More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_4340 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004578  PSPTO_2496  major facilitator family transporter  85.53 
 
 
472 aa  808    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.206768  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2304  major facilitator transporter  85.47 
 
 
472 aa  806    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.759044  normal  0.046264 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4340  general substrate transporter  100 
 
 
477 aa  957    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00188  MFS transporter  67.44 
 
 
471 aa  592  1e-168  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.103216  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3193  major facilitator transporter  64.27 
 
 
472 aa  588  1e-167  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.9008 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1759  major facilitator superfamily MFS_1  59.92 
 
 
472 aa  565  1e-160  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4015  major facilitator superfamily MFS_1  50.95 
 
 
477 aa  502  1e-141  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0910  major facilitator family transporter  52.31 
 
 
472 aa  484  1e-135  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.367874  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3453  major facilitator transporter  51.86 
 
 
472 aa  476  1e-133  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0499831  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0788  major facilitator family transporter  52.44 
 
 
472 aa  476  1e-133  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.509193  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0486  major facilitator family transporter  52.23 
 
 
472 aa  475  1e-133  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0312823  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1973  major facilitator transporter  52.44 
 
 
472 aa  476  1e-133  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0555  major facilitator family transporter  52.44 
 
 
472 aa  476  1e-133  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0382  major facilitator transporter  51.28 
 
 
472 aa  474  1e-132  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.660441 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1717  major facilitator transporter  53.63 
 
 
488 aa  474  1e-132  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2070  major facilitator transporter  52.13 
 
 
472 aa  474  1e-132  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.376866  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5153  major facilitator transporter  51.97 
 
 
475 aa  474  1e-132  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.507557  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4627  major facilitator transporter  50.95 
 
 
475 aa  471  1e-132  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5007  major facilitator transporter  50.32 
 
 
472 aa  468  1.0000000000000001e-131  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3036  major facilitator transporter  52.03 
 
 
487 aa  469  1.0000000000000001e-131  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1268  MFS transporter  51.81 
 
 
487 aa  469  1.0000000000000001e-131  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.916286  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2231  major facilitator family transporter  52.06 
 
 
482 aa  470  1.0000000000000001e-131  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3101  major facilitator transporter  50.32 
 
 
472 aa  468  1.0000000000000001e-131  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.380275  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5266  major facilitator transporter  50.32 
 
 
472 aa  468  1.0000000000000001e-131  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6200  major facilitator transporter  51.85 
 
 
492 aa  466  9.999999999999999e-131  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0622411 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4647  major facilitator superfamily MFS_1  50.22 
 
 
488 aa  464  1e-129  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.866665  normal  0.46173 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0920  major facilitator superfamily transporter metabolite/H(+) symporter  50.44 
 
 
487 aa  462  1e-129  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.697574 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2063  major facilitator superfamily MFS_1  46.76 
 
 
479 aa  445  1.0000000000000001e-124  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0432509  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0808  major facilitator superfamily MFS_1  51.16 
 
 
494 aa  448  1.0000000000000001e-124  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5986  major facilitator transporter  48.15 
 
 
479 aa  442  1e-123  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6282  major facilitator transporter  48.37 
 
 
479 aa  444  1e-123  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.384913  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3530  major facilitator transporter  50.43 
 
 
469 aa  432  1e-120  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.229516  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6611  major facilitator transporter  46.97 
 
 
479 aa  429  1e-119  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.410873  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6959  major facilitator transporter  46.33 
 
 
479 aa  410  1e-113  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0667  major facilitator family transporter  52.93 
 
 
494 aa  408  1.0000000000000001e-112  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0482021  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1412  major facilitator transporter  45.34 
 
 
465 aa  398  1e-109  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1718  major facilitator transporter  45.69 
 
 
473 aa  386  1e-106  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.442738  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6205  major facilitator superfamily MFS_1  42.01 
 
 
471 aa  377  1e-103  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4090  major facilitator superfamily metabolite(sugar)/H(+) symporter  41.58 
 
 
471 aa  375  1e-102  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.94274  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2576  major facilitator transporter  41.97 
 
 
475 aa  350  3e-95  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.634768  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1269  major facilitator transporter  38.93 
 
 
466 aa  321  1.9999999999999998e-86  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0792  major facilitator superfamily MFS_1  32.89 
 
 
458 aa  256  5e-67  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.753449  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1483  major facilitator superfamily MFS_1  32.83 
 
 
456 aa  244  3e-63  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1551  major facilitator transporter  31.47 
 
 
485 aa  236  6e-61  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.308182  normal  0.0914413 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4860  major facilitator transporter  30.17 
 
 
487 aa  233  4.0000000000000004e-60  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0839463 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1604  major facilitator transporter  31.48 
 
 
485 aa  229  7e-59  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0463  major facilitator transporter  31.65 
 
 
448 aa  229  1e-58  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0213055  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1626  major facilitator transporter  31.26 
 
 
485 aa  228  2e-58  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.408436  normal  0.668079 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0285  major facilitator superfamily sugar transporter  31.86 
 
 
464 aa  222  9.999999999999999e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.192742  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1217  major facilitator transporter  29.52 
 
 
487 aa  222  9.999999999999999e-57  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.207678  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1696  major facilitator transporter  29.52 
 
