More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SYO3AOP1_0434 on replicon NC_010730
Organism: Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010730  SYO3AOP1_0434  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 
446 aa  878    Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000104713  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2550  major facilitator transporter  34.37 
 
 
481 aa  242  1e-62  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.325766 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0195  major facilitator transporter  33.11 
 
 
465 aa  236  5.0000000000000005e-61  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3624  major facilitator superfamily MFS_1  31.47 
 
 
597 aa  226  8e-58  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1026  major facilitator transporter  32.7 
 
 
494 aa  223  4.9999999999999996e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.76492  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5143  major facilitator superfamily MFS_1  32.91 
 
 
495 aa  221  1.9999999999999999e-56  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0576  major facilitator transporter  32.14 
 
 
504 aa  219  8.999999999999998e-56  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.474079  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2711  major facilitator transporter  32.98 
 
 
480 aa  218  2e-55  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0257064  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4525  major facilitator transporter  33.55 
 
 
493 aa  218  2e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.432658 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3027  major facilitator transporter  33.4 
 
 
481 aa  217  4e-55  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6486  major facilitator transporter  34.62 
 
 
488 aa  214  2.9999999999999995e-54  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.158233  normal  0.579657 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1576  major facilitator superfamily MFS_1  31.34 
 
 
483 aa  213  3.9999999999999995e-54  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2549  major facilitator superfamily MFS_1  31.91 
 
 
495 aa  212  9e-54  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7236  major facilitator superfamily MFS_1  32.91 
 
 
484 aa  212  9e-54  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.440846  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0856  major facilitator superfamily protein  33.68 
 
 
483 aa  212  1e-53  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0609243 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2085  major facilitator superfamily transporter  31.74 
 
 
501 aa  211  2e-53  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  decreased coverage  0.00714059  normal  0.900579 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2306  major facilitator transporter  34.04 
 
 
483 aa  209  7e-53  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.957896  normal  0.102132 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08810  arabinose efflux permease family protein  32.05 
 
 
494 aa  209  7e-53  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3612  major facilitator transporter  32.08 
 
 
476 aa  209  9e-53  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.384434  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4643  major facilitator superfamily MFS_1  32.34 
 
 
492 aa  208  2e-52  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4276  major facilitator transporter  32.34 
 
 
492 aa  208  2e-52  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0915  major facilitator transporter  32.97 
 
 
493 aa  207  4e-52  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.86159  normal  0.650234 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0050  major facilitator transporter  33.26 
 
 
484 aa  206  5e-52  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0174826 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4791  major facilitator superfamily MFS_1  31.97 
 
 
492 aa  207  5e-52  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.263491  normal  0.581697 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0395  major facilitator superfamily MFS_1  33.66 
 
 
472 aa  206  6e-52  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.90687 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1458  major facilitator transporter  33.65 
 
 
474 aa  206  8e-52  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.201779  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5496  major facilitator transporter  31.56 
 
 
490 aa  205  2e-51  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2500  major facilitator family transporter  33.69 
 
 
483 aa  203  5e-51  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.589471  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4810  MFS superfamily transporter permease  31.66 
 
 
514 aa  202  9.999999999999999e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.98055 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2715  major facilitator transporter  32.35 
 
 
491 aa  201  1.9999999999999998e-50  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3249  major facilitator superfamily MFS_1  33.33 
 
 
497 aa  201  3e-50  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.468482  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1785  major facilitator transporter  33.12 
 
 
493 aa  199  7e-50  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9266  major facilitator transporter  32.49 
 
 
479 aa  196  6e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.248133 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2729  major facilitator transporter  33.55 
 
 
489 aa  195  1e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.876432  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3353  major facilitator superfamily transporter  31.08 
 
 
483 aa  193  5e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.379633  decreased coverage  0.00165452 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4845  major facilitator transporter  31.85 
 
 
457 aa  191  2e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0428  major facilitator superfamily sugar transporter  32.98 
 
 
491 aa  188  2e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3530  major facilitator superfamily MFS_1  32.55 
 
 
491 aa  184  3e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0831333  normal  0.224408 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2413  major facilitator transporter  31.8 
 
 
447 aa  183  6e-45  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000787137  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1482  major facilitator superfamily MFS_1  28.71 
 
 
451 aa  173  5e-42  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000115751  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8056  major facilitator superfamily MFS_1  29.8 
 
 
451 aa  171  3e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5178  major facilitator transporter  27.43 
 
 
457 aa  169  7e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0670  general substrate transporter  28.6 
 
 
459 aa  163  5.0000000000000005e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.753041 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3564  major facilitator transporter  26.9 
 
 
436 aa  158  1e-37  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4993  MFS family membrane efflux protein  28.8 
 
 
526 aa  159  1e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.521864 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5283  major facilitator transporter  28.98 
 
 
463 aa  159  1e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.591426  normal  0.763827 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4638  major facilitator superfamily MFS_1  28.38 
 
 
451 aa  159  1e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000178504  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0532  major facilitator family transporter  27.19 
 
 
436 aa  158  2e-37  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0462  major facilitator family transporter  27.19 
 
