More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_1626 on replicon NC_010551
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010084  Bmul_1551  major facilitator transporter  86.19 
 
 
485 aa  811    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.308182  normal  0.0914413 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1626  major facilitator transporter  100 
 
 
485 aa  962    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.408436  normal  0.668079 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4860  major facilitator transporter  91.58 
 
 
487 aa  856    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0839463 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1217  major facilitator transporter  91.38 
 
 
487 aa  857    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.207678  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1604  major facilitator transporter  98.35 
 
 
485 aa  946    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1668  major facilitator transporter  90.76 
 
 
487 aa  851    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.339414  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1696  major facilitator transporter  91.38 
 
 
487 aa  857    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.4496  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0792  major facilitator superfamily MFS_1  45.74 
 
 
458 aa  386  1e-106  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.753449  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1483  major facilitator superfamily MFS_1  47.09 
 
 
456 aa  369  1e-101  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4015  major facilitator superfamily MFS_1  34.94 
 
 
477 aa  275  1.0000000000000001e-72  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6611  major facilitator transporter  34.37 
 
 
479 aa  249  7e-65  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.410873  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6282  major facilitator transporter  33.4 
 
 
479 aa  246  8e-64  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.384913  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5986  major facilitator transporter  32.98 
 
 
479 aa  244  3e-63  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1759  major facilitator superfamily MFS_1  32.44 
 
 
472 aa  239  5.999999999999999e-62  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2063  major facilitator superfamily MFS_1  33.61 
 
 
479 aa  239  8e-62  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0432509  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0808  major facilitator superfamily MFS_1  33.67 
 
 
494 aa  238  1e-61  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6200  major facilitator transporter  32.05 
 
 
492 aa  237  4e-61  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0622411 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1268  MFS transporter  32.9 
 
 
487 aa  236  6e-61  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.916286  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2231  major facilitator family transporter  32.31 
 
 
482 aa  235  1.0000000000000001e-60  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3036  major facilitator transporter  32.68 
 
 
487 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3453  major facilitator transporter  32.77 
 
 
472 aa  234  4.0000000000000004e-60  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0499831  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6959  major facilitator transporter  32.92 
 
 
479 aa  232  1e-59  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3193  major facilitator transporter  31.08 
 
 
472 aa  232  1e-59  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.9008 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4340  general substrate transporter  31.76 
 
 
477 aa  230  3e-59  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4647  major facilitator superfamily MFS_1  31.61 
 
 
488 aa  230  4e-59  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.866665  normal  0.46173 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0910  major facilitator family transporter  31.93 
 
 
472 aa  229  6e-59  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.367874  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4627  major facilitator transporter  31.59 
 
 
475 aa  229  1e-58  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0920  major facilitator superfamily transporter metabolite/H(+) symporter  31.39 
 
 
487 aa  228  2e-58  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.697574 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5153  major facilitator transporter  31.59 
 
 
475 aa  228  2e-58  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.507557  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2070  major facilitator transporter  32.27 
 
 
472 aa  227  3e-58  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.376866  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0382  major facilitator transporter  31.36 
 
 
472 aa  227  4e-58  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.660441 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0788  major facilitator family transporter  31.34 
 
 
472 aa  226  8e-58  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.509193  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1973  major facilitator transporter  31.34 
 
 
472 aa  226  8e-58  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0555  major facilitator family transporter  31.34 
 
 
472 aa  226  8e-58  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2496  major facilitator family transporter  31.85 
 
 
472 aa  225  2e-57  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.206768  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0486  major facilitator family transporter  31.13 
 
 
472 aa  225  2e-57  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0312823  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5007  major facilitator transporter  31.71 
 
 
472 aa  224  3e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3101  major facilitator transporter  31.71 
 
 
472 aa  224  3e-57  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.380275  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5266  major facilitator transporter  31.71 
 
 
472 aa  224  3e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1412  major facilitator transporter  32.76 
 
 
465 aa  222  9.999999999999999e-57  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6205  major facilitator superfamily MFS_1  31.78 
 
 
471 aa  219  1e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2304  major facilitator transporter  31.43 
 
 
472 aa  218  2e-55  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.759044  normal  0.046264 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4090  major facilitator superfamily metabolite(sugar)/H(+) symporter  32.24 
 
 
471 aa  216  7e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.94274  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3530  major facilitator transporter  33.62 
 
 
469 aa  216  7e-55  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.229516  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0463  major facilitator transporter  33.11 
 
 
448 aa  211  2e-53  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0213055  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1717  major facilitator transporter  32.97 
 
 
488 aa  211  3e-53  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0285  major facilitator superfamily sugar transporter  31.76 
 
 
464 aa  211  3e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.192742  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0881  major facilitator superfamily MFS_1  32.29 
 
 
448 aa  207  2e-52  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.202747  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0668  major facilitator transporter  34.87 
 
 
474 aa  205  1e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00169534  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0667  major facilitator family transporter  31.83 
 
 
494 aa  203  6e-51  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0482021  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00188  MFS transporter  33.04 
 
