More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_6282 on replicon NC_008392
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010557  BamMC406_5986  major facilitator transporter  99.16 
 
 
479 aa  949    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6611  major facilitator transporter  76.72 
 
 
479 aa  723    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.410873  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6959  major facilitator transporter  77.45 
 
 
479 aa  706    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6282  major facilitator transporter  100 
 
 
479 aa  956    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.384913  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2063  major facilitator superfamily MFS_1  76.62 
 
 
479 aa  729    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0432509  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4015  major facilitator superfamily MFS_1  57.02 
 
 
477 aa  539  9.999999999999999e-153  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4647  major facilitator superfamily MFS_1  56.11 
 
 
488 aa  513  1e-144  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.866665  normal  0.46173 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0920  major facilitator superfamily transporter metabolite/H(+) symporter  55.46 
 
 
487 aa  509  1e-143  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.697574 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3453  major facilitator transporter  54.58 
 
 
472 aa  507  9.999999999999999e-143  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0499831  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5007  major facilitator transporter  54.07 
 
 
472 aa  502  1e-141  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0382  major facilitator transporter  54.58 
 
 
472 aa  502  1e-141  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.660441 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3101  major facilitator transporter  54.07 
 
 
472 aa  502  1e-141  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.380275  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6200  major facilitator transporter  53.19 
 
 
492 aa  504  1e-141  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0622411 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5266  major facilitator transporter  54.07 
 
 
472 aa  502  1e-141  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0808  major facilitator superfamily MFS_1  55.7 
 
 
494 aa  499  1e-140  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5153  major facilitator transporter  55.07 
 
 
475 aa  499  1e-140  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.507557  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4627  major facilitator transporter  55.07 
 
 
475 aa  499  1e-140  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0910  major facilitator family transporter  53.49 
 
 
472 aa  488  1e-136  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.367874  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0788  major facilitator family transporter  53.04 
 
 
472 aa  482  1e-135  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.509193  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0486  major facilitator family transporter  53.04 
 
 
472 aa  483  1e-135  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0312823  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0555  major facilitator family transporter  53.04 
 
 
472 aa  482  1e-135  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1973  major facilitator transporter  53.04 
 
 
472 aa  482  1e-135  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2070  major facilitator transporter  52.83 
 
 
472 aa  481  1e-134  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.376866  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3530  major facilitator transporter  53.04 
 
 
469 aa  464  1e-129  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.229516  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4340  general substrate transporter  48.37 
 
 
477 aa  439  9.999999999999999e-123  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6205  major facilitator superfamily MFS_1  47.26 
 
 
471 aa  426  1e-118  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2496  major facilitator family transporter  46.98 
 
 
472 aa  424  1e-117  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.206768  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2304  major facilitator transporter  46.48 
 
 
472 aa  422  1e-117  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.759044  normal  0.046264 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0667  major facilitator family transporter  53.49 
 
 
494 aa  425  1e-117  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0482021  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4090  major facilitator superfamily metabolite(sugar)/H(+) symporter  46.83 
 
 
471 aa  424  1e-117  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.94274  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1412  major facilitator transporter  48.59 
 
 
465 aa  422  1e-117  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1717  major facilitator transporter  47.57 
 
 
488 aa  396  1e-109  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1268  MFS transporter  47.1 
 
 
487 aa  393  1e-108  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.916286  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2231  major facilitator family transporter  46.54 
 
 
482 aa  393  1e-108  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3036  major facilitator transporter  47.1 
 
 
487 aa  392  1e-108  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1759  major facilitator superfamily MFS_1  42.98 
 
 
472 aa  389  1e-107  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3193  major facilitator transporter  43.76 
 
 
472 aa  387  1e-106  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.9008 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00188  MFS transporter  46.17 
 
 
471 aa  370  1e-101  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.103216  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1718  major facilitator transporter  40.78 
 
 
473 aa  339  5e-92  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.442738  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1269  major facilitator transporter  40.71 
 
 
466 aa  336  5e-91  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2576  major facilitator transporter  38.13 
 
 
475 aa  327  2.0000000000000001e-88  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.634768  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0792  major facilitator superfamily MFS_1  32.97 
 
 
458 aa  271  2.9999999999999997e-71  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.753449  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1483  major facilitator superfamily MFS_1  33.84 
 
 
456 aa  261  2e-68  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4860  major facilitator transporter  33.63 
 
 
487 aa  251  2e-65  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0839463 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1668  major facilitator transporter  33.19 
 
 
487 aa  245  9.999999999999999e-64  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.339414  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1551  major facilitator transporter  33.11 
 
 
485 aa  244  3e-63  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.308182  normal  0.0914413 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1626  major facilitator transporter  33.41 
 
 
485 aa  243  7e-63  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.408436  normal  0.668079 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0463  major facilitator transporter  33.92 
 
 
448 aa  241  1e-62  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0213055  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1217  major facilitator transporter  32.96 
 
 
487 aa  242  1e-62  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.207678  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1696  major facilitator transporter  32.96 
 
 
487 aa  242  1e-62  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.4496  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1604  major facilitator transporter  33.18 
 
