More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_8056 on replicon NC_011887
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011887  Mnod_8056  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 451 aa  876    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4638  major facilitator superfamily MFS_1  61.17 
 
 		 451 aa  548  1e-155  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000178504  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19270  putative MFS transporter  58.35 
 
 		 455 aa  512  1e-144  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.149627  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0471  major facilitator family transporter  62.08 
 
 		 478 aa  512  1e-144  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1431  major facilitator family transporter  62.08 
 
 		 478 aa  512  1e-144  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.475934  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0177  major facilitator family transporter  62.08 
 
 		 478 aa  512  1e-144  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1931  major facilitator superfamily permease  62.08 
 
 		 478 aa  513  1e-144  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0979116  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0379  major facilitator family transporter  62.08 
 
 		 478 aa  511  1e-144  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1595  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  62.28 
 
 		 472 aa  514  1e-144  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1841  major facilitator family transporter  62.08 
 
 		 478 aa  513  1e-144  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0911  major facilitator family transporter  61.85 
 
 		 478 aa  511  1e-143  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.577596  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5053  major facilitator superfamily MFS_1  60.99 
 
 		 472 aa  510  1e-143  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.122247 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1660  MFS family transporter  59.51 
 
 		 455 aa  507  9.999999999999999e-143  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0670  general substrate transporter  59.96 
 
 		 459 aa  502  1e-141  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.753041 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3311  major facilitator transporter  60.27 
 
 		 474 aa  497  1e-139  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.799238  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0539  major facilitator transporter  60.54 
 
 		 473 aa  491  9.999999999999999e-139  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5109  major facilitator transporter  60.41 
 
 		 474 aa  491  1e-137  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5172  major facilitator transporter  60.54 
 
 		 474 aa  490  1e-137  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0809503 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3259  major facilitator transporter  60.41 
 
 		 474 aa  489  1e-137  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.331503  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02027  metabolite transporter  60.95 
 
 		 476 aa  483  1e-135  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.158134 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2900  major facilitator transporter  56.92 
 
 		 514 aa  482  1e-135  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.473738  normal  0.0138886 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5178  major facilitator transporter  55.93 
 
 		 457 aa  478  1e-133  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2073  major facilitator superfamily transporter  59.46 
 
 		 467 aa  474  1e-132  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0013865 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3533  major facilitator transporter  60.18 
 
 		 473 aa  464  1e-129  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1010  major facilitator family transporter  60.83 
 
 		 398 aa  390  1e-107  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1561  major facilitator transporter  47.27 
 
 		 509 aa  367  1e-100  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.141298  normal  0.174962 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1482  major facilitator superfamily MFS_1  39.42 
 
 		 451 aa  331  1e-89  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000115751  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2413  major facilitator transporter  40.67 
 
 		 447 aa  321  1.9999999999999998e-86  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000787137  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1523  major facilitator transporter  38.78 
 
 		 438 aa  295  1e-78  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.295641  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1875  major facilitator transporter  37.25 
 
 		 459 aa  279  7e-74  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.473892  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2088  major facilitator superfamily MFS_1  37.97 
 
 		 456 aa  275  9e-73  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.565943 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4651  major facilitator superfamily MFS_1  38.53 
 
 		 470 aa  275  2.0000000000000002e-72  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2255  major facilitator superfamily MFS_1  38.05 
 
 		 473 aa  273  4.0000000000000004e-72  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3497  major facilitator superfamily MFS_1  36.92 
 
 		 398 aa  256  7e-67  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4019  major facilitator superfamily MFS_1  38.66 
 
 		 435 aa  254  2.0000000000000002e-66  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.000381325  normal  0.201783 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2754  major facilitator superfamily MFS_1  38 
 
 		 465 aa  253  7e-66  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.182715  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3374  major facilitator superfamily MFS_1  35.03 
 
 		 398 aa  252  9.000000000000001e-66  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000527195  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21330  sugar phosphate permease  37.5 
 
 		 477 aa  252  1e-65  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.428425  hitchhiker  0.00018034 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5115  major facilitator family transporter  34.12 
 
 		 399 aa  251  1e-65  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000159613  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5599  major facilitator family transporter  34.12 
 
 		 399 aa  251  1e-65  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000105464  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5547  major facilitator family transporter  34.43 
 
 		 399 aa  251  2e-65  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.00000000869498  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5543  major facilitator family transporter  34.35 
 
 		 399 aa  251  2e-65  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000723204  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5271  major facilitator family transporter  34.19 
 
 		 399 aa  250  4e-65  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000000222558  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5098  major facilitator family transporter  34.19 
 
 		 399 aa  250  4e-65  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.20566e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5668  major facilitator family transporter  34.19 
 
 		 399 aa  250  4e-65  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.0000000000480591  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29790  sugar phosphate permease  35.91 
 
 		 485 aa  250  4e-65  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5513  major facilitator family transporter  34.19 
 
 		 399 aa  250  4e-65  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5212  major facilitator transporter  34.89 
 
 		 399 aa  250  4e-65  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000114177  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5409  major facilitator family transporter  34.12 
 
 		 399 aa  249  6e-65  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000000725853  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3933  major facilitator transporter  32.47 
 
 		 399 aa  244  1.9999999999999999e-63  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000233422  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0547  major facilitator superfamily transporter  33.11 
 