 
471 aa  203  7e-51  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.103216  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1269  major facilitator transporter  31.28 
 
 
466 aa  194  2e-48  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2576  major facilitator transporter  29.93 
 
 
475 aa  191  2e-47  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.634768  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3358  major facilitator superfamily MFS_1  29.42 
 
 
459 aa  188  2e-46  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5172  major facilitator superfamily MFS_1  31.53 
 
 
466 aa  181  2.9999999999999997e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1718  major facilitator transporter  29.02 
 
 
473 aa  170  6e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.442738  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6268  major facilitator transporter  30.16 
 
 
462 aa  168  2e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.492492 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5972  major facilitator transporter  30.16 
 
 
462 aa  167  4e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0896  major facilitator superfamily MFS_1  32.61 
 
 
462 aa  167  5.9999999999999996e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0528  major facilitator transporter  29.57 
 
 
467 aa  164  5.0000000000000005e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0826405  hitchhiker  0.00770286 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4876  major facilitator transporter  33.49 
 
 
465 aa  164  5.0000000000000005e-39  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.116768 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1660  MFS family transporter  30.19 
 
 
455 aa  162  2e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0987  major facilitator superfamily transporter metabolite/H(+) symporter  29.04 
 
 
461 aa  162  2e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.496425 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5109  major facilitator transporter  30.89 
 
 
474 aa  159  8e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1326  major facilitator transporter  32.53 
 
 
464 aa  159  9e-38  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.367254  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5172  major facilitator transporter  30.43 
 
 
474 aa  157  3e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0809503 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3259  major facilitator transporter  30.66 
 
 
474 aa  157  5.0000000000000005e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.331503  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19270  putative MFS transporter  29.61 
 
 
455 aa  156  6e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.149627  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0190  major facilitator superfamily MFS_1  28.24 
 
 
460 aa  156  7e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000521499 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0177  major facilitator family transporter  29.8 
 
 
478 aa  155  2e-36  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0911  major facilitator family transporter  29.8 
 
 
478 aa  155  2e-36  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.577596  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4638  major facilitator superfamily MFS_1  24.89 
 
 
451 aa  155  2e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000178504  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0379  major facilitator family transporter  29.8 
 
 
478 aa  155  2e-36  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0539  major facilitator transporter  30.43 
 
 
473 aa  155  2e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1431  major facilitator family transporter  29.8 
 
 
478 aa  155  2e-36  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.475934  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1931  major facilitator superfamily permease  29.8 
 
 
478 aa  155  2e-36  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0979116  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2413  major facilitator transporter  28.98 
 
 
447 aa  155  2e-36  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000787137  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0471  major facilitator family transporter  29.8 
 
 
478 aa  155  2e-36  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1841  major facilitator family transporter  29.8 
 
 
478 aa  154  2e-36  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0443  major facilitator superfamily MFS_1  28.82 
 
 
461 aa  155  2e-36  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4019  major facilitator superfamily MFS_1  35.03 
 
 
435 aa  154  2.9999999999999998e-36  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.000381325  normal  0.201783 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1937  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  27.99 
 
 
474 aa  154  2.9999999999999998e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000000000973666  normal  0.0403058 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1898  major facilitator superfamily MFS_1  27.56 
 
 
448 aa  154  2.9999999999999998e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0970  major facilitator superfamily transporter metabolite/H(+) symporter  29.42 
 
 
470 aa  154  4e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00262609  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29790  sugar phosphate permease  30.11 
 
 
485 aa  153  8e-36  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5178  major facilitator transporter  28.57 
 
 
457 aa  152  1e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3311  major facilitator transporter  29.36 
 
 
474 aa  152  1e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.799238  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5934  major facilitator transporter  31.96 
 
 
468 aa  151  2e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0786793 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0670  general substrate transporter  30.55 
 
 
459 aa  151  3e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.753041 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2255  major facilitator superfamily MFS_1  30.93 
 
 
473 aa  150  5e-35  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8056  major facilitator superfamily MFS_1  27.97 
 
 
451 aa  150  5e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0897  major facilitator superfamily MFS_1  32.39 
 
 
447 aa  150  6e-35  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0894914  normal  0.147269 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0967  major facilitator superfamily aromatic acid/H(+) symporter  27.64 
 
 
462 aa  150  6e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3533  major facilitator transporter  30.55 
 
 
473 aa  147  5e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS02027  metabolite transporter  29.25 
 
 
476 aa  147  6e-34  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.158134 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6599  major facilitator superfamily MFS_1  28.73 
 
 
459 aa  146  7.0000000000000006e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.332731  normal  0.158495 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5167  major facilitator superfamily MFS_1  29.89 
 
 
470 aa  145  1e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1414  major facilitator superfamily MFS_1  26.36 
 
 
444 aa  145  2e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0129  putative permease  26.89 
 
 
459 aa  144  3e-33  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.549779  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1523  major facilitator transporter  27.72 
 
 
438 aa  144  4e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.295641  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>