More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BMA0350 on replicon NC_006348
Organism: Burkholderia mallei ATCC 23344



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010084  Bmul_0717  major facilitator transporter  76.66 
 
 		 530 aa  666    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.320017 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0649  major facilitator family transporter  99.14 
 
 		 484 aa  797    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  decreased coverage  0.0060403  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0350  4-hydroxybenzoate transporter, putative  100 
 
 		 460 aa  885    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2499  major facilitator transporter  78.92 
 
 		 465 aa  678    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.728984 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2580  major facilitator transporter  78.56 
 
 		 467 aa  668    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2604  major facilitator transporter  78.77 
 
 		 467 aa  668    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.792684  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0097  major facilitator family transporter  99.14 
 
 		 484 aa  797    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.0077935  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1052  4-hydroxybenzoate transporter  98.71 
 
 		 464 aa  793    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0891  major facilitator family transporter  99.14 
 
 		 484 aa  797    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.885088  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5911  major facilitator transporter  77.42 
 
 		 487 aa  662    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2484  putative 4-hydroxybenzoate transporter  99.14 
 
 		 484 aa  797    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.750954  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0708  4-hydroxybenzoate transporter, putative  94.4 
 
 		 464 aa  821    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0289026  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0894  major facilitator family transporter  98.71 
 
 		 484 aa  792    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1969  major facilitator transporter  78.56 
 
 		 467 aa  668    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.364305  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2628  major facilitator transporter  78.71 
 
 		 465 aa  676    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1996  major facilitator superfamily MFS_1  72.4 
 
 		 485 aa  605  9.999999999999999e-173  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.512683 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6160  major facilitator transporter  68.93 
 
 		 458 aa  590  1e-167  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.730505  normal  0.770759 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3364  major facilitator superfamily MFS_1  61.78 
 
 		 463 aa  529  1e-149  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1093  4-hydroxybenzoate transporter  35.92 
 
 		 454 aa  236  6e-61  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.818104 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0259  major facilitator transporter  36.72 
 
 		 449 aa  224  2e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6102  major facilitator superfamily MFS_1  34.67 
 
 		 452 aa  223  7e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.224126  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3798  major facilitator transporter  33.75 
 
 		 452 aa  222  9.999999999999999e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.120406  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6376  major facilitator transporter  33.33 
 
 		 449 aa  217  5e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000765522  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3708  major facilitator superfamily transporter  33.03 
 
 		 441 aa  214  1.9999999999999998e-54  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0245193 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3271  transporter, major facilitator family  33.87 
 
 		 452 aa  214  2.9999999999999995e-54  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.557085 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6105  major facilitator transporter  33.79 
 
 		 465 aa  214  3.9999999999999995e-54  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.84268 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2434  major facilitator transporter  33.26 
 
 		 452 aa  211  2e-53  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0733  major facilitator transporter  36.7 
 
 		 454 aa  209  8e-53  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2304  major facilitator superfamily aromatic acid transporter  34.42 
 
 		 452 aa  209  9e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.551017 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3163  major facilitator transporter  33.5 
 
 		 452 aa  208  1e-52  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2603  major facilitator transporter  36.25 
 
 		 461 aa  209  1e-52  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.731275 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0354  major facilitator superfamily aromatic acid/H(+) symporter  32.1 
 
 		 465 aa  208  2e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000650677  hitchhiker  0.00000770433 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5022  major facilitator transporter  33.25 
 
 		 452 aa  206  5e-52  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3199  major facilitator transporter  34.98 
 
 		 449 aa  206  7e-52  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.105283  normal  0.0955769 
 
 
-
 
NC_003296  RS01667  4-hydroxybenzoate transporter  37.1 
 
 		 458 aa  204  2e-51  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.42633  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5481  major facilitator transporter  39.38 
 
 		 468 aa  205  2e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2690  major facilitator transporter  35.01 
 
 		 455 aa  204  2e-51  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.12833 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31240  Major facilitator superfamily protein  36.23 
 
 		 446 aa  205  2e-51  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3124  major facilitator transporter  33.75 
 
 		 452 aa  204  3e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2696  MFS superfamily protocatechuate transporter  36.5 
 
 		 458 aa  203  5e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.309624  normal  0.47724 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4450  major facilitator transporter  34.93 
 
 		 460 aa  203  5e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.489654  normal  0.0331479 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4472  major facilitator transporter  34.01 
 
 		 452 aa  203  6e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5283  major facilitator transporter  34.01 
 
 		 452 aa  202  8e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.595477  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1376  benzoate transport  35.45 
 
 		 448 aa  202  9e-51  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.282947 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5751  major facilitator transporter  33.75 
 
 		 452 aa  202  9e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.126582 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5108  major facilitator transporter  33.75 
 
 		 452 aa  202  9e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4356  major facilitator transporter  34.54 
 
 		 447 aa  201  1.9999999999999998e-50  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0726  4-hydroxybenzoate transporter  35.03 
 
 		 455 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4347  benzoate transport  36.25 
 
 		 448 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0793736  normal  0.0224677 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4438  benzoate transport  36.25 
 
 		 448 aa  200  3.9999999999999996e-50  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00260043 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4077  4-hydroxybenzoate transporter  33.62 
 
