More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msed_0463 on replicon NC_009440
Organism: Metallosphaera sedula DSM 5348



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001800  Ssol_0881  major facilitator superfamily MFS_1  77.01 
 
 
448 aa  726    Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.202747  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0463  major facilitator transporter  100 
 
 
448 aa  885    Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0213055  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0792  major facilitator superfamily MFS_1  38.48 
 
 
458 aa  295  1e-78  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.753449  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6611  major facilitator transporter  34.07 
 
 
479 aa  251  2e-65  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.410873  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1483  major facilitator superfamily MFS_1  35.36 
 
 
456 aa  247  3e-64  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4090  major facilitator superfamily metabolite(sugar)/H(+) symporter  34.2 
 
 
471 aa  243  7e-63  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.94274  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4647  major facilitator superfamily MFS_1  34.73 
 
 
488 aa  242  1e-62  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.866665  normal  0.46173 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5986  major facilitator transporter  33.99 
 
 
479 aa  241  1e-62  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2063  major facilitator superfamily MFS_1  34.57 
 
 
479 aa  241  1e-62  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0432509  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0920  major facilitator superfamily transporter metabolite/H(+) symporter  35.59 
 
 
487 aa  242  1e-62  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.697574 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6282  major facilitator transporter  33.92 
 
 
479 aa  241  1e-62  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.384913  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6200  major facilitator transporter  33.92 
 
 
492 aa  241  2e-62  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0622411 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6205  major facilitator superfamily MFS_1  34.2 
 
 
471 aa  239  8e-62  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0808  major facilitator superfamily MFS_1  33.85 
 
 
494 aa  236  6e-61  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5153  major facilitator transporter  34.07 
 
 
475 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.507557  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0382  major facilitator transporter  34.29 
 
 
472 aa  234  3e-60  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.660441 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2070  major facilitator transporter  35.23 
 
 
472 aa  233  5e-60  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.376866  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4015  major facilitator superfamily MFS_1  32.31 
 
 
477 aa  232  9e-60  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5007  major facilitator transporter  34.29 
 
 
472 aa  232  9e-60  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5266  major facilitator transporter  34.29 
 
 
472 aa  232  9e-60  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0910  major facilitator family transporter  35.23 
 
 
472 aa  232  9e-60  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.367874  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3101  major facilitator transporter  34.29 
 
 
472 aa  232  9e-60  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.380275  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0486  major facilitator family transporter  35.01 
 
 
472 aa  232  1e-59  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0312823  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4627  major facilitator transporter  33.85 
 
 
475 aa  232  1e-59  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0788  major facilitator family transporter  34.79 
 
 
472 aa  231  2e-59  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.509193  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1973  major facilitator transporter  34.79 
 
 
472 aa  231  2e-59  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0555  major facilitator family transporter  34.79 
 
 
472 aa  231  2e-59  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3453  major facilitator transporter  33.85 
 
 
472 aa  229  8e-59  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0499831  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1269  major facilitator transporter  33.99 
 
 
466 aa  226  5.0000000000000005e-58  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2496  major facilitator family transporter  31.73 
 
 
472 aa  223  4.9999999999999996e-57  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.206768  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4340  general substrate transporter  31.65 
 
 
477 aa  223  6e-57  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2304  major facilitator transporter  31.43 
 
 
472 aa  222  9.999999999999999e-57  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.759044  normal  0.046264 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1759  major facilitator superfamily MFS_1  31.42 
 
 
472 aa  221  3e-56  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6959  major facilitator transporter  32.24 
 
 
479 aa  219  7e-56  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1412  major facilitator transporter  34.12 
 
 
465 aa  219  7.999999999999999e-56  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4860  major facilitator transporter  33.56 
 
 
487 aa  219  1e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0839463 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1668  major facilitator transporter  33.56 
 
 
487 aa  216  5e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.339414  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1217  major facilitator transporter  33.33 
 
 
487 aa  213  7.999999999999999e-54  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.207678  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1696  major facilitator transporter  33.33 
 
 
487 aa  213  7.999999999999999e-54  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.4496  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0285  major facilitator superfamily sugar transporter  31.01 
 
 
464 aa  211  1e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.192742  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1626  major facilitator transporter  33.11 
 
 
485 aa  211  2e-53  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.408436  normal  0.668079 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3193  major facilitator transporter  30.8 
 
 
472 aa  210  4e-53  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.9008 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1604  major facilitator transporter  32.88 
 
 
485 aa  209  8e-53  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1551  major facilitator transporter  32.89 
 
 
485 aa  207  3e-52  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.308182  normal  0.0914413 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2231  major facilitator family transporter  30.43 
 
 
482 aa  206  6e-52  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0667  major facilitator family transporter  35.71 
 
 
494 aa  206  6e-52  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0482021  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0668  major facilitator transporter  34.06 
 
 
474 aa  206  1e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00169534  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1268  MFS transporter  30.6 
 
 
487 aa  204  3e-51  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.916286  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1717  major facilitator transporter  32.03 
 
 
488 aa  203  4e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3036  major facilitator transporter  30.6 
 
