More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_C0828 on replicon NC_007953
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007953  Bxe_C0828  major facilitator superfamily aromatic acid/H(+) symporter  100 
 
 
450 aa  885    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.420618  normal  0.255495 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0613  major facilitator superfamily MFS_1  55.53 
 
 
473 aa  497  1e-139  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0274336 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6599  major facilitator superfamily MFS_1  55.86 
 
 
459 aa  493  9.999999999999999e-139  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.332731  normal  0.158495 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4087  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  56.21 
 
 
468 aa  490  1e-137  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.281632  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5972  major facilitator transporter  52.35 
 
 
462 aa  461  1e-129  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6268  major facilitator transporter  52.57 
 
 
462 aa  462  1e-129  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.492492 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5167  major facilitator superfamily MFS_1  48.31 
 
 
470 aa  401  9.999999999999999e-111  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5172  major facilitator superfamily MFS_1  46.65 
 
 
466 aa  390  1e-107  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0190  major facilitator superfamily MFS_1  45.74 
 
 
460 aa  390  1e-107  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000521499 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0987  major facilitator superfamily transporter metabolite/H(+) symporter  46.19 
 
 
461 aa  387  1e-106  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.496425 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0970  major facilitator superfamily transporter metabolite/H(+) symporter  44.54 
 
 
470 aa  384  1e-105  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00262609  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0528  major facilitator transporter  46.55 
 
 
467 aa  384  1e-105  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0826405  hitchhiker  0.00770286 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5934  major facilitator transporter  50.34 
 
 
468 aa  380  1e-104  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0786793 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0974  major facilitator superfamily aromatic acid/H(+) symporter  45.62 
 
 
462 aa  379  1e-104  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00000109951  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1937  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  46.29 
 
 
474 aa  375  1e-103  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000000000973666  normal  0.0403058 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0896  major facilitator superfamily MFS_1  44.39 
 
 
462 aa  353  5e-96  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0270  major facilitator transporter  42.67 
 
 
477 aa  347  3e-94  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0250869  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0967  major facilitator superfamily aromatic acid/H(+) symporter  42.38 
 
 
462 aa  346  4e-94  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6853  major facilitator transporter  40.71 
 
 
430 aa  307  2.0000000000000002e-82  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.854567  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2028  major facilitator superfamily permease  35.28 
 
 
428 aa  265  2e-69  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1422  major facilitator family transporter  34.44 
 
 
452 aa  254  2.0000000000000002e-66  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.452173  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0129  putative permease  35.62 
 
 
459 aa  254  2.0000000000000002e-66  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.549779  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1863  major facilitator transporter  34.44 
 
 
452 aa  253  6e-66  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.369973  hitchhiker  0.0000261137 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01738  predicted transporter  34.44 
 
 
452 aa  252  1e-65  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.375088  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1873  major facilitator superfamily MFS_1  34.44 
 
 
452 aa  252  1e-65  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0070319  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01726  hypothetical protein  34.44 
 
 
452 aa  252  1e-65  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.448165  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1993  major facilitator family transporter  34.44 
 
 
452 aa  251  2e-65  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.863885  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2054  inner membrane metabolite transport protein YdjE  33.18 
 
 
452 aa  249  9e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.0842085 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1853  major facilitator family transporter  33.18 
 
 
452 aa  248  2e-64  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0220731  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4647  major facilitator superfamily MFS_1  35.1 
 
 
488 aa  239  6.999999999999999e-62  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.866665  normal  0.46173 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0920  major facilitator superfamily transporter metabolite/H(+) symporter  34.36 
 
 
487 aa  239  1e-61  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.697574 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3220  major facilitator superfamily MFS_1  32.52 
 
 
463 aa  234  3e-60  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0542188  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6200  major facilitator transporter  33.11 
 
 
492 aa  233  5e-60  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0622411 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0808  major facilitator superfamily MFS_1  35.68 
 
 
494 aa  231  2e-59  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2060  inner membrane metabolite transport protein YdjE  32.53 
 
 
459 aa  229  1e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0010058 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4638  major facilitator superfamily MFS_1  31.06 
 
 
451 aa  228  1e-58  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000178504  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1999  major facilitator family transporter  32.39 
 
 
459 aa  228  2e-58  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0702699  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1857  major facilitator transporter  32.39 
 
 
459 aa  228  2e-58  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.526363  hitchhiker  0.0000247936 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4015  major facilitator superfamily MFS_1  31.29 
 
 
477 aa  227  4e-58  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1860  major facilitator family transporter  32.17 
 
 
459 aa  226  5.0000000000000005e-58  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0174535  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5986  major facilitator transporter  32.75 
 
 
479 aa  225  1e-57  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6282  major facilitator transporter  32.75 
 
 
479 aa  225  1e-57  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.384913  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2413  major facilitator transporter  33.56 
 
 
447 aa  224  2e-57  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000787137  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2499  major facilitator family transporter  32.6 
 
 
459 aa  224  2e-57  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.465931  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2490  inner membrane metabolite transport protein YdjE  33.98 
 
 
416 aa  223  4e-57  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.754275 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0910  major facilitator family transporter  32.68 
 
