More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_C0668 on replicon NC_007953
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007953  Bxe_C0668  major facilitator transporter  100 
 
 
474 aa  936    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00169534  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0792  major facilitator superfamily MFS_1  37.39 
 
 
458 aa  252  1e-65  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.753449  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4090  major facilitator superfamily metabolite(sugar)/H(+) symporter  34.27 
 
 
471 aa  228  2e-58  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.94274  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1483  major facilitator superfamily MFS_1  37.25 
 
 
456 aa  224  2e-57  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6205  major facilitator superfamily MFS_1  33.55 
 
 
471 aa  224  3e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5986  major facilitator transporter  33.55 
 
 
479 aa  216  7e-55  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6282  major facilitator transporter  33.33 
 
 
479 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.384913  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0285  major facilitator superfamily sugar transporter  33.05 
 
 
464 aa  213  7e-54  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.192742  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4860  major facilitator transporter  35.37 
 
 
487 aa  211  2e-53  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0839463 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4647  major facilitator superfamily MFS_1  35.5 
 
 
488 aa  211  3e-53  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.866665  normal  0.46173 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1626  major facilitator transporter  34.87 
 
 
485 aa  211  3e-53  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.408436  normal  0.668079 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0920  major facilitator superfamily transporter metabolite/H(+) symporter  35.27 
 
 
487 aa  209  1e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.697574 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1412  major facilitator transporter  35.54 
 
 
465 aa  208  1e-52  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1604  major facilitator transporter  35.11 
 
 
485 aa  209  1e-52  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1759  major facilitator superfamily MFS_1  34.12 
 
 
472 aa  207  3e-52  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0463  major facilitator transporter  34.06 
 
 
448 aa  207  4e-52  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0213055  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1551  major facilitator transporter  35.63 
 
 
485 aa  207  5e-52  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.308182  normal  0.0914413 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0808  major facilitator superfamily MFS_1  33.33 
 
 
494 aa  207  5e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1217  major facilitator transporter  35.32 
 
 
487 aa  206  7e-52  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.207678  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1696  major facilitator transporter  35.32 
 
 
487 aa  206  7e-52  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.4496  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6611  major facilitator transporter  33.04 
 
 
479 aa  205  2e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.410873  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1269  major facilitator transporter  32.27 
 
 
466 aa  204  4e-51  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4015  major facilitator superfamily MFS_1  34.14 
 
 
477 aa  203  5e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3193  major facilitator transporter  31.67 
 
 
472 aa  203  6e-51  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.9008 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6200  major facilitator transporter  34.57 
 
 
492 aa  202  8e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0622411 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1668  major facilitator transporter  35.07 
 
 
487 aa  202  9e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.339414  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2063  major facilitator superfamily MFS_1  33.65 
 
 
479 aa  198  2.0000000000000003e-49  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0432509  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19270  putative MFS transporter  33.62 
 
 
455 aa  197  3e-49  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.149627  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3453  major facilitator transporter  33.01 
 
 
472 aa  196  8.000000000000001e-49  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0499831  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0881  major facilitator superfamily MFS_1  33.01 
 
 
448 aa  195  2e-48  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.202747  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3101  major facilitator transporter  34.04 
 
 
472 aa  195  2e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.380275  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5007  major facilitator transporter  34.04 
 
 
472 aa  195  2e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5266  major facilitator transporter  34.04 
 
 
472 aa  195  2e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0382  major facilitator transporter  32.75 
 
 
472 aa  192  1e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.660441 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4627  major facilitator transporter  32.78 
 
 
475 aa  191  2e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5972  major facilitator transporter  31.47 
 
 
462 aa  191  2e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2304  major facilitator transporter  31.99 
 
 
472 aa  190  4e-47  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.759044  normal  0.046264 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5153  major facilitator transporter  32.54 
 
 
475 aa  191  4e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.507557  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6268  major facilitator transporter  31.18 
 
 
462 aa  189  9e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.492492 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1660  MFS family transporter  33.26 
 
 
455 aa  189  9e-47  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4340  general substrate transporter  30.6 
 
 
477 aa  188  2e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3530  major facilitator transporter  33.33 
 
 
469 aa  187  5e-46  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.229516  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2070  major facilitator transporter  33.33 
 
 
472 aa  185  2.0000000000000003e-45  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.376866  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2496  major facilitator family transporter  31.52 
 
 
472 aa  185  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.206768  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0486  major facilitator family transporter  33.1 
 
 
472 aa  184  4.0000000000000006e-45  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0312823  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0828  major facilitator superfamily aromatic acid/H(+) symporter  33.5 
 
 
450 aa  184  4.0000000000000006e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.420618  normal  0.255495 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0555  major facilitator family transporter  33.1 
 
 
472 aa  183  6e-45  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0788  major facilitator family transporter  33.1 
 
 
472 aa  183  6e-45  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.509193  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1973  major facilitator transporter  33.1 
 
 
472 aa  183  6e-45  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1717  major facilitator transporter  33.1 
 
