More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_1482 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011830  Dhaf_1482  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 
451 aa  892    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000115751  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2413  major facilitator transporter  51.1 
 
 
447 aa  468  9.999999999999999e-131  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000787137  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1523  major facilitator transporter  53.22 
 
 
438 aa  449  1e-125  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.295641  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5409  major facilitator family transporter  49.53 
 
 
399 aa  413  1e-114  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000000725853  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5547  major facilitator family transporter  48.6 
 
 
399 aa  409  1e-113  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.00000000869498  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5271  major facilitator family transporter  48.83 
 
 
399 aa  409  1e-113  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000000222558  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5098  major facilitator family transporter  48.83 
 
 
399 aa  409  1e-113  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.20566e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5513  major facilitator family transporter  48.83 
 
 
399 aa  409  1e-113  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5668  major facilitator family transporter  48.83 
 
 
399 aa  409  1e-113  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.0000000000480591  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5543  major facilitator family transporter  48.83 
 
 
399 aa  409  1e-113  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000723204  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5115  major facilitator family transporter  48.83 
 
 
399 aa  408  1.0000000000000001e-112  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000159613  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5212  major facilitator transporter  48.59 
 
 
399 aa  407  1.0000000000000001e-112  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000114177  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5599  major facilitator family transporter  48.59 
 
 
399 aa  407  1.0000000000000001e-112  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000105464  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3933  major facilitator transporter  47.89 
 
 
399 aa  404  1e-111  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000233422  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3374  major facilitator superfamily MFS_1  49.77 
 
 
398 aa  395  1e-109  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000527195  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3497  major facilitator superfamily MFS_1  49.07 
 
 
398 aa  390  1e-107  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2255  major facilitator superfamily MFS_1  45.77 
 
 
473 aa  384  1e-105  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1377  major facilitator superfamily MFS_1  48.69 
 
 
445 aa  360  3e-98  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21330  sugar phosphate permease  46.83 
 
 
477 aa  357  2.9999999999999997e-97  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.428425  hitchhiker  0.00018034 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0897  major facilitator superfamily MFS_1  49.64 
 
 
447 aa  347  2e-94  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0894914  normal  0.147269 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29790  sugar phosphate permease  44.6 
 
 
485 aa  345  8.999999999999999e-94  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4019  major facilitator superfamily MFS_1  46 
 
 
435 aa  344  2e-93  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.000381325  normal  0.201783 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3242  major facilitator superfamily MFS_1  41.41 
 
 
539 aa  337  1.9999999999999998e-91  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  hitchhiker  0.00325514  normal  0.76951 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0245  putative permease  46.39 
 
 
449 aa  329  5.0000000000000004e-89  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0461827  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2078  major facilitator superfamily MFS_1  44.57 
 
 
404 aa  328  1.0000000000000001e-88  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4638  major facilitator superfamily MFS_1  38.22 
 
 
451 aa  327  3e-88  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000178504  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8056  major facilitator superfamily MFS_1  39.42 
 
 
451 aa  325  7e-88  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19270  putative MFS transporter  39.91 
 
 
455 aa  320  3e-86  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.149627  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1660  MFS family transporter  38.55 
 
 
455 aa  313  4.999999999999999e-84  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5053  major facilitator superfamily MFS_1  37.44 
 
 
472 aa  306  4.0000000000000004e-82  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.122247 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1875  major facilitator transporter  38.77 
 
 
459 aa  306  4.0000000000000004e-82  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.473892  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0670  general substrate transporter  37.89 
 
 
459 aa  305  2.0000000000000002e-81  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.753041 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1595  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  37.44 
 
 
472 aa  304  2.0000000000000002e-81  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5109  major facilitator transporter  38.67 
 
 
474 aa  303  6.000000000000001e-81  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5172  major facilitator transporter  38.67 
 
 
474 aa  303  6.000000000000001e-81  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0809503 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3259  major facilitator transporter  38.67 
 
 
474 aa  301  2e-80  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.331503  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0539  major facilitator transporter  38 
 
 
473 aa  300  4e-80  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5178  major facilitator transporter  36.38 
 
 
457 aa  300  5e-80  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1431  major facilitator family transporter  37.42 
 
 
478 aa  297  2e-79  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.475934  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0471  major facilitator family transporter  37.42 
 
 
478 aa  297  2e-79  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0177  major facilitator family transporter  37.42 
 
 
478 aa  297  2e-79  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0379  major facilitator family transporter  37.42 
 
 
478 aa  297  3e-79  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1931  major facilitator superfamily permease  37.19 
 
 
478 aa  297  3e-79  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0979116  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02027  metabolite transporter  38.44 
 
 
476 aa  296  7e-79  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.158134 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1841  major facilitator family transporter  37.19 
 
 
478 aa  296  7e-79  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3311  major facilitator transporter  37.19 
 
 
474 aa  295  8e-79  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.799238  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0911  major facilitator family transporter  37.19 
 
 
478 aa  295  9e-79  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.577596  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3533  major facilitator transporter  38.44 
 
 
473 aa  295  1e-78  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1683  major facilitator transporter  40.38 
 
 
415 aa  291  2e-77  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.249309  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2088  major facilitator superfamily MFS_1  37.31 
 