 
472 aa  223  4e-57  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.367874  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1416  major facilitator family transporter  32.39 
 
 
459 aa  222  9e-57  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.888006  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0788  major facilitator family transporter  32.9 
 
 
472 aa  222  9e-57  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.509193  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1973  major facilitator transporter  32.9 
 
 
472 aa  222  9e-57  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0555  major facilitator family transporter  32.9 
 
 
472 aa  222  9e-57  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1867  major facilitator superfamily MFS_1  32.39 
 
 
459 aa  222  9.999999999999999e-57  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000517052  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0382  major facilitator transporter  32.76 
 
 
472 aa  222  9.999999999999999e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.660441 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5153  major facilitator transporter  32.76 
 
 
475 aa  222  9.999999999999999e-57  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.507557  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3453  major facilitator transporter  32.76 
 
 
472 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0499831  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0486  major facilitator family transporter  32.68 
 
 
472 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0312823  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4627  major facilitator transporter  32.76 
 
 
475 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01744  predicted transporter  32.17 
 
 
459 aa  220  3e-56  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.955946  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5266  major facilitator transporter  32.76 
 
 
472 aa  221  3e-56  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5007  major facilitator transporter  32.76 
 
 
472 aa  221  3e-56  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0285  major facilitator superfamily sugar transporter  33.11 
 
 
464 aa  221  3e-56  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.192742  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3101  major facilitator transporter  32.76 
 
 
472 aa  221  3e-56  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.380275  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01732  hypothetical protein  32.17 
 
 
459 aa  220  3e-56  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2070  major facilitator transporter  32.47 
 
 
472 aa  220  3.9999999999999997e-56  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.376866  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2063  major facilitator superfamily MFS_1  31.73 
 
 
479 aa  212  1e-53  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0432509  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5109  major facilitator transporter  34.15 
 
 
474 aa  210  5e-53  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6611  major facilitator transporter  31.8 
 
 
479 aa  210  5e-53  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.410873  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19270  putative MFS transporter  33.26 
 
 
455 aa  208  1e-52  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.149627  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0792  major facilitator superfamily MFS_1  31.56 
 
 
458 aa  207  3e-52  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.753449  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3259  major facilitator transporter  33.93 
 
 
474 aa  207  3e-52  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.331503  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5172  major facilitator transporter  33.78 
 
 
474 aa  207  4e-52  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0809503 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0539  major facilitator transporter  34.98 
 
 
473 aa  206  6e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1412  major facilitator transporter  33.83 
 
 
465 aa  206  6e-52  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8056  major facilitator superfamily MFS_1  32.73 
 
 
451 aa  206  1e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2231  major facilitator family transporter  31.8 
 
 
482 aa  205  1e-51  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02027  metabolite transporter  33.19 
 
 
476 aa  204  2e-51  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.158134 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1269  major facilitator transporter  32.52 
 
 
466 aa  204  3e-51  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1660  MFS family transporter  33.04 
 
 
455 aa  203  4e-51  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1595  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  33.26 
 
 
472 aa  203  4e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3530  major facilitator transporter  33.63 
 
 
469 aa  203  5e-51  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.229516  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5053  major facilitator superfamily MFS_1  32.59 
 
 
472 aa  202  9e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.122247 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0670  general substrate transporter  33.26 
 
 
459 aa  202  9e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.753041 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1717  major facilitator transporter  31.4 
 
 
488 aa  202  9e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3533  major facilitator transporter  34.15 
 
 
473 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4090  major facilitator superfamily metabolite(sugar)/H(+) symporter  30.35 
 
 
471 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.94274  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1482  major facilitator superfamily MFS_1  32.53 
 
 
451 aa  201  1.9999999999999998e-50  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000115751  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6205  major facilitator superfamily MFS_1  31.25 
 
 
471 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0667  major facilitator family transporter  34.25 
 
 
494 aa  201  3e-50  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0482021  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4340  general substrate transporter  31.07 
 
 
477 aa  200  5e-50  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5178  major facilitator transporter  32.82 
 
 
457 aa  199  7.999999999999999e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3311  major facilitator transporter  33.11 
 
 
474 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.799238  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0471  major facilitator family transporter  34 
 
 
478 aa  197  4.0000000000000005e-49  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1431  major facilitator family transporter  34 
 
 
478 aa  197  4.0000000000000005e-49  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.475934  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0177  major facilitator family transporter  34 
 
 
478 aa  197  4.0000000000000005e-49  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0379  major facilitator family transporter  34 
 
 
478 aa  197  5.000000000000001e-49  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1931  major facilitator superfamily permease  34 
 
 
478 aa  197  5.000000000000001e-49  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0979116  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2088  major facilitator superfamily MFS_1  31.33 
 
 
456 aa  196  5.000000000000001e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.565943 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1841  major facilitator family transporter  34 
 
 
478 aa  196  7e-49  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2255  major facilitator superfamily MFS_1  33.04 
 
 
473 aa  196  8.000000000000001e-49  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6959  major facilitator transporter  29.32 
 
 
479 aa  196  8.000000000000001e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1268  MFS transporter  31.14 
 
 
487 aa  196  9e-49  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.916286  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>