More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_1604 on replicon NC_008390
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007510  Bcep18194_A4860  major facilitator transporter  91.79 
 
 		 487 aa  858    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0839463 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1217  major facilitator transporter  91.79 
 
 		 487 aa  861    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.207678  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1604  major facilitator transporter  100 
 
 		 485 aa  961    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1668  major facilitator transporter  91.17 
 
 		 487 aa  853    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.339414  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1551  major facilitator transporter  86.8 
 
 		 485 aa  817    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.308182  normal  0.0914413 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1696  major facilitator transporter  91.79 
 
 		 487 aa  861    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.4496  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1626  major facilitator transporter  98.35 
 
 		 485 aa  946    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.408436  normal  0.668079 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0792  major facilitator superfamily MFS_1  46.52 
 
 		 458 aa  391  1e-107  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.753449  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1483  major facilitator superfamily MFS_1  46.99 
 
 		 456 aa  367  1e-100  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4015  major facilitator superfamily MFS_1  34.18 
 
 		 477 aa  271  2e-71  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6611  major facilitator transporter  33.78 
 
 		 479 aa  249  1e-64  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.410873  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6282  major facilitator transporter  33.19 
 
 		 479 aa  242  1e-62  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.384913  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5986  major facilitator transporter  32.76 
 
 		 479 aa  239  5.999999999999999e-62  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1759  major facilitator superfamily MFS_1  32.21 
 
 		 472 aa  235  1.0000000000000001e-60  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2231  major facilitator family transporter  32.68 
 
 		 482 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2063  major facilitator superfamily MFS_1  33.4 
 
 		 479 aa  234  3e-60  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0432509  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6200  major facilitator transporter  32.05 
 
 		 492 aa  233  4.0000000000000004e-60  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0622411 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1268  MFS transporter  32.47 
 
 		 487 aa  233  6e-60  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.916286  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0808  major facilitator superfamily MFS_1  33.61 
 
 		 494 aa  231  2e-59  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3036  major facilitator transporter  32.25 
 
 		 487 aa  231  3e-59  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4340  general substrate transporter  31.83 
 
 		 477 aa  229  7e-59  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6959  major facilitator transporter  32.58 
 
 		 479 aa  229  1e-58  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3453  major facilitator transporter  32.34 
 
 		 472 aa  228  2e-58  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0499831  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3193  major facilitator transporter  30.88 
 
 		 472 aa  228  2e-58  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.9008 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4647  major facilitator superfamily MFS_1  31.63 
 
 		 488 aa  225  1e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.866665  normal  0.46173 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0910  major facilitator family transporter  30.94 
 
 		 472 aa  225  2e-57  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.367874  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0920  major facilitator superfamily transporter metabolite/H(+) symporter  31.19 
 
 		 487 aa  225  2e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.697574 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4627  major facilitator transporter  31.91 
 
 		 475 aa  224  3e-57  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2496  major facilitator family transporter  31.42 
 
 		 472 aa  223  4e-57  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.206768  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5153  major facilitator transporter  31.91 
 
 		 475 aa  223  4e-57  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.507557  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2070  major facilitator transporter  31.26 
 
 		 472 aa  223  7e-57  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.376866  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1973  major facilitator transporter  31.06 
 
 		 472 aa  221  3e-56  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0788  major facilitator family transporter  31.06 
 
 		 472 aa  221  3e-56  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.509193  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0555  major facilitator family transporter  31.06 
 
 		 472 aa  221  3e-56  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0486  major facilitator family transporter  30.85 
 
 		 472 aa  220  5e-56  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0312823  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0382  major facilitator transporter  31.59 
 
 		 472 aa  220  5e-56  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.660441 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1412  major facilitator transporter  32.69 
 
 		 465 aa  219  7.999999999999999e-56  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6205  major facilitator superfamily MFS_1  31.99 
 
 		 471 aa  219  1e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4090  major facilitator superfamily metabolite(sugar)/H(+) symporter  32.68 
 
 		 471 aa  218  2e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.94274  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5007  major facilitator transporter  31.95 
 
 		 472 aa  217  2.9999999999999998e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5266  major facilitator transporter  31.95 
 
 		 472 aa  217  2.9999999999999998e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3101  major facilitator transporter  31.95 
 
 		 472 aa  217  2.9999999999999998e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.380275  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2304  major facilitator transporter  30.82 
 
 		 472 aa  216  9e-55  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.759044  normal  0.046264 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0285  major facilitator superfamily sugar transporter  32.21 
 
 		 464 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.192742  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3530  major facilitator transporter  33.48 
 
 		 469 aa  211  2e-53  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.229516  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0463  major facilitator transporter  32.88 
 
 		 448 aa  209  9e-53  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0213055  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0881  major facilitator superfamily MFS_1  32.29 
 
 		 448 aa  208  2e-52  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.202747  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1717  major facilitator transporter  31.65 
 
 		 488 aa  204  2e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0668  major facilitator transporter  35.02 
 
 		 474 aa  203  5e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00169534  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0667  major facilitator family transporter  31.5 
 
 		 494 aa  199  1.0000000000000001e-49  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0482021  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00188  MFS transporter  33.62 
 
