More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_1523 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009253  Dred_1523  major facilitator transporter  100 
 
 
438 aa  857    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.295641  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2413  major facilitator transporter  54.32 
 
 
447 aa  484  1e-135  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000787137  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1482  major facilitator superfamily MFS_1  53.22 
 
 
451 aa  469  1.0000000000000001e-131  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000115751  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5212  major facilitator transporter  51.21 
 
 
399 aa  398  9.999999999999999e-111  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000114177  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5543  major facilitator family transporter  50.24 
 
 
399 aa  397  1e-109  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000723204  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5547  major facilitator family transporter  50.47 
 
 
399 aa  395  1e-109  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.00000000869498  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5115  major facilitator family transporter  50.84 
 
 
399 aa  395  1e-109  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000159613  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5409  major facilitator family transporter  50 
 
 
399 aa  395  1e-109  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000000725853  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5271  major facilitator family transporter  50.72 
 
 
399 aa  394  1e-108  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000000222558  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5098  major facilitator family transporter  50.72 
 
 
399 aa  394  1e-108  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.20566e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5599  major facilitator family transporter  50.96 
 
 
399 aa  394  1e-108  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000105464  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5513  major facilitator family transporter  50.72 
 
 
399 aa  394  1e-108  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5668  major facilitator family transporter  50.72 
 
 
399 aa  394  1e-108  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.0000000000480591  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3933  major facilitator transporter  49.76 
 
 
399 aa  385  1e-106  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000233422  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3497  major facilitator superfamily MFS_1  51.08 
 
 
398 aa  384  1e-105  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3374  major facilitator superfamily MFS_1  49.88 
 
 
398 aa  377  1e-103  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000527195  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2255  major facilitator superfamily MFS_1  49.76 
 
 
473 aa  372  1e-102  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4019  major facilitator superfamily MFS_1  51.49 
 
 
435 aa  366  1e-100  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.000381325  normal  0.201783 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29790  sugar phosphate permease  45.53 
 
 
485 aa  366  1e-100  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1377  major facilitator superfamily MFS_1  52.74 
 
 
445 aa  363  4e-99  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21330  sugar phosphate permease  47.3 
 
 
477 aa  358  7e-98  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.428425  hitchhiker  0.00018034 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0897  major facilitator superfamily MFS_1  49.87 
 
 
447 aa  338  9.999999999999999e-92  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0894914  normal  0.147269 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4638  major facilitator superfamily MFS_1  37.7 
 
 
451 aa  324  2e-87  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000178504  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0245  putative permease  48.38 
 
 
449 aa  311  1e-83  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0461827  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2078  major facilitator superfamily MFS_1  42.86 
 
 
404 aa  311  1e-83  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19270  putative MFS transporter  39.29 
 
 
455 aa  310  4e-83  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.149627  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1660  MFS family transporter  38.17 
 
 
455 aa  308  9e-83  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1595  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  38.57 
 
 
472 aa  307  3e-82  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5053  major facilitator superfamily MFS_1  38.57 
 
 
472 aa  305  1.0000000000000001e-81  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.122247 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8056  major facilitator superfamily MFS_1  38.78 
 
 
451 aa  303  3.0000000000000004e-81  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2088  major facilitator superfamily MFS_1  39.82 
 
 
456 aa  299  6e-80  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.565943 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3311  major facilitator transporter  38.15 
 
 
474 aa  296  3e-79  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.799238  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5172  major facilitator transporter  38.46 
 
 
474 aa  293  4e-78  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0809503 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5109  major facilitator transporter  38.46 
 
 
474 aa  293  5e-78  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0670  general substrate transporter  37.5 
 
 
459 aa  292  7e-78  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.753041 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3259  major facilitator transporter  38.46 
 
 
474 aa  292  7e-78  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.331503  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1841  major facilitator family transporter  37.56 
 
 
478 aa  289  5.0000000000000004e-77  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0539  major facilitator transporter  37.56 
 
 
473 aa  289  7e-77  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1931  major facilitator superfamily permease  37.56 
 
 
478 aa  289  8e-77  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0979116  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1431  major facilitator family transporter  37.56 
 
 
478 aa  288  1e-76  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.475934  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0471  major facilitator family transporter  37.56 
 
 
478 aa  288  1e-76  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0177  major facilitator family transporter  37.56 
 
 
478 aa  288  1e-76  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0379  major facilitator family transporter  37.56 
 
 
478 aa  288  2e-76  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2754  major facilitator superfamily MFS_1  38.58 
 
 
465 aa  287  2e-76  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.182715  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0911  major facilitator family transporter  37.33 
 
 
478 aa  286  4e-76  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.577596  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02027  metabolite transporter  37.78 
 
 
476 aa  285  9e-76  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.158134 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1875  major facilitator transporter  37.1 
 
 
459 aa  281  1e-74  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.473892  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0911  major facilitator superfamily permease  37.74 
 
 
388 aa  280  3e-74  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.000338401  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5178  major facilitator transporter  36.2 
 
 
457 aa  279  7e-74  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3533  major facilitator transporter  38.91 
 
 
473 aa  278  1e-73  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2900  major facilitator transporter  36.73 
 
 
514 aa  276  7e-73  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.473738  normal  0.0138886 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0547  major facilitator superfamily transporter  35.71 
 
