More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ECD_01744 on replicon CP001509
Organism: Escherichia coli BL21(DE3)



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001509  ECD_01744  predicted transporter  100 
 
 
459 aa  923    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.955946  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01732  hypothetical protein  100 
 
 
459 aa  923    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1867  major facilitator superfamily MFS_1  99.56 
 
 
459 aa  917    Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000517052  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3220  major facilitator superfamily MFS_1  78.77 
 
 
463 aa  726    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0542188  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1857  major facilitator transporter  99.35 
 
 
459 aa  917    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.526363  hitchhiker  0.0000247936 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1416  major facilitator family transporter  99.35 
 
 
459 aa  916    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.888006  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1860  major facilitator family transporter  99.13 
 
 
459 aa  915    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0174535  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2499  major facilitator family transporter  98.91 
 
 
459 aa  912    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.465931  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1999  major facilitator family transporter  99.35 
 
 
459 aa  917    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0702699  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2060  inner membrane metabolite transport protein YdjE  94.99 
 
 
459 aa  883    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0010058 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1863  major facilitator transporter  43.3 
 
 
452 aa  372  1e-102  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.369973  hitchhiker  0.0000261137 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1422  major facilitator family transporter  43.52 
 
 
452 aa  375  1e-102  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.452173  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01738  predicted transporter  43.52 
 
 
452 aa  371  1e-101  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.375088  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1873  major facilitator superfamily MFS_1  43.52 
 
 
452 aa  370  1e-101  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0070319  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2054  inner membrane metabolite transport protein YdjE  44.25 
 
 
452 aa  369  1e-101  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.0842085 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1853  major facilitator family transporter  43.52 
 
 
452 aa  369  1e-101  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0220731  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01726  hypothetical protein  43.52 
 
 
452 aa  371  1e-101  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.448165  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1993  major facilitator family transporter  43.3 
 
 
452 aa  368  1e-100  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.863885  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2490  inner membrane metabolite transport protein YdjE  43.58 
 
 
416 aa  343  5e-93  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.754275 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0613  major facilitator superfamily MFS_1  34.23 
 
 
473 aa  247  3e-64  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0274336 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6599  major facilitator superfamily MFS_1  34.67 
 
 
459 aa  246  4e-64  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.332731  normal  0.158495 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5167  major facilitator superfamily MFS_1  34.51 
 
 
470 aa  237  3e-61  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4087  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  33.78 
 
 
468 aa  236  6e-61  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.281632  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0270  major facilitator transporter  34.21 
 
 
477 aa  236  8e-61  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0250869  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5172  major facilitator superfamily MFS_1  34.3 
 
 
466 aa  231  2e-59  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5972  major facilitator transporter  34.3 
 
 
462 aa  229  8e-59  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0967  major facilitator superfamily aromatic acid/H(+) symporter  32.96 
 
 
462 aa  229  1e-58  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0190  major facilitator superfamily MFS_1  31.7 
 
 
460 aa  228  2e-58  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000521499 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6268  major facilitator transporter  34.3 
 
 
462 aa  228  2e-58  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.492492 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0828  major facilitator superfamily aromatic acid/H(+) symporter  32.17 
 
 
450 aa  226  5.0000000000000005e-58  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.420618  normal  0.255495 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1937  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  32.66 
 
 
474 aa  226  6e-58  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000000000973666  normal  0.0403058 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0129  putative permease  32.89 
 
 
459 aa  225  1e-57  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.549779  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0987  major facilitator superfamily transporter metabolite/H(+) symporter  32.36 
 
 
461 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.496425 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0974  major facilitator superfamily aromatic acid/H(+) symporter  33.33 
 
 
462 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00000109951  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0970  major facilitator superfamily transporter metabolite/H(+) symporter  31.17 
 
 
470 aa  218  1e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00262609  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0528  major facilitator transporter  31.79 
 
 
467 aa  211  1e-53  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0826405  hitchhiker  0.00770286 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6853  major facilitator transporter  31.76 
 
 
430 aa  210  3e-53  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.854567  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0896  major facilitator superfamily MFS_1  30.13 
 
 
462 aa  207  5e-52  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5934  major facilitator transporter  32.31 
 
 
468 aa  199  1.0000000000000001e-49  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0786793 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2028  major facilitator superfamily permease  32.44 
 
 
428 aa  192  8e-48  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0285  major facilitator superfamily sugar transporter  29.75 
 
 
464 aa  189  5.999999999999999e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.192742  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0792  major facilitator superfamily MFS_1  27.96 
 
 
458 aa  178  2e-43  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.753449  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4638  major facilitator superfamily MFS_1  32.11 
 
 
451 aa  176  5e-43  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000178504  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6200  major facilitator transporter  29.07 
 
 
492 aa  173  3.9999999999999995e-42  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0622411 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0547  major facilitator superfamily transporter  30.32 
 
 
456 aa  166  5.9999999999999996e-40  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.392915  normal  0.285749 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4090  major facilitator superfamily metabolite(sugar)/H(+) symporter  29.15 
 
 
471 aa  166  6.9999999999999995e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.94274  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1759  major facilitator superfamily MFS_1  30.52 
 
