More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_19270 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009656  PSPA7_1660  MFS family transporter  94.95 
 
 
455 aa  834    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0670  general substrate transporter  80.62 
 
 
459 aa  691    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.753041 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19270  putative MFS transporter  100 
 
 
455 aa  883    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.149627  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0379  major facilitator family transporter  70.91 
 
 
478 aa  616  1e-175  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0911  major facilitator family transporter  70.47 
 
 
478 aa  612  9.999999999999999e-175  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.577596  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0471  major facilitator family transporter  70.69 
 
 
478 aa  613  9.999999999999999e-175  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0177  major facilitator family transporter  70.69 
 
 
478 aa  613  9.999999999999999e-175  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1431  major facilitator family transporter  70.69 
 
 
478 aa  613  9.999999999999999e-175  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.475934  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1931  major facilitator superfamily permease  70.69 
 
 
478 aa  613  9.999999999999999e-175  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0979116  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1841  major facilitator family transporter  70.69 
 
 
478 aa  613  9.999999999999999e-175  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0539  major facilitator transporter  69.89 
 
 
473 aa  605  9.999999999999999e-173  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5109  major facilitator transporter  70.18 
 
 
474 aa  606  9.999999999999999e-173  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5172  major facilitator transporter  70.11 
 
 
474 aa  604  9.999999999999999e-173  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0809503 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3259  major facilitator transporter  69.96 
 
 
474 aa  603  1.0000000000000001e-171  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.331503  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02027  metabolite transporter  72.2 
 
 
476 aa  600  1e-170  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.158134 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3311  major facilitator transporter  70.05 
 
 
474 aa  598  1e-170  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.799238  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5053  major facilitator superfamily MFS_1  68.89 
 
 
472 aa  594  1e-168  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.122247 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1595  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  69.11 
 
 
472 aa  593  1e-168  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2073  major facilitator superfamily transporter  70.13 
 
 
467 aa  588  1e-167  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0013865 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3533  major facilitator transporter  71.08 
 
 
473 aa  579  1e-164  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5178  major facilitator transporter  61.57 
 
 
457 aa  535  1e-151  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4638  major facilitator superfamily MFS_1  58.04 
 
 
451 aa  525  1e-148  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000178504  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8056  major facilitator superfamily MFS_1  58.35 
 
 
451 aa  506  9.999999999999999e-143  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1010  major facilitator family transporter  70.88 
 
 
398 aa  476  1e-133  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2900  major facilitator transporter  53.07 
 
 
514 aa  450  1e-125  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.473738  normal  0.0138886 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1561  major facilitator transporter  46.67 
 
 
509 aa  359  5e-98  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.141298  normal  0.174962 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2413  major facilitator transporter  39.96 
 
 
447 aa  328  1.0000000000000001e-88  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000787137  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1482  major facilitator superfamily MFS_1  39.91 
 
 
451 aa  320  3e-86  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000115751  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1523  major facilitator transporter  39.29 
 
 
438 aa  296  7e-79  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.295641  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2088  major facilitator superfamily MFS_1  36 
 
 
456 aa  284  2.0000000000000002e-75  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.565943 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2754  major facilitator superfamily MFS_1  39.82 
 
 
465 aa  276  5e-73  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.182715  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2255  major facilitator superfamily MFS_1  35.7 
 
 
473 aa  269  8e-71  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4651  major facilitator superfamily MFS_1  36.2 
 
 
470 aa  267  2.9999999999999995e-70  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1414  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  37.11 
 
 
468 aa  266  5e-70  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000198546  normal  0.095851 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21330  sugar phosphate permease  36.3 
 
 
477 aa  261  2e-68  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.428425  hitchhiker  0.00018034 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4019  major facilitator superfamily MFS_1  36.89 
 
 
435 aa  260  3e-68  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.000381325  normal  0.201783 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29790  sugar phosphate permease  34.89 
 
 
485 aa  256  5e-67  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5409  major facilitator family transporter  34.64 
 
 
399 aa  256  6e-67  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000000725853  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3374  major facilitator superfamily MFS_1  34.34 
 
 
398 aa  256  7e-67  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000527195  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0547  major facilitator superfamily transporter  33.77 
 
 
456 aa  256  7e-67  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.392915  normal  0.285749 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3497  major facilitator superfamily MFS_1  35.25 
 
 
398 aa  255  9e-67  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5547  major facilitator family transporter  33.95 
 
 
399 aa  255  1.0000000000000001e-66  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.00000000869498  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5115  major facilitator family transporter  33.72 
 
 
399 aa  255  1.0000000000000001e-66  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000159613  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5599  major facilitator family transporter  33.72 
 
 
399 aa  255  1.0000000000000001e-66  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000105464  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5271  major facilitator family transporter  33.95 
 
 
399 aa  254  2.0000000000000002e-66  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000000222558  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5098  major facilitator family transporter  33.95 
 
 
399 aa  254  2.0000000000000002e-66  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.20566e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5513  major facilitator family transporter  33.95 
 
 
399 aa  254  2.0000000000000002e-66  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5668  major facilitator family transporter  33.95 
 
 
399 aa  254  2.0000000000000002e-66  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.0000000000480591  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3933  major facilitator transporter  33.72 
 
 
399 aa  254  2.0000000000000002e-66  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000233422  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5212  major facilitator transporter  33.95 
 