 
456 aa  270  2.9999999999999997e-71  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.392915  normal  0.285749 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4651  major facilitator superfamily MFS_1  37 
 
 
470 aa  270  4e-71  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2073  major facilitator superfamily transporter  37.58 
 
 
467 aa  265  8.999999999999999e-70  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0013865 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1414  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  37 
 
 
468 aa  259  6e-68  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000198546  normal  0.095851 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1683  major facilitator transporter  38.11 
 
 
415 aa  254  2.0000000000000002e-66  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.249309  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1561  major facilitator transporter  36.4 
 
 
509 aa  254  3e-66  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.141298  normal  0.174962 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1326  major facilitator transporter  36.34 
 
 
464 aa  234  3e-60  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.367254  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0532  major facilitator family transporter  36.04 
 
 
436 aa  232  8.000000000000001e-60  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3564  major facilitator transporter  35.36 
 
 
436 aa  231  2e-59  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0462  major facilitator family transporter  35.81 
 
 
436 aa  231  3e-59  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.450318  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2518  major facilitator transporter  34.5 
 
 
437 aa  228  2e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1671  major facilitator transporter  34.66 
 
 
381 aa  228  2e-58  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    decreased coverage  0.0000914056 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1856  major facilitator transporter  33.25 
 
 
438 aa  227  3e-58  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3924  major facilitator superfamily transporter  34.19 
 
 
438 aa  226  5.0000000000000005e-58  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.496152  normal  0.0457831 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4993  MFS family membrane efflux protein  34.5 
 
 
526 aa  222  8e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.521864 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1972  major facilitator transporter  37.05 
 
 
372 aa  220  3.9999999999999997e-56  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.106436  hitchhiker  0.000000141049 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1266  major facilitator transporter  34.63 
 
 
422 aa  219  7.999999999999999e-56  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.693096  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1543  major facilitator transporter  37.01 
 
 
382 aa  218  1e-55  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.0259552 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1189  major facilitator transporter  34.63 
 
 
422 aa  218  2e-55  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00252456  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1076  major facilitator transporter  37.32 
 
 
382 aa  217  2.9999999999999998e-55  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.197988  normal  0.0589295 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1992  major facilitator transporter  37.2 
 
 
436 aa  214  1.9999999999999998e-54  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.252047  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1010  major facilitator family transporter  36.29 
 
 
398 aa  214  3.9999999999999995e-54  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6599  major facilitator superfamily MFS_1  33.71 
 
 
459 aa  208  2e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.332731  normal  0.158495 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3580  hypothetical protein  33.11 
 
 
478 aa  207  4e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.024372  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0285  major facilitator superfamily sugar transporter  31.32 
 
 
464 aa  207  4e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.192742  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3242  major facilitator superfamily MFS_1  50 
 
 
539 aa  206  7e-52  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  hitchhiker  0.00325514  normal  0.76951 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0602  major facilitator superfamily MFS_1  32.96 
 
 
459 aa  206  9e-52  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0090  major facilitator transporter  32.65 
 
 
422 aa  204  2e-51  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.000497214  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0070  MFS permease  33.63 
 
 
460 aa  202  9e-51  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3160  major facilitator superfamily MFS_1  33.63 
 
 
461 aa  201  1.9999999999999998e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0312386 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0914  major facilitator transporter  31.29 
 
 
434 aa  200  3.9999999999999996e-50  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00481205  normal  0.205021 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3655  major facilitator superfamily MFS_1  29.06 
 
 
447 aa  200  5e-50  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.304643  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1414  major facilitator transporter  33.16 
 
 
424 aa  199  6e-50  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5283  major facilitator transporter  32.66 
 
 
463 aa  199  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.591426  normal  0.763827 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1548  major facilitator superfamily MFS_1  33.76 
 
 
380 aa  197  3e-49  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5083  major facilitator transporter  35.05 
 
 
437 aa  197  4.0000000000000005e-49  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.418338  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0613  major facilitator superfamily MFS_1  32.06 
 
 
473 aa  195  1e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0274336 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7070  major facilitator superfamily MFS_1  32.06 
 
 
467 aa  194  2e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.710966  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4498  major facilitator superfamily MFS_1  30.38 
 
 
467 aa  193  5e-48  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0152994  normal  0.24714 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4630  major facilitator superfamily MFS_1  30.38 
 
 
467 aa  193  5e-48  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.234892  hitchhiker  0.00910919 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0186  major facilitator transporter  31.84 
 
 
479 aa  192  8e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5972  major facilitator transporter  31.22 
 
 
462 aa  192  1e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4087  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  33.01 
 
 
468 aa  192  1e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.281632  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0987  major facilitator superfamily transporter metabolite/H(+) symporter  34.55 
 
 
461 aa  192  1e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.496425 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1318  major facilitator family transporter  31.91 
 
 
468 aa  192  1e-47  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1490  major facilitator family transporter  31.53 
 
 
468 aa  191  2e-47  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0970  major facilitator superfamily transporter metabolite/H(+) symporter  33.86 
 
 
470 aa  191  2e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00262609  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1166  major facilitator superfamily MFS_1  32.34 
 
 
450 aa  190  5.999999999999999e-47  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000374507 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6268  major facilitator transporter  31 
 
 
462 aa  189  1e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.492492 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>