More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BLD_0129 on replicon NC_010816
Organism: Bifidobacterium longum DJO10A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010816  BLD_0129  putative permease  100 
 
 
459 aa  919    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.549779  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2028  major facilitator superfamily permease  49.53 
 
 
428 aa  411  1e-113  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5167  major facilitator superfamily MFS_1  37.7 
 
 
470 aa  287  2.9999999999999996e-76  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0970  major facilitator superfamily transporter metabolite/H(+) symporter  37.88 
 
 
470 aa  275  1.0000000000000001e-72  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00262609  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5172  major facilitator superfamily MFS_1  37.33 
 
 
466 aa  273  3e-72  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0190  major facilitator superfamily MFS_1  37.1 
 
 
460 aa  273  4.0000000000000004e-72  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000521499 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0974  major facilitator superfamily aromatic acid/H(+) symporter  37.25 
 
 
462 aa  272  9e-72  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00000109951  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0528  major facilitator transporter  36.32 
 
 
467 aa  272  1e-71  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0826405  hitchhiker  0.00770286 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0987  major facilitator superfamily transporter metabolite/H(+) symporter  36.26 
 
 
461 aa  269  7e-71  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.496425 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1937  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  36.41 
 
 
474 aa  265  8.999999999999999e-70  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000000000973666  normal  0.0403058 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0896  major facilitator superfamily MFS_1  35.27 
 
 
462 aa  263  6e-69  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5934  major facilitator transporter  37.35 
 
 
468 aa  258  1e-67  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0786793 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0828  major facilitator superfamily aromatic acid/H(+) symporter  35.62 
 
 
450 aa  258  1e-67  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.420618  normal  0.255495 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0967  major facilitator superfamily aromatic acid/H(+) symporter  35.65 
 
 
462 aa  259  1e-67  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6268  major facilitator transporter  32.25 
 
 
462 aa  252  1e-65  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.492492 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5972  major facilitator transporter  32.02 
 
 
462 aa  248  1e-64  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6853  major facilitator transporter  35.45 
 
 
430 aa  248  2e-64  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.854567  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4087  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  33.8 
 
 
468 aa  242  1e-62  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.281632  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0613  major facilitator superfamily MFS_1  33.57 
 
 
473 aa  241  2.9999999999999997e-62  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0274336 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0270  major facilitator transporter  33.8 
 
 
477 aa  238  1e-61  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0250869  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6599  major facilitator superfamily MFS_1  33.64 
 
 
459 aa  236  4e-61  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.332731  normal  0.158495 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2054  inner membrane metabolite transport protein YdjE  34.62 
 
 
452 aa  229  6e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.0842085 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1857  major facilitator transporter  32.66 
 
 
459 aa  227  3e-58  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.526363  hitchhiker  0.0000247936 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1999  major facilitator family transporter  32.66 
 
 
459 aa  227  3e-58  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0702699  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1993  major facilitator family transporter  31.83 
 
 
452 aa  227  4e-58  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.863885  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1860  major facilitator family transporter  31.99 
 
 
459 aa  227  4e-58  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0174535  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1873  major facilitator superfamily MFS_1  32.28 
 
 
452 aa  226  5.0000000000000005e-58  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0070319  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1422  major facilitator family transporter  32.05 
 
 
452 aa  226  5.0000000000000005e-58  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.452173  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1853  major facilitator family transporter  31.83 
 
 
452 aa  226  8e-58  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0220731  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01738  predicted transporter  32.28 
 
 
452 aa  225  1e-57  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.375088  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01726  hypothetical protein  32.28 
 
 
452 aa  225  1e-57  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.448165  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1863  major facilitator transporter  32.05 
 
 
452 aa  225  1e-57  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.369973  hitchhiker  0.0000261137 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01744  predicted transporter  33.18 
 
 
459 aa  221  1.9999999999999999e-56  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.955946  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01732  hypothetical protein  33.18 
 
 
459 aa  221  1.9999999999999999e-56  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2060  inner membrane metabolite transport protein YdjE  31.99 
 
 
459 aa  220  3.9999999999999997e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0010058 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2499  major facilitator family transporter  32.48 
 
 
459 aa  219  6e-56  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.465931  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1867  major facilitator superfamily MFS_1  32.94 
 
 
459 aa  219  1e-55  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000517052  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1416  major facilitator family transporter  32.94 
 
 
459 aa  219  1e-55  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.888006  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2490  inner membrane metabolite transport protein YdjE  33.42 
 
 
416 aa  215  1.9999999999999998e-54  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.754275 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3220  major facilitator superfamily MFS_1  32.35 
 
 
463 aa  212  9e-54  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0542188  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4015  major facilitator superfamily MFS_1  31.58 
 
 
477 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6200  major facilitator transporter  29.93 
 
 
492 aa  195  2e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0622411 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0382  major facilitator transporter  31.26 
 
 
472 aa  191  2e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.660441 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3453  major facilitator transporter  31.76 
 
 
472 aa  189  5.999999999999999e-47  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0499831  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5266  major facilitator transporter  31.05 
 
 
472 aa  188  2e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5007  major facilitator transporter  31.05 
 
 
472 aa  188  2e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3101  major facilitator transporter  31.05 
 