 
472 aa  166  8e-40  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5986  major facilitator transporter  28.63 
 
 
479 aa  166  9e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6282  major facilitator transporter  28.63 
 
 
479 aa  166  1.0000000000000001e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.384913  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3453  major facilitator transporter  28.88 
 
 
472 aa  164  3e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0499831  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1412  major facilitator transporter  28.63 
 
 
465 aa  164  4.0000000000000004e-39  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6205  major facilitator superfamily MFS_1  28.54 
 
 
471 aa  163  7e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4015  major facilitator superfamily MFS_1  27.9 
 
 
477 aa  162  9e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4647  major facilitator superfamily MFS_1  29.17 
 
 
488 aa  161  2e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.866665  normal  0.46173 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0382  major facilitator transporter  29.54 
 
 
472 aa  161  2e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.660441 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4627  major facilitator transporter  29.1 
 
 
475 aa  161  2e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5153  major facilitator transporter  29.32 
 
 
475 aa  160  3e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.507557  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0555  major facilitator family transporter  29.52 
 
 
472 aa  160  4e-38  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1973  major facilitator transporter  29.52 
 
 
472 aa  160  4e-38  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0788  major facilitator family transporter  29.52 
 
 
472 aa  160  4e-38  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.509193  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5007  major facilitator transporter  29.3 
 
 
472 aa  160  4e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5266  major facilitator transporter  29.3 
 
 
472 aa  160  4e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3101  major facilitator transporter  29.3 
 
 
472 aa  160  4e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.380275  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0486  major facilitator family transporter  29.52 
 
 
472 aa  160  5e-38  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0312823  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2070  major facilitator transporter  29.3 
 
 
472 aa  158  1e-37  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.376866  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2413  major facilitator transporter  30 
 
 
447 aa  156  7e-37  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000787137  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0668  major facilitator transporter  29.13 
 
 
474 aa  156  8e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00169534  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1483  major facilitator superfamily MFS_1  28.85 
 
 
456 aa  154  2.9999999999999998e-36  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0910  major facilitator family transporter  29.32 
 
 
472 aa  154  2.9999999999999998e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.367874  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0920  major facilitator superfamily transporter metabolite/H(+) symporter  28.35 
 
 
487 aa  153  5.9999999999999996e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.697574 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1269  major facilitator transporter  28.57 
 
 
466 aa  153  5.9999999999999996e-36  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3358  major facilitator superfamily MFS_1  27.85 
 
 
459 aa  153  8e-36  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8056  major facilitator superfamily MFS_1  29.13 
 
 
451 aa  152  8.999999999999999e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5172  major facilitator transporter  30.2 
 
 
474 aa  152  1e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0809503 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5109  major facilitator transporter  29.87 
 
 
474 aa  152  1e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1414  major facilitator superfamily MFS_1  26.82 
 
 
444 aa  152  2e-35  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1717  major facilitator transporter  30.1 
 
 
488 aa  151  2e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2231  major facilitator family transporter  28.61 
 
 
482 aa  151  2e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6611  major facilitator transporter  27.89 
 
 
479 aa  152  2e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.410873  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2754  major facilitator superfamily MFS_1  30.02 
 
 
465 aa  150  3e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.182715  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5053  major facilitator superfamily MFS_1  28.14 
 
 
472 aa  151  3e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.122247 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3259  major facilitator transporter  29.87 
 
 
474 aa  150  3e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.331503  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1595  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  27.72 
 
 
472 aa  150  5e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5178  major facilitator transporter  26.74 
 
 
457 aa  149  1.0000000000000001e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2073  major facilitator superfamily transporter  30.28 
 
 
467 aa  148  2.0000000000000003e-34  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0013865 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1414  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  27.19 
 
 
468 aa  148  3e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000198546  normal  0.095851 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4860  major facilitator transporter  28.68 
 
 
487 aa  145  1e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0839463 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0539  major facilitator transporter  29.9 
 
 
473 aa  145  1e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3311  major facilitator transporter  28.5 
 
 
474 aa  145  2e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.799238  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2088  major facilitator superfamily MFS_1  26.87 
 
 
456 aa  144  2e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.565943 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0808  major facilitator superfamily MFS_1  28.07 
 
 
494 aa  144  3e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3193  major facilitator transporter  27.93 
 
 
472 aa  144  3e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.9008 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1482  major facilitator superfamily MFS_1  28.04 
 
 
451 aa  143  5e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000115751  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2496  major facilitator family transporter  27.3 
 
 
472 aa  142  8e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.206768  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1268  MFS transporter  29.58 
 
 
487 aa  142  1.9999999999999998e-32  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.916286  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3036  major facilitator transporter  29.58 
 
 
487 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2304  major facilitator transporter  26.33 
 
 
472 aa  141  3e-32  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.759044  normal  0.046264 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1217  major facilitator transporter  27.92 
 
 
487 aa  141  3e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.207678  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1668  major facilitator transporter  28.1 
 
 
487 aa  141  3e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.339414  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1696  major facilitator transporter  27.92 
 
 
487 aa  141  3e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.4496  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>