More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_A1718 on replicon NC_007951
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007951  Bxe_A1718  major facilitator transporter  100 
 
 
473 aa  939    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.442738  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2576  major facilitator transporter  57.75 
 
 
475 aa  503  1e-141  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.634768  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4340  general substrate transporter  46.12 
 
 
477 aa  392  1e-108  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6200  major facilitator transporter  44.66 
 
 
492 aa  387  1e-106  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0622411 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4015  major facilitator superfamily MFS_1  44.49 
 
 
477 aa  383  1e-105  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2304  major facilitator transporter  46.67 
 
 
472 aa  384  1e-105  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.759044  normal  0.046264 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2496  major facilitator family transporter  46.25 
 
 
472 aa  380  1e-104  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.206768  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0920  major facilitator superfamily transporter metabolite/H(+) symporter  44.15 
 
 
487 aa  375  1e-103  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.697574 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1759  major facilitator superfamily MFS_1  42.37 
 
 
472 aa  374  1e-102  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4647  major facilitator superfamily MFS_1  42.59 
 
 
488 aa  374  1e-102  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.866665  normal  0.46173 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3193  major facilitator transporter  44.15 
 
 
472 aa  373  1e-102  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.9008 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3453  major facilitator transporter  42.74 
 
 
472 aa  371  1e-101  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0499831  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0382  major facilitator transporter  42.23 
 
 
472 aa  367  1e-100  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.660441 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5266  major facilitator transporter  42.16 
 
 
472 aa  362  9e-99  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5007  major facilitator transporter  42.16 
 
 
472 aa  362  9e-99  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3101  major facilitator transporter  42.16 
 
 
472 aa  362  9e-99  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.380275  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3530  major facilitator transporter  45.07 
 
 
469 aa  361  1e-98  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.229516  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4627  major facilitator transporter  43.32 
 
 
475 aa  362  1e-98  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5153  major facilitator transporter  42.89 
 
 
475 aa  361  2e-98  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.507557  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0910  major facilitator family transporter  42.62 
 
 
472 aa  360  2e-98  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.367874  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2070  major facilitator transporter  42.34 
 
 
472 aa  359  7e-98  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.376866  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0486  major facilitator family transporter  42.34 
 
 
472 aa  358  9.999999999999999e-98  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0312823  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0788  major facilitator family transporter  42.13 
 
 
472 aa  357  2.9999999999999997e-97  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.509193  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0555  major facilitator family transporter  42.13 
 
 
472 aa  357  2.9999999999999997e-97  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1973  major facilitator transporter  42.13 
 
 
472 aa  357  2.9999999999999997e-97  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5986  major facilitator transporter  41.23 
 
 
479 aa  353  5e-96  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1717  major facilitator transporter  43.51 
 
 
488 aa  352  7e-96  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6282  major facilitator transporter  40.78 
 
 
479 aa  352  1e-95  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.384913  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0808  major facilitator superfamily MFS_1  43.35 
 
 
494 aa  351  2e-95  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00188  MFS transporter  45.85 
 
 
471 aa  344  2e-93  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.103216  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2063  major facilitator superfamily MFS_1  40.81 
 
 
479 aa  344  2e-93  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0432509  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6611  major facilitator transporter  40.63 
 
 
479 aa  336  7e-91  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.410873  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2231  major facilitator family transporter  40.88 
 
 
482 aa  335  1e-90  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4090  major facilitator superfamily metabolite(sugar)/H(+) symporter  39.18 
 
 
471 aa  329  7e-89  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.94274  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1268  MFS transporter  40.83 
 
 
487 aa  328  1.0000000000000001e-88  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.916286  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6205  major facilitator superfamily MFS_1  39.35 
 
 
471 aa  327  2.0000000000000001e-88  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3036  major facilitator transporter  40.61 
 
 
487 aa  327  3e-88  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6959  major facilitator transporter  40.6 
 
 
479 aa  322  6e-87  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1412  major facilitator transporter  41.15 
 
 
465 aa  309  5.9999999999999995e-83  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0667  major facilitator family transporter  42.01 
 
 
494 aa  309  6.999999999999999e-83  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0482021  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1269  major facilitator transporter  36.74 
 
 
466 aa  268  2e-70  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0792  major facilitator superfamily MFS_1  32.25 
 
 
458 aa  231  2e-59  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.753449  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4860  major facilitator transporter  30.02 
 
 
487 aa  194  4e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0839463 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1551  major facilitator transporter  29.54 
 
 
485 aa  193  6e-48  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.308182  normal  0.0914413 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0987  major facilitator superfamily transporter metabolite/H(+) symporter  29.93 
 
 
461 aa  191  2e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.496425 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0828  major facilitator superfamily aromatic acid/H(+) symporter  33.12 
 
 
450 aa  189  1e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.420618  normal  0.255495 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1668  major facilitator transporter  29.57 
 
 
487 aa  186  1.0000000000000001e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.339414  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0970  major facilitator superfamily transporter metabolite/H(+) symporter  29.98 
 
 
470 aa  185  2.0000000000000003e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00262609  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1696  major facilitator transporter  29.57 
 
 
487 aa  184  3e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.4496  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1217  major facilitator transporter  29.57 
 
