More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_2304 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_2496  major facilitator family transporter  93.01 
 
 		 472 aa  873    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.206768  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2304  major facilitator transporter  100 
 
 		 472 aa  942    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.759044  normal  0.046264 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4340  general substrate transporter  85.47 
 
 		 477 aa  807    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00188  MFS transporter  66.67 
 
 		 471 aa  586  1e-166  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.103216  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3193  major facilitator transporter  62.37 
 
 		 472 aa  574  1.0000000000000001e-162  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.9008 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1759  major facilitator superfamily MFS_1  62.61 
 
 		 472 aa  561  1.0000000000000001e-159  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4015  major facilitator superfamily MFS_1  52.46 
 
 		 477 aa  501  1e-140  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0788  major facilitator family transporter  53.3 
 
 		 472 aa  472  1e-132  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.509193  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1973  major facilitator transporter  53.3 
 
 		 472 aa  472  1e-132  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0910  major facilitator family transporter  53.07 
 
 		 472 aa  474  1e-132  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.367874  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0555  major facilitator family transporter  53.3 
 
 		 472 aa  472  1e-132  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5153  major facilitator transporter  52.11 
 
 		 475 aa  473  1e-132  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.507557  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3453  major facilitator transporter  52.55 
 
 		 472 aa  474  1e-132  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0499831  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0486  major facilitator family transporter  53.09 
 
 		 472 aa  471  1.0000000000000001e-131  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0312823  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0382  major facilitator transporter  52.81 
 
 		 472 aa  470  1.0000000000000001e-131  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.660441 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2070  major facilitator transporter  53.09 
 
 		 472 aa  471  1.0000000000000001e-131  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.376866  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4627  major facilitator transporter  52.69 
 
 		 475 aa  470  1.0000000000000001e-131  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5007  major facilitator transporter  52.03 
 
 		 472 aa  467  9.999999999999999e-131  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4647  major facilitator superfamily MFS_1  50.32 
 
 		 488 aa  465  9.999999999999999e-131  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.866665  normal  0.46173 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3101  major facilitator transporter  52.03 
 
 		 472 aa  467  9.999999999999999e-131  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.380275  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5266  major facilitator transporter  52.03 
 
 		 472 aa  467  9.999999999999999e-131  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6200  major facilitator transporter  52.27 
 
 		 492 aa  463  1e-129  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0622411 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0920  major facilitator superfamily transporter metabolite/H(+) symporter  51.09 
 
 		 487 aa  459  9.999999999999999e-129  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.697574 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1717  major facilitator transporter  51.22 
 
 		 488 aa  456  1e-127  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2231  major facilitator family transporter  51.09 
 
 		 482 aa  458  1e-127  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1268  MFS transporter  51.18 
 
 		 487 aa  454  1.0000000000000001e-126  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.916286  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3036  major facilitator transporter  51.4 
 
 		 487 aa  454  1.0000000000000001e-126  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0808  major facilitator superfamily MFS_1  51.07 
 
 		 494 aa  439  9.999999999999999e-123  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3530  major facilitator transporter  50.54 
 
 		 469 aa  426  1e-118  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.229516  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6282  major facilitator transporter  46.48 
 
 		 479 aa  427  1e-118  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.384913  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2063  major facilitator superfamily MFS_1  45.45 
 
 		 479 aa  426  1e-118  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0432509  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5986  major facilitator transporter  46.27 
 
 		 479 aa  425  1e-117  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6611  major facilitator transporter  45.43 
 
 		 479 aa  410  1e-113  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.410873  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0667  major facilitator family transporter  53.09 
 
 		 494 aa  404  1e-111  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0482021  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6959  major facilitator transporter  47.9 
 
 		 479 aa  401  9.999999999999999e-111  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1412  major facilitator transporter  46.64 
 
 		 465 aa  397  1e-109  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4090  major facilitator superfamily metabolite(sugar)/H(+) symporter  42.23 
 
 		 471 aa  379  1e-104  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.94274  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1718  major facilitator transporter  46.67 
 
 		 473 aa  377  1e-103  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.442738  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6205  major facilitator superfamily MFS_1  42.45 
 
 		 471 aa  374  1e-102  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2576  major facilitator transporter  42.46 
 
 		 475 aa  341  2e-92  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.634768  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1269  major facilitator transporter  38.03 
 
 		 466 aa  311  2e-83  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0792  major facilitator superfamily MFS_1  32.89 
 
 		 458 aa  257  3e-67  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.753449  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1483  major facilitator superfamily MFS_1  32.97 
 
 		 456 aa  242  9e-63  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0463  major facilitator transporter  31.43 
 
 		 448 aa  228  1e-58  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0213055  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1551  major facilitator transporter  30.62 
 
 		 485 aa  225  1e-57  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.308182  normal  0.0914413 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4860  major facilitator transporter  29.96 
 
 		 487 aa  224  3e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0839463 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1626  major facilitator transporter  31.39 
 
 		 485 aa  220  5e-56  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.408436  normal  0.668079 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0881  major facilitator superfamily MFS_1  30.77 
 
 		 448 aa  219  7e-56  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.202747  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1604  major facilitator transporter  30.75 
 
