More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ddes_1414 on replicon NC_011883
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011883  Ddes_1414  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 444 aa  907    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1898  major facilitator superfamily MFS_1  34.68 
 
 		 448 aa  270  5.9999999999999995e-71  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0285  major facilitator superfamily sugar transporter  29.72 
 
 		 464 aa  209  6e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.192742  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3358  major facilitator superfamily MFS_1  28.57 
 
 		 459 aa  182  1e-44  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4638  major facilitator superfamily MFS_1  28.35 
 
 		 451 aa  179  7e-44  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000178504  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6200  major facilitator transporter  29.4 
 
 		 492 aa  166  8e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0622411 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1422  major facilitator family transporter  29.29 
 
 		 452 aa  162  1e-38  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.452173  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2490  inner membrane metabolite transport protein YdjE  29.02 
 
 		 416 aa  160  3e-38  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.754275 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1873  major facilitator superfamily MFS_1  29.02 
 
 		 452 aa  160  4e-38  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0070319  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1863  major facilitator transporter  28.76 
 
 		 452 aa  159  1e-37  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.369973  hitchhiker  0.0000261137 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01738  predicted transporter  28.76 
 
 		 452 aa  158  2e-37  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.375088  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1660  MFS family transporter  27.55 
 
 		 455 aa  158  2e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01726  hypothetical protein  28.76 
 
 		 452 aa  158  2e-37  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.448165  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1993  major facilitator family transporter  28.76 
 
 		 452 aa  157  3e-37  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.863885  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1853  major facilitator family transporter  28.76 
 
 		 452 aa  157  3e-37  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0220731  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1482  major facilitator superfamily MFS_1  26.56 
 
 		 451 aa  157  5.0000000000000005e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000115751  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19270  putative MFS transporter  28.17 
 
 		 455 aa  156  6e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.149627  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5178  major facilitator transporter  26.17 
 
 		 457 aa  155  1e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0547  major facilitator superfamily transporter  26.77 
 
 		 456 aa  154  4e-36  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.392915  normal  0.285749 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0910  major facilitator family transporter  29.06 
 
 		 472 aa  153  5.9999999999999996e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.367874  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8056  major facilitator superfamily MFS_1  27.95 
 
 		 451 aa  153  7e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2060  inner membrane metabolite transport protein YdjE  26.49 
 
 		 459 aa  152  8.999999999999999e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0010058 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1857  major facilitator transporter  27.08 
 
 		 459 aa  152  1e-35  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.526363  hitchhiker  0.0000247936 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0486  major facilitator family transporter  28.83 
 
 		 472 aa  152  1e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0312823  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1999  major facilitator family transporter  27.08 
 
 		 459 aa  152  1e-35  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0702699  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2070  major facilitator transporter  28.83 
 
 		 472 aa  152  1e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.376866  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0555  major facilitator family transporter  28.6 
 
 		 472 aa  151  2e-35  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0788  major facilitator family transporter  28.6 
 
 		 472 aa  151  2e-35  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.509193  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1973  major facilitator transporter  28.6 
 
 		 472 aa  151  2e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1523  major facilitator transporter  27.29 
 
 		 438 aa  152  2e-35  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.295641  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1860  major facilitator family transporter  27.08 
 
 		 459 aa  152  2e-35  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0174535  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0920  major facilitator superfamily transporter metabolite/H(+) symporter  27.98 
 
 		 487 aa  150  5e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.697574 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4627  major facilitator transporter  28.31 
 
 		 475 aa  150  5e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5153  major facilitator transporter  28.31 
 
 		 475 aa  149  8e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.507557  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0808  major facilitator superfamily MFS_1  26.58 
 
 		 494 aa  149  8e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5172  major facilitator superfamily MFS_1  27.56 
 
 		 466 aa  149  1.0000000000000001e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0967  major facilitator superfamily aromatic acid/H(+) symporter  28.79 
 
 		 462 aa  149  1.0000000000000001e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1408  major facilitator transporter  26.67 
 
 		 484 aa  148  2.0000000000000003e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  decreased coverage  0.0000966462  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2054  inner membrane metabolite transport protein YdjE  27.58 
 
 		 452 aa  148  2.0000000000000003e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0842085 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0471  major facilitator family transporter  26.91 
 
 		 478 aa  147  3e-34  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2088  major facilitator superfamily MFS_1  26.52 
 
 		 456 aa  147  3e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.565943 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5007  major facilitator transporter  28.08 
 
 		 472 aa  147  3e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1841  major facilitator family transporter  26.91 
 
 		 478 aa  147  3e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0379  major facilitator family transporter  26.91 
 
 		 478 aa  147  3e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1431  major facilitator family transporter  26.91 
 
 		 478 aa  147  3e-34  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.475934  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1931  major facilitator superfamily permease  26.91 
 
 		 478 aa  147  3e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0979116  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3101  major facilitator transporter  28.08 
 
 		 472 aa  147  3e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.380275  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0177  major facilitator family transporter  26.91 
 
 		 478 aa  147  3e-34  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5266  major facilitator transporter  28.08 
 
 		 472 aa  147  3e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0911  major facilitator family transporter  26.91 
 
 		 478 aa  147  4.0000000000000006e-34  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.577596  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0382  major facilitator transporter  27.63 
 
