More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_3311 on replicon NC_010623
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008543  Bcen2424_5109  major facilitator transporter  83.77 
 
 		 474 aa  737    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5172  major facilitator transporter  86.39 
 
 		 474 aa  735    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0809503 
 
 
-
 
NC_003296  RS02027  metabolite transporter  82.93 
 
 		 476 aa  706    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.158134 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3311  major facilitator transporter  100 
 
 		 474 aa  934    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.799238  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0911  major facilitator family transporter  86.43 
 
 		 478 aa  730    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.577596  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0177  major facilitator family transporter  86.65 
 
 		 478 aa  732    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5053  major facilitator superfamily MFS_1  84.85 
 
 		 472 aa  755    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.122247 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0379  major facilitator family transporter  86.43 
 
 		 478 aa  730    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1431  major facilitator family transporter  86.65 
 
 		 478 aa  732    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.475934  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2073  major facilitator superfamily transporter  81.96 
 
 		 467 aa  707    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0013865 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0539  major facilitator transporter  85.94 
 
 		 473 aa  732    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3533  major facilitator transporter  83.62 
 
 		 473 aa  697    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1595  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  84.2 
 
 		 472 aa  748    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1841  major facilitator family transporter  86.43 
 
 		 478 aa  730    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3259  major facilitator transporter  83.55 
 
 		 474 aa  734    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.331503  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1931  major facilitator superfamily permease  86.65 
 
 		 478 aa  732    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0979116  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0471  major facilitator family transporter  86.65 
 
 		 478 aa  732    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1660  MFS family transporter  69.15 
 
 		 455 aa  633  1e-180  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19270  putative MFS transporter  70.22 
 
 		 455 aa  629  1e-179  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.149627  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0670  general substrate transporter  69.4 
 
 		 459 aa  609  1e-173  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.753041 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1010  major facilitator family transporter  85.28 
 
 		 398 aa  578  1e-164  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5178  major facilitator transporter  59.03 
 
 		 457 aa  542  1e-153  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8056  major facilitator superfamily MFS_1  60.36 
 
 		 451 aa  516  1.0000000000000001e-145  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4638  major facilitator superfamily MFS_1  55.8 
 
 		 451 aa  494  9.999999999999999e-139  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000178504  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2900  major facilitator transporter  54.13 
 
 		 514 aa  463  1e-129  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.473738  normal  0.0138886 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1561  major facilitator transporter  43.61 
 
 		 509 aa  352  7e-96  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.141298  normal  0.174962 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2413  major facilitator transporter  39.64 
 
 		 447 aa  331  2e-89  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000787137  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1482  major facilitator superfamily MFS_1  37.22 
 
 		 451 aa  307  3e-82  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000115751  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1523  major facilitator transporter  38.17 
 
 		 438 aa  296  5e-79  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.295641  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2088  major facilitator superfamily MFS_1  36.36 
 
 		 456 aa  290  3e-77  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.565943 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21330  sugar phosphate permease  38.26 
 
 		 477 aa  280  3e-74  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.428425  hitchhiker  0.00018034 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2255  major facilitator superfamily MFS_1  37.39 
 
 		 473 aa  276  7e-73  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4019  major facilitator superfamily MFS_1  39.15 
 
 		 435 aa  273  4.0000000000000004e-72  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.000381325  normal  0.201783 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3933  major facilitator transporter  35.66 
 
 		 399 aa  271  1e-71  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000233422  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29790  sugar phosphate permease  38.13 
 
 		 485 aa  271  2e-71  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5543  major facilitator family transporter  35.53 
 
 		 399 aa  271  2.9999999999999997e-71  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000723204  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3497  major facilitator superfamily MFS_1  37.85 
 
 		 398 aa  270  2.9999999999999997e-71  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5115  major facilitator family transporter  34.82 
 
 		 399 aa  269  5.9999999999999995e-71  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000159613  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5409  major facilitator family transporter  35.29 
 
 		 399 aa  270  5.9999999999999995e-71  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000000725853  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5599  major facilitator family transporter  34.82 
 
 		 399 aa  269  8.999999999999999e-71  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000105464  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5547  major facilitator family transporter  34.89 
 
 		 399 aa  269  1e-70  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.00000000869498  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5271  major facilitator family transporter  35.13 
 
 		 399 aa  268  1e-70  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000000222558  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5098  major facilitator family transporter  35.13 
 
 		 399 aa  268  1e-70  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.20566e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5668  major facilitator family transporter  35.13 
 
 		 399 aa  268  1e-70  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.0000000000480591  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5513  major facilitator family transporter  35.13 
 
 		 399 aa  268  1e-70  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3374  major facilitator superfamily MFS_1  36.47 
 
 		 398 aa  267  2.9999999999999995e-70  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000527195  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5212  major facilitator transporter  34.89 
 
 		 399 aa  267  4e-70  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000114177  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4651  major facilitator superfamily MFS_1  34.58 
 
 		 470 aa  263  4e-69  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0547  major facilitator superfamily transporter  35.32 
 
 		 456 aa  263  4.999999999999999e-69  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.392915  normal  0.285749 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2754  major facilitator superfamily MFS_1  37.22 
 
 		 465 aa  259  9e-68  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.182715  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1414  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  35.97 
 
 		 468 aa  258  1e-67  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000198546  normal  0.095851 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1377  major facilitator superfamily MFS_1  38.53 
 