 
488 aa  182  1e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1595  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  31.37 
 
 
472 aa  182  1e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6959  major facilitator transporter  32.17 
 
 
479 aa  181  2e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0910  major facilitator family transporter  32.13 
 
 
472 aa  181  2e-44  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.367874  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6599  major facilitator superfamily MFS_1  30.29 
 
 
459 aa  180  4e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.332731  normal  0.158495 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0987  major facilitator superfamily transporter metabolite/H(+) symporter  29.85 
 
 
461 aa  180  4.999999999999999e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.496425 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00188  MFS transporter  33.05 
 
 
471 aa  179  7e-44  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.103216  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4638  major facilitator superfamily MFS_1  29.87 
 
 
451 aa  179  8e-44  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000178504  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2231  major facilitator family transporter  30.37 
 
 
482 aa  179  8e-44  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5053  major facilitator superfamily MFS_1  30.98 
 
 
472 aa  179  1e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.122247 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5172  major facilitator superfamily MFS_1  31.78 
 
 
466 aa  178  2e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5109  major facilitator transporter  31.36 
 
 
474 aa  176  6e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5172  major facilitator transporter  31.28 
 
 
474 aa  176  7e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0809503 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5178  major facilitator transporter  30.43 
 
 
457 aa  176  9e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0667  major facilitator family transporter  33.93 
 
 
494 aa  175  9.999999999999999e-43  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0482021  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3259  major facilitator transporter  31.36 
 
 
474 aa  176  9.999999999999999e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.331503  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3036  major facilitator transporter  30.83 
 
 
487 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1268  MFS transporter  30.63 
 
 
487 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.916286  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0443  major facilitator superfamily MFS_1  32.34 
 
 
461 aa  174  2.9999999999999996e-42  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0539  major facilitator transporter  31.14 
 
 
473 aa  172  1e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3311  major facilitator transporter  31.47 
 
 
474 aa  170  5e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.799238  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6853  major facilitator transporter  31.16 
 
 
430 aa  170  5e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.854567  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0613  major facilitator superfamily MFS_1  29.55 
 
 
473 aa  170  6e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0274336 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0670  general substrate transporter  31.84 
 
 
459 aa  168  2e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.753041 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0967  major facilitator superfamily aromatic acid/H(+) symporter  28.66 
 
 
462 aa  168  2e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4087  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  30.22 
 
 
468 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.281632  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2413  major facilitator transporter  30.12 
 
 
447 aa  166  5.9999999999999996e-40  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000787137  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2576  major facilitator transporter  29.84 
 
 
475 aa  164  2.0000000000000002e-39  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.634768  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1999  major facilitator family transporter  29.57 
 
 
459 aa  164  4.0000000000000004e-39  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0702699  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1857  major facilitator transporter  29.57 
 
 
459 aa  164  4.0000000000000004e-39  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.526363  hitchhiker  0.0000247936 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1860  major facilitator family transporter  29.87 
 
 
459 aa  164  5.0000000000000005e-39  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0174535  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1931  major facilitator superfamily permease  30.55 
 
 
478 aa  163  7e-39  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0979116  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02027  metabolite transporter  30.82 
 
 
476 aa  163  7e-39  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.158134 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0177  major facilitator family transporter  30.55 
 
 
478 aa  162  9e-39  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0471  major facilitator family transporter  30.55 
 
 
478 aa  162  9e-39  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1431  major facilitator family transporter  30.55 
 
 
478 aa  162  9e-39  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.475934  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2073  major facilitator superfamily transporter  31.54 
 
 
467 aa  162  1e-38  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0013865 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0379  major facilitator family transporter  30.55 
 
 
478 aa  162  1e-38  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1841  major facilitator family transporter  30.55 
 
 
478 aa  162  1e-38  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8056  major facilitator superfamily MFS_1  30.22 
 
 
451 aa  161  2e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0911  major facilitator family transporter  30.46 
 
 
478 aa  161  3e-38  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.577596  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3533  major facilitator transporter  31.6 
 
 
473 aa  159  7e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3220  major facilitator superfamily MFS_1  27.81 
 
 
463 aa  159  1e-37  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0542188  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2060  inner membrane metabolite transport protein YdjE  29.35 
 
 
459 aa  158  2e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0010058 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2499  major facilitator family transporter  29.79 
 
 
459 aa  156  8e-37  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.465931  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1867  major facilitator superfamily MFS_1  29.79 
 
 
459 aa  156  9e-37  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000517052  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1416  major facilitator family transporter  29.79 
 
 
459 aa  156  9e-37  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.888006  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3358  major facilitator superfamily MFS_1  27.77 
 
 
459 aa  155  1e-36  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0970  major facilitator superfamily transporter metabolite/H(+) symporter  28.14 
 
 
470 aa  154  4e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00262609  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01732  hypothetical protein  29.33 
 
 
459 aa  152  1e-35  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0528  major facilitator transporter  29.57 
 
 
467 aa  152  1e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0826405  hitchhiker  0.00770286 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>