More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS1710b_A1268 on replicon NC_007435
Organism: Burkholderia pseudomallei 1710b



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007435  BURPS1710b_A1268  MFS transporter  100 
 
 
487 aa  955    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.916286  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1717  major facilitator transporter  71.76 
 
 
488 aa  667    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3036  major facilitator transporter  99.59 
 
 
487 aa  952    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2231  major facilitator family transporter  91.58 
 
 
482 aa  866    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4340  general substrate transporter  51.71 
 
 
477 aa  465  9.999999999999999e-131  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4015  major facilitator superfamily MFS_1  51.22 
 
 
477 aa  460  9.999999999999999e-129  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2496  major facilitator family transporter  51.19 
 
 
472 aa  452  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.206768  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2304  major facilitator transporter  51.41 
 
 
472 aa  452  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.759044  normal  0.046264 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6200  major facilitator transporter  50.77 
 
 
492 aa  438  1e-121  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0622411 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00188  MFS transporter  51.75 
 
 
471 aa  429  1e-119  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.103216  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3453  major facilitator transporter  49.56 
 
 
472 aa  424  1e-117  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0499831  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0788  major facilitator family transporter  49.57 
 
 
472 aa  422  1e-117  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.509193  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0382  major facilitator transporter  50.65 
 
 
472 aa  423  1e-117  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.660441 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0555  major facilitator family transporter  49.57 
 
 
472 aa  422  1e-117  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1973  major facilitator transporter  49.57 
 
 
472 aa  422  1e-117  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2070  major facilitator transporter  49.13 
 
 
472 aa  420  1e-116  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.376866  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5266  major facilitator transporter  50.11 
 
 
472 aa  420  1e-116  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0486  major facilitator family transporter  49.35 
 
 
472 aa  421  1e-116  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0312823  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5007  major facilitator transporter  50.11 
 
 
472 aa  420  1e-116  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5153  major facilitator transporter  50.22 
 
 
475 aa  421  1e-116  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.507557  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3101  major facilitator transporter  50.11 
 
 
472 aa  420  1e-116  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.380275  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4627  major facilitator transporter  50.44 
 
 
475 aa  421  1e-116  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4647  major facilitator superfamily MFS_1  49.13 
 
 
488 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.866665  normal  0.46173 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0910  major facilitator family transporter  49.57 
 
 
472 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.367874  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0920  major facilitator superfamily transporter metabolite/H(+) symporter  49.34 
 
 
487 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.697574 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0808  major facilitator superfamily MFS_1  49.24 
 
 
494 aa  412  1e-114  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5986  major facilitator transporter  47.38 
 
 
479 aa  410  1e-113  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2063  major facilitator superfamily MFS_1  47.41 
 
 
479 aa  410  1e-113  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0432509  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3530  major facilitator transporter  49.56 
 
 
469 aa  405  1.0000000000000001e-112  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.229516  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6282  major facilitator transporter  47.1 
 
 
479 aa  408  1.0000000000000001e-112  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.384913  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3193  major facilitator transporter  44.59 
 
 
472 aa  394  1e-108  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.9008 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6611  major facilitator transporter  45.13 
 
 
479 aa  386  1e-106  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.410873  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1759  major facilitator superfamily MFS_1  44.08 
 
 
472 aa  384  1e-105  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0667  major facilitator family transporter  49.5 
 
 
494 aa  364  2e-99  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0482021  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4090  major facilitator superfamily metabolite(sugar)/H(+) symporter  41.98 
 
 
471 aa  358  1.9999999999999998e-97  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.94274  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1412  major facilitator transporter  43.25 
 
 
465 aa  354  2e-96  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6205  major facilitator superfamily MFS_1  41.76 
 
 
471 aa  353  2.9999999999999997e-96  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6959  major facilitator transporter  44.84 
 
 
479 aa  353  2.9999999999999997e-96  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2576  major facilitator transporter  40.17 
 
 
475 aa  331  1e-89  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.634768  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1718  major facilitator transporter  40.83 
 
 
473 aa  325  1e-87  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.442738  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1269  major facilitator transporter  39.38 
 
 
466 aa  300  3e-80  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0792  major facilitator superfamily MFS_1  33.26 
 
 
458 aa  262  1e-68  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.753449  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1551  major facilitator transporter  33.41 
 
 
485 aa  239  5.999999999999999e-62  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.308182  normal  0.0914413 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4860  major facilitator transporter  32.83 
 
 
487 aa  239  8e-62  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0839463 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1626  major facilitator transporter  32.9 
 
 
485 aa  238  2e-61  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.408436  normal  0.668079 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1217  major facilitator transporter  32.46 
 
 
487 aa  236  5.0000000000000005e-61  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.207678  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1696  major facilitator transporter  32.46 
 
 
487 aa  236  5.0000000000000005e-61  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.4496  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1668  major facilitator transporter  32.46 
 
 
487 aa  235  1.0000000000000001e-60  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.339414  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1604  major facilitator transporter  32.47 
 
 
485 aa  233  6e-60  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0285  major facilitator superfamily sugar transporter  32.97 
 
 
464 aa  227  3e-58  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.192742  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1483  major facilitator superfamily MFS_1  32.55 
 
