
 
459 aa  189  1e-46  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.201063 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5481  major facilitator transporter  32.7 
 
 
468 aa  187  5e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5027  major facilitator transporter  30.05 
 
 
457 aa  186  8e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1266  benzoate transport  30.32 
 
 
448 aa  186  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4149  major facilitator transporter  31.31 
 
 
453 aa  186  1.0000000000000001e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0152976  normal  0.117223 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4217  major facilitator transporter  31.31 
 
 
453 aa  186  1.0000000000000001e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.344742  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1376  benzoate transport  29.52 
 
 
448 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.282947 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3852  major facilitator superfamily MFS_1  35.81 
 
 
446 aa  185  2.0000000000000003e-45  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00000421805  normal  0.905597 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>