More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_C0270 on replicon NC_007953
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007953  Bxe_C0270  major facilitator transporter  100 
 
 
477 aa  936    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0250869  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6599  major facilitator superfamily MFS_1  45.18 
 
 
459 aa  387  1e-106  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.332731  normal  0.158495 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5972  major facilitator transporter  44.64 
 
 
462 aa  388  1e-106  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1937  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  47.05 
 
 
474 aa  385  1e-106  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000000000973666  normal  0.0403058 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6268  major facilitator transporter  44.2 
 
 
462 aa  385  1e-106  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.492492 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0987  major facilitator superfamily transporter metabolite/H(+) symporter  44.24 
 
 
461 aa  383  1e-105  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.496425 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5167  major facilitator superfamily MFS_1  48.03 
 
 
470 aa  384  1e-105  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0970  major facilitator superfamily transporter metabolite/H(+) symporter  41.58 
 
 
470 aa  379  1e-104  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00262609  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0613  major facilitator superfamily MFS_1  43.56 
 
 
473 aa  377  1e-103  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0274336 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0190  major facilitator superfamily MFS_1  45.84 
 
 
460 aa  378  1e-103  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000521499 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0974  major facilitator superfamily aromatic acid/H(+) symporter  46.29 
 
 
462 aa  378  1e-103  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00000109951  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4087  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  42.46 
 
 
468 aa  375  1e-102  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.281632  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0528  major facilitator transporter  47.02 
 
 
467 aa  369  1e-101  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0826405  hitchhiker  0.00770286 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5172  major facilitator superfamily MFS_1  46.8 
 
 
466 aa  366  1e-100  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0967  major facilitator superfamily aromatic acid/H(+) symporter  44.12 
 
 
462 aa  366  1e-100  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0896  major facilitator superfamily MFS_1  47.25 
 
 
462 aa  363  4e-99  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0828  major facilitator superfamily aromatic acid/H(+) symporter  42.67 
 
 
450 aa  361  2e-98  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.420618  normal  0.255495 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5934  major facilitator transporter  44.35 
 
 
468 aa  338  9.999999999999999e-92  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0786793 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6853  major facilitator transporter  40.57 
 
 
430 aa  313  4.999999999999999e-84  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.854567  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1993  major facilitator family transporter  35.7 
 
 
452 aa  270  4e-71  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.863885  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1873  major facilitator superfamily MFS_1  35.7 
 
 
452 aa  269  1e-70  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0070319  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1422  major facilitator family transporter  35.48 
 
 
452 aa  268  1e-70  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.452173  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1863  major facilitator transporter  35.7 
 
 
452 aa  268  1e-70  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.369973  hitchhiker  0.0000261137 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2054  inner membrane metabolite transport protein YdjE  36.3 
 
 
452 aa  269  1e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.0842085 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01738  predicted transporter  35.7 
 
 
452 aa  267  2.9999999999999995e-70  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.375088  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01726  hypothetical protein  35.7 
 
 
452 aa  267  2.9999999999999995e-70  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.448165  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1853  major facilitator family transporter  35.7 
 
 
452 aa  266  5e-70  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0220731  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3220  major facilitator superfamily MFS_1  35.24 
 
 
463 aa  253  5.000000000000001e-66  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0542188  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0129  putative permease  34.11 
 
 
459 aa  248  1e-64  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.549779  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1999  major facilitator family transporter  34.43 
 
 
459 aa  242  1e-62  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0702699  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1857  major facilitator transporter  34.43 
 
 
459 aa  242  1e-62  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.526363  hitchhiker  0.0000247936 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1860  major facilitator family transporter  34.43 
 
 
459 aa  241  2.9999999999999997e-62  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0174535  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2060  inner membrane metabolite transport protein YdjE  34.5 
 
 
459 aa  236  8e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0010058 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2490  inner membrane metabolite transport protein YdjE  34.87 
 
 
416 aa  234  3e-60  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.754275 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01744  predicted transporter  34.43 
 
 
459 aa  233  8.000000000000001e-60  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.955946  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01732  hypothetical protein  34.43 
 
 
459 aa  233  8.000000000000001e-60  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2499  major facilitator family transporter  34.43 
 
 
459 aa  232  1e-59  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.465931  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2028  major facilitator superfamily permease  33.5 
 
 
428 aa  231  2e-59  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1867  major facilitator superfamily MFS_1  34.43 
 
 
459 aa  231  3e-59  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000517052  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1416  major facilitator family transporter  34.43 
 
 
459 aa  230  3e-59  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.888006  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4627  major facilitator transporter  35.09 
 
 
475 aa  219  7e-56  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5153  major facilitator transporter  34.65 
 
 
475 aa  218  1e-55  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.507557  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0382  major facilitator transporter  34.43 
 
 
472 aa  216  5e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.660441 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5266  major facilitator transporter  34.43 
 
 
472 aa  215  9.999999999999999e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5007  major facilitator transporter  34.43 
 
 
472 aa  215  9.999999999999999e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3101  major facilitator transporter  34.43 
 
 
472 aa  215  9.999999999999999e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.380275  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6611  major facilitator transporter  32.96 
 
 
479 aa  214  2.9999999999999995e-54  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.410873  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4647  major facilitator superfamily MFS_1  33.48 
 