 
456 aa  290  5.0000000000000004e-77  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.565943 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2073  major facilitator superfamily transporter  37.12 
 
 
467 aa  285  1.0000000000000001e-75  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0013865 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2754  major facilitator superfamily MFS_1  38.83 
 
 
465 aa  284  3.0000000000000004e-75  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.182715  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1561  major facilitator transporter  37.31 
 
 
509 aa  278  2e-73  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.141298  normal  0.174962 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0911  major facilitator superfamily permease  35.39 
 
 
388 aa  272  1e-71  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.000338401  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2518  major facilitator transporter  36.48 
 
 
437 aa  269  8.999999999999999e-71  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1856  major facilitator transporter  34.59 
 
 
438 aa  265  1e-69  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4651  major facilitator superfamily MFS_1  34.88 
 
 
470 aa  264  3e-69  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0547  major facilitator superfamily transporter  34.2 
 
 
456 aa  263  4.999999999999999e-69  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.392915  normal  0.285749 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4993  MFS family membrane efflux protein  35.45 
 
 
526 aa  263  4.999999999999999e-69  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.521864 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3924  major facilitator superfamily transporter  34.88 
 
 
438 aa  261  2e-68  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.496152  normal  0.0457831 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2900  major facilitator transporter  34.44 
 
 
514 aa  260  3e-68  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.473738  normal  0.0138886 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1266  major facilitator transporter  36.26 
 
 
422 aa  254  2.0000000000000002e-66  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.693096  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1671  major facilitator transporter  37.11 
 
 
381 aa  251  2e-65  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    decreased coverage  0.0000914056 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1189  major facilitator transporter  36.04 
 
 
422 aa  251  2e-65  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00252456  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0532  major facilitator family transporter  34.88 
 
 
436 aa  249  7e-65  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1326  major facilitator transporter  38.73 
 
 
464 aa  248  2e-64  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.367254  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0462  major facilitator family transporter  34.66 
 
 
436 aa  247  3e-64  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.450318  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3564  major facilitator transporter  36.76 
 
 
436 aa  242  9e-63  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1543  major facilitator transporter  37.22 
 
 
382 aa  238  2e-61  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.0259552 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4630  major facilitator superfamily MFS_1  32.6 
 
 
467 aa  237  3e-61  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.234892  hitchhiker  0.00910919 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4498  major facilitator superfamily MFS_1  32.6 
 
 
467 aa  237  3e-61  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0152994  normal  0.24714 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0090  major facilitator transporter  33.33 
 
 
422 aa  236  8e-61  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.000497214  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1166  major facilitator superfamily MFS_1  36.04 
 
 
450 aa  234  3e-60  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000374507 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1010  major facilitator family transporter  37.5 
 
 
398 aa  233  5e-60  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1414  major facilitator transporter  33.48 
 
 
424 aa  232  1e-59  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1414  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  32.82 
 
 
468 aa  232  1e-59  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000198546  normal  0.095851 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3653  major facilitator superfamily MFS_1  31.35 
 
 
446 aa  228  2e-58  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1992  major facilitator transporter  36.63 
 
 
436 aa  227  3e-58  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.252047  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0186  major facilitator transporter  31.65 
 
 
479 aa  227  3e-58  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0602  major facilitator superfamily MFS_1  33.26 
 
 
459 aa  226  7e-58  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7070  major facilitator superfamily MFS_1  31.65 
 
 
467 aa  225  1e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.710966  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3580  hypothetical protein  31.06 
 
 
478 aa  224  3e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.024372  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3655  major facilitator superfamily MFS_1  30.51 
 
 
447 aa  221  3e-56  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.304643  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1089  major facilitator transporter  34.96 
 
 
450 aa  219  7e-56  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.10347  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5083  major facilitator transporter  35.68 
 
 
437 aa  219  8.999999999999998e-56  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.418338  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1318  major facilitator family transporter  32.1 
 
 
468 aa  218  2e-55  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0914  major facilitator transporter  31.11 
 
 
434 aa  218  2e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00481205  normal  0.205021 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3160  major facilitator superfamily MFS_1  32.16 
 
 
461 aa  216  9e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0312386 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1325  major facilitator family transporter  32.6 
 
 
468 aa  215  9.999999999999999e-55  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.68992  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2505  major facilitator family transporter  32.61 
 
 
468 aa  215  9.999999999999999e-55  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1548  major facilitator superfamily MFS_1  34.24 
 
 
380 aa  215  9.999999999999999e-55  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0983  major facilitator family transporter  32.6 
 
 
468 aa  215  9.999999999999999e-55  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.387482  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1245  major facilitator family transporter  32.6 
 
 
468 aa  215  9.999999999999999e-55  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0308  major facilitator family transporter  32.6 
 
 
474 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0584  major facilitator family transporter  32.6 
 
 
474 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.789618  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6741  major facilitator transporter  34.06 
 
 
480 aa  213  3.9999999999999995e-54  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6265  major facilitator transporter  33.84 
 
 
480 aa  213  4.9999999999999996e-54  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1565  major facilitator transporter  33.84 
 
 
480 aa  213  4.9999999999999996e-54  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.523471  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0647  major facilitator superfamily MFS_1  31.22 
 
 
451 aa  212  9e-54  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2550  major facilitator transporter  33.41 
 
 
442 aa  211  1e-53  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>