More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_5153 on replicon NC_010552
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009078  BURPS1106A_A1973  major facilitator transporter  85.47 
 
 
472 aa  774    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0808  major facilitator superfamily MFS_1  75.22 
 
 
494 aa  673    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2070  major facilitator transporter  85.68 
 
 
472 aa  775    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.376866  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0788  major facilitator family transporter  85.47 
 
 
472 aa  774    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.509193  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6200  major facilitator transporter  69.67 
 
 
492 aa  662    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0622411 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0486  major facilitator family transporter  85.68 
 
 
472 aa  775    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0312823  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5007  major facilitator transporter  94.95 
 
 
472 aa  853    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0382  major facilitator transporter  95.58 
 
 
472 aa  863    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.660441 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5153  major facilitator transporter  100 
 
 
475 aa  941    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.507557  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0910  major facilitator family transporter  86.53 
 
 
472 aa  778    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.367874  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0920  major facilitator superfamily transporter metabolite/H(+) symporter  84.9 
 
 
487 aa  769    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.697574 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4647  major facilitator superfamily MFS_1  83.37 
 
 
488 aa  775    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.866665  normal  0.46173 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5266  major facilitator transporter  94.95 
 
 
472 aa  853    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0555  major facilitator family transporter  85.47 
 
 
472 aa  774    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0667  major facilitator family transporter  85.16 
 
 
494 aa  667    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0482021  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3453  major facilitator transporter  92.42 
 
 
472 aa  851    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0499831  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3101  major facilitator transporter  94.95 
 
 
472 aa  853    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.380275  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4627  major facilitator transporter  98.95 
 
 
475 aa  931    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3530  major facilitator transporter  71.43 
 
 
469 aa  624  1e-178  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.229516  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4015  major facilitator superfamily MFS_1  57.98 
 
 
477 aa  554  1e-156  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5986  major facilitator transporter  55.29 
 
 
479 aa  520  1e-146  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6282  major facilitator transporter  55.51 
 
 
479 aa  521  1e-146  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.384913  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2063  major facilitator superfamily MFS_1  54.82 
 
 
479 aa  495  1e-139  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0432509  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6611  major facilitator transporter  54.34 
 
 
479 aa  489  1e-137  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.410873  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2496  major facilitator family transporter  52.77 
 
 
472 aa  486  1e-136  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.206768  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2304  major facilitator transporter  52.11 
 
 
472 aa  482  1e-135  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.759044  normal  0.046264 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4340  general substrate transporter  52.62 
 
 
477 aa  482  1e-135  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6959  major facilitator transporter  55.31 
 
 
479 aa  467  9.999999999999999e-131  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1412  major facilitator transporter  50.65 
 
 
465 aa  452  1.0000000000000001e-126  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4090  major facilitator superfamily metabolite(sugar)/H(+) symporter  49.89 
 
 
471 aa  450  1e-125  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.94274  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6205  major facilitator superfamily MFS_1  49.56 
 
 
471 aa  446  1.0000000000000001e-124  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1268  MFS transporter  49.57 
 
 
487 aa  427  1e-118  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.916286  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2231  major facilitator family transporter  48.8 
 
 
482 aa  426  1e-118  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3036  major facilitator transporter  49.35 
 
 
487 aa  426  1e-118  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1717  major facilitator transporter  47.24 
 
 
488 aa  415  9.999999999999999e-116  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3193  major facilitator transporter  46.72 
 
 
472 aa  417  9.999999999999999e-116  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.9008 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1759  major facilitator superfamily MFS_1  44.92 
 
 
472 aa  405  1.0000000000000001e-112  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00188  MFS transporter  49.24 
 
 
471 aa  395  1e-109  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.103216  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1269  major facilitator transporter  44.81 
 
 
466 aa  380  1e-104  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2576  major facilitator transporter  43.01 
 
 
475 aa  364  2e-99  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.634768  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1718  major facilitator transporter  43.13 
 
 
473 aa  360  4e-98  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.442738  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0792  major facilitator superfamily MFS_1  37.03 
 
 
458 aa  296  6e-79  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.753449  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1483  major facilitator superfamily MFS_1  37.37 
 
 
456 aa  273  4.0000000000000004e-72  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0285  major facilitator superfamily sugar transporter  35.92 
 
 
464 aa  263  4.999999999999999e-69  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.192742  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0881  major facilitator superfamily MFS_1  32.75 
 
 
448 aa  236  5.0000000000000005e-61  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.202747  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4860  major facilitator transporter  32.59 
 
 
487 aa  236  6e-61  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0839463 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0463  major facilitator transporter  34.07 
 
 
448 aa  234  2.0000000000000002e-60  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0213055  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4638  major facilitator superfamily MFS_1  32.83 
 
 
451 aa  233  7.000000000000001e-60  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000178504  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1551  major facilitator transporter  32.54 
 
 
485 aa  232  9e-60  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.308182  normal  0.0914413 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1626  major facilitator transporter  31.59 
 
