More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_5172 on replicon NC_010676
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010676  Bphyt_5172  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 466 aa  919    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0528  major facilitator transporter  70.31 
 
 		 467 aa  603  1.0000000000000001e-171  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0826405  hitchhiker  0.00770286 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5934  major facilitator transporter  68.03 
 
 		 468 aa  582  1.0000000000000001e-165  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0786793 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0828  major facilitator superfamily aromatic acid/H(+) symporter  46.99 
 
 		 450 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.420618  normal  0.255495 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0613  major facilitator superfamily MFS_1  46.19 
 
 		 473 aa  396  1e-109  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0274336 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6599  major facilitator superfamily MFS_1  48.22 
 
 		 459 aa  397  1e-109  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.332731  normal  0.158495 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5167  major facilitator superfamily MFS_1  49.13 
 
 		 470 aa  392  1e-108  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5972  major facilitator transporter  47.8 
 
 		 462 aa  389  1e-107  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6268  major facilitator transporter  48.02 
 
 		 462 aa  389  1e-107  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.492492 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0974  major facilitator superfamily aromatic acid/H(+) symporter  47.4 
 
 		 462 aa  386  1e-106  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00000109951  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0190  major facilitator superfamily MFS_1  46.51 
 
 		 460 aa  383  1e-105  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000521499 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4087  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  46.3 
 
 		 468 aa  384  1e-105  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.281632  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0970  major facilitator superfamily transporter metabolite/H(+) symporter  45.22 
 
 		 470 aa  382  1e-105  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00262609  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0987  major facilitator superfamily transporter metabolite/H(+) symporter  45.15 
 
 		 461 aa  369  1e-101  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.496425 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1937  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  45.9 
 
 		 474 aa  370  1e-101  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000000000973666  normal  0.0403058 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0967  major facilitator superfamily aromatic acid/H(+) symporter  43.86 
 
 		 462 aa  363  3e-99  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0270  major facilitator transporter  46.8 
 
 		 477 aa  358  9.999999999999999e-98  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0250869  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0896  major facilitator superfamily MFS_1  45.21 
 
 		 462 aa  348  1e-94  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6853  major facilitator transporter  42.33 
 
 		 430 aa  320  5e-86  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.854567  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1993  major facilitator family transporter  37.64 
 
 		 452 aa  277  3e-73  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.863885  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1422  major facilitator family transporter  37.64 
 
 		 452 aa  277  3e-73  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.452173  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1873  major facilitator superfamily MFS_1  37.64 
 
 		 452 aa  276  4e-73  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0070319  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0129  putative permease  37.33 
 
 		 459 aa  276  5e-73  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.549779  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01738  predicted transporter  37.64 
 
 		 452 aa  275  2.0000000000000002e-72  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.375088  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01726  hypothetical protein  37.64 
 
 		 452 aa  275  2.0000000000000002e-72  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.448165  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1853  major facilitator family transporter  37.64 
 
 		 452 aa  274  3e-72  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0220731  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1863  major facilitator transporter  37.42 
 
 		 452 aa  272  1e-71  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.369973  hitchhiker  0.0000261137 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2054  inner membrane metabolite transport protein YdjE  37.78 
 
 		 452 aa  263  4e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0842085 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2028  major facilitator superfamily permease  35.84 
 
 		 428 aa  251  2e-65  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2490  inner membrane metabolite transport protein YdjE  37.08 
 
 		 416 aa  251  3e-65  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.754275 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3220  major facilitator superfamily MFS_1  32.82 
 
 		 463 aa  248  1e-64  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0542188  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1999  major facilitator family transporter  34.3 
 
 		 459 aa  245  9.999999999999999e-64  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0702699  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1857  major facilitator transporter  34.3 
 
 		 459 aa  245  9.999999999999999e-64  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.526363  hitchhiker  0.0000247936 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2060  inner membrane metabolite transport protein YdjE  34.15 
 
 		 459 aa  244  1.9999999999999999e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0010058 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1860  major facilitator family transporter  34.3 
 
 		 459 aa  244  3e-63  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0174535  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1416  major facilitator family transporter  35.07 
 
 		 459 aa  237  3e-61  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.888006  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1867  major facilitator superfamily MFS_1  35.07 
 
 		 459 aa  237  4e-61  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000517052  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01744  predicted transporter  34.83 
 
 		 459 aa  236  8e-61  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.955946  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01732  hypothetical protein  34.83 
 
 		 459 aa  236  8e-61  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2499  major facilitator family transporter  34.83 
 
 		 459 aa  235  1.0000000000000001e-60  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.465931  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0792  major facilitator superfamily MFS_1  33.33 
 
 		 458 aa  234  3e-60  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.753449  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0285  major facilitator superfamily sugar transporter  32.96 
 
 		 464 aa  227  3e-58  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.192742  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5109  major facilitator transporter  36.14 
 
 		 474 aa  227  4e-58  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2413  major facilitator transporter  35.36 
 
 		 447 aa  226  8e-58  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000787137  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8056  major facilitator superfamily MFS_1  34.3 
 
 		 451 aa  225  2e-57  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5172  major facilitator transporter  36.02 
 
 		 474 aa  224  3e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0809503 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3259  major facilitator transporter  35.92 
 
 		 474 aa  224  3e-57  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.331503  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6200  major facilitator transporter  32.67 
 
 		 492 aa  220  3e-56  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0622411 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0670  general substrate transporter  33.99 
 
