More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_0190 on replicon NC_010681
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010681  Bphyt_0190  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 
460 aa  919    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000521499 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1937  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  78.35 
 
 
474 aa  723    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000000000973666  normal  0.0403058 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0974  major facilitator superfamily aromatic acid/H(+) symporter  76.41 
 
 
462 aa  702    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00000109951  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0967  major facilitator superfamily aromatic acid/H(+) symporter  63.35 
 
 
462 aa  576  1.0000000000000001e-163  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6599  major facilitator superfamily MFS_1  47.2 
 
 
459 aa  411  1e-113  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.332731  normal  0.158495 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0613  major facilitator superfamily MFS_1  45.72 
 
 
473 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0274336 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6268  major facilitator transporter  45.02 
 
 
462 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.492492 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5972  major facilitator transporter  44.59 
 
 
462 aa  395  1e-109  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5167  major facilitator superfamily MFS_1  45.43 
 
 
470 aa  391  1e-107  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0828  major facilitator superfamily aromatic acid/H(+) symporter  45.74 
 
 
450 aa  390  1e-107  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.420618  normal  0.255495 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4087  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  45.72 
 
 
468 aa  384  1e-105  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.281632  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5172  major facilitator superfamily MFS_1  46.51 
 
 
466 aa  374  1e-102  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0970  major facilitator superfamily transporter metabolite/H(+) symporter  43.36 
 
 
470 aa  369  1e-101  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00262609  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0987  major facilitator superfamily transporter metabolite/H(+) symporter  46.24 
 
 
461 aa  371  1e-101  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.496425 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0528  major facilitator transporter  44.15 
 
 
467 aa  360  3e-98  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0826405  hitchhiker  0.00770286 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0270  major facilitator transporter  45.84 
 
 
477 aa  355  6.999999999999999e-97  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0250869  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5934  major facilitator transporter  44.81 
 
 
468 aa  349  7e-95  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0786793 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0896  major facilitator superfamily MFS_1  43.49 
 
 
462 aa  336  5.999999999999999e-91  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6853  major facilitator transporter  41.71 
 
 
430 aa  334  2e-90  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.854567  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2028  major facilitator superfamily permease  35.19 
 
 
428 aa  271  2e-71  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0129  putative permease  37.1 
 
 
459 aa  271  2.9999999999999997e-71  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.549779  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01738  predicted transporter  35.59 
 
 
452 aa  261  2e-68  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.375088  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1863  major facilitator transporter  36.04 
 
 
452 aa  261  2e-68  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.369973  hitchhiker  0.0000261137 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01726  hypothetical protein  35.59 
 
 
452 aa  261  2e-68  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.448165  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2054  inner membrane metabolite transport protein YdjE  34.73 
 
 
452 aa  261  2e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.0842085 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1993  major facilitator family transporter  35.36 
 
 
452 aa  260  3e-68  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.863885  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1853  major facilitator family transporter  35.59 
 
 
452 aa  260  3e-68  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0220731  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1873  major facilitator superfamily MFS_1  35.36 
 
 
452 aa  260  4e-68  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0070319  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1422  major facilitator family transporter  35.67 
 
 
452 aa  260  4e-68  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.452173  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3220  major facilitator superfamily MFS_1  33.93 
 
 
463 aa  243  3.9999999999999997e-63  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0542188  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2060  inner membrane metabolite transport protein YdjE  32.81 
 
 
459 aa  237  3e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0010058 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2490  inner membrane metabolite transport protein YdjE  34.22 
 
 
416 aa  232  1e-59  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.754275 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1999  major facilitator family transporter  31.92 
 
 
459 aa  229  6e-59  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0702699  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1857  major facilitator transporter  31.92 
 
 
459 aa  229  6e-59  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.526363  hitchhiker  0.0000247936 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1860  major facilitator family transporter  31.92 
 
 
459 aa  228  1e-58  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0174535  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1867  major facilitator superfamily MFS_1  31.92 
 
 
459 aa  216  7e-55  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000517052  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1416  major facilitator family transporter  31.92 
 
 
459 aa  216  7e-55  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.888006  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2499  major facilitator family transporter  31.7 
 
 
459 aa  215  9.999999999999999e-55  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.465931  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5109  major facilitator transporter  33.98 
 
 
474 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01744  predicted transporter  31.7 
 
 
459 aa  214  2.9999999999999995e-54  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.955946  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01732  hypothetical protein  31.7 
 
 
459 aa  214  2.9999999999999995e-54  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5172  major facilitator transporter  34.08 
 
 
474 aa  214  3.9999999999999995e-54  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0809503 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3259  major facilitator transporter  33.76 
 
 
474 aa  212  1e-53  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.331503  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3311  major facilitator transporter  33.55 
 
 
474 aa  211  2e-53  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.799238  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0539  major facilitator transporter  33.63 
 
 
473 aa  208  2e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1595  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  33.19 
 
 
472 aa  208  2e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5053  major facilitator superfamily MFS_1  33.55 
 
 
472 aa  207  3e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.122247 
 
 
-
 
NC_003296  RS02027  metabolite transporter  34.13 
 
 
476 aa  204  2e-51  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.158134 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3533  major facilitator transporter  32.25 
 
