More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic_1368 on replicon NC_010682
Organism: Ralstonia pickettii 12J



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010682  Rpic_1368  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 439 aa  874    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.00531865  normal  0.175653 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5312  major facilitator superfamily MFS_1  73 
 
 		 458 aa  654    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.104662  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1432  major facilitator superfamily MFS_1  99.32 
 
 		 439 aa  868    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.528546  normal  0.24074 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2108  major facilitator superfamily transporter  76.55 
 
 		 454 aa  685    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0152433  normal  0.3868 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4515  major facilitator transporter  70.57 
 
 		 454 aa  634    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3938  major facilitator transporter  77.52 
 
 		 456 aa  632  1e-180  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.718892  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1353  major facilitator transporter  71.43 
 
 		 448 aa  599  1e-170  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.418078 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4030  DNA-cytosine methyltransferase  67.51 
 
 		 455 aa  589  1e-167  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7161  major facilitator transporter  62.41 
 
 		 456 aa  526  1e-148  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5941  hypothetical protein  60.37 
 
 		 456 aa  518  1e-146  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.00787806  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1099  major facilitator superfamily aromatic acid/H(+) symporter  61.24 
 
 		 461 aa  518  1e-146  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0863734  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6046  major facilitator transporter  60.51 
 
 		 446 aa  511  1e-144  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3658  aromatic compound MFS transporter, putative  56.14 
 
 		 450 aa  510  1e-143  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.691847  normal  0.164035 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1618  major facilitator transporter  64.41 
 
 		 458 aa  510  1e-143  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2072  major facilitator transporter  56.69 
 
 		 450 aa  508  1e-143  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6028  major facilitator transporter  58.39 
 
 		 452 aa  508  1e-143  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.672209  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2637  major facilitator superfamily MFS_1  61.56 
 
 		 455 aa  507  9.999999999999999e-143  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5784  major facilitator transporter  58.94 
 
 		 452 aa  502  1e-141  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08630  benzoate transporter  56.85 
 
 		 443 aa  455  1e-127  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.866353  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2964  hypothetical protein  55.84 
 
 		 446 aa  440  9.999999999999999e-123  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.83907  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0647  major facilitator superfamily MFS_1  55.07 
 
 		 451 aa  436  1e-121  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1257  major facilitator transporter  50.94 
 
 		 454 aa  431  1e-120  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.281321  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3165  major facilitator transporter  53.06 
 
 		 442 aa  422  1e-117  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.660067 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2550  major facilitator transporter  53.06 
 
 		 442 aa  422  1e-117  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2684  major facilitator transporter  53.51 
 
 		 442 aa  423  1e-117  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2706  major facilitator transporter  53.63 
 
 		 440 aa  417  9.999999999999999e-116  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.728097  normal  0.300526 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3587  major facilitator transporter  51.83 
 
 		 445 aa  412  1e-114  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.472801 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1895  major facilitator transporter  44.88 
 
 		 451 aa  363  4e-99  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.004098  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2316  major facilitator superfamily MFS_1  43.61 
 
 		 446 aa  363  4e-99  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1181  major facilitator transporter  48 
 
 		 443 aa  359  4e-98  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.383013  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64750  putative MFS transporter  44.5 
 
 		 446 aa  337  2.9999999999999997e-91  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5623  MFS family transporter  44.68 
 
 		 446 aa  334  2e-90  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3052  benzoate MFS transporter  38.43 
 
 		 452 aa  324  2e-87  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2281  major facilitator superfamily MFS_1  35.96 
 
 		 450 aa  303  3.0000000000000004e-81  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1856  major facilitator superfamily MFS_1  36.47 
 
 		 435 aa  293  6e-78  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4906  putative benzoate transport protein  39.51 
 
 		 433 aa  286  4e-76  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0464  benzoate transport protein, putative  39.02 
 
 		 433 aa  286  5.999999999999999e-76  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0460  putative benzoate transport protein  39.02 
 
 		 433 aa  286  5.999999999999999e-76  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0412  putative benzoate transport protein  39.51 
 
 		 433 aa  285  8e-76  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0344  major facilitator transporter  39.08 
 
 		 433 aa  285  2.0000000000000002e-75  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0349  benzoate transport protein  39.51 
 
 		 436 aa  283  3.0000000000000004e-75  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0364  benzoate transport protein  39.51 
 
 		 433 aa  284  3.0000000000000004e-75  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0335  sugar transporter; benzoate transport protein  39.27 
 
 		 436 aa  281  1e-74  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0398  putative benzoate transport protein  39.27 
 
 		 433 aa  280  3e-74  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0340  major facilitator transporter  39.51 
 
 		 436 aa  266  5e-70  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1823  major facilitator transporter  37.1 
 
 		 442 aa  256  6e-67  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.112408  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0788  major facilitator transporter  35.68 
 
 		 453 aa  249  8e-65  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0819  major facilitator transporter  36.45 
 
 		 452 aa  248  2e-64  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.138145  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0336  major facilitator transporter  36.45 
 
 		 452 aa  248  2e-64  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4077  4-hydroxybenzoate transporter  35.6 
 
 		 475 aa  246  4e-64  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0892005  normal  0.387821 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0700  major facilitator transporter  35.66 
 