 		 475 aa  199  6e-50  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0892005  normal  0.387821 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2108  major facilitator superfamily transporter  34.17 
 
 		 454 aa  198  1.0000000000000001e-49  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0152433  normal  0.3868 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5027  major facilitator transporter  34.58 
 
 		 457 aa  199  1.0000000000000001e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6040  major facilitator transporter  34.4 
 
 		 449 aa  198  2.0000000000000003e-49  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.489761  normal  0.189475 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0913  general substrate transporter  32.72 
 
 		 465 aa  196  7e-49  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1029  major facilitator superfamily aromatic acid/H(+) symporter  33.72 
 
 		 452 aa  196  7e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.000542182  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1266  benzoate transport  34.96 
 
 		 448 aa  196  8.000000000000001e-49  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0321  4-hydroxybenzoate transporter PcaK  36.56 
 
 		 448 aa  196  1e-48  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.200049  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02690  4-hydroxybenzoate transporter PcaK  36.88 
 
 		 458 aa  194  2e-48  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2512  major facilitator transporter  33.9 
 
 		 452 aa  194  2e-48  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.851571  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0819  major facilitator transporter  34.19 
 
 		 452 aa  194  3e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.138145  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0336  major facilitator transporter  34.19 
 
 		 452 aa  194  3e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2523  major facilitator superfamily aromatic acid/H(+) symporter  34.59 
 
 		 461 aa  193  5e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.108392 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4009  major facilitator transporter  33.11 
 
 		 454 aa  192  8e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5860  major facilitator transporter  37.56 
 
 		 447 aa  192  8e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02900  4-hydroxybenzoate transporter PcaK  35.56 
 
 		 448 aa  192  8e-48  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00278203 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20360  major facilitator superfamily (MFS) permease  33.79 
 
 		 432 aa  192  9e-48  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1016  benzoate transport  35.94 
 
 		 447 aa  192  9e-48  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0402464  hitchhiker  0.0000294981 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3283  MFS family transporter  36.18 
 
 		 450 aa  192  1e-47  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.170295  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2745  major facilitator transporter  35.04 
 
 		 449 aa  191  2e-47  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.382719  normal  0.460456 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0051  4-hydroxybenzoate transporter  35.65 
 
 		 452 aa  191  2e-47  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2375  major facilitator superfamily MFS_1  35.56 
 
 		 451 aa  191  2e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.661624  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3243  major facilitator transporter  36.96 
 
 		 448 aa  191  2.9999999999999997e-47  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.12624 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1821  major facilitator superfamily MFS_1  33.66 
 
 		 448 aa  190  4e-47  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.450146  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2913  major facilitator transporter  29.96 
 
 		 454 aa  190  4e-47  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7571  major facilitator transporter  34.78 
 
 		 450 aa  190  5e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.749151  normal  0.898059 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2325  4-hydroxybenzoate transporter  33.48 
 
 		 452 aa  189  5.999999999999999e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0788  major facilitator transporter  33.72 
 
 		 453 aa  189  5.999999999999999e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3912  major facilitator transporter  34.26 
 
 		 453 aa  189  7e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2369  4-hydroxybenzoate transporter  33.48 
 
 		 452 aa  189  7e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.708273  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6034  major facilitator transporter  32.77 
 
 		 458 aa  189  8e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.323723  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2414  4-hydroxybenzoate transporter  33.48 
 
 		 452 aa  188  1e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2418  4-hydroxybenzoate transporter  33.48 
 
 		 452 aa  189  1e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.364564  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2766  MFS family transporter  37.37 
 
 		 449 aa  189  1e-46  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.648112  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2340  4-hydroxybenzoate transporter  35.05 
 
 		 449 aa  188  2e-46  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.934409  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6976  major facilitator transporter  32.01 
 
 		 453 aa  188  2e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0717  major facilitator transporter  33.26 
 
 		 453 aa  187  4e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.231958  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2625  major facilitator superfamily transporter 4- hydroxybenzoate transporter  32.35 
 
 		 466 aa  187  4e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000676448  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4528  major facilitator superfamily transporter 4- hydroxybenzoate transporter  32.35 
 
 		 466 aa  187  4e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000028085  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38560  putative MFS transporter  35.71 
 
 		 450 aa  186  6e-46  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.020424  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2095  major facilitator superfamily MFS_1  33.41 
 
 		 447 aa  186  6e-46  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2718  major facilitator superfamily aromatic acid transporter  33.87 
 
 		 445 aa  186  6e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0133806  normal  0.187148 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1885  major facilitator transporter  36.42 
 
 		 453 aa  186  8e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.211239 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0149  major facilitator superfamily transporter  37.13 
 
 		 441 aa  186  1.0000000000000001e-45  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00293447 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0700  major facilitator transporter  33.26 
 
 		 453 aa  185  1.0000000000000001e-45  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4063  major facilitator superfamily MFS_1  36.51 
 
 		 461 aa  184  2.0000000000000003e-45  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4030  DNA-cytosine methyltransferase  33.67 
 
 		 455 aa  185  2.0000000000000003e-45  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4243  major facilitator transporter  34.43 
 
 		 455 aa  184  3e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.104244  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1137  major facilitator transporter  34.84 
 
 		 457 aa  183  7e-45  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2507  benzoate transport  31.44 
 
 		 451 aa  182  9.000000000000001e-45  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>