 
488 aa  213  9e-54  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.866665  normal  0.46173 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3453  major facilitator transporter  34.07 
 
 
472 aa  212  9e-54  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0499831  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0910  major facilitator family transporter  34.73 
 
 
472 aa  212  1e-53  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.367874  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6200  major facilitator transporter  34.52 
 
 
492 aa  210  4e-53  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0622411 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0920  major facilitator superfamily transporter metabolite/H(+) symporter  33.26 
 
 
487 aa  209  6e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.697574 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5986  major facilitator transporter  30.99 
 
 
479 aa  209  1e-52  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6282  major facilitator transporter  30.99 
 
 
479 aa  209  1e-52  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.384913  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2063  major facilitator superfamily MFS_1  32.54 
 
 
479 aa  208  2e-52  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0432509  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0788  major facilitator family transporter  34.51 
 
 
472 aa  206  1e-51  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.509193  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1973  major facilitator transporter  34.51 
 
 
472 aa  206  1e-51  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0285  major facilitator superfamily sugar transporter  32.77 
 
 
464 aa  206  1e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.192742  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0555  major facilitator family transporter  34.51 
 
 
472 aa  206  1e-51  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2070  major facilitator transporter  34.29 
 
 
472 aa  205  1e-51  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.376866  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4015  major facilitator superfamily MFS_1  30.96 
 
 
477 aa  204  2e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0486  major facilitator family transporter  34.29 
 
 
472 aa  205  2e-51  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0312823  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4090  major facilitator superfamily metabolite(sugar)/H(+) symporter  31 
 
 
471 aa  199  9e-50  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.94274  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0808  major facilitator superfamily MFS_1  33.41 
 
 
494 aa  198  2.0000000000000003e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6205  major facilitator superfamily MFS_1  30.7 
 
 
471 aa  197  3e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6959  major facilitator transporter  31.79 
 
 
479 aa  196  1e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1595  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  31.14 
 
 
472 aa  191  2e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2576  major facilitator transporter  31.86 
 
 
475 aa  191  2.9999999999999997e-47  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.634768  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5053  major facilitator superfamily MFS_1  30.62 
 
 
472 aa  190  5.999999999999999e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.122247 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1268  MFS transporter  32.12 
 
 
487 aa  189  1e-46  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.916286  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2413  major facilitator transporter  31.06 
 
 
447 aa  188  2e-46  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000787137  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3036  major facilitator transporter  31.91 
 
 
487 aa  187  3e-46  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2496  major facilitator family transporter  29.27 
 
 
472 aa  186  8e-46  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.206768  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5109  major facilitator transporter  31.69 
 
 
474 aa  185  2.0000000000000003e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4340  general substrate transporter  29.71 
 
 
477 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5172  major facilitator transporter  32.37 
 
 
474 aa  185  2.0000000000000003e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0809503 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0667  major facilitator family transporter  35.22 
 
 
494 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0482021  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3530  major facilitator transporter  33.62 
 
 
469 aa  184  3e-45  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.229516  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2231  major facilitator family transporter  32.19 
 
 
482 aa  184  3e-45  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3259  major facilitator transporter  31.48 
 
 
474 aa  182  9.000000000000001e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.331503  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1269  major facilitator transporter  29.26 
 
 
466 aa  181  2.9999999999999997e-44  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0539  major facilitator transporter  31.57 
 
 
473 aa  181  4e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0670  general substrate transporter  30.55 
 
 
459 aa  180  5.999999999999999e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.753041 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3311  major facilitator transporter  30.99 
 
 
474 aa  179  7e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.799238  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2304  major facilitator transporter  28.79 
 
 
472 aa  178  1e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.759044  normal  0.046264 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3533  major facilitator transporter  31.75 
 
 
473 aa  176  6e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0379  major facilitator family transporter  32.73 
 
 
478 aa  176  9e-43  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1841  major facilitator family transporter  32.51 
 
 
478 aa  175  9.999999999999999e-43  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4638  major facilitator superfamily MFS_1  28.1 
 
 
451 aa  176  9.999999999999999e-43  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000178504  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1931  major facilitator superfamily permease  32.51 
 
 
478 aa  175  9.999999999999999e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0979116  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0911  major facilitator family transporter  32.51 
 
 
478 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.577596  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0177  major facilitator family transporter  32.51 
 
 
478 aa  175  1.9999999999999998e-42  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0471  major facilitator family transporter  32.51 
 
 
478 aa  175  1.9999999999999998e-42  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1431  major facilitator family transporter  32.51 
 
 
478 aa  175  1.9999999999999998e-42  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.475934  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2088  major facilitator superfamily MFS_1  30.87 
 
 
456 aa  174  5e-42  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.565943 
 
 
-
 
NC_003296  RS02027  metabolite transporter  30.3 
 
 
476 aa  172  1e-41  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.158134 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0792  major facilitator superfamily MFS_1  28.26 
 
 
458 aa  172  1e-41  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.753449  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1412  major facilitator transporter  31.7 
 
 
465 aa  172  1e-41  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4651  major facilitator superfamily MFS_1  28.66 
 
 
470 aa  171  2e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1414  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  29.2 
 
 
468 aa  171  2e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000198546  normal  0.095851 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>