More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_C6959 on replicon NC_007509
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010557  BamMC406_5986  major facilitator transporter  77.24 
 
 
479 aa  750    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6611  major facilitator transporter  74.21 
 
 
479 aa  701    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.410873  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2063  major facilitator superfamily MFS_1  73.07 
 
 
479 aa  688    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0432509  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6959  major facilitator transporter  100 
 
 
479 aa  952    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6282  major facilitator transporter  77.45 
 
 
479 aa  749    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.384913  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4015  major facilitator superfamily MFS_1  55.7 
 
 
477 aa  520  1e-146  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4647  major facilitator superfamily MFS_1  54.01 
 
 
488 aa  498  1e-140  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.866665  normal  0.46173 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6200  major facilitator transporter  53.19 
 
 
492 aa  493  9.999999999999999e-139  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0622411 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3453  major facilitator transporter  53.24 
 
 
472 aa  489  1e-137  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0499831  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0920  major facilitator superfamily transporter metabolite/H(+) symporter  55.07 
 
 
487 aa  491  1e-137  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.697574 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5153  major facilitator transporter  54.66 
 
 
475 aa  482  1e-135  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.507557  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0808  major facilitator superfamily MFS_1  56.58 
 
 
494 aa  483  1e-135  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4627  major facilitator transporter  53.86 
 
 
475 aa  484  1e-135  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0382  major facilitator transporter  52.61 
 
 
472 aa  481  1e-134  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.660441 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3101  major facilitator transporter  52.19 
 
 
472 aa  477  1e-133  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.380275  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5007  major facilitator transporter  52.19 
 
 
472 aa  477  1e-133  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5266  major facilitator transporter  52.19 
 
 
472 aa  477  1e-133  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0910  major facilitator family transporter  52.82 
 
 
472 aa  467  9.999999999999999e-131  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.367874  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0788  major facilitator family transporter  52.61 
 
 
472 aa  462  1e-129  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.509193  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0486  major facilitator family transporter  52.61 
 
 
472 aa  463  1e-129  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0312823  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1973  major facilitator transporter  52.61 
 
 
472 aa  462  1e-129  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0555  major facilitator family transporter  52.61 
 
 
472 aa  462  1e-129  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2070  major facilitator transporter  52.61 
 
 
472 aa  461  9.999999999999999e-129  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.376866  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3530  major facilitator transporter  52.18 
 
 
469 aa  442  1e-123  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.229516  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2496  major facilitator family transporter  47.38 
 
 
472 aa  428  1e-118  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.206768  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4340  general substrate transporter  46.65 
 
 
477 aa  427  1e-118  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2304  major facilitator transporter  47.9 
 
 
472 aa  422  1e-117  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.759044  normal  0.046264 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1412  major facilitator transporter  49.03 
 
 
465 aa  413  1e-114  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6205  major facilitator superfamily MFS_1  45.97 
 
 
471 aa  412  1e-114  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4090  major facilitator superfamily metabolite(sugar)/H(+) symporter  45.97 
 
 
471 aa  411  1e-113  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.94274  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0667  major facilitator family transporter  53.01 
 
 
494 aa  410  1e-113  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0482021  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3193  major facilitator transporter  44.27 
 
 
472 aa  395  1e-109  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.9008 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1717  major facilitator transporter  46.78 
 
 
488 aa  384  1e-105  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1759  major facilitator superfamily MFS_1  44.12 
 
 
472 aa  385  1e-105  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00188  MFS transporter  45.18 
 
 
471 aa  374  1e-102  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.103216  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2231  major facilitator family transporter  44.96 
 
 
482 aa  372  1e-102  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1268  MFS transporter  45.71 
 
 
487 aa  370  1e-101  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.916286  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3036  major facilitator transporter  45.49 
 
 
487 aa  368  1e-100  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1718  major facilitator transporter  41.03 
 
 
473 aa  332  9e-90  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.442738  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1269  major facilitator transporter  39.6 
 
 
466 aa  332  1e-89  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2576  major facilitator transporter  39.65 
 
 
475 aa  325  1e-87  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.634768  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0792  major facilitator superfamily MFS_1  33.77 
 
 
458 aa  273  7e-72  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.753449  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1626  major facilitator transporter  33.48 
 
 
485 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.408436  normal  0.668079 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1551  major facilitator transporter  33.55 
 
 
485 aa  241  2e-62  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.308182  normal  0.0914413 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4860  major facilitator transporter  33.11 
 
 
487 aa  241  2.9999999999999997e-62  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0839463 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1483  major facilitator superfamily MFS_1  33.78 
 
 
456 aa  240  4e-62  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1604  major facilitator transporter  33.04 
 
 
485 aa  237  4e-61  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1668  major facilitator transporter  32.74 
 
 
487 aa  235  1.0000000000000001e-60  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.339414  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1217  major facilitator transporter  32.52 
 
 
487 aa  232  1e-59  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.207678  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1696  major facilitator transporter  32.52 
 
 
487 aa  232  1e-59  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.4496  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0285  major facilitator superfamily sugar transporter  33.19 
 