 
473 aa  204  2e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5986  major facilitator transporter  30.48 
 
 
479 aa  204  3e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6282  major facilitator transporter  30.48 
 
 
479 aa  204  3e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.384913  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4647  major facilitator superfamily MFS_1  30.02 
 
 
488 aa  203  5e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.866665  normal  0.46173 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0920  major facilitator superfamily transporter metabolite/H(+) symporter  31.84 
 
 
487 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.697574 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6611  major facilitator transporter  32.24 
 
 
479 aa  200  6e-50  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.410873  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6200  major facilitator transporter  29.98 
 
 
492 aa  199  7e-50  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0622411 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2073  major facilitator superfamily transporter  33.83 
 
 
467 aa  196  8.000000000000001e-49  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0013865 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1931  major facilitator superfamily permease  32.44 
 
 
478 aa  194  2e-48  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0979116  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0177  major facilitator family transporter  32.44 
 
 
478 aa  194  3e-48  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1431  major facilitator family transporter  32.44 
 
 
478 aa  194  3e-48  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.475934  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2413  major facilitator transporter  30.96 
 
 
447 aa  194  3e-48  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000787137  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4015  major facilitator superfamily MFS_1  31.03 
 
 
477 aa  194  3e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0471  major facilitator family transporter  32.44 
 
 
478 aa  194  3e-48  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1841  major facilitator family transporter  32.44 
 
 
478 aa  194  4e-48  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0911  major facilitator family transporter  32.44 
 
 
478 aa  193  5e-48  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.577596  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0379  major facilitator family transporter  32.44 
 
 
478 aa  193  5e-48  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2063  major facilitator superfamily MFS_1  30.77 
 
 
479 aa  191  2e-47  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0432509  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4638  major facilitator superfamily MFS_1  29.73 
 
 
451 aa  191  2.9999999999999997e-47  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000178504  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6959  major facilitator transporter  31.21 
 
 
479 aa  190  4e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0910  major facilitator family transporter  29.52 
 
 
472 aa  190  5e-47  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.367874  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2070  major facilitator transporter  31.21 
 
 
472 aa  189  5.999999999999999e-47  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.376866  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3530  major facilitator transporter  34.05 
 
 
469 aa  190  5.999999999999999e-47  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.229516  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0788  major facilitator family transporter  31.21 
 
 
472 aa  189  7e-47  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.509193  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1973  major facilitator transporter  31.21 
 
 
472 aa  189  7e-47  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0555  major facilitator family transporter  31.21 
 
 
472 aa  189  7e-47  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1482  major facilitator superfamily MFS_1  31.79 
 
 
451 aa  189  9e-47  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000115751  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3453  major facilitator transporter  28.97 
 
 
472 aa  189  1e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0499831  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0486  major facilitator family transporter  30.99 
 
 
472 aa  188  1e-46  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0312823  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0808  major facilitator superfamily MFS_1  30.79 
 
 
494 aa  188  1e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0382  major facilitator transporter  28.76 
 
 
472 aa  188  2e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.660441 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0667  major facilitator family transporter  32.06 
 
 
494 aa  187  2e-46  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0482021  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5266  major facilitator transporter  28.76 
 
 
472 aa  187  3e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5178  major facilitator transporter  31.26 
 
 
457 aa  187  3e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5007  major facilitator transporter  28.76 
 
 
472 aa  187  3e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3101  major facilitator transporter  28.76 
 
 
472 aa  187  3e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.380275  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0792  major facilitator superfamily MFS_1  28.45 
 
 
458 aa  187  3e-46  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.753449  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8056  major facilitator superfamily MFS_1  32.51 
 
 
451 aa  187  5e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0285  major facilitator superfamily sugar transporter  30.8 
 
 
464 aa  186  6e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.192742  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5153  major facilitator transporter  28.45 
 
 
475 aa  186  6e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.507557  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4627  major facilitator transporter  28.45 
 
 
475 aa  186  8e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19270  putative MFS transporter  31.42 
 
 
455 aa  184  3e-45  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.149627  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1660  MFS family transporter  31.19 
 
 
455 aa  182  8.000000000000001e-45  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0670  general substrate transporter  31.79 
 
 
459 aa  182  1e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.753041 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1483  major facilitator superfamily MFS_1  28.61 
 
 
456 aa  182  1e-44  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2088  major facilitator superfamily MFS_1  30.44 
 
 
456 aa  179  8e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.565943 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4340  general substrate transporter  27.91 
 
 
477 aa  179  1e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2304  major facilitator transporter  28.13 
 
 
472 aa  176  9e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.759044  normal  0.046264 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3193  major facilitator transporter  28.24 
 
 
472 aa  175  1.9999999999999998e-42  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.9008 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1414  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  30.62 
 
 
468 aa  174  3.9999999999999995e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000198546  normal  0.095851 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2496  major facilitator family transporter  27.9 
 
 
472 aa  171  2e-41  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.206768  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1759  major facilitator superfamily MFS_1  28.45 
 
 
472 aa  171  3e-41  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>