 
487 aa  222  9.999999999999999e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.4496  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1668  major facilitator transporter  29.52 
 
 
487 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.339414  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0881  major facilitator superfamily MFS_1  30.04 
 
 
448 aa  215  1.9999999999999998e-54  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.202747  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0970  major facilitator superfamily transporter metabolite/H(+) symporter  32.09 
 
 
470 aa  211  3e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00262609  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0828  major facilitator superfamily aromatic acid/H(+) symporter  31.07 
 
 
450 aa  200  3.9999999999999996e-50  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.420618  normal  0.255495 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0987  major facilitator superfamily transporter metabolite/H(+) symporter  31.94 
 
 
461 aa  199  1.0000000000000001e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.496425 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0528  major facilitator transporter  29.58 
 
 
467 aa  196  9e-49  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0826405  hitchhiker  0.00770286 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5972  major facilitator transporter  28.41 
 
 
462 aa  192  1e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0668  major facilitator transporter  30.6 
 
 
474 aa  190  4e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00169534  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6268  major facilitator transporter  28.35 
 
 
462 aa  191  4e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.492492 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0379  major facilitator family transporter  31.51 
 
 
478 aa  189  7e-47  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0670  general substrate transporter  32.27 
 
 
459 aa  188  2e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.753041 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8056  major facilitator superfamily MFS_1  32.62 
 
 
451 aa  187  2e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1931  major facilitator superfamily permease  31.29 
 
 
478 aa  186  6e-46  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0979116  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0177  major facilitator family transporter  31.29 
 
 
478 aa  186  7e-46  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1431  major facilitator family transporter  31.29 
 
 
478 aa  186  7e-46  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.475934  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0471  major facilitator family transporter  31.29 
 
 
478 aa  186  7e-46  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1841  major facilitator family transporter  31.07 
 
 
478 aa  185  1.0000000000000001e-45  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0911  major facilitator family transporter  31.07 
 
 
478 aa  185  2.0000000000000003e-45  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.577596  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1660  MFS family transporter  30.28 
 
 
455 aa  185  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4638  major facilitator superfamily MFS_1  26.75 
 
 
451 aa  183  5.0000000000000004e-45  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000178504  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5109  major facilitator transporter  32.1 
 
 
474 aa  183  5.0000000000000004e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0967  major facilitator superfamily aromatic acid/H(+) symporter  28.63 
 
 
462 aa  182  9.000000000000001e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0539  major facilitator transporter  32.43 
 
 
473 aa  182  1e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5172  major facilitator transporter  31.93 
 
 
474 aa  181  2e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0809503 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0974  major facilitator superfamily aromatic acid/H(+) symporter  29.3 
 
 
462 aa  181  2e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00000109951  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3259  major facilitator transporter  31.85 
 
 
474 aa  181  2.9999999999999997e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.331503  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19270  putative MFS transporter  30.06 
 
 
455 aa  181  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.149627  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1595  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  31.37 
 
 
472 aa  180  4.999999999999999e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0190  major facilitator superfamily MFS_1  27.85 
 
 
460 aa  179  9e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000521499 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2413  major facilitator transporter  27.65 
 
 
447 aa  177  5e-43  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000787137  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1937  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  27.35 
 
 
474 aa  176  7e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000000000973666  normal  0.0403058 
 
 
-
 
NC_003296  RS02027  metabolite transporter  31.7 
 
 
476 aa  176  8e-43  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.158134 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0613  major facilitator superfamily MFS_1  28.54 
 
 
473 aa  174  2.9999999999999996e-42  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0274336 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5053  major facilitator superfamily MFS_1  31.37 
 
 
472 aa  174  2.9999999999999996e-42  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.122247 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3311  major facilitator transporter  31.11 
 
 
474 aa  173  5.999999999999999e-42  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.799238  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0129  putative permease  27.99 
 
 
459 aa  173  6.999999999999999e-42  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.549779  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5934  major facilitator transporter  28.63 
 
 
468 aa  172  1e-41  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0786793 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4087  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  28.54 
 
 
468 aa  172  1e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.281632  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0270  major facilitator transporter  29.91 
 
 
477 aa  172  1e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0250869  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3533  major facilitator transporter  31.71 
 
 
473 aa  172  1e-41  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0896  major facilitator superfamily MFS_1  31.06 
 
 
462 aa  170  5e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5178  major facilitator transporter  29.98 
 
 
457 aa  168  2e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5172  major facilitator superfamily MFS_1  27.65 
 
 
466 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2088  major facilitator superfamily MFS_1  30.28 
 
 
456 aa  166  5.9999999999999996e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.565943 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6599  major facilitator superfamily MFS_1  26.71 
 
 
459 aa  164  3e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.332731  normal  0.158495 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3358  major facilitator superfamily MFS_1  29.03 
 
 
459 aa  164  4.0000000000000004e-39  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5167  major facilitator superfamily MFS_1  27.03 
 
 
470 aa  162  1e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6853  major facilitator transporter  28.21 
 
 
430 aa  159  1e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.854567  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4651  major facilitator superfamily MFS_1  27.1 
 
 
470 aa  153  5.9999999999999996e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>