More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_B0920 on replicon NC_007952
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009075  BURPS668_A2070  major facilitator transporter  81.24 
 
 
472 aa  728    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.376866  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1973  major facilitator transporter  81.02 
 
 
472 aa  726    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0788  major facilitator family transporter  81.02 
 
 
472 aa  726    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.509193  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4647  major facilitator superfamily MFS_1  94.06 
 
 
488 aa  889    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.866665  normal  0.46173 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3453  major facilitator transporter  82.98 
 
 
472 aa  764    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0499831  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0486  major facilitator family transporter  81.24 
 
 
472 aa  727    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0312823  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0382  major facilitator transporter  82.09 
 
 
472 aa  761    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.660441 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6200  major facilitator transporter  70.28 
 
 
492 aa  663    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0622411 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5266  major facilitator transporter  82.55 
 
 
472 aa  759    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0910  major facilitator family transporter  81.24 
 
 
472 aa  733    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.367874  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0920  major facilitator superfamily transporter metabolite/H(+) symporter  100 
 
 
487 aa  966    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.697574 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5007  major facilitator transporter  82.55 
 
 
472 aa  759    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3101  major facilitator transporter  82.55 
 
 
472 aa  759    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.380275  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5153  major facilitator transporter  83.94 
 
 
475 aa  767    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.507557  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0555  major facilitator family transporter  81.02 
 
 
472 aa  726    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4627  major facilitator transporter  85.12 
 
 
475 aa  765    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0808  major facilitator superfamily MFS_1  76.54 
 
 
494 aa  686    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0667  major facilitator family transporter  80.99 
 
 
494 aa  628  1e-179  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0482021  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3530  major facilitator transporter  69.83 
 
 
469 aa  616  1e-175  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.229516  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4015  major facilitator superfamily MFS_1  57.65 
 
 
477 aa  547  1e-154  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5986  major facilitator transporter  55.9 
 
 
479 aa  527  1e-148  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6282  major facilitator transporter  55.68 
 
 
479 aa  525  1e-148  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.384913  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2063  major facilitator superfamily MFS_1  53.99 
 
 
479 aa  506  9.999999999999999e-143  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0432509  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6611  major facilitator transporter  54.12 
 
 
479 aa  487  1e-136  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.410873  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6959  major facilitator transporter  54.85 
 
 
479 aa  472  1e-132  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2496  major facilitator family transporter  50.85 
 
 
472 aa  466  9.999999999999999e-131  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.206768  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2304  major facilitator transporter  51.08 
 
 
472 aa  466  9.999999999999999e-131  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.759044  normal  0.046264 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4340  general substrate transporter  50.98 
 
 
477 aa  464  1e-129  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4090  major facilitator superfamily metabolite(sugar)/H(+) symporter  50.66 
 
 
471 aa  448  1.0000000000000001e-124  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.94274  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6205  major facilitator superfamily MFS_1  49.89 
 
 
471 aa  442  1e-123  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1412  major facilitator transporter  49.35 
 
 
465 aa  439  9.999999999999999e-123  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2231  major facilitator family transporter  48.46 
 
 
482 aa  429  1e-119  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3036  major facilitator transporter  48.38 
 
 
487 aa  419  1e-116  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1268  MFS transporter  48.6 
 
 
487 aa  420  1e-116  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.916286  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3193  major facilitator transporter  45.49 
 
 
472 aa  415  9.999999999999999e-116  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.9008 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1717  major facilitator transporter  48.12 
 
 
488 aa  412  1e-114  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1759  major facilitator superfamily MFS_1  44.4 
 
 
472 aa  387  1e-106  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00188  MFS transporter  47.28 
 
 
471 aa  378  1e-103  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.103216  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1718  major facilitator transporter  44.84 
 
 
473 aa  374  1e-102  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.442738  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1269  major facilitator transporter  43.27 
 
 
466 aa  367  1e-100  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2576  major facilitator transporter  42.58 
 
 
475 aa  353  5.9999999999999994e-96  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.634768  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0792  major facilitator superfamily MFS_1  37.69 
 
 
458 aa  290  4e-77  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.753449  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1483  major facilitator superfamily MFS_1  37.17 
 
 
456 aa  275  2.0000000000000002e-72  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0285  major facilitator superfamily sugar transporter  36.67 
 
 
464 aa  265  1e-69  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.192742  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0828  major facilitator superfamily aromatic acid/H(+) symporter  34.84 
 
 
450 aa  248  2e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.420618  normal  0.255495 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0463  major facilitator transporter  35.16 
 
 
448 aa  246  8e-64  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0213055  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0881  major facilitator superfamily MFS_1  33.63 
 
 
448 aa  244  1.9999999999999999e-63  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.202747  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4860  major facilitator transporter  33.11 
 
 
487 aa  240  4e-62  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0839463 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4638  major facilitator superfamily MFS_1  34.27 
 
 
451 aa  234  2.0000000000000002e-60  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000178504  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1668  major facilitator transporter  32.96 
 
 
487 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.339414  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1626  major facilitator transporter  31.35 
 
