More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcolC_1863 on replicon NC_010468
Organism: Escherichia coli ATCC 8739



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001509  ECD_01738  predicted transporter  98.89 
 
 
452 aa  883    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.375088  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1873  major facilitator superfamily MFS_1  98.67 
 
 
452 aa  882    Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0070319  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1863  major facilitator transporter  100 
 
 
452 aa  895    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.369973  hitchhiker  0.0000261137 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2054  inner membrane metabolite transport protein YdjE  82.52 
 
 
452 aa  749    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.0842085 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01726  hypothetical protein  98.89 
 
 
452 aa  883    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.448165  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1853  major facilitator family transporter  98.23 
 
 
452 aa  877    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0220731  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1422  major facilitator family transporter  99.34 
 
 
452 aa  890    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.452173  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2490  inner membrane metabolite transport protein YdjE  98.32 
 
 
416 aa  807    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.754275 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1993  major facilitator family transporter  98.67 
 
 
452 aa  880    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.863885  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3220  major facilitator superfamily MFS_1  44.03 
 
 
463 aa  377  1e-103  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0542188  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2060  inner membrane metabolite transport protein YdjE  43.52 
 
 
459 aa  374  1e-102  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0010058 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1860  major facilitator family transporter  43.52 
 
 
459 aa  372  1e-102  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0174535  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1857  major facilitator transporter  43.52 
 
 
459 aa  374  1e-102  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.526363  hitchhiker  0.0000247936 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1999  major facilitator family transporter  43.52 
 
 
459 aa  374  1e-102  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0702699  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1867  major facilitator superfamily MFS_1  43.52 
 
 
459 aa  362  6e-99  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000517052  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1416  major facilitator family transporter  43.52 
 
 
459 aa  362  8e-99  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.888006  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01744  predicted transporter  43.3 
 
 
459 aa  360  3e-98  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.955946  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01732  hypothetical protein  43.3 
 
 
459 aa  360  3e-98  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2499  major facilitator family transporter  43.08 
 
 
459 aa  359  7e-98  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.465931  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0613  major facilitator superfamily MFS_1  38.36 
 
 
473 aa  296  7e-79  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0274336 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4087  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  38.91 
 
 
468 aa  290  3e-77  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.281632  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6599  major facilitator superfamily MFS_1  37.25 
 
 
459 aa  285  8e-76  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.332731  normal  0.158495 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0970  major facilitator superfamily transporter metabolite/H(+) symporter  37.64 
 
 
470 aa  280  4e-74  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00262609  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5167  major facilitator superfamily MFS_1  38.37 
 
 
470 aa  273  3e-72  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0987  major facilitator superfamily transporter metabolite/H(+) symporter  36.71 
 
 
461 aa  274  3e-72  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.496425 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5172  major facilitator superfamily MFS_1  37.42 
 
 
466 aa  265  1e-69  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0974  major facilitator superfamily aromatic acid/H(+) symporter  35.98 
 
 
462 aa  261  1e-68  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00000109951  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0190  major facilitator superfamily MFS_1  36.04 
 
 
460 aa  261  2e-68  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000521499 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0967  major facilitator superfamily aromatic acid/H(+) symporter  35.32 
 
 
462 aa  260  3e-68  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5972  major facilitator transporter  34.95 
 
 
462 aa  259  7e-68  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6268  major facilitator transporter  34.87 
 
 
462 aa  258  1e-67  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.492492 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0270  major facilitator transporter  35.7 
 
 
477 aa  255  1.0000000000000001e-66  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0250869  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0828  major facilitator superfamily aromatic acid/H(+) symporter  34.44 
 
 
450 aa  253  6e-66  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.420618  normal  0.255495 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0528  major facilitator transporter  37.58 
 
 
467 aa  252  8.000000000000001e-66  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0826405  hitchhiker  0.00770286 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1937  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  34.07 
 
 
474 aa  246  9e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000000000973666  normal  0.0403058 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2028  major facilitator superfamily permease  33.03 
 
 
428 aa  235  1.0000000000000001e-60  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0896  major facilitator superfamily MFS_1  32.35 
 
 
462 aa  227  3e-58  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5934  major facilitator transporter  37.28 
 
 
468 aa  220  3.9999999999999997e-56  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0786793 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0129  putative permease  32.05 
 
 
459 aa  218  1e-55  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.549779  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6853  major facilitator transporter  32.54 
 
 
430 aa  211  2e-53  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.854567  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0285  major facilitator superfamily sugar transporter  28.91 
 
 
464 aa  183  4.0000000000000006e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.192742  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2413  major facilitator transporter  28.45 
 
 
447 aa  174  2.9999999999999996e-42  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000787137  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3358  major facilitator superfamily MFS_1  30.27 
 
 
459 aa  171  2e-41  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4638  major facilitator superfamily MFS_1  29.69 
 
 
451 aa  170  6e-41  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000178504  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5178  major facilitator transporter  29.3 
 
 
457 aa  167  2.9999999999999998e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0920  major facilitator superfamily transporter metabolite/H(+) symporter  29.61 
 