 		 459 aa  220  3.9999999999999997e-56  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.753041 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5178  major facilitator transporter  32.29 
 
 		 457 aa  218  1e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1595  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  33.98 
 
 		 472 aa  219  1e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4638  major facilitator superfamily MFS_1  32.37 
 
 		 451 aa  219  1e-55  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000178504  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2088  major facilitator superfamily MFS_1  34.86 
 
 		 456 aa  218  2e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.565943 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3533  major facilitator transporter  35.41 
 
 		 473 aa  218  2e-55  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5053  major facilitator superfamily MFS_1  33.91 
 
 		 472 aa  217  2.9999999999999998e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.122247 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5986  major facilitator transporter  30.92 
 
 		 479 aa  217  4e-55  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0539  major facilitator transporter  35.57 
 
 		 473 aa  217  4e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02027  metabolite transporter  33.84 
 
 		 476 aa  216  5e-55  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.158134 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6282  major facilitator transporter  30.92 
 
 		 479 aa  216  5e-55  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.384913  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1483  major facilitator superfamily MFS_1  34.45 
 
 		 456 aa  215  9.999999999999999e-55  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3311  major facilitator transporter  33.55 
 
 		 474 aa  214  2.9999999999999995e-54  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.799238  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3453  major facilitator transporter  33.33 
 
 		 472 aa  214  2.9999999999999995e-54  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0499831  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2231  major facilitator family transporter  31.87 
 
 		 482 aa  214  2.9999999999999995e-54  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5007  major facilitator transporter  33.77 
 
 		 472 aa  213  4.9999999999999996e-54  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5266  major facilitator transporter  33.77 
 
 		 472 aa  213  4.9999999999999996e-54  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3101  major facilitator transporter  33.77 
 
 		 472 aa  213  4.9999999999999996e-54  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.380275  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19270  putative MFS transporter  32.3 
 
 		 455 aa  213  7.999999999999999e-54  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.149627  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2073  major facilitator superfamily transporter  35.01 
 
 		 467 aa  212  1e-53  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0013865 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1841  major facilitator family transporter  34.52 
 
 		 478 aa  212  1e-53  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1931  major facilitator superfamily permease  34.52 
 
 		 478 aa  212  1e-53  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0979116  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0471  major facilitator family transporter  34.52 
 
 		 478 aa  211  2e-53  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0177  major facilitator family transporter  34.52 
 
 		 478 aa  211  2e-53  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0911  major facilitator family transporter  34.52 
 
 		 478 aa  211  2e-53  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.577596  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1431  major facilitator family transporter  34.52 
 
 		 478 aa  211  2e-53  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.475934  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1660  MFS family transporter  32.89 
 
 		 455 aa  211  3e-53  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0379  major facilitator family transporter  34.52 
 
 		 478 aa  210  3e-53  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0382  major facilitator transporter  33.77 
 
 		 472 aa  210  4e-53  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.660441 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2063  major facilitator superfamily MFS_1  31.73 
 
 		 479 aa  207  2e-52  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0432509  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4647  major facilitator superfamily MFS_1  31.35 
 
 		 488 aa  207  3e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.866665  normal  0.46173 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5153  major facilitator transporter  33.33 
 
 		 475 aa  207  4e-52  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.507557  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1268  MFS transporter  31.58 
 
 		 487 aa  206  6e-52  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.916286  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4627  major facilitator transporter  33.33 
 
 		 475 aa  206  6e-52  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6611  major facilitator transporter  31.58 
 
 		 479 aa  204  2e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.410873  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2900  major facilitator transporter  29.46 
 
 		 514 aa  204  2e-51  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.473738  normal  0.0138886 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3036  major facilitator transporter  31.36 
 
 		 487 aa  205  2e-51  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0910  major facilitator family transporter  33.41 
 
 		 472 aa  204  3e-51  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.367874  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0920  major facilitator superfamily transporter metabolite/H(+) symporter  30.02 
 
 		 487 aa  203  7e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.697574 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2255  major facilitator superfamily MFS_1  33.98 
 
 		 473 aa  202  9.999999999999999e-51  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4090  major facilitator superfamily metabolite(sugar)/H(+) symporter  29.8 
 
 		 471 aa  199  7.999999999999999e-50  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.94274  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2070  major facilitator transporter  33.33 
 
 		 472 aa  198  2.0000000000000003e-49  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.376866  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0788  major facilitator family transporter  33.33 
 
 		 472 aa  198  2.0000000000000003e-49  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.509193  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0555  major facilitator family transporter  33.33 
 
 		 472 aa  198  2.0000000000000003e-49  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1973  major facilitator transporter  33.33 
 
 		 472 aa  198  2.0000000000000003e-49  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6205  major facilitator superfamily MFS_1  30.18 
 
 		 471 aa  198  2.0000000000000003e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0486  major facilitator family transporter  33.12 
 
 		 472 aa  197  3e-49  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0312823  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4015  major facilitator superfamily MFS_1  29.22 
 
 		 477 aa  197  5.000000000000001e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1269  major facilitator transporter  31.06 
 
 		 466 aa  193  4e-48  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4651  major facilitator superfamily MFS_1  31.36 
 
 		 470 aa  193  6e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3530  major facilitator transporter  32.94 
 
 		 469 aa  189  7e-47  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.229516  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0808  major facilitator superfamily MFS_1  30.62 
 
 		 494 aa  188  1e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>