 
464 aa  228  2e-58  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.192742  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0463  major facilitator transporter  32.89 
 
 
448 aa  227  3e-58  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0213055  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0613  major facilitator superfamily MFS_1  32.15 
 
 
473 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0274336 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5972  major facilitator transporter  30.68 
 
 
462 aa  218  2e-55  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6599  major facilitator superfamily MFS_1  32.24 
 
 
459 aa  218  2e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.332731  normal  0.158495 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0881  major facilitator superfamily MFS_1  31.73 
 
 
448 aa  216  7e-55  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.202747  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0828  major facilitator superfamily aromatic acid/H(+) symporter  30.35 
 
 
450 aa  213  7e-54  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.420618  normal  0.255495 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6268  major facilitator transporter  30.46 
 
 
462 aa  213  7e-54  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.492492 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4087  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  31.53 
 
 
468 aa  211  2e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.281632  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0967  major facilitator superfamily aromatic acid/H(+) symporter  31.97 
 
 
462 aa  209  6e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0987  major facilitator superfamily transporter metabolite/H(+) symporter  32.11 
 
 
461 aa  209  1e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.496425 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5172  major facilitator superfamily MFS_1  31.51 
 
 
466 aa  207  3e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0528  major facilitator transporter  31.6 
 
 
467 aa  205  2e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0826405  hitchhiker  0.00770286 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1937  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  31.57 
 
 
474 aa  203  6e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000000000973666  normal  0.0403058 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4638  major facilitator superfamily MFS_1  30.07 
 
 
451 aa  201  3e-50  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000178504  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0190  major facilitator superfamily MFS_1  31.22 
 
 
460 aa  199  7e-50  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000521499 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0270  major facilitator transporter  31.93 
 
 
477 aa  196  8.000000000000001e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0250869  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0974  major facilitator superfamily aromatic acid/H(+) symporter  30.02 
 
 
462 aa  194  3e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00000109951  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0970  major facilitator superfamily transporter metabolite/H(+) symporter  29.52 
 
 
470 aa  191  2e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00262609  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0668  major facilitator transporter  32.4 
 
 
474 aa  189  1e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00169534  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5934  major facilitator transporter  31.62 
 
 
468 aa  185  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0786793 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5178  major facilitator transporter  30.08 
 
 
457 aa  183  6e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0896  major facilitator superfamily MFS_1  30.82 
 
 
462 aa  182  1e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3358  major facilitator superfamily MFS_1  28.44 
 
 
459 aa  181  4e-44  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5167  major facilitator superfamily MFS_1  30.23 
 
 
470 aa  180  4e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1660  MFS family transporter  30.95 
 
 
455 aa  179  7e-44  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6853  major facilitator transporter  30.77 
 
 
430 aa  179  1e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.854567  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19270  putative MFS transporter  29.91 
 
 
455 aa  177  3e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.149627  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0129  putative permease  29.47 
 
 
459 aa  171  2e-41  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.549779  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5172  major facilitator transporter  31.85 
 
 
474 aa  169  9e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0809503 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5109  major facilitator transporter  31.6 
 
 
474 aa  169  1e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5283  major facilitator transporter  28.18 
 
 
463 aa  168  2e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.591426  normal  0.763827 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0670  general substrate transporter  29.35 
 
 
459 aa  168  2e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.753041 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3533  major facilitator transporter  31.11 
 
 
473 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1414  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  28.05 
 
 
468 aa  167  4e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000198546  normal  0.095851 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3259  major facilitator transporter  31.6 
 
 
474 aa  167  4e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.331503  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0070  MFS permease  27.65 
 
 
460 aa  166  5.9999999999999996e-40  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3220  major facilitator superfamily MFS_1  27.39 
 
 
463 aa  166  6.9999999999999995e-40  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0542188  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8056  major facilitator superfamily MFS_1  28.73 
 
 
451 aa  166  8e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2088  major facilitator superfamily MFS_1  29.22 
 
 
456 aa  166  9e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.565943 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0443  major facilitator superfamily MFS_1  26.93 
 
 
461 aa  165  1.0000000000000001e-39  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2413  major facilitator transporter  26.32 
 
 
447 aa  165  2.0000000000000002e-39  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000787137  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0539  major facilitator transporter  30.62 
 
 
473 aa  164  3e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2060  inner membrane metabolite transport protein YdjE  28.32 
 
 
459 aa  164  3e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0010058 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1857  major facilitator transporter  28.54 
 
 
459 aa  164  5.0000000000000005e-39  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.526363  hitchhiker  0.0000247936 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1999  major facilitator family transporter  28.54 
 
 
459 aa  164  5.0000000000000005e-39  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0702699  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1931  major facilitator superfamily permease  29.91 
 
 
478 aa  162  9e-39  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0979116  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1860  major facilitator family transporter  28.54 
 
 
459 aa  162  9e-39  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0174535  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1993  major facilitator family transporter  28.6 
 
 
452 aa  162  1e-38  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.863885  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0547  major facilitator superfamily transporter  30.32 
 
 
456 aa  162  1e-38  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.392915  normal  0.285749 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>