 
399 aa  253  4.0000000000000004e-66  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000114177  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5543  major facilitator family transporter  33.72 
 
 
399 aa  253  6e-66  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000723204  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0897  major facilitator superfamily MFS_1  35.27 
 
 
447 aa  248  2e-64  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0894914  normal  0.147269 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0245  putative permease  36.29 
 
 
449 aa  247  4e-64  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0461827  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1875  major facilitator transporter  33.19 
 
 
459 aa  239  8e-62  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.473892  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1377  major facilitator superfamily MFS_1  36.34 
 
 
445 aa  234  3e-60  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3924  major facilitator superfamily transporter  33.63 
 
 
438 aa  233  4.0000000000000004e-60  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.496152  normal  0.0457831 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0602  major facilitator superfamily MFS_1  33.33 
 
 
459 aa  231  1e-59  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5283  major facilitator transporter  32.15 
 
 
463 aa  230  5e-59  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.591426  normal  0.763827 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1856  major facilitator transporter  32.53 
 
 
438 aa  229  7e-59  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2078  major facilitator superfamily MFS_1  33.1 
 
 
404 aa  228  1e-58  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0285  major facilitator superfamily sugar transporter  32.44 
 
 
464 aa  229  1e-58  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.192742  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2518  major facilitator transporter  33.64 
 
 
437 aa  226  5.0000000000000005e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4993  MFS family membrane efflux protein  32.77 
 
 
526 aa  224  3e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.521864 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0070  MFS permease  32.14 
 
 
460 aa  219  1e-55  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0532  major facilitator family transporter  32.59 
 
 
436 aa  217  4e-55  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3564  major facilitator transporter  33.9 
 
 
436 aa  216  7e-55  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1326  major facilitator transporter  38.1 
 
 
464 aa  216  8e-55  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.367254  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0462  major facilitator family transporter  32.37 
 
 
436 aa  215  9.999999999999999e-55  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.450318  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3160  major facilitator superfamily MFS_1  32.15 
 
 
461 aa  211  2e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0312386 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0828  major facilitator superfamily aromatic acid/H(+) symporter  33.26 
 
 
450 aa  208  1e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.420618  normal  0.255495 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0528  major facilitator transporter  33.12 
 
 
467 aa  209  1e-52  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0826405  hitchhiker  0.00770286 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0896  major facilitator superfamily MFS_1  31.52 
 
 
462 aa  207  3e-52  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5172  major facilitator superfamily MFS_1  32.3 
 
 
466 aa  207  4e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1683  major facilitator transporter  36.32 
 
 
415 aa  206  9e-52  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.249309  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1992  major facilitator transporter  37.25 
 
 
436 aa  203  4e-51  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.252047  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5083  major facilitator transporter  33.73 
 
 
437 aa  201  1.9999999999999998e-50  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.418338  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6599  major facilitator superfamily MFS_1  30.16 
 
 
459 aa  198  2.0000000000000003e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.332731  normal  0.158495 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0909  major facilitator transporter  34.28 
 
 
455 aa  197  3e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0703326  normal  0.129634 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3580  hypothetical protein  33.48 
 
 
478 aa  196  8.000000000000001e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.024372  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1671  major facilitator transporter  30.36 
 
 
381 aa  194  2e-48  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    decreased coverage  0.0000914056 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1318  major facilitator family transporter  32.68 
 
 
468 aa  194  3e-48  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0613  major facilitator superfamily MFS_1  29.62 
 
 
473 aa  193  4e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0274336 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0668  major facilitator transporter  32.9 
 
 
474 aa  193  6e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00169534  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3530  major facilitator transporter  34.4 
 
 
469 aa  192  1e-47  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.229516  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3653  major facilitator superfamily MFS_1  29.2 
 
 
446 aa  192  1e-47  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0382  major facilitator transporter  31.34 
 
 
472 aa  192  1e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.660441 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4627  major facilitator transporter  31.56 
 
 
475 aa  192  1e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3453  major facilitator transporter  32.02 
 
 
472 aa  191  2e-47  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0499831  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5972  major facilitator transporter  30.36 
 
 
462 aa  191  2.9999999999999997e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0987  major facilitator superfamily transporter metabolite/H(+) symporter  30 
 
 
461 aa  190  5e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.496425 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0308  major facilitator family transporter  32.11 
 
 
474 aa  189  5.999999999999999e-47  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0584  major facilitator family transporter  32.11 
 
 
474 aa  189  5.999999999999999e-47  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.789618  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1325  major facilitator family transporter  32.11 
 
 
468 aa  189  7e-47  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.68992  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0983  major facilitator family transporter  32.11 
 
 
468 aa  189  7e-47  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.387482  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2505  major facilitator family transporter  32.11 
 
 
468 aa  189  7e-47  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1245  major facilitator family transporter  32.11 
 
 
468 aa  189  7e-47  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0920  major facilitator superfamily transporter metabolite/H(+) symporter  32.2 
 
 
487 aa  189  7e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.697574 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0967  major facilitator superfamily aromatic acid/H(+) symporter  31.22 
 
 
462 aa  189  7e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5266  major facilitator transporter  31.55 
 
 
472 aa  189  8e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3101  major facilitator transporter  31.55 
 
 
472 aa  189  8e-47  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.380275  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>