More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_B0285 on replicon NC_007952
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007952  Bxe_B0285  major facilitator superfamily sugar transporter  100 
 
 
464 aa  925    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.192742  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3358  major facilitator superfamily MFS_1  41.5 
 
 
459 aa  356  5e-97  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0792  major facilitator superfamily MFS_1  35.08 
 
 
458 aa  276  5e-73  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.753449  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6200  major facilitator transporter  36.89 
 
 
492 aa  267  2e-70  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0622411 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4647  major facilitator superfamily MFS_1  36.22 
 
 
488 aa  265  1e-69  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.866665  normal  0.46173 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0920  major facilitator superfamily transporter metabolite/H(+) symporter  36.59 
 
 
487 aa  263  3e-69  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.697574 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3453  major facilitator transporter  36 
 
 
472 aa  260  3e-68  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0499831  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4627  major facilitator transporter  35.56 
 
 
475 aa  259  6e-68  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0382  major facilitator transporter  35.33 
 
 
472 aa  259  8e-68  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.660441 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5007  major facilitator transporter  35.33 
 
 
472 aa  259  8e-68  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5153  major facilitator transporter  35.33 
 
 
475 aa  259  8e-68  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.507557  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3101  major facilitator transporter  35.33 
 
 
472 aa  259  8e-68  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.380275  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5266  major facilitator transporter  35.33 
 
 
472 aa  259  8e-68  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4015  major facilitator superfamily MFS_1  35.03 
 
 
477 aa  258  2e-67  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4090  major facilitator superfamily metabolite(sugar)/H(+) symporter  34.73 
 
 
471 aa  251  2e-65  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.94274  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0910  major facilitator family transporter  35.16 
 
 
472 aa  249  6e-65  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.367874  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1483  major facilitator superfamily MFS_1  35.79 
 
 
456 aa  249  7e-65  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2070  major facilitator transporter  35.38 
 
 
472 aa  249  8e-65  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.376866  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0486  major facilitator family transporter  35.16 
 
 
472 aa  248  2e-64  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0312823  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6205  major facilitator superfamily MFS_1  35.38 
 
 
471 aa  248  2e-64  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0788  major facilitator family transporter  34.95 
 
 
472 aa  247  4e-64  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.509193  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1973  major facilitator transporter  34.95 
 
 
472 aa  247  4e-64  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0555  major facilitator family transporter  34.95 
 
 
472 aa  247  4e-64  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2088  major facilitator superfamily MFS_1  35.94 
 
 
456 aa  246  4.9999999999999997e-64  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.565943 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1898  major facilitator superfamily MFS_1  35.03 
 
 
448 aa  246  8e-64  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0808  major facilitator superfamily MFS_1  33.77 
 
 
494 aa  243  5e-63  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0613  major facilitator superfamily MFS_1  33.11 
 
 
473 aa  232  1e-59  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0274336 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6611  major facilitator transporter  33.33 
 
 
479 aa  229  9e-59  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.410873  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4087  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  32.96 
 
 
468 aa  229  1e-58  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.281632  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19270  putative MFS transporter  32.44 
 
 
455 aa  229  1e-58  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.149627  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1660  MFS family transporter  32.89 
 
 
455 aa  226  6e-58  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3530  major facilitator transporter  33.92 
 
 
469 aa  226  9e-58  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.229516  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5986  major facilitator transporter  32.6 
 
 
479 aa  225  1e-57  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6282  major facilitator transporter  32.6 
 
 
479 aa  225  2e-57  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.384913  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4860  major facilitator transporter  33.33 
 
 
487 aa  224  3e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0839463 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2063  major facilitator superfamily MFS_1  32.3 
 
 
479 aa  223  7e-57  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0432509  normal 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8056  major facilitator superfamily MFS_1  32.89 
 
 
451 aa  222  9.999999999999999e-57  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6599  major facilitator superfamily MFS_1  32.57 
 
 
459 aa  222  9.999999999999999e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.332731  normal  0.158495 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1268  MFS transporter  32.76 
 
 
487 aa  220  3e-56  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.916286  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0828  major facilitator superfamily aromatic acid/H(+) symporter  33.11 
 
 
450 aa  221  3e-56  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.420618  normal  0.255495 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4340  general substrate transporter  31.86 
 
 
477 aa  220  5e-56  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3036  major facilitator transporter  32.54 
 
 
487 aa  219  7e-56  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1717  major facilitator transporter  32.96 
 
 
488 aa  219  1e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5109  major facilitator transporter  35.02 
 
 
474 aa  217  2.9999999999999998e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2231  major facilitator family transporter  33.04 
 
 
482 aa  217  2.9999999999999998e-55  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1759  major facilitator superfamily MFS_1  32.08 
 
 
472 aa  217  4e-55  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0670  general substrate transporter  32.68 
 
 
459 aa  217  4e-55  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.753041 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5972  major facilitator transporter  32.52 
 
 
462 aa  217  4e-55  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5172  major facilitator transporter  35.02 
 
 
474 aa  216  7e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0809503 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5172  major facilitator superfamily MFS_1  32.96 
 
 
466 aa  216  7e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6268  major facilitator transporter  32.6 
 