 		 453 aa  246  6.999999999999999e-64  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0717  major facilitator transporter  35.13 
 
 		 453 aa  245  9.999999999999999e-64  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.231958  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3370  major facilitator transporter  35.31 
 
 		 453 aa  241  1e-62  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.278479  normal  0.891983 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6376  major facilitator transporter  34.09 
 
 		 449 aa  241  2e-62  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000765522  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7483  major facilitator transporter  34.75 
 
 		 428 aa  237  3e-61  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1093  4-hydroxybenzoate transporter  33.8 
 
 		 454 aa  237  4e-61  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.818104 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3912  major facilitator transporter  35.43 
 
 		 453 aa  236  6e-61  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1885  major facilitator transporter  36.68 
 
 		 453 aa  235  1.0000000000000001e-60  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.211239 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3229  4-hydroxybenzoate transporter  35.01 
 
 		 451 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3214  4-hydroxybenzoate transporter  35.01 
 
 		 451 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0855  putative 4-hydroxyphenylacetate transporter  35.01 
 
 		 451 aa  234  3e-60  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2057  4-hydroxyphenylacetate transporter, putative  35.01 
 
 		 451 aa  234  3e-60  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1922  4-hydroxybenzoate transporter  35.01 
 
 		 451 aa  234  3e-60  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2687  putative 4-hydroxyphenylacetate transporter  35.01 
 
 		 451 aa  234  3e-60  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3175  4-hydroxybenzoate transporter  34.77 
 
 		 451 aa  233  5e-60  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.902434  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5722  major facilitator superfamily MFS_1  36.49 
 
 		 433 aa  233  7.000000000000001e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.731406  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2097  major facilitator transporter  34.78 
 
 		 459 aa  233  7.000000000000001e-60  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.201063 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4149  major facilitator transporter  35.68 
 
 		 453 aa  232  1e-59  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0152976  normal  0.117223 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0913  general substrate transporter  35.02 
 
 		 465 aa  232  1e-59  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2564  major facilitator transporter  34.51 
 
 		 450 aa  231  1e-59  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4217  major facilitator transporter  35.68 
 
 		 453 aa  232  1e-59  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.344742  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7272  major facilitator transporter  33.49 
 
 		 437 aa  230  5e-59  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1376  benzoate transport  34.81 
 
 		 448 aa  228  2e-58  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.282947 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2523  major facilitator superfamily aromatic acid/H(+) symporter  35.75 
 
 		 461 aa  228  2e-58  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.108392 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6040  major facilitator transporter  33.94 
 
 		 449 aa  226  8e-58  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.489761  normal  0.189475 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2913  major facilitator transporter  33.88 
 
 		 454 aa  225  1e-57  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2507  benzoate transport  32.95 
 
 		 451 aa  224  2e-57  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5860  major facilitator transporter  36.17 
 
 		 447 aa  224  2e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1396  4-hydroxybenzoate transporter  34.86 
 
 		 579 aa  223  4e-57  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3708  major facilitator superfamily transporter  31.14 
 
 		 441 aa  223  4.9999999999999996e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0245193 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2718  major facilitator superfamily aromatic acid transporter  33.87 
 
 		 445 aa  222  9.999999999999999e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0133806  normal  0.187148 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4347  benzoate transport  34.81 
 
 		 448 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0793736  normal  0.0224677 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1266  benzoate transport  34.04 
 
 		 448 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0741  major facilitator transporter  31.22 
 
 		 438 aa  221  1.9999999999999999e-56  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0470116 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4011  major facilitator transporter  34.62 
 
 		 435 aa  221  3e-56  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.46849  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5027  major facilitator transporter  33.26 
 
 		 457 aa  219  1e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0726  4-hydroxybenzoate transporter  33.41 
 
 		 455 aa  219  1e-55  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6105  major facilitator transporter  32.13 
 
 		 465 aa  218  1e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.84268 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4438  major facilitator transporter  35.01 
 
 		 453 aa  217  2.9999999999999998e-55  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.456474  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0051  4-hydroxybenzoate transporter  35.76 
 
 		 452 aa  216  7e-55  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20360  major facilitator superfamily (MFS) permease  33.87 
 
 		 432 aa  216  9e-55  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2375  major facilitator superfamily MFS_1  35.36 
 
 		 451 aa  214  1.9999999999999998e-54  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.661624  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2095  major facilitator superfamily MFS_1  30.88 
 
 		 447 aa  213  5.999999999999999e-54  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3199  major facilitator transporter  33.92 
 
 		 449 aa  213  7e-54  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.105283  normal  0.0955769 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4438  benzoate transport  35.44 
 
 		 448 aa  212  7.999999999999999e-54  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00260043 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2126  major facilitator superfamily MFS_1  33.65 
 
 		 444 aa  211  2e-53  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.647931  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0259  major facilitator transporter  32.47 
 
 		 449 aa  211  2e-53  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4944  major facilitator transporter  34.58 
 
 		 456 aa  210  4e-53  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.986503  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0354  major facilitator superfamily aromatic acid/H(+) symporter  32.62 
 
 		 465 aa  210  4e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000650677  hitchhiker  0.00000770433 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2434  major facilitator transporter  33.49 
 
 		 452 aa  209  7e-53  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>