More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_1668 on replicon NC_010508
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010508  Bcenmc03_1668  major facilitator transporter  100 
 
 		 487 aa  965    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.339414  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1551  major facilitator transporter  85.01 
 
 		 485 aa  798    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.308182  normal  0.0914413 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4860  major facilitator transporter  93.84 
 
 		 487 aa  874    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0839463 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1217  major facilitator transporter  99.18 
 
 		 487 aa  956    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.207678  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1604  major facilitator transporter  91.79 
 
 		 485 aa  865    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1626  major facilitator transporter  91.38 
 
 		 485 aa  862    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.408436  normal  0.668079 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1696  major facilitator transporter  99.18 
 
 		 487 aa  956    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.4496  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0792  major facilitator superfamily MFS_1  45.07 
 
 		 458 aa  378  1e-103  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.753449  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1483  major facilitator superfamily MFS_1  47.53 
 
 		 456 aa  366  1e-100  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4015  major facilitator superfamily MFS_1  34.03 
 
 		 477 aa  273  4.0000000000000004e-72  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6282  major facilitator transporter  32.98 
 
 		 479 aa  248  2e-64  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.384913  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6611  major facilitator transporter  33.86 
 
 		 479 aa  246  8e-64  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.410873  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5986  major facilitator transporter  32.55 
 
 		 479 aa  245  9.999999999999999e-64  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0808  major facilitator superfamily MFS_1  33.74 
 
 		 494 aa  241  2.9999999999999997e-62  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6200  major facilitator transporter  31.77 
 
 		 492 aa  239  1e-61  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0622411 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1759  major facilitator superfamily MFS_1  32.58 
 
 		 472 aa  238  2e-61  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2231  major facilitator family transporter  32.75 
 
 		 482 aa  235  1.0000000000000001e-60  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1268  MFS transporter  32.03 
 
 		 487 aa  233  8.000000000000001e-60  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.916286  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2063  major facilitator superfamily MFS_1  32.43 
 
 		 479 aa  230  5e-59  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0432509  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3036  major facilitator transporter  31.81 
 
 		 487 aa  230  5e-59  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3453  major facilitator transporter  32.67 
 
 		 472 aa  229  1e-58  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0499831  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4647  major facilitator superfamily MFS_1  31.36 
 
 		 488 aa  229  1e-58  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.866665  normal  0.46173 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0920  major facilitator superfamily transporter metabolite/H(+) symporter  32.34 
 
 		 487 aa  227  3e-58  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.697574 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3193  major facilitator transporter  30.69 
 
 		 472 aa  224  3e-57  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.9008 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1412  major facilitator transporter  33.05 
 
 		 465 aa  223  6e-57  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6959  major facilitator transporter  32.63 
 
 		 479 aa  222  9.999999999999999e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2070  major facilitator transporter  31.36 
 
 		 472 aa  222  9.999999999999999e-57  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.376866  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6205  major facilitator superfamily MFS_1  31.86 
 
 		 471 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0910  major facilitator family transporter  31.51 
 
 		 472 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.367874  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4340  general substrate transporter  29.55 
 
 		 477 aa  221  3e-56  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0788  major facilitator family transporter  31.99 
 
 		 472 aa  220  3.9999999999999997e-56  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.509193  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1973  major facilitator transporter  31.99 
 
 		 472 aa  220  3.9999999999999997e-56  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0382  major facilitator transporter  32.45 
 
 		 472 aa  220  3.9999999999999997e-56  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.660441 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0555  major facilitator family transporter  31.99 
 
 		 472 aa  220  3.9999999999999997e-56  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0486  major facilitator family transporter  31.77 
 
 		 472 aa  219  6e-56  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0312823  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4090  major facilitator superfamily metabolite(sugar)/H(+) symporter  30.9 
 
 		 471 aa  220  6e-56  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.94274  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5007  major facilitator transporter  32.38 
 
 		 472 aa  219  7.999999999999999e-56  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3101  major facilitator transporter  32.38 
 
 		 472 aa  219  7.999999999999999e-56  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.380275  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5266  major facilitator transporter  32.38 
 
 		 472 aa  219  7.999999999999999e-56  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5153  major facilitator transporter  31.61 
 
 		 475 aa  218  1e-55  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.507557  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4627  major facilitator transporter  32.38 
 
 		 475 aa  219  1e-55  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0463  major facilitator transporter  33.56 
 
 		 448 aa  217  4e-55  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0213055  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2496  major facilitator family transporter  29.57 
 
 		 472 aa  216  9e-55  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.206768  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0285  major facilitator superfamily sugar transporter  32.66 
 
 		 464 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.192742  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2304  major facilitator transporter  29.27 
 
 		 472 aa  211  3e-53  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.759044  normal  0.046264 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1717  major facilitator transporter  32.31 
 
 		 488 aa  209  1e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3530  major facilitator transporter  32.78 
 
 		 469 aa  209  1e-52  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.229516  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0881  major facilitator superfamily MFS_1  32.51 
 
 		 448 aa  207  5e-52  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.202747  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0668  major facilitator transporter  35.07 
 
 		 474 aa  197  3e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00169534  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0667  major facilitator family transporter  32.64 
 