 		 456 aa  244  3e-63  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.392915  normal  0.285749 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4993  MFS family membrane efflux protein  36.51 
 
 		 526 aa  244  3e-63  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.521864 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2518  major facilitator transporter  37.21 
 
 		 437 aa  241  1e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0602  major facilitator superfamily MFS_1  35.31 
 
 		 459 aa  241  2e-62  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1414  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  35.86 
 
 		 468 aa  241  2.9999999999999997e-62  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000198546  normal  0.095851 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3924  major facilitator superfamily transporter  34.65 
 
 		 438 aa  240  5e-62  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.496152  normal  0.0457831 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0897  major facilitator superfamily MFS_1  37.81 
 
 		 447 aa  237  3e-61  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0894914  normal  0.147269 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1377  major facilitator superfamily MFS_1  38.29 
 
 		 445 aa  233  5e-60  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0245  putative permease  37.37 
 
 		 449 aa  232  8.000000000000001e-60  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0461827  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1856  major facilitator transporter  33.95 
 
 		 438 aa  230  3e-59  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0285  major facilitator superfamily sugar transporter  32.89 
 
 		 464 aa  226  7e-58  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.192742  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5172  major facilitator superfamily MFS_1  34.23 
 
 		 466 aa  223  4.9999999999999996e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1683  major facilitator transporter  36.74 
 
 		 415 aa  219  7.999999999999999e-56  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.249309  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2078  major facilitator superfamily MFS_1  33.73 
 
 		 404 aa  218  2e-55  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3160  major facilitator superfamily MFS_1  32.91 
 
 		 461 aa  215  9.999999999999999e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0312386 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5283  major facilitator transporter  34.51 
 
 		 463 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.591426  normal  0.763827 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0070  MFS permease  33.26 
 
 		 460 aa  214  2.9999999999999995e-54  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0532  major facilitator family transporter  34.19 
 
 		 436 aa  213  7e-54  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0462  major facilitator family transporter  34.19 
 
 		 436 aa  212  9e-54  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.450318  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3564  major facilitator transporter  33.99 
 
 		 436 aa  212  1e-53  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1326  major facilitator transporter  36.73 
 
 		 464 aa  212  1e-53  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.367254  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0828  major facilitator superfamily aromatic acid/H(+) symporter  32.73 
 
 		 450 aa  209  7e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.420618  normal  0.255495 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1992  major facilitator transporter  37.84 
 
 		 436 aa  204  2e-51  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.252047  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3453  major facilitator transporter  32.68 
 
 		 472 aa  204  2e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0499831  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5083  major facilitator transporter  34.16 
 
 		 437 aa  204  3e-51  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.418338  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6599  major facilitator superfamily MFS_1  31.01 
 
 		 459 aa  201  3e-50  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.332731  normal  0.158495 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1166  major facilitator superfamily MFS_1  34.72 
 
 		 450 aa  201  3e-50  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000374507 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5153  major facilitator transporter  31.6 
 
 		 475 aa  200  3.9999999999999996e-50  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.507557  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0910  major facilitator family transporter  32.97 
 
 		 472 aa  199  7.999999999999999e-50  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.367874  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1671  major facilitator transporter  33.87 
 
 		 381 aa  198  1.0000000000000001e-49  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    decreased coverage  0.0000914056 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3580  hypothetical protein  31.28 
 
 		 478 aa  197  2.0000000000000003e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.024372  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0382  major facilitator transporter  31.66 
 
 		 472 aa  198  2.0000000000000003e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.660441 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4627  major facilitator transporter  31.6 
 
 		 475 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5266  major facilitator transporter  31.22 
 
 		 472 aa  197  3e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5007  major facilitator transporter  31.22 
 
 		 472 aa  197  3e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3101  major facilitator transporter  31.22 
 
 		 472 aa  197  3e-49  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.380275  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0486  major facilitator family transporter  33.19 
 
 		 472 aa  197  4.0000000000000005e-49  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0312823  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7070  major facilitator superfamily MFS_1  31.58 
 
 		 467 aa  197  4.0000000000000005e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.710966  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0186  major facilitator transporter  31.36 
 
 		 479 aa  196  5.000000000000001e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0970  major facilitator superfamily transporter metabolite/H(+) symporter  31.71 
 
 		 470 aa  196  5.000000000000001e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00262609  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0788  major facilitator family transporter  33.19 
 
 		 472 aa  196  7e-49  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.509193  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0555  major facilitator family transporter  33.19 
 
 		 472 aa  196  7e-49  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1973  major facilitator transporter  33.19 
 
 		 472 aa  196  7e-49  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2070  major facilitator transporter  32.97 
 
 		 472 aa  196  8.000000000000001e-49  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.376866  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0911  major facilitator superfamily permease  28.98 
 
 		 388 aa  196  8.000000000000001e-49  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.000338401  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1543  major facilitator transporter  31.93 
 
 		 382 aa  195  1e-48  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.0259552 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6265  major facilitator transporter  32.33 
 
 		 480 aa  194  2e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4087  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  31.67 
 
 		 468 aa  195  2e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.281632  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0909  major facilitator transporter  32.61 
 
 		 455 aa  195  2e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0703326  normal  0.129634 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1565  major facilitator transporter  32.33 
 
 		 480 aa  194  2e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.523471  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>