 
436 aa  157  3e-37  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.450318  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3580  hypothetical protein  27.29 
 
 
478 aa  157  4e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.024372  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29790  sugar phosphate permease  30.05 
 
 
485 aa  156  8e-37  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5972  major facilitator transporter  28.07 
 
 
462 aa  155  1e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6599  major facilitator superfamily MFS_1  28.96 
 
 
459 aa  155  1e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.332731  normal  0.158495 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0070  MFS permease  28.91 
 
 
460 aa  155  1e-36  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5172  major facilitator superfamily MFS_1  28.27 
 
 
466 aa  155  2e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1414  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  26.43 
 
 
468 aa  155  2e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000198546  normal  0.095851 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2255  major facilitator superfamily MFS_1  29.29 
 
 
473 aa  154  2.9999999999999998e-36  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1595  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  27.39 
 
 
472 aa  154  2.9999999999999998e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6268  major facilitator transporter  28.07 
 
 
462 aa  154  2.9999999999999998e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.492492 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1875  major facilitator transporter  29.77 
 
 
459 aa  154  4e-36  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.473892  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5053  major facilitator superfamily MFS_1  27.07 
 
 
472 aa  153  7e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.122247 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0897  major facilitator superfamily MFS_1  30.51 
 
 
447 aa  152  8.999999999999999e-36  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0894914  normal  0.147269 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0528  major facilitator transporter  29.44 
 
 
467 aa  152  8.999999999999999e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0826405  hitchhiker  0.00770286 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1523  major facilitator transporter  30.17 
 
 
438 aa  152  1e-35  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.295641  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1856  major facilitator transporter  27.08 
 
 
438 aa  151  3e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0547  major facilitator superfamily transporter  27.63 
 
 
456 aa  150  4e-35  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.392915  normal  0.285749 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4019  major facilitator superfamily MFS_1  29.72 
 
 
435 aa  149  7e-35  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.000381325  normal  0.201783 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0186  major facilitator transporter  27.13 
 
 
479 aa  149  8e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6611  major facilitator transporter  28.29 
 
 
479 aa  149  9e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.410873  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0602  major facilitator superfamily MFS_1  26.48 
 
 
459 aa  147  4.0000000000000006e-34  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2088  major facilitator superfamily MFS_1  26.19 
 
 
456 aa  147  4.0000000000000006e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.565943 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7070  major facilitator superfamily MFS_1  26.91 
 
 
467 aa  147  4.0000000000000006e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.710966  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19270  putative MFS transporter  26.32 
 
 
455 aa  147  5e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.149627  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1166  major facilitator superfamily MFS_1  29.18 
 
 
450 aa  146  6e-34  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000374507 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3497  major facilitator superfamily MFS_1  28.39 
 
 
398 aa  146  6e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4932  major facilitator transporter  26.25 
 
 
480 aa  147  6e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.828486  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3228  major facilitator transporter  26.25 
 
 
480 aa  147  6e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.325137 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1660  MFS family transporter  26.75 
 
 
455 aa  146  8.000000000000001e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0463  major facilitator transporter  28.06 
 
 
448 aa  146  9e-34  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0213055  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS02027  metabolite transporter  25.83 
 
 
476 aa  145  1e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.158134 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21330  sugar phosphate permease  29.29 
 
 
477 aa  145  1e-33  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.428425  hitchhiker  0.00018034 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3924  major facilitator superfamily transporter  26.57 
 
 
438 aa  145  1e-33  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.496152  normal  0.0457831 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0245  putative permease  30.41 
 
 
449 aa  145  1e-33  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0461827  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5115  major facilitator family transporter  27.04 
 
 
399 aa  144  3e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000159613  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0270  major facilitator transporter  26.8 
 
 
477 aa  144  4e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0250869  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5599  major facilitator family transporter  26.79 
 
 
399 aa  144  4e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000105464  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5543  major facilitator family transporter  27.3 
 
 
399 aa  143  5e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000723204  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2518  major facilitator transporter  26.22 
 
 
437 aa  142  8e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4244  major facilitator transporter  25.82 
 
 
467 aa  142  9e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0539  major facilitator transporter  26.05 
 
 
473 aa  142  9e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2467  major facilitator transporter  26.95 
 
 
453 aa  142  9.999999999999999e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1543  major facilitator transporter  27.34 
 
 
382 aa  142  9.999999999999999e-33  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.0259552 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5547  major facilitator family transporter  26.79 
 
 
399 aa  142  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.00000000869498  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5271  major facilitator family transporter  26.79 
 
 
399 aa  142  9.999999999999999e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000000222558  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5098  major facilitator family transporter  26.79 
 
 
399 aa  142  9.999999999999999e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.20566e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5513  major facilitator family transporter  26.79 
 
 
399 aa  142  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5668  major facilitator family transporter  26.79 
 
 
399 aa  142  9.999999999999999e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.0000000000480591  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5172  major facilitator transporter  25.71 
 
 
474 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0809503 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3311  major facilitator transporter  26.44 
 
 
474 aa  142  1.9999999999999998e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.799238  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1377  major facilitator superfamily MFS_1  30 
 
 
445 aa  142  1.9999999999999998e-32  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>