 		 494 aa  197  4.0000000000000005e-49  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0482021  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1269  major facilitator transporter  31.28 
 
 		 466 aa  195  1e-48  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00188  MFS transporter  32.17 
 
 		 471 aa  194  3e-48  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.103216  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2576  major facilitator transporter  30.02 
 
 		 475 aa  192  1e-47  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.634768  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3358  major facilitator superfamily MFS_1  29.42 
 
 		 459 aa  187  3e-46  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1718  major facilitator transporter  29.22 
 
 		 473 aa  175  9.999999999999999e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.442738  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5172  major facilitator superfamily MFS_1  31.06 
 
 		 466 aa  175  1.9999999999999998e-42  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6268  major facilitator transporter  30.07 
 
 		 462 aa  167  4e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.492492 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0896  major facilitator superfamily MFS_1  31.52 
 
 		 462 aa  167  5e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5972  major facilitator transporter  29.84 
 
 		 462 aa  165  2.0000000000000002e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0987  major facilitator superfamily transporter metabolite/H(+) symporter  31.26 
 
 		 461 aa  161  2e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.496425 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1326  major facilitator transporter  32.34 
 
 		 464 aa  159  1e-37  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.367254  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4638  major facilitator superfamily MFS_1  25.56 
 
 		 451 aa  159  1e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000178504  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0528  major facilitator transporter  29.72 
 
 		 467 aa  157  4e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0826405  hitchhiker  0.00770286 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4876  major facilitator transporter  33.96 
 
 		 465 aa  157  5.0000000000000005e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.116768 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0443  major facilitator superfamily MFS_1  29.48 
 
 		 461 aa  156  9e-37  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0970  major facilitator superfamily transporter metabolite/H(+) symporter  28.73 
 
 		 470 aa  154  2.9999999999999998e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00262609  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4019  major facilitator superfamily MFS_1  35.1 
 
 		 435 aa  154  4e-36  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.000381325  normal  0.201783 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8056  major facilitator superfamily MFS_1  30.29 
 
 		 451 aa  153  7e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0190  major facilitator superfamily MFS_1  29.63 
 
 		 460 aa  152  1e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000521499 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1660  MFS family transporter  29.54 
 
 		 455 aa  152  2e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1937  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  30.03 
 
 		 474 aa  152  2e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000000000973666  normal  0.0403058 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0967  major facilitator superfamily aromatic acid/H(+) symporter  29.03 
 
 		 462 aa  151  3e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1898  major facilitator superfamily MFS_1  27.74 
 
 		 448 aa  150  4e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2413  major facilitator transporter  27.13 
 
 		 447 aa  149  8e-35  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000787137  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0539  major facilitator transporter  29.27 
 
 		 473 aa  149  1.0000000000000001e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5934  major facilitator transporter  31.51 
 
 		 468 aa  149  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0786793 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19270  putative MFS transporter  28.33 
 
 		 455 aa  149  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.149627  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5178  major facilitator transporter  27.97 
 
 		 457 aa  148  2.0000000000000003e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1931  major facilitator superfamily permease  28.89 
 
 		 478 aa  148  3e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0979116  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0911  major facilitator family transporter  28.89 
 
 		 478 aa  147  3e-34  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.577596  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0379  major facilitator family transporter  28.89 
 
 		 478 aa  148  3e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0177  major facilitator family transporter  28.89 
 
 		 478 aa  147  3e-34  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1431  major facilitator family transporter  28.89 
 
 		 478 aa  147  3e-34  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.475934  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0471  major facilitator family transporter  28.89 
 
 		 478 aa  147  3e-34  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1841  major facilitator family transporter  28.89 
 
 		 478 aa  147  4.0000000000000006e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5109  major facilitator transporter  29.82 
 
 		 474 aa  147  5e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29790  sugar phosphate permease  30.44 
 
 		 485 aa  147  6e-34  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1633  general substrate transporter  26.69 
 
 		 476 aa  146  9e-34  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.904084  normal  0.408822 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5167  major facilitator superfamily MFS_1  30.38 
 
 		 470 aa  145  2e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6599  major facilitator superfamily MFS_1  28.73 
 
 		 459 aa  144  2e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.332731  normal  0.158495 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0670  general substrate transporter  28.57 
 
 		 459 aa  144  3e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.753041 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3259  major facilitator transporter  29.61 
 
 		 474 aa  144  3e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.331503  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5172  major facilitator transporter  30.27 
 
 		 474 aa  144  3e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0809503 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0129  putative permease  26.83 
 
 		 459 aa  142  9.999999999999999e-33  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.549779  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3533  major facilitator transporter  30.24 
 
 		 473 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3311  major facilitator transporter  29.61 
 
 		 474 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.799238  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0613  major facilitator superfamily MFS_1  27.89 
 
 		 473 aa  142  1.9999999999999998e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0274336 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2255  major facilitator superfamily MFS_1  30.61 
 
 		 473 aa  142  1.9999999999999998e-32  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04490  sugar phosphate permease  28.67 
 
 		 469 aa  140  3.9999999999999997e-32  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1414  major facilitator superfamily MFS_1  25.27 
 
 		 444 aa  140  3.9999999999999997e-32  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>