 
472 aa  188  2e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.380275  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5153  major facilitator transporter  31.49 
 
 
475 aa  187  4e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.507557  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4647  major facilitator superfamily MFS_1  31.42 
 
 
488 aa  186  6e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.866665  normal  0.46173 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4627  major facilitator transporter  31.49 
 
 
475 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1483  major facilitator superfamily MFS_1  27.75 
 
 
456 aa  182  7e-45  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1717  major facilitator transporter  30.46 
 
 
488 aa  179  8e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0285  major facilitator superfamily sugar transporter  29.55 
 
 
464 aa  179  1e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.192742  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0920  major facilitator superfamily transporter metabolite/H(+) symporter  31.47 
 
 
487 aa  179  1e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.697574 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0910  major facilitator family transporter  30.62 
 
 
472 aa  177  2e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.367874  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1759  major facilitator superfamily MFS_1  29.41 
 
 
472 aa  177  3e-43  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0792  major facilitator superfamily MFS_1  27.89 
 
 
458 aa  176  6e-43  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.753449  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2070  major facilitator transporter  30.19 
 
 
472 aa  176  9.999999999999999e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.376866  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6282  major facilitator transporter  29.93 
 
 
479 aa  176  9.999999999999999e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.384913  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2413  major facilitator transporter  29.89 
 
 
447 aa  175  9.999999999999999e-43  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000787137  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5986  major facilitator transporter  29.93 
 
 
479 aa  176  9.999999999999999e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0486  major facilitator family transporter  30.19 
 
 
472 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0312823  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4340  general substrate transporter  28.21 
 
 
477 aa  175  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0808  major facilitator superfamily MFS_1  30.75 
 
 
494 aa  174  2.9999999999999996e-42  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0555  major facilitator family transporter  30.19 
 
 
472 aa  174  3.9999999999999995e-42  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0788  major facilitator family transporter  30.19 
 
 
472 aa  174  3.9999999999999995e-42  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.509193  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1973  major facilitator transporter  30.19 
 
 
472 aa  174  3.9999999999999995e-42  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3530  major facilitator transporter  33.41 
 
 
469 aa  172  7.999999999999999e-42  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.229516  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1269  major facilitator transporter  29.18 
 
 
466 aa  172  2e-41  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2063  major facilitator superfamily MFS_1  29.93 
 
 
479 aa  168  2e-40  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0432509  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4638  major facilitator superfamily MFS_1  26.71 
 
 
451 aa  167  2.9999999999999998e-40  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000178504  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2576  major facilitator transporter  29.26 
 
 
475 aa  166  1.0000000000000001e-39  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.634768  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3036  major facilitator transporter  27.55 
 
 
487 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1268  MFS transporter  27.55 
 
 
487 aa  164  3e-39  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.916286  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3358  major facilitator superfamily MFS_1  28.28 
 
 
459 aa  162  9e-39  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6205  major facilitator superfamily MFS_1  27.35 
 
 
471 aa  162  1e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6959  major facilitator transporter  29.02 
 
 
479 aa  162  2e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4090  major facilitator superfamily metabolite(sugar)/H(+) symporter  27.89 
 
 
471 aa  161  2e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.94274  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6611  major facilitator transporter  27.65 
 
 
479 aa  160  3e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.410873  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3193  major facilitator transporter  27.07 
 
 
472 aa  160  5e-38  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.9008 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2304  major facilitator transporter  27.96 
 
 
472 aa  159  8e-38  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.759044  normal  0.046264 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2496  major facilitator family transporter  28.19 
 
 
472 aa  158  2e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.206768  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2231  major facilitator family transporter  26.96 
 
 
482 aa  158  2e-37  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1718  major facilitator transporter  29.09 
 
 
473 aa  157  3e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.442738  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0667  major facilitator family transporter  31.23 
 
 
494 aa  156  7e-37  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0482021  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2088  major facilitator superfamily MFS_1  29.02 
 
 
456 aa  156  9e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.565943 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1412  major facilitator transporter  29.49 
 
 
465 aa  154  5e-36  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0670  general substrate transporter  27.35 
 
 
459 aa  153  5.9999999999999996e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.753041 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1875  major facilitator transporter  28.05 
 
 
459 aa  153  5.9999999999999996e-36  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.473892  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8056  major facilitator superfamily MFS_1  26.95 
 
 
451 aa  152  8.999999999999999e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19270  putative MFS transporter  26.7 
 
 
455 aa  152  1e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.149627  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4860  major facilitator transporter  28.05 
 
 
487 aa  152  1e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0839463 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1523  major facilitator transporter  30.91 
 
 
438 aa  150  5e-35  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.295641  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0602  major facilitator superfamily MFS_1  28.57 
 
 
459 aa  150  5e-35  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1414  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  29 
 
 
468 aa  149  1.0000000000000001e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000198546  normal  0.095851 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1551  major facilitator transporter  27.59 
 
 
485 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.308182  normal  0.0914413 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0539  major facilitator transporter  26.48 
 
 
473 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5172  major facilitator transporter  26.65 
 
 
474 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0809503 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5109  major facilitator transporter  26.65 
 
 
474 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3259  major facilitator transporter  26.65 
 
 
474 aa  147  3e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.331503  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>