More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen2424_1696 on replicon NC_008542
Organism: Burkholderia cenocepacia HI2424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007510  Bcep18194_A4860  major facilitator transporter  94.25 
 
 		 487 aa  879    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0839463 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1551  major facilitator transporter  85.22 
 
 		 485 aa  803    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.308182  normal  0.0914413 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1668  major facilitator transporter  99.18 
 
 		 487 aa  956    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.339414  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1626  major facilitator transporter  91.99 
 
 		 485 aa  870    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.408436  normal  0.668079 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1217  major facilitator transporter  100 
 
 		 487 aa  964    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.207678  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1604  major facilitator transporter  92.4 
 
 		 485 aa  872    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1696  major facilitator transporter  100 
 
 		 487 aa  964    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.4496  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0792  major facilitator superfamily MFS_1  45.29 
 
 		 458 aa  379  1e-104  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.753449  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1483  major facilitator superfamily MFS_1  47.76 
 
 		 456 aa  368  1e-100  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4015  major facilitator superfamily MFS_1  34.03 
 
 		 477 aa  274  2.0000000000000002e-72  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6611  major facilitator transporter  33.86 
 
 		 479 aa  247  3e-64  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.410873  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6282  major facilitator transporter  32.76 
 
 		 479 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.384913  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5986  major facilitator transporter  32.33 
 
 		 479 aa  242  1e-62  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1759  major facilitator superfamily MFS_1  32.74 
 
 		 472 aa  239  8e-62  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0808  major facilitator superfamily MFS_1  33.54 
 
 		 494 aa  238  2e-61  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6200  major facilitator transporter  31.77 
 
 		 492 aa  237  4e-61  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0622411 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2231  major facilitator family transporter  32.75 
 
 		 482 aa  237  4e-61  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1268  MFS transporter  32.03 
 
 		 487 aa  233  4.0000000000000004e-60  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.916286  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2063  major facilitator superfamily MFS_1  32.64 
 
 		 479 aa  233  6e-60  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0432509  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3036  major facilitator transporter  31.81 
 
 		 487 aa  231  2e-59  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3193  major facilitator transporter  30.9 
 
 		 472 aa  228  2e-58  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.9008 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3453  major facilitator transporter  32.67 
 
 		 472 aa  226  5.0000000000000005e-58  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0499831  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0920  major facilitator superfamily transporter metabolite/H(+) symporter  32.13 
 
 		 487 aa  226  7e-58  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.697574 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4647  major facilitator superfamily MFS_1  31.16 
 
 		 488 aa  224  2e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.866665  normal  0.46173 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1412  major facilitator transporter  33.05 
 
 		 465 aa  222  9.999999999999999e-57  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4340  general substrate transporter  29.55 
 
 		 477 aa  222  9.999999999999999e-57  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2070  major facilitator transporter  31.36 
 
 		 472 aa  221  3e-56  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.376866  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0910  major facilitator family transporter  31.51 
 
 		 472 aa  221  3e-56  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.367874  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1973  major facilitator transporter  31.99 
 
 		 472 aa  219  6e-56  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0788  major facilitator family transporter  31.99 
 
 		 472 aa  219  6e-56  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.509193  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0555  major facilitator family transporter  31.99 
 
 		 472 aa  219  6e-56  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6959  major facilitator transporter  32.42 
 
 		 479 aa  219  7.999999999999999e-56  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0486  major facilitator family transporter  31.77 
 
 		 472 aa  219  1e-55  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0312823  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2496  major facilitator family transporter  29.79 
 
 		 472 aa  218  2e-55  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.206768  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0382  major facilitator transporter  32.75 
 
 		 472 aa  218  2e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.660441 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4090  major facilitator superfamily metabolite(sugar)/H(+) symporter  30.9 
 
 		 471 aa  218  2e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.94274  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6205  major facilitator superfamily MFS_1  31.65 
 
 		 471 aa  218  2.9999999999999998e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3101  major facilitator transporter  31.81 
 
 		 472 aa  217  2.9999999999999998e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.380275  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5007  major facilitator transporter  31.81 
 
 		 472 aa  217  2.9999999999999998e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5266  major facilitator transporter  31.81 
 
 		 472 aa  217  2.9999999999999998e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4627  major facilitator transporter  32.68 
 
 		 475 aa  217  4e-55  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5153  major facilitator transporter  31.89 
 
 		 475 aa  216  5e-55  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.507557  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0285  major facilitator superfamily sugar transporter  32.66 
 
 		 464 aa  216  9.999999999999999e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.192742  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2304  major facilitator transporter  29.49 
 
 		 472 aa  212  1e-53  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.759044  normal  0.046264 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0463  major facilitator transporter  33.33 
 
 		 448 aa  212  1e-53  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0213055  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1717  major facilitator transporter  32.53 
 
 		 488 aa  211  2e-53  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3530  major facilitator transporter  32.78 
 
 		 469 aa  207  3e-52  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.229516  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0881  major facilitator superfamily MFS_1  32.51 
 
 		 448 aa  206  5e-52  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.202747  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0668  major facilitator transporter  35.32 
 
 		 474 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00169534  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0667  major facilitator family transporter  32.64 
 