 
456 aa  224  3e-57  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5972  major facilitator transporter  31.42 
 
 
462 aa  215  9.999999999999999e-55  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0970  major facilitator superfamily transporter metabolite/H(+) symporter  32.16 
 
 
470 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00262609  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6268  major facilitator transporter  31 
 
 
462 aa  213  4.9999999999999996e-54  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.492492 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0613  major facilitator superfamily MFS_1  32.83 
 
 
473 aa  210  5e-53  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0274336 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6599  major facilitator superfamily MFS_1  30.99 
 
 
459 aa  208  2e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.332731  normal  0.158495 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0463  major facilitator transporter  30.6 
 
 
448 aa  207  3e-52  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0213055  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5172  major facilitator superfamily MFS_1  32.31 
 
 
466 aa  204  2e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0828  major facilitator superfamily aromatic acid/H(+) symporter  31.35 
 
 
450 aa  203  6e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.420618  normal  0.255495 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4638  major facilitator superfamily MFS_1  29.24 
 
 
451 aa  202  9.999999999999999e-51  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000178504  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4087  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  32.61 
 
 
468 aa  199  9e-50  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.281632  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0987  major facilitator superfamily transporter metabolite/H(+) symporter  31.02 
 
 
461 aa  199  1.0000000000000001e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.496425 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0881  major facilitator superfamily MFS_1  28.26 
 
 
448 aa  197  5.000000000000001e-49  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.202747  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0528  major facilitator transporter  30.74 
 
 
467 aa  192  8e-48  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0826405  hitchhiker  0.00770286 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2088  major facilitator superfamily MFS_1  32.13 
 
 
456 aa  188  2e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.565943 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0896  major facilitator superfamily MFS_1  30.18 
 
 
462 aa  183  5.0000000000000004e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5934  major facilitator transporter  30.06 
 
 
468 aa  183  8.000000000000001e-45  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0786793 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5167  major facilitator superfamily MFS_1  30.87 
 
 
470 aa  182  1e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0270  major facilitator transporter  31.88 
 
 
477 aa  181  2e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0250869  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0668  major facilitator transporter  31.33 
 
 
474 aa  179  7e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00169534  normal 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8056  major facilitator superfamily MFS_1  32.84 
 
 
451 aa  179  7e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3358  major facilitator superfamily MFS_1  31.37 
 
 
459 aa  179  9e-44  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0967  major facilitator superfamily aromatic acid/H(+) symporter  30.33 
 
 
462 aa  179  1e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19270  putative MFS transporter  30.04 
 
 
455 aa  168  2e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.149627  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0547  major facilitator superfamily transporter  32.2 
 
 
456 aa  166  8e-40  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.392915  normal  0.285749 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0129  putative permease  27.59 
 
 
459 aa  166  1.0000000000000001e-39  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.549779  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1422  major facilitator family transporter  26.98 
 
 
452 aa  163  6e-39  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.452173  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2060  inner membrane metabolite transport protein YdjE  29.51 
 
 
459 aa  162  1e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0010058 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1993  major facilitator family transporter  26.77 
 
 
452 aa  162  1e-38  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.863885  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1873  major facilitator superfamily MFS_1  26.77 
 
 
452 aa  162  2e-38  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0070319  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0670  general substrate transporter  29.24 
 
 
459 aa  161  2e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.753041 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01738  predicted transporter  26.77 
 
 
452 aa  161  3e-38  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.375088  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01726  hypothetical protein  26.77 
 
 
452 aa  161  3e-38  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.448165  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0914  major facilitator transporter  30.52 
 
 
434 aa  161  3e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00481205  normal  0.205021 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0190  major facilitator superfamily MFS_1  29.25 
 
 
460 aa  160  6e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000521499 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1853  major facilitator family transporter  26.55 
 
 
452 aa  160  7e-38  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0220731  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1931  major facilitator superfamily permease  30.22 
 
 
478 aa  160  7e-38  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0979116  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1431  major facilitator family transporter  30.22 
 
 
478 aa  159  9e-38  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.475934  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0471  major facilitator family transporter  30.22 
 
 
478 aa  159  9e-38  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0177  major facilitator family transporter  30.22 
 
 
478 aa  159  9e-38  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1841  major facilitator family transporter  30.22 
 
 
478 aa  159  1e-37  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0911  major facilitator family transporter  30.22 
 
 
478 aa  159  1e-37  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.577596  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1863  major facilitator transporter  26.77 
 
 
452 aa  159  1e-37  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.369973  hitchhiker  0.0000261137 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3311  major facilitator transporter  30.56 
 
 
474 aa  159  2e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.799238  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2413  major facilitator transporter  27.49 
 
 
447 aa  158  2e-37  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000787137  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1937  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  29.32 
 
 
474 aa  157  3e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000000000973666  normal  0.0403058 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0379  major facilitator family transporter  30 
 
 
478 aa  157  4e-37  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1660  MFS family transporter  28.94 
 
 
455 aa  157  4e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5178  major facilitator transporter  30.2 
 
 
457 aa  157  5.0000000000000005e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6853  major facilitator transporter  29.64 
 
 
430 aa  157  5.0000000000000005e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.854567  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>