 
485 aa  231  2e-59  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.408436  normal  0.668079 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0828  major facilitator superfamily aromatic acid/H(+) symporter  33.33 
 
 
450 aa  230  4e-59  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.420618  normal  0.255495 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0528  major facilitator transporter  34.2 
 
 
467 aa  229  8e-59  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0826405  hitchhiker  0.00770286 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1668  major facilitator transporter  32.67 
 
 
487 aa  227  3e-58  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.339414  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1604  major facilitator transporter  32.15 
 
 
485 aa  226  9e-58  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1696  major facilitator transporter  32.52 
 
 
487 aa  225  1e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.4496  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1217  major facilitator transporter  32.52 
 
 
487 aa  225  1e-57  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.207678  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0967  major facilitator superfamily aromatic acid/H(+) symporter  32.82 
 
 
462 aa  223  4e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0970  major facilitator superfamily transporter metabolite/H(+) symporter  31.51 
 
 
470 aa  220  3.9999999999999997e-56  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00262609  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0987  major facilitator superfamily transporter metabolite/H(+) symporter  32.52 
 
 
461 aa  220  3.9999999999999997e-56  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.496425 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0270  major facilitator transporter  35.53 
 
 
477 aa  219  1e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0250869  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0613  major facilitator superfamily MFS_1  31.56 
 
 
473 aa  218  2e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0274336 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5172  major facilitator superfamily MFS_1  33.33 
 
 
466 aa  217  4e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4087  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  32.22 
 
 
468 aa  217  4e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.281632  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6599  major facilitator superfamily MFS_1  31.15 
 
 
459 aa  212  1e-53  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.332731  normal  0.158495 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5972  major facilitator transporter  29.78 
 
 
462 aa  208  1e-52  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8056  major facilitator superfamily MFS_1  32.83 
 
 
451 aa  207  3e-52  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6268  major facilitator transporter  29.78 
 
 
462 aa  207  4e-52  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.492492 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0670  general substrate transporter  32.91 
 
 
459 aa  207  5e-52  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.753041 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1595  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  34.06 
 
 
472 aa  206  5e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3358  major facilitator superfamily MFS_1  30.72 
 
 
459 aa  206  7e-52  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5109  major facilitator transporter  35.29 
 
 
474 aa  204  3e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5053  major facilitator superfamily MFS_1  33.62 
 
 
472 aa  204  4e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.122247 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0539  major facilitator transporter  34.65 
 
 
473 aa  202  9e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1660  MFS family transporter  32.06 
 
 
455 aa  202  9.999999999999999e-51  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5172  major facilitator transporter  35.7 
 
 
474 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0809503 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3259  major facilitator transporter  35.29 
 
 
474 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.331503  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0379  major facilitator family transporter  33.12 
 
 
478 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3533  major facilitator transporter  34.01 
 
 
473 aa  200  5e-50  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1931  major facilitator superfamily permease  32.68 
 
 
478 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0979116  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1431  major facilitator family transporter  32.9 
 
 
478 aa  198  2.0000000000000003e-49  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.475934  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0177  major facilitator family transporter  32.9 
 
 
478 aa  198  2.0000000000000003e-49  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1841  major facilitator family transporter  32.68 
 
 
478 aa  198  2.0000000000000003e-49  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0471  major facilitator family transporter  32.9 
 
 
478 aa  198  2.0000000000000003e-49  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19270  putative MFS transporter  31.13 
 
 
455 aa  197  3e-49  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.149627  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5167  major facilitator superfamily MFS_1  32.03 
 
 
470 aa  197  4.0000000000000005e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1937  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  32.44 
 
 
474 aa  197  5.000000000000001e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000000000973666  normal  0.0403058 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0911  major facilitator family transporter  32.68 
 
 
478 aa  196  6e-49  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.577596  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5934  major facilitator transporter  32.46 
 
 
468 aa  195  2e-48  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0786793 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0190  major facilitator superfamily MFS_1  29.56 
 
 
460 aa  194  2e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000521499 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0974  major facilitator superfamily aromatic acid/H(+) symporter  31.95 
 
 
462 aa  194  3e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00000109951  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS02027  metabolite transporter  31.15 
 
 
476 aa  192  7e-48  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.158134 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0668  major facilitator transporter  33.25 
 
 
474 aa  193  7e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00169534  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3311  major facilitator transporter  33.17 
 
 
474 aa  192  8e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.799238  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0129  putative permease  31.91 
 
 
459 aa  192  2e-47  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.549779  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6853  major facilitator transporter  31.94 
 
 
430 aa  191  2.9999999999999997e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.854567  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2088  major facilitator superfamily MFS_1  32.18 
 
 
456 aa  189  9e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.565943 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2060  inner membrane metabolite transport protein YdjE  30.42 
 
 
459 aa  186  7e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0010058 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1414  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  30.37 
 
 
468 aa  184  3e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000198546  normal  0.095851 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2413  major facilitator transporter  30.28 
 
 
447 aa  184  4.0000000000000006e-45  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000787137  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0896  major facilitator superfamily MFS_1  30.55 
 
 
462 aa  183  6e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>