 		 494 aa  197  5.000000000000001e-49  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0482021  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00188  MFS transporter  32.17 
 
 		 471 aa  196  7e-49  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.103216  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2576  major facilitator transporter  30.02 
 
 		 475 aa  191  2e-47  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.634768  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1269  major facilitator transporter  31.05 
 
 		 466 aa  191  2e-47  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3358  major facilitator superfamily MFS_1  29.2 
 
 		 459 aa  184  2.0000000000000003e-45  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5172  major facilitator superfamily MFS_1  31.28 
 
 		 466 aa  177  3e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1718  major facilitator transporter  29.22 
 
 		 473 aa  174  3.9999999999999995e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.442738  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0896  major facilitator superfamily MFS_1  31.74 
 
 		 462 aa  169  1e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6268  major facilitator transporter  30.07 
 
 		 462 aa  163  6e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.492492 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5972  major facilitator transporter  29.84 
 
 		 462 aa  162  1e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4638  major facilitator superfamily MFS_1  26.28 
 
 		 451 aa  160  3e-38  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000178504  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0528  major facilitator transporter  29.93 
 
 		 467 aa  160  4e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0826405  hitchhiker  0.00770286 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0987  major facilitator superfamily transporter metabolite/H(+) symporter  31.26 
 
 		 461 aa  160  6e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.496425 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1326  major facilitator transporter  32.85 
 
 		 464 aa  160  6e-38  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.367254  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4876  major facilitator transporter  34.19 
 
 		 465 aa  159  1e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.116768 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4019  major facilitator superfamily MFS_1  35.33 
 
 		 435 aa  155  1e-36  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.000381325  normal  0.201783 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1660  MFS family transporter  29.67 
 
 		 455 aa  155  1e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0970  major facilitator superfamily transporter metabolite/H(+) symporter  28.73 
 
 		 470 aa  156  1e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00262609  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0443  major facilitator superfamily MFS_1  29.26 
 
 		 461 aa  154  2.9999999999999998e-36  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0539  major facilitator transporter  29.49 
 
 		 473 aa  153  5.9999999999999996e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19270  putative MFS transporter  28.45 
 
 		 455 aa  153  5.9999999999999996e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.149627  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0190  major facilitator superfamily MFS_1  30.54 
 
 		 460 aa  153  8e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000521499 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1931  major facilitator superfamily permease  29.35 
 
 		 478 aa  153  8e-36  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0979116  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1431  major facilitator family transporter  29.35 
 
 		 478 aa  152  8.999999999999999e-36  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.475934  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0471  major facilitator family transporter  29.35 
 
 		 478 aa  152  8.999999999999999e-36  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0177  major facilitator family transporter  29.35 
 
 		 478 aa  152  8.999999999999999e-36  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0911  major facilitator family transporter  29.35 
 
 		 478 aa  152  1e-35  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.577596  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0379  major facilitator family transporter  29.35 
 
 		 478 aa  152  1e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1841  major facilitator family transporter  29.35 
 
 		 478 aa  152  1e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1898  major facilitator superfamily MFS_1  27.29 
 
 		 448 aa  152  1e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5109  major facilitator transporter  29.71 
 
 		 474 aa  151  2e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1937  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  29.75 
 
 		 474 aa  151  3e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000000000973666  normal  0.0403058 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0967  major facilitator superfamily aromatic acid/H(+) symporter  29.03 
 
 		 462 aa  151  3e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8056  major facilitator superfamily MFS_1  30.29 
 
 		 451 aa  150  4e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5934  major facilitator transporter  31.51 
 
 		 468 aa  149  8e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0786793 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5172  major facilitator transporter  29.27 
 
 		 474 aa  149  1.0000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0809503 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3259  major facilitator transporter  29.49 
 
 		 474 aa  149  1.0000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.331503  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0670  general substrate transporter  28.79 
 
 		 459 aa  148  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.753041 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5167  major facilitator superfamily MFS_1  30.62 
 
 		 470 aa  147  4.0000000000000006e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2413  major facilitator transporter  27.13 
 
 		 447 aa  147  5e-34  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000787137  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5178  major facilitator transporter  27.29 
 
 		 457 aa  146  1e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1633  general substrate transporter  26.33 
 
 		 476 aa  145  1e-33  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.904084  normal  0.408822 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3533  major facilitator transporter  30.33 
 
 		 473 aa  146  1e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29790  sugar phosphate permease  30.44 
 
 		 485 aa  145  1e-33  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2255  major facilitator superfamily MFS_1  31.36 
 
 		 473 aa  144  2e-33  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3311  major facilitator transporter  30.07 
 
 		 474 aa  144  5e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.799238  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0129  putative permease  26.83 
 
 		 459 aa  142  9.999999999999999e-33  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.549779  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6599  major facilitator superfamily MFS_1  28.73 
 
 		 459 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.332731  normal  0.158495 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0613  major facilitator superfamily MFS_1  27.89 
 
 		 473 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0274336 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0897  major facilitator superfamily MFS_1  31.5 
 
 		 447 aa  141  3e-32  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0894914  normal  0.147269 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2073  major facilitator superfamily transporter  29.31 
 
 		 467 aa  141  3e-32  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0013865 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>