 
487 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.697574 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4647  major facilitator superfamily MFS_1  29.18 
 
 
488 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.866665  normal  0.46173 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3453  major facilitator transporter  28.6 
 
 
472 aa  167  4e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0499831  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0382  major facilitator transporter  28.33 
 
 
472 aa  166  6.9999999999999995e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.660441 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4627  major facilitator transporter  28.33 
 
 
475 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5153  major facilitator transporter  28.33 
 
 
475 aa  166  1.0000000000000001e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.507557  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5266  major facilitator transporter  28.33 
 
 
472 aa  165  2.0000000000000002e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5007  major facilitator transporter  28.33 
 
 
472 aa  165  2.0000000000000002e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6200  major facilitator transporter  29.4 
 
 
492 aa  165  2.0000000000000002e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0622411 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3101  major facilitator transporter  28.33 
 
 
472 aa  165  2.0000000000000002e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.380275  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6282  major facilitator transporter  28.21 
 
 
479 aa  164  3e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.384913  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5986  major facilitator transporter  28.21 
 
 
479 aa  164  3e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8056  major facilitator superfamily MFS_1  28.76 
 
 
451 aa  161  2e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0910  major facilitator family transporter  28.29 
 
 
472 aa  161  2e-38  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.367874  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1660  MFS family transporter  30.18 
 
 
455 aa  160  3e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2063  major facilitator superfamily MFS_1  28.9 
 
 
479 aa  160  3e-38  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0432509  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1973  major facilitator transporter  27.89 
 
 
472 aa  160  4e-38  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0788  major facilitator family transporter  27.89 
 
 
472 aa  160  4e-38  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.509193  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0486  major facilitator family transporter  27.89 
 
 
472 aa  160  4e-38  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0312823  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0555  major facilitator family transporter  27.89 
 
 
472 aa  160  4e-38  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5053  major facilitator superfamily MFS_1  30.29 
 
 
472 aa  160  5e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.122247 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19270  putative MFS transporter  29.87 
 
 
455 aa  160  6e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.149627  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2070  major facilitator transporter  27.89 
 
 
472 aa  159  7e-38  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.376866  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1595  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  31.49 
 
 
472 aa  159  1e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1414  major facilitator superfamily MFS_1  28.76 
 
 
444 aa  159  1e-37  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0808  major facilitator superfamily MFS_1  29.4 
 
 
494 aa  158  2e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1268  MFS transporter  26.77 
 
 
487 aa  154  5e-36  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.916286  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3036  major facilitator transporter  26.55 
 
 
487 aa  152  1e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3311  major facilitator transporter  30 
 
 
474 aa  151  2e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.799238  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1717  major facilitator transporter  28.57 
 
 
488 aa  151  2e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1482  major facilitator superfamily MFS_1  28.57 
 
 
451 aa  150  4e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000115751  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1412  major facilitator transporter  28.73 
 
 
465 aa  150  4e-35  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2231  major facilitator family transporter  26.72 
 
 
482 aa  149  1.0000000000000001e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0177  major facilitator family transporter  27.49 
 
 
478 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3530  major facilitator transporter  29.76 
 
 
469 aa  148  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.229516  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0471  major facilitator family transporter  27.49 
 
 
478 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1431  major facilitator family transporter  27.49 
 
 
478 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.475934  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0911  major facilitator family transporter  27.49 
 
 
478 aa  147  3e-34  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.577596  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0379  major facilitator family transporter  27.49 
 
 
478 aa  147  3e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0539  major facilitator transporter  28.64 
 
 
473 aa  147  3e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1931  major facilitator superfamily permease  27.27 
 
 
478 aa  147  4.0000000000000006e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0979116  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1841  major facilitator family transporter  27.27 
 
 
478 aa  147  5e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5172  major facilitator transporter  27.96 
 
 
474 aa  147  5e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0809503 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5109  major facilitator transporter  27.72 
 
 
474 aa  147  5e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0792  major facilitator superfamily MFS_1  27.09 
 
 
458 aa  147  5e-34  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.753449  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4090  major facilitator superfamily metabolite(sugar)/H(+) symporter  26.71 
 
 
471 aa  146  9e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.94274  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1483  major facilitator superfamily MFS_1  28.9 
 
 
456 aa  145  1e-33  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1414  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  26.93 
 
 
468 aa  145  1e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000198546  normal  0.095851 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3259  major facilitator transporter  27.72 
 
 
474 aa  145  1e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.331503  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6205  major facilitator superfamily MFS_1  25.76 
 
 
471 aa  145  1e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6611  major facilitator transporter  27.04 
 
 
479 aa  145  2e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.410873  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0547  major facilitator superfamily transporter  27.09 
 
 
456 aa  145  2e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.392915  normal  0.285749 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6959  major facilitator transporter  27.87 
 
 
479 aa  143  7e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0670  general substrate transporter  27.35 
 
 
459 aa  141  3e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.753041 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4015  major facilitator superfamily MFS_1  25.76 
 
 
477 aa  140  3e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>