 
462 aa  216  9e-55  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.492492 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1696  major facilitator transporter  32.66 
 
 
487 aa  215  9.999999999999999e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.4496  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2496  major facilitator family transporter  31.67 
 
 
472 aa  215  9.999999999999999e-55  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.206768  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2304  major facilitator transporter  31.93 
 
 
472 aa  215  9.999999999999999e-55  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.759044  normal  0.046264 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5178  major facilitator transporter  33.85 
 
 
457 aa  215  9.999999999999999e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2413  major facilitator transporter  32.96 
 
 
447 aa  215  9.999999999999999e-55  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000787137  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1217  major facilitator transporter  32.66 
 
 
487 aa  215  9.999999999999999e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.207678  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3259  major facilitator transporter  35.02 
 
 
474 aa  215  9.999999999999999e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.331503  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0528  major facilitator transporter  32.95 
 
 
467 aa  215  1.9999999999999998e-54  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0826405  hitchhiker  0.00770286 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0539  major facilitator transporter  34.15 
 
 
473 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1668  major facilitator transporter  32.66 
 
 
487 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.339414  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1604  major facilitator transporter  32.21 
 
 
485 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1269  major facilitator transporter  31.94 
 
 
466 aa  213  3.9999999999999995e-54  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0667  major facilitator family transporter  34.1 
 
 
494 aa  213  5.999999999999999e-54  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0482021  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1551  major facilitator transporter  32.14 
 
 
485 aa  213  7.999999999999999e-54  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.308182  normal  0.0914413 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6959  major facilitator transporter  32.08 
 
 
479 aa  213  7.999999999999999e-54  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0471  major facilitator family transporter  32.67 
 
 
478 aa  211  1e-53  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1431  major facilitator family transporter  32.67 
 
 
478 aa  211  1e-53  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.475934  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0177  major facilitator family transporter  32.67 
 
 
478 aa  211  1e-53  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1482  major facilitator superfamily MFS_1  30.82 
 
 
451 aa  211  2e-53  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000115751  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1841  major facilitator family transporter  32.67 
 
 
478 aa  211  2e-53  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1626  major facilitator transporter  31.76 
 
 
485 aa  211  2e-53  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.408436  normal  0.668079 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0463  major facilitator transporter  31.01 
 
 
448 aa  211  2e-53  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0213055  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1931  major facilitator superfamily permease  32.67 
 
 
478 aa  211  2e-53  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0979116  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0379  major facilitator family transporter  32.67 
 
 
478 aa  210  4e-53  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0896  major facilitator superfamily MFS_1  35.97 
 
 
462 aa  210  4e-53  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5053  major facilitator superfamily MFS_1  32.15 
 
 
472 aa  210  4e-53  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.122247 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1412  major facilitator transporter  33.26 
 
 
465 aa  210  4e-53  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0911  major facilitator family transporter  32.44 
 
 
478 aa  210  5e-53  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.577596  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4638  major facilitator superfamily MFS_1  29.6 
 
 
451 aa  210  5e-53  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000178504  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1414  major facilitator superfamily MFS_1  29.72 
 
 
444 aa  209  6e-53  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02027  metabolite transporter  32.9 
 
 
476 aa  208  1e-52  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.158134 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0668  major facilitator transporter  33.05 
 
 
474 aa  208  1e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00169534  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2754  major facilitator superfamily MFS_1  32.66 
 
 
465 aa  209  1e-52  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.182715  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0987  major facilitator superfamily transporter metabolite/H(+) symporter  32.67 
 
 
461 aa  208  2e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.496425 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1595  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  32.15 
 
 
472 aa  206  6e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4651  major facilitator superfamily MFS_1  31.84 
 
 
470 aa  206  7e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0881  major facilitator superfamily MFS_1  32.66 
 
 
448 aa  206  9e-52  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.202747  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3220  major facilitator superfamily MFS_1  33.48 
 
 
463 aa  203  4e-51  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0542188  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0970  major facilitator superfamily transporter metabolite/H(+) symporter  31.95 
 
 
470 aa  203  6e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00262609  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6853  major facilitator transporter  31.86 
 
 
430 aa  202  8e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.854567  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3311  major facilitator transporter  31.42 
 
 
474 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.799238  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5167  major facilitator superfamily MFS_1  34.36 
 
 
470 aa  201  3e-50  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0547  major facilitator superfamily transporter  28.73 
 
 
456 aa  201  3e-50  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.392915  normal  0.285749 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1414  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  28.79 
 
 
468 aa  201  3e-50  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000198546  normal  0.095851 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3533  major facilitator transporter  34.15 
 
 
473 aa  200  3.9999999999999996e-50  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1523  major facilitator transporter  31.32 
 
 
438 aa  197  2.0000000000000003e-49  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.295641  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0443  major facilitator superfamily MFS_1  30.7 
 
 
461 aa  198  2.0000000000000003e-49  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3193  major facilitator transporter  30.72 
 
 
472 aa  196  5.000000000000001e-49  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.9008 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0967  major facilitator superfamily aromatic acid/H(+) symporter  31.76 
 
 
462 aa  196  7e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>