 		 471 aa  198  1.0000000000000001e-49  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.103216  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1269  major facilitator transporter  30.82 
 
 		 466 aa  190  5e-47  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2576  major facilitator transporter  29.28 
 
 		 475 aa  189  1e-46  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.634768  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3358  major facilitator superfamily MFS_1  29.8 
 
 		 459 aa  187  2e-46  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5172  major facilitator superfamily MFS_1  31.56 
 
 		 466 aa  181  2e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1718  major facilitator transporter  28.89 
 
 		 473 aa  169  1e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.442738  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0896  major facilitator superfamily MFS_1  32.1 
 
 		 462 aa  164  4.0000000000000004e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0528  major facilitator transporter  29.78 
 
 		 467 aa  163  6e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0826405  hitchhiker  0.00770286 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6268  major facilitator transporter  29.65 
 
 		 462 aa  163  7e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.492492 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0987  major facilitator superfamily transporter metabolite/H(+) symporter  28.95 
 
 		 461 aa  163  8.000000000000001e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.496425 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5972  major facilitator transporter  29.58 
 
 		 462 aa  162  9e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4019  major facilitator superfamily MFS_1  36.03 
 
 		 435 aa  160  5e-38  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.000381325  normal  0.201783 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4876  major facilitator transporter  33.18 
 
 		 465 aa  159  2e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.116768 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0190  major facilitator superfamily MFS_1  28.47 
 
 		 460 aa  158  2e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000521499 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5109  major facilitator transporter  30.91 
 
 		 474 aa  157  3e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1660  MFS family transporter  29.64 
 
 		 455 aa  157  4e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1326  major facilitator transporter  32.37 
 
 		 464 aa  157  5.0000000000000005e-37  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.367254  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5172  major facilitator transporter  30.45 
 
 		 474 aa  156  9e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0809503 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2413  major facilitator transporter  28.98 
 
 		 447 aa  155  1e-36  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000787137  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3259  major facilitator transporter  30.68 
 
 		 474 aa  155  1e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.331503  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0443  major facilitator superfamily MFS_1  28.98 
 
 		 461 aa  155  2e-36  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1931  major facilitator superfamily permease  30.02 
 
 		 478 aa  155  2e-36  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0979116  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29790  sugar phosphate permease  31.09 
 
 		 485 aa  155  2e-36  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0911  major facilitator family transporter  30.02 
 
 		 478 aa  154  2.9999999999999998e-36  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.577596  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0970  major facilitator superfamily transporter metabolite/H(+) symporter  29.2 
 
 		 470 aa  154  2.9999999999999998e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00262609  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1841  major facilitator family transporter  30.02 
 
 		 478 aa  154  2.9999999999999998e-36  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0177  major facilitator family transporter  30.02 
 
 		 478 aa  154  4e-36  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0379  major facilitator family transporter  30.02 
 
 		 478 aa  154  4e-36  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0471  major facilitator family transporter  30.02 
 
 		 478 aa  154  4e-36  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1431  major facilitator family transporter  30.02 
 
 		 478 aa  154  4e-36  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.475934  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4638  major facilitator superfamily MFS_1  24.61 
 
 		 451 aa  154  5e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000178504  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0539  major facilitator transporter  30.45 
 
 		 473 aa  152  2e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5934  major facilitator transporter  32.19 
 
 		 468 aa  150  4e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0786793 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1937  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  27.75 
 
 		 474 aa  150  4e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000000000973666  normal  0.0403058 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19270  putative MFS transporter  28.94 
 
 		 455 aa  150  4e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.149627  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0129  putative permease  26.5 
 
 		 459 aa  150  6e-35  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.549779  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8056  major facilitator superfamily MFS_1  29.35 
 
 		 451 aa  150  6e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3311  major facilitator transporter  29.14 
 
 		 474 aa  149  8e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.799238  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1898  major facilitator superfamily MFS_1  27.07 
 
 		 448 aa  149  1.0000000000000001e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0967  major facilitator superfamily aromatic acid/H(+) symporter  27.64 
 
 		 462 aa  147  3e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0897  major facilitator superfamily MFS_1  32.39 
 
 		 447 aa  147  4.0000000000000006e-34  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0894914  normal  0.147269 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0670  general substrate transporter  30.33 
 
 		 459 aa  146  8.000000000000001e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.753041 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6599  major facilitator superfamily MFS_1  28.95 
 
 		 459 aa  145  2e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.332731  normal  0.158495 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5178  major facilitator transporter  27.23 
 
 		 457 aa  145  2e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2255  major facilitator superfamily MFS_1  30.88 
 
 		 473 aa  145  2e-33  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02027  metabolite transporter  29.74 
 
 		 476 aa  144  4e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.158134 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5167  major facilitator superfamily MFS_1  29.17 
 
 		 470 aa  144  4e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1414  major facilitator superfamily MFS_1  26.21 
 
 		 444 aa  143  6e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0613  major facilitator superfamily MFS_1  27.48 
 
 		 473 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0274336 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2073  major facilitator superfamily transporter  29.55 
 
 		 467 aa  142  9.999999999999999e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0013865 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>