 
487 aa  203  4e-51  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3530  major facilitator transporter  33.41 
 
 
469 aa  200  6e-50  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.229516  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00188  MFS transporter  32.24 
 
 
471 aa  191  2.9999999999999997e-47  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.103216  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2576  major facilitator transporter  30.55 
 
 
475 aa  184  3e-45  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.634768  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0987  major facilitator superfamily transporter metabolite/H(+) symporter  31.14 
 
 
461 aa  173  5.999999999999999e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.496425 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19270  putative MFS transporter  29.63 
 
 
455 aa  169  9e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.149627  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2413  major facilitator transporter  27.81 
 
 
447 aa  169  1e-40  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000787137  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0970  major facilitator superfamily transporter metabolite/H(+) symporter  28.06 
 
 
470 aa  166  5.9999999999999996e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00262609  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0539  major facilitator transporter  29.78 
 
 
473 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4638  major facilitator superfamily MFS_1  27.27 
 
 
451 aa  165  2.0000000000000002e-39  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000178504  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8056  major facilitator superfamily MFS_1  28.79 
 
 
451 aa  165  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4087  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  30.89 
 
 
468 aa  163  7e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.281632  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5972  major facilitator transporter  28.32 
 
 
462 aa  162  8.000000000000001e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2088  major facilitator superfamily MFS_1  29.13 
 
 
456 aa  162  8.000000000000001e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.565943 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5172  major facilitator transporter  29.56 
 
 
474 aa  162  1e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0809503 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5109  major facilitator transporter  29.49 
 
 
474 aa  162  1e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3358  major facilitator superfamily MFS_1  28.6 
 
 
459 aa  162  2e-38  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1931  major facilitator superfamily permease  30 
 
 
478 aa  161  3e-38  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0979116  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1718  major facilitator transporter  27.64 
 
 
473 aa  161  3e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.442738  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3259  major facilitator transporter  29.49 
 
 
474 aa  160  3e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.331503  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1841  major facilitator family transporter  30 
 
 
478 aa  160  4e-38  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0471  major facilitator family transporter  29.78 
 
 
478 aa  160  5e-38  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0379  major facilitator family transporter  29.78 
 
 
478 aa  160  5e-38  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0177  major facilitator family transporter  29.78 
 
 
478 aa  160  5e-38  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1431  major facilitator family transporter  29.78 
 
 
478 aa  160  5e-38  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.475934  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6268  major facilitator transporter  28.1 
 
 
462 aa  160  6e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.492492 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0911  major facilitator family transporter  29.78 
 
 
478 aa  159  8e-38  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.577596  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0613  major facilitator superfamily MFS_1  30.07 
 
 
473 aa  158  2e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0274336 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1660  MFS family transporter  28.54 
 
 
455 aa  157  3e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3533  major facilitator transporter  29.42 
 
 
473 aa  157  4e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3311  major facilitator transporter  28.67 
 
 
474 aa  155  1e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.799238  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4651  major facilitator superfamily MFS_1  29 
 
 
470 aa  155  1e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0828  major facilitator superfamily aromatic acid/H(+) symporter  28.98 
 
 
450 aa  154  2.9999999999999998e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.420618  normal  0.255495 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1482  major facilitator superfamily MFS_1  28.88 
 
 
451 aa  153  5.9999999999999996e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000115751  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5053  major facilitator superfamily MFS_1  28.04 
 
 
472 aa  152  1e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.122247 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6599  major facilitator superfamily MFS_1  28.09 
 
 
459 aa  152  1e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.332731  normal  0.158495 
 
 
-
 
NC_003296  RS02027  metabolite transporter  28.6 
 
 
476 aa  151  2e-35  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.158134 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0967  major facilitator superfamily aromatic acid/H(+) symporter  29.9 
 
 
462 aa  151  2e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1595  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  28.04 
 
 
472 aa  151  3e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0443  major facilitator superfamily MFS_1  28.03 
 
 
461 aa  151  3e-35  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0670  general substrate transporter  29.41 
 
 
459 aa  150  6e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.753041 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1937  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  30.46 
 
 
474 aa  150  6e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000000000973666  normal  0.0403058 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1898  major facilitator superfamily MFS_1  30.8 
 
 
448 aa  150  6e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0528  major facilitator transporter  27.05 
 
 
467 aa  149  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0826405  hitchhiker  0.00770286 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5143  major facilitator transporter  29.2 
 
 
482 aa  149  1.0000000000000001e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0270  major facilitator transporter  29.14 
 
 
477 aa  147  3e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0250869  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5283  major facilitator transporter  27.05 
 
 
463 aa  146  8.000000000000001e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.591426  normal  0.763827 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2073  major facilitator superfamily transporter  27.83 
 
 
467 aa  146  8.000000000000001e-34  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0013865 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0547  major facilitator superfamily transporter  26.75 
 
 
456 aa  146  8.000000000000001e-34  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.392915  normal  0.285749 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0434  major facilitator superfamily MFS_1  28.06 
 
 
446 aa  146  9e-34  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000104713  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5172  major facilitator superfamily MFS_1  26.72 
 
 
466 aa  145  2e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>