 
485 aa  233  6e-60  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.408436  normal  0.668079 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1696  major facilitator transporter  32.74 
 
 
487 aa  233  6e-60  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.4496  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1217  major facilitator transporter  32.74 
 
 
487 aa  233  6e-60  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.207678  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1551  major facilitator transporter  32.54 
 
 
485 aa  231  2e-59  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.308182  normal  0.0914413 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1604  major facilitator transporter  30.94 
 
 
485 aa  230  5e-59  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0528  major facilitator transporter  34.5 
 
 
467 aa  224  2e-57  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0826405  hitchhiker  0.00770286 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0987  major facilitator superfamily transporter metabolite/H(+) symporter  32.74 
 
 
461 aa  222  9.999999999999999e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.496425 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0967  major facilitator superfamily aromatic acid/H(+) symporter  33.99 
 
 
462 aa  222  9.999999999999999e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0613  major facilitator superfamily MFS_1  31.5 
 
 
473 aa  220  6e-56  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0274336 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0970  major facilitator superfamily transporter metabolite/H(+) symporter  31.51 
 
 
470 aa  215  1.9999999999999998e-54  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00262609  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6599  major facilitator superfamily MFS_1  32.45 
 
 
459 aa  213  5.999999999999999e-54  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.332731  normal  0.158495 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4087  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  32.23 
 
 
468 aa  211  2e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.281632  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0190  major facilitator superfamily MFS_1  33.19 
 
 
460 aa  211  3e-53  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000521499 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0668  major facilitator transporter  36.19 
 
 
474 aa  211  4e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00169534  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5972  major facilitator transporter  30.38 
 
 
462 aa  207  2e-52  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0270  major facilitator transporter  33.55 
 
 
477 aa  206  7e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0250869  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1937  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  34.38 
 
 
474 aa  206  8e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000000000973666  normal  0.0403058 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6268  major facilitator transporter  30.4 
 
 
462 aa  206  8e-52  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.492492 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1414  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  32.32 
 
 
468 aa  206  1e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000198546  normal  0.095851 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0974  major facilitator superfamily aromatic acid/H(+) symporter  34.27 
 
 
462 aa  206  1e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00000109951  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5172  major facilitator superfamily MFS_1  30.75 
 
 
466 aa  202  8e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0379  major facilitator family transporter  34.2 
 
 
478 aa  200  3.9999999999999996e-50  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0539  major facilitator transporter  35.06 
 
 
473 aa  200  5e-50  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8056  major facilitator superfamily MFS_1  32.17 
 
 
451 aa  199  6e-50  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5109  major facilitator transporter  34.57 
 
 
474 aa  199  7.999999999999999e-50  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5172  major facilitator transporter  34.65 
 
 
474 aa  199  1.0000000000000001e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0809503 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19270  putative MFS transporter  32.84 
 
 
455 aa  199  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.149627  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1595  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  32.97 
 
 
472 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5167  major facilitator superfamily MFS_1  30.47 
 
 
470 aa  197  3e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1431  major facilitator family transporter  33.99 
 
 
478 aa  197  3e-49  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.475934  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0177  major facilitator family transporter  33.99 
 
 
478 aa  197  3e-49  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0471  major facilitator family transporter  33.99 
 
 
478 aa  197  3e-49  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3259  major facilitator transporter  34.57 
 
 
474 aa  197  3e-49  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.331503  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1931  major facilitator superfamily permease  33.77 
 
 
478 aa  197  4.0000000000000005e-49  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0979116  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3358  major facilitator superfamily MFS_1  30.79 
 
 
459 aa  197  4.0000000000000005e-49  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1660  MFS family transporter  32.62 
 
 
455 aa  197  4.0000000000000005e-49  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1841  major facilitator family transporter  33.77 
 
 
478 aa  196  6e-49  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5053  major facilitator superfamily MFS_1  32.75 
 
 
472 aa  196  7e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.122247 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0911  major facilitator family transporter  33.77 
 
 
478 aa  196  9e-49  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.577596  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5934  major facilitator transporter  32.51 
 
 
468 aa  195  1e-48  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0786793 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3533  major facilitator transporter  34.68 
 
 
473 aa  193  6e-48  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0670  general substrate transporter  33.12 
 
 
459 aa  193  8e-48  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.753041 
 
 
-
 
NC_003296  RS02027  metabolite transporter  33.12 
 
 
476 aa  191  2.9999999999999997e-47  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.158134 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6853  major facilitator transporter  31.71 
 
 
430 aa  189  7e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.854567  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3311  major facilitator transporter  32.92 
 
 
474 aa  188  2e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.799238  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0896  major facilitator superfamily MFS_1  31.86 
 
 
462 aa  184  3e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0129  putative permease  31.25 
 
 
459 aa  184  3e-45  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.549779  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2088  major facilitator superfamily MFS_1  32.05 
 
 
456 aa  183  5.0000000000000004e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.565943 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5178  major facilitator transporter  30.51 
 
 
457 aa  177  3e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1993  major facilitator family transporter  30.57 
 
 
452 aa  177  4e-43  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.863885  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>