 
487 aa  184  3e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.207678  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0881  major facilitator superfamily MFS_1  29.44 
 
 
448 aa  182  9.000000000000001e-45  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.202747  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5167  major facilitator superfamily MFS_1  32.07 
 
 
470 aa  182  1e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0285  major facilitator superfamily sugar transporter  30.82 
 
 
464 aa  182  2e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.192742  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0613  major facilitator superfamily MFS_1  29.36 
 
 
473 aa  181  2.9999999999999997e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0274336 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1626  major facilitator transporter  29.02 
 
 
485 aa  181  2.9999999999999997e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.408436  normal  0.668079 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1604  major facilitator transporter  28.89 
 
 
485 aa  180  4.999999999999999e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4087  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  29.36 
 
 
468 aa  178  1e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.281632  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0896  major facilitator superfamily MFS_1  31.26 
 
 
462 aa  177  3e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5172  major facilitator superfamily MFS_1  31.45 
 
 
466 aa  174  3.9999999999999995e-42  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5972  major facilitator transporter  30.82 
 
 
462 aa  173  5e-42  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6599  major facilitator superfamily MFS_1  30.15 
 
 
459 aa  172  1e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.332731  normal  0.158495 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0270  major facilitator transporter  33.99 
 
 
477 aa  172  2e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0250869  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0528  major facilitator transporter  30.22 
 
 
467 aa  171  3e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0826405  hitchhiker  0.00770286 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0129  putative permease  29.09 
 
 
459 aa  170  6e-41  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.549779  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1483  major facilitator superfamily MFS_1  28.39 
 
 
456 aa  169  8e-41  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0463  major facilitator transporter  27.64 
 
 
448 aa  168  2e-40  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0213055  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6268  major facilitator transporter  30.38 
 
 
462 aa  168  2e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.492492 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0967  major facilitator superfamily aromatic acid/H(+) symporter  29.32 
 
 
462 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0190  major facilitator superfamily MFS_1  30.52 
 
 
460 aa  165  2.0000000000000002e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000521499 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1937  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  28.69 
 
 
474 aa  163  6e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000000000973666  normal  0.0403058 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3358  major facilitator superfamily MFS_1  29.22 
 
 
459 aa  162  1e-38  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6853  major facilitator transporter  29.72 
 
 
430 aa  161  3e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.854567  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0974  major facilitator superfamily aromatic acid/H(+) symporter  29.61 
 
 
462 aa  155  2e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00000109951  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5934  major facilitator transporter  29.7 
 
 
468 aa  149  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0786793 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4638  major facilitator superfamily MFS_1  27.85 
 
 
451 aa  148  2.0000000000000003e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000178504  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1414  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  30.3 
 
 
468 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000198546  normal  0.095851 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19270  putative MFS transporter  29.21 
 
 
455 aa  148  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.149627  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1660  MFS family transporter  28.09 
 
 
455 aa  146  8.000000000000001e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4651  major facilitator superfamily MFS_1  29.9 
 
 
470 aa  146  1e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2088  major facilitator superfamily MFS_1  29.18 
 
 
456 aa  144  4e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.565943 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0668  major facilitator transporter  26.71 
 
 
474 aa  144  5e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00169534  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2413  major facilitator transporter  29.41 
 
 
447 aa  143  6e-33  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000787137  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2028  major facilitator superfamily permease  27.49 
 
 
428 aa  140  3e-32  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1414  major facilitator superfamily MFS_1  28.69 
 
 
444 aa  138  2e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3580  hypothetical protein  27.1 
 
 
478 aa  135  9.999999999999999e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.024372  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0670  general substrate transporter  28.29 
 
 
459 aa  135  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.753041 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5178  major facilitator transporter  27.33 
 
 
457 aa  133  6e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0914  major facilitator transporter  29.26 
 
 
434 aa  133  7.999999999999999e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00481205  normal  0.205021 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2060  inner membrane metabolite transport protein YdjE  28.18 
 
 
459 aa  130  4.0000000000000003e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0010058 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5053  major facilitator superfamily MFS_1  29.04 
 
 
472 aa  130  7.000000000000001e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.122247 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1999  major facilitator family transporter  28.71 
 
 
459 aa  129  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0702699  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1857  major facilitator transporter  28.71 
 
 
459 aa  129  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.526363  hitchhiker  0.0000247936 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1595  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  27.82 
 
 
472 aa  129  2.0000000000000002e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1860  major facilitator family transporter  28.47 
 
 
459 aa  127  4.0000000000000003e-28  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0174535  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4019  major facilitator superfamily MFS_1  32.87 
 
 
435 aa  126  1e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.000381325  normal  0.201783 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0547  major facilitator superfamily transporter  27.57 
 
 
456 aa  125  2e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.392915  normal  0.285749 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01738  predicted transporter  25.85 
 
 
452 aa  124  3e-27  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.375088  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01726  hypothetical protein  25.85 
 
 
452 aa  124  3e-27  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.448165  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0602  major facilitator superfamily MFS_1  26.27 
 
 
459 aa  124  3e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1873  major facilitator superfamily MFS_1  25.85 
 
 
452 aa  124  5e-27  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0070319  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>