 		 472 aa  147  4.0000000000000006e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.660441 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2413  major facilitator transporter  25.62 
 
 		 447 aa  147  5e-34  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000787137  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4647  major facilitator superfamily MFS_1  27.06 
 
 		 488 aa  146  9e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.866665  normal  0.46173 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4860  major facilitator transporter  24.39 
 
 		 487 aa  145  2e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0839463 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1412  major facilitator transporter  27.83 
 
 		 465 aa  144  2e-33  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1626  major facilitator transporter  26.36 
 
 		 485 aa  145  2e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.408436  normal  0.668079 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3453  major facilitator transporter  28.48 
 
 		 472 aa  144  3e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0499831  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0792  major facilitator superfamily MFS_1  25.29 
 
 		 458 aa  144  3e-33  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.753449  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1604  major facilitator transporter  26.21 
 
 		 485 aa  143  5e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1414  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  27.68 
 
 		 468 aa  142  8e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000198546  normal  0.095851 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3220  major facilitator superfamily MFS_1  27.32 
 
 		 463 aa  141  1.9999999999999998e-32  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0542188  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2754  major facilitator superfamily MFS_1  27.13 
 
 		 465 aa  140  3e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.182715  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4651  major facilitator superfamily MFS_1  25.5 
 
 		 470 aa  140  4.999999999999999e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4015  major facilitator superfamily MFS_1  26.99 
 
 		 477 aa  140  6e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0670  general substrate transporter  27.43 
 
 		 459 aa  140  6e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.753041 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01744  predicted transporter  26.82 
 
 		 459 aa  139  8.999999999999999e-32  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.955946  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01732  hypothetical protein  26.82 
 
 		 459 aa  139  8.999999999999999e-32  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2499  major facilitator family transporter  27.32 
 
 		 459 aa  139  8.999999999999999e-32  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.465931  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1867  major facilitator superfamily MFS_1  26.3 
 
 		 459 aa  139  1e-31  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000517052  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3655  major facilitator superfamily MFS_1  25.91 
 
 		 447 aa  139  1e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.304643  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1416  major facilitator family transporter  26.3 
 
 		 459 aa  139  1e-31  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.888006  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5053  major facilitator superfamily MFS_1  26.02 
 
 		 472 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.122247 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4087  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  27.39 
 
 		 468 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.281632  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5143  major facilitator transporter  26.19 
 
 		 482 aa  136  6.0000000000000005e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0987  major facilitator superfamily transporter metabolite/H(+) symporter  26.38 
 
 		 461 aa  137  6.0000000000000005e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.496425 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1217  major facilitator transporter  25.28 
 
 		 487 aa  137  6.0000000000000005e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.207678  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1696  major facilitator transporter  25.28 
 
 		 487 aa  137  6.0000000000000005e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.4496  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1668  major facilitator transporter  25.28 
 
 		 487 aa  136  9e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.339414  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0613  major facilitator superfamily MFS_1  28.13 
 
 		 473 aa  136  9e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0274336 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6268  major facilitator transporter  28.42 
 
 		 462 aa  136  9e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.492492 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1759  major facilitator superfamily MFS_1  27.1 
 
 		 472 aa  135  9.999999999999999e-31  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3311  major facilitator transporter  26.64 
 
 		 474 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.799238  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2576  major facilitator transporter  26.46 
 
 		 475 aa  135  1.9999999999999998e-30  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.634768  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3530  major facilitator transporter  27.15 
 
 		 469 aa  135  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.229516  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1551  major facilitator transporter  25.11 
 
 		 485 aa  134  3e-30  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.308182  normal  0.0914413 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4090  major facilitator superfamily metabolite(sugar)/H(+) symporter  25.71 
 
 		 471 aa  134  3e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.94274  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3410  major facilitator superfamily MFS_1  27.05 
 
 		 484 aa  134  3e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0539  major facilitator transporter  26.58 
 
 		 473 aa  134  3.9999999999999996e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1595  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  25.78 
 
 		 472 aa  134  3.9999999999999996e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6611  major facilitator transporter  25.78 
 
 		 479 aa  134  3.9999999999999996e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.410873  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0828  major facilitator superfamily aromatic acid/H(+) symporter  24.89 
 
 		 450 aa  134  5e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.420618  normal  0.255495 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5109  major facilitator transporter  27.17 
 
 		 474 aa  133  5e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5972  major facilitator transporter  28.17 
 
 		 462 aa  133  6e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5172  major facilitator transporter  26.23 
 
 		 474 aa  133  6.999999999999999e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0809503 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1717  major facilitator transporter  28.43 
 
 		 488 aa  133  7.999999999999999e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2900  major facilitator transporter  25.83 
 
 		 514 aa  132  7.999999999999999e-30  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.473738  normal  0.0138886 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2063  major facilitator superfamily MFS_1  26.6 
 
 		 479 aa  132  1.0000000000000001e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0432509  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5716  major facilitator transporter  27.52 
 
 		 482 aa  131  2.0000000000000002e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3259  major facilitator transporter  27.17 
 
 		 474 aa  132  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.331503  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02027  metabolite transporter  26.19 
 
 		 476 aa  131  3e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.158134 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>