 		 445 aa  256  4e-67  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0897  major facilitator superfamily MFS_1  38.48 
 
 		 447 aa  255  1.0000000000000001e-66  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0894914  normal  0.147269 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0245  putative permease  36.71 
 
 		 449 aa  245  9.999999999999999e-64  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0461827  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1875  major facilitator transporter  32.67 
 
 		 459 aa  233  8.000000000000001e-60  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.473892  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0190  major facilitator superfamily MFS_1  33.91 
 
 		 460 aa  228  2e-58  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000521499 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2078  major facilitator superfamily MFS_1  32.89 
 
 		 404 aa  228  2e-58  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1683  major facilitator transporter  36.15 
 
 		 415 aa  225  1e-57  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.249309  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5172  major facilitator superfamily MFS_1  33.26 
 
 		 466 aa  224  3e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0967  major facilitator superfamily aromatic acid/H(+) symporter  33.98 
 
 		 462 aa  223  4.9999999999999996e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0285  major facilitator superfamily sugar transporter  31.87 
 
 		 464 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.192742  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2518  major facilitator transporter  33.03 
 
 		 437 aa  214  2.9999999999999995e-54  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4993  MFS family membrane efflux protein  31.65 
 
 		 526 aa  214  2.9999999999999995e-54  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.521864 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0974  major facilitator superfamily aromatic acid/H(+) symporter  35.29 
 
 		 462 aa  213  4.9999999999999996e-54  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00000109951  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0602  major facilitator superfamily MFS_1  32.44 
 
 		 459 aa  213  5.999999999999999e-54  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1326  major facilitator transporter  35.99 
 
 		 464 aa  212  1e-53  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.367254  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3580  hypothetical protein  34.2 
 
 		 478 aa  211  2e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.024372  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0828  major facilitator superfamily aromatic acid/H(+) symporter  33.41 
 
 		 450 aa  210  5e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.420618  normal  0.255495 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0896  major facilitator superfamily MFS_1  33.18 
 
 		 462 aa  208  1e-52  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0613  major facilitator superfamily MFS_1  31.24 
 
 		 473 aa  208  2e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0274336 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0970  major facilitator superfamily transporter metabolite/H(+) symporter  32.7 
 
 		 470 aa  207  3e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00262609  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4498  major facilitator superfamily MFS_1  34.6 
 
 		 467 aa  206  5e-52  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0152994  normal  0.24714 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3924  major facilitator superfamily transporter  31.42 
 
 		 438 aa  206  5e-52  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.496152  normal  0.0457831 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4630  major facilitator superfamily MFS_1  34.6 
 
 		 467 aa  206  5e-52  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.234892  hitchhiker  0.00910919 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4087  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  31.37 
 
 		 468 aa  205  1e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.281632  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5972  major facilitator transporter  32.55 
 
 		 462 aa  204  2e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1937  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  34.51 
 
 		 474 aa  202  8e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000000000973666  normal  0.0403058 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6200  major facilitator transporter  32.91 
 
 		 492 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0622411 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5934  major facilitator transporter  32.14 
 
 		 468 aa  202  1.9999999999999998e-50  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0786793 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6268  major facilitator transporter  32.12 
 
 		 462 aa  200  3.9999999999999996e-50  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.492492 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5283  major facilitator transporter  31.13 
 
 		 463 aa  199  7.999999999999999e-50  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.591426  normal  0.763827 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4627  major facilitator transporter  31.2 
 
 		 475 aa  199  1.0000000000000001e-49  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5167  major facilitator superfamily MFS_1  31.62 
 
 		 470 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5153  major facilitator transporter  30.98 
 
 		 475 aa  198  2.0000000000000003e-49  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.507557  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5007  major facilitator transporter  31.41 
 
 		 472 aa  197  3e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3453  major facilitator transporter  32.03 
 
 		 472 aa  197  3e-49  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0499831  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5266  major facilitator transporter  31.41 
 
 		 472 aa  197  3e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0382  major facilitator transporter  31.45 
 
 		 472 aa  197  3e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.660441 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3101  major facilitator transporter  31.41 
 
 		 472 aa  197  3e-49  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.380275  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4647  major facilitator superfamily MFS_1  32.25 
 
 		 488 aa  197  4.0000000000000005e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.866665  normal  0.46173 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1856  major facilitator transporter  29.82 
 
 		 438 aa  197  5.000000000000001e-49  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6599  major facilitator superfamily MFS_1  31.44 
 
 		 459 aa  196  9e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.332731  normal  0.158495 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0070  MFS permease  31.29 
 
 		 460 aa  195  1e-48  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0920  major facilitator superfamily transporter metabolite/H(+) symporter  31.67 
 
 		 487 aa  195  2e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.697574 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2070  major facilitator transporter  31.81 
 
 		 472 aa  195  2e-48  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.376866  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0555  major facilitator family transporter  31.6 
 
 		 472 aa  194  3e-48  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0788  major facilitator family transporter  31.6 
 
 		 472 aa  194  3e-48  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.509193  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1973  major facilitator transporter  31.6 
 
 		 472 aa  194  3e-48  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0486  major facilitator family transporter  31.39 
 
 		 472 aa  193  5e-48  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0312823  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0987  major facilitator superfamily transporter metabolite/H(+) symporter  31.67 
 
 		 461 aa  193  5e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.496425 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>