 
485 aa  239  9e-62  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0881  major facilitator superfamily MFS_1  32.6 
 
 
448 aa  234  3e-60  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.202747  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0828  major facilitator superfamily aromatic acid/H(+) symporter  32.75 
 
 
450 aa  225  1e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.420618  normal  0.255495 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0285  major facilitator superfamily sugar transporter  32.6 
 
 
464 aa  225  2e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.192742  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5972  major facilitator transporter  32.37 
 
 
462 aa  224  3e-57  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4638  major facilitator superfamily MFS_1  32.1 
 
 
451 aa  223  4.9999999999999996e-57  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000178504  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0967  major facilitator superfamily aromatic acid/H(+) symporter  31.95 
 
 
462 aa  222  9.999999999999999e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6268  major facilitator transporter  32.15 
 
 
462 aa  222  9.999999999999999e-57  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.492492 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6599  major facilitator superfamily MFS_1  30.38 
 
 
459 aa  213  7e-54  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.332731  normal  0.158495 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0974  major facilitator superfamily aromatic acid/H(+) symporter  31.86 
 
 
462 aa  212  1e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00000109951  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0668  major facilitator transporter  33.33 
 
 
474 aa  211  2e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00169534  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5172  major facilitator superfamily MFS_1  30.92 
 
 
466 aa  208  2e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0613  major facilitator superfamily MFS_1  30.38 
 
 
473 aa  207  4e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0274336 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0528  major facilitator transporter  31.29 
 
 
467 aa  207  5e-52  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0826405  hitchhiker  0.00770286 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0190  major facilitator superfamily MFS_1  30.48 
 
 
460 aa  204  3e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000521499 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4087  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  29.71 
 
 
468 aa  203  6e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.281632  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1937  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  30.08 
 
 
474 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000000000973666  normal  0.0403058 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0270  major facilitator transporter  30.99 
 
 
477 aa  199  1.0000000000000001e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0250869  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0896  major facilitator superfamily MFS_1  31.29 
 
 
462 aa  197  4.0000000000000005e-49  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0987  major facilitator superfamily transporter metabolite/H(+) symporter  31.8 
 
 
461 aa  194  4e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.496425 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5178  major facilitator transporter  31.43 
 
 
457 aa  192  1e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0970  major facilitator superfamily transporter metabolite/H(+) symporter  28.85 
 
 
470 aa  190  5e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00262609  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5167  major facilitator superfamily MFS_1  29.4 
 
 
470 aa  188  1e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3358  major facilitator superfamily MFS_1  29.08 
 
 
459 aa  188  2e-46  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5934  major facilitator transporter  31.81 
 
 
468 aa  187  3e-46  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0786793 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19270  putative MFS transporter  30.26 
 
 
455 aa  187  3e-46  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.149627  normal 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8056  major facilitator superfamily MFS_1  31.59 
 
 
451 aa  185  1.0000000000000001e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5109  major facilitator transporter  32.04 
 
 
474 aa  185  1.0000000000000001e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5172  major facilitator transporter  31.8 
 
 
474 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0809503 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0670  general substrate transporter  31.17 
 
 
459 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.753041 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3259  major facilitator transporter  32.04 
 
 
474 aa  183  6e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.331503  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0539  major facilitator transporter  32.04 
 
 
473 aa  181  2e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1660  MFS family transporter  29.91 
 
 
455 aa  179  1e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3533  major facilitator transporter  32.13 
 
 
473 aa  178  2e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0379  major facilitator family transporter  29.96 
 
 
478 aa  178  2e-43  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3311  major facilitator transporter  30.5 
 
 
474 aa  178  2e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.799238  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1595  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  29.22 
 
 
472 aa  177  4e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6853  major facilitator transporter  29.44 
 
 
430 aa  177  5e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.854567  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS02027  metabolite transporter  30.42 
 
 
476 aa  176  6e-43  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.158134 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5053  major facilitator superfamily MFS_1  29.22 
 
 
472 aa  176  6e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.122247 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1931  major facilitator superfamily permease  29.96 
 
 
478 aa  175  9.999999999999999e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0979116  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0471  major facilitator family transporter  29.74 
 
 
478 aa  175  1.9999999999999998e-42  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0177  major facilitator family transporter  29.74 
 
 
478 aa  175  1.9999999999999998e-42  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1431  major facilitator family transporter  29.74 
 
 
478 aa  175  1.9999999999999998e-42  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.475934  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1841  major facilitator family transporter  29.96 
 
 
478 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0129  putative permease  29.93 
 
 
459 aa  174  2.9999999999999996e-42  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.549779  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1414  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  29.93 
 
 
468 aa  173  5e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000198546  normal  0.095851 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0911  major facilitator family transporter  29.52 
 
 
478 aa  173  5.999999999999999e-42  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.577596  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2754  major facilitator superfamily MFS_1  31.4 
 
 
465 aa  172  1e-41  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.182715  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0443  major facilitator superfamily MFS_1  27.35 
 
 
461 aa  172  1e-41  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>