 		 485 aa  218  2.9999999999999998e-55  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0285  major facilitator superfamily sugar transporter  31.93 
 
 		 464 aa  217  4e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.192742  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1217  major facilitator transporter  29.52 
 
 		 487 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.207678  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1696  major facilitator transporter  29.52 
 
 		 487 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.4496  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1668  major facilitator transporter  29.3 
 
 		 487 aa  213  7e-54  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.339414  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0970  major facilitator superfamily transporter metabolite/H(+) symporter  32.75 
 
 		 470 aa  209  8e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00262609  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0828  major facilitator superfamily aromatic acid/H(+) symporter  30.53 
 
 		 450 aa  196  9e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.420618  normal  0.255495 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0668  major facilitator transporter  31.99 
 
 		 474 aa  194  3e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00169534  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0528  major facilitator transporter  29.91 
 
 		 467 aa  192  9e-48  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0826405  hitchhiker  0.00770286 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0987  major facilitator superfamily transporter metabolite/H(+) symporter  31.06 
 
 		 461 aa  190  4e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.496425 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8056  major facilitator superfamily MFS_1  31 
 
 		 451 aa  188  2e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5109  major facilitator transporter  32.1 
 
 		 474 aa  185  1.0000000000000001e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19270  putative MFS transporter  29.71 
 
 		 455 aa  184  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.149627  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0539  major facilitator transporter  32.18 
 
 		 473 aa  183  6e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0974  major facilitator superfamily aromatic acid/H(+) symporter  28.19 
 
 		 462 aa  183  7e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00000109951  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5172  major facilitator transporter  31.68 
 
 		 474 aa  183  7e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0809503 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0967  major facilitator superfamily aromatic acid/H(+) symporter  29.3 
 
 		 462 aa  182  8.000000000000001e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3259  major facilitator transporter  31.85 
 
 		 474 aa  182  8.000000000000001e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.331503  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4638  major facilitator superfamily MFS_1  26.59 
 
 		 451 aa  182  9.000000000000001e-45  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000178504  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5972  major facilitator transporter  27.91 
 
 		 462 aa  182  1e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0379  major facilitator family transporter  30.11 
 
 		 478 aa  181  2e-44  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1660  MFS family transporter  29.58 
 
 		 455 aa  181  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6268  major facilitator transporter  27.69 
 
 		 462 aa  180  4e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.492492 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1931  major facilitator superfamily permease  29.89 
 
 		 478 aa  178  2e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0979116  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1431  major facilitator family transporter  29.89 
 
 		 478 aa  178  2e-43  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.475934  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0471  major facilitator family transporter  29.89 
 
 		 478 aa  178  2e-43  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0670  general substrate transporter  31.13 
 
 		 459 aa  178  2e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.753041 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1937  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  29.8 
 
 		 474 aa  178  2e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000000000973666  normal  0.0403058 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0177  major facilitator family transporter  29.89 
 
 		 478 aa  178  2e-43  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1841  major facilitator family transporter  29.89 
 
 		 478 aa  177  4e-43  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0190  major facilitator superfamily MFS_1  28.13 
 
 		 460 aa  176  7e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000521499 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0911  major facilitator family transporter  29.67 
 
 		 478 aa  176  7e-43  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.577596  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02027  metabolite transporter  30.2 
 
 		 476 aa  176  9.999999999999999e-43  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.158134 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5934  major facilitator transporter  30.36 
 
 		 468 aa  175  9.999999999999999e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0786793 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2413  major facilitator transporter  28.07 
 
 		 447 aa  174  3.9999999999999995e-42  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000787137  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1595  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  31.03 
 
 		 472 aa  173  5e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3533  major facilitator transporter  30.69 
 
 		 473 aa  172  1e-41  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4087  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  28.26 
 
 		 468 aa  171  2e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.281632  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5172  major facilitator superfamily MFS_1  28.57 
 
 		 466 aa  171  3e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5053  major facilitator superfamily MFS_1  30.64 
 
 		 472 aa  170  5e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.122247 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0270  major facilitator transporter  28.79 
 
 		 477 aa  169  8e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0250869  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3358  major facilitator superfamily MFS_1  29.3 
 
 		 459 aa  169  9e-41  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0613  major facilitator superfamily MFS_1  28.35 
 
 		 473 aa  169  1e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0274336 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3311  major facilitator transporter  29.95 
 
 		 474 aa  168  2e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.799238  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0896  major facilitator superfamily MFS_1  30.28 
 
 		 462 aa  168  2e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6853  major facilitator transporter  30.65 
 
 		 430 aa  167  4e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.854567  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5178  major facilitator transporter  29.65 
 
 		 457 aa  163  8.000000000000001e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2088  major facilitator superfamily MFS_1  29.18 
 
 		 456 aa  162  9e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.565943 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6599  major facilitator superfamily MFS_1  26.99 
 
 		 459 aa  160  6e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.332731  normal  0.158495 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0129  putative permease  26.96 
 
 		 459 aa  158  2e-37  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.549779  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4651  major facilitator superfamily MFS_1  29.03 
 
 		 470 aa  157  3e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5167  major facilitator superfamily MFS_1  27.77 
 
 		 470 aa  157  3e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>