More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic_2063 on replicon NC_010682
Organism: Ralstonia pickettii 12J



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010557  BamMC406_5986  major facilitator transporter  76.83 
 
 
479 aa  744    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6959  major facilitator transporter  73.07 
 
 
479 aa  667    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2063  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 
479 aa  962    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0432509  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6611  major facilitator transporter  79.54 
 
 
479 aa  757    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.410873  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6282  major facilitator transporter  76.62 
 
 
479 aa  741    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.384913  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4015  major facilitator superfamily MFS_1  56.95 
 
 
477 aa  535  1e-151  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0920  major facilitator superfamily transporter metabolite/H(+) symporter  55.48 
 
 
487 aa  501  1e-140  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.697574 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4647  major facilitator superfamily MFS_1  55.04 
 
 
488 aa  499  1e-140  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.866665  normal  0.46173 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6200  major facilitator transporter  53.64 
 
 
492 aa  493  9.999999999999999e-139  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0622411 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3453  major facilitator transporter  53.16 
 
 
472 aa  487  1e-136  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0499831  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5266  major facilitator transporter  52.95 
 
 
472 aa  488  1e-136  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5153  major facilitator transporter  54.17 
 
 
475 aa  486  1e-136  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.507557  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5007  major facilitator transporter  52.95 
 
 
472 aa  488  1e-136  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3101  major facilitator transporter  52.95 
 
 
472 aa  488  1e-136  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.380275  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0382  major facilitator transporter  52.32 
 
 
472 aa  483  1e-135  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.660441 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4627  major facilitator transporter  53.95 
 
 
475 aa  483  1e-135  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0808  major facilitator superfamily MFS_1  54.32 
 
 
494 aa  476  1e-133  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0910  major facilitator family transporter  52.74 
 
 
472 aa  476  1e-133  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.367874  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0788  major facilitator family transporter  51.48 
 
 
472 aa  465  9.999999999999999e-131  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.509193  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0555  major facilitator family transporter  51.48 
 
 
472 aa  465  9.999999999999999e-131  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0486  major facilitator family transporter  51.48 
 
 
472 aa  466  9.999999999999999e-131  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0312823  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2070  major facilitator transporter  51.69 
 
 
472 aa  467  9.999999999999999e-131  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.376866  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1973  major facilitator transporter  51.48 
 
 
472 aa  465  9.999999999999999e-131  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4090  major facilitator superfamily metabolite(sugar)/H(+) symporter  49.12 
 
 
471 aa  454  1.0000000000000001e-126  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.94274  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3530  major facilitator transporter  50.54 
 
 
469 aa  451  1e-125  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.229516  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6205  major facilitator superfamily MFS_1  47.65 
 
 
471 aa  450  1e-125  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4340  general substrate transporter  46.76 
 
 
477 aa  447  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2496  major facilitator family transporter  45.63 
 
 
472 aa  429  1e-119  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.206768  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2304  major facilitator transporter  45.45 
 
 
472 aa  427  1e-118  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.759044  normal  0.046264 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1412  major facilitator transporter  49.14 
 
 
465 aa  419  1e-116  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0667  major facilitator family transporter  51.94 
 
 
494 aa  411  1e-113  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0482021  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1268  MFS transporter  47.41 
 
 
487 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.916286  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1717  major facilitator transporter  47.28 
 
 
488 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2231  major facilitator family transporter  47.62 
 
 
482 aa  408  1.0000000000000001e-112  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3036  major facilitator transporter  47.41 
 
 
487 aa  406  1.0000000000000001e-112  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3193  major facilitator transporter  43.64 
 
 
472 aa  405  1e-111  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.9008 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1759  major facilitator superfamily MFS_1  42.35 
 
 
472 aa  389  1e-107  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00188  MFS transporter  44.7 
 
 
471 aa  375  1e-102  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.103216  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1718  major facilitator transporter  40.81 
 
 
473 aa  342  7e-93  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.442738  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1269  major facilitator transporter  39.09 
 
 
466 aa  333  4e-90  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2576  major facilitator transporter  38.82 
 
 
475 aa  322  6e-87  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.634768  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0792  major facilitator superfamily MFS_1  34 
 
 
458 aa  284  2.0000000000000002e-75  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.753449  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1483  major facilitator superfamily MFS_1  34.65 
 
 
456 aa  258  1e-67  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0463  major facilitator transporter  34.57 
 
 
448 aa  245  9.999999999999999e-64  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0213055  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0881  major facilitator superfamily MFS_1  33.04 
 
 
448 aa  243  6e-63  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.202747  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1626  major facilitator transporter  33.91 
 
 
485 aa  240  2.9999999999999997e-62  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.408436  normal  0.668079 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1551  major facilitator transporter  33.04 
 
 
485 aa  240  2.9999999999999997e-62  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.308182  normal  0.0914413 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4860  major facilitator transporter  33.26 
 
 
487 aa  239  9e-62  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0839463 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1217  major facilitator transporter  33.04 
 
 
487 aa  238  2e-61  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.207678  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1696  major facilitator transporter  33.04 
 
 
487 aa  238  2e-61  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.4496  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1604  major facilitator transporter  33.91 
 
 
485 aa  237  3e-61  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1668  major facilitator transporter  32.82 
 
 
487 aa  235  1.0000000000000001e-60  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.339414  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0285  major facilitator superfamily sugar transporter  32.3 
 
 
464 aa  226  6e-58  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.192742  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5972  major facilitator transporter  32.67 
 
 
462 aa  226  1e-57  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6268  major facilitator transporter  31.64 
 
 
462 aa  220  3e-56  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.492492 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0967  major facilitator superfamily aromatic acid/H(+) symporter  32.01 
 
 
462 aa  219  7e-56  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0528  major facilitator transporter  32.77 
 
 
467 aa  218  2e-55  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0826405  hitchhiker  0.00770286 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0828  major facilitator superfamily aromatic acid/H(+) symporter  31.73 
 
 
450 aa  215  9.999999999999999e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.420618  normal  0.255495 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4638  major facilitator superfamily MFS_1  32.31 
 
 
451 aa  214  2.9999999999999995e-54  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000178504  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6599  major facilitator superfamily MFS_1  29.27 
 
 
459 aa  207  4e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.332731  normal  0.158495 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0270  major facilitator transporter  32.54 
 
 
477 aa  203  4e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0250869  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5172  major facilitator superfamily MFS_1  31.73 
 
 
466 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0613  major facilitator superfamily MFS_1  28.76 
 
 
473 aa  201  3e-50  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0274336 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4087  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  28.97 
 
 
468 aa  199  7e-50  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.281632  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0974  major facilitator superfamily aromatic acid/H(+) symporter  31.47 
 
 
462 aa  199  9e-50  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00000109951  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0668  major facilitator transporter  33.65 
 
 
474 aa  197  3e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00169534  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0190  major facilitator superfamily MFS_1  30.77 
 
 
460 aa  195  1e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000521499 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1937  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  31.12 
 
 
474 aa  195  2e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000000000973666  normal  0.0403058 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0970  major facilitator superfamily transporter metabolite/H(+) symporter  30.22 
 
 
470 aa  194  3e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00262609  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5934  major facilitator transporter  31.53 
 
 
468 aa  193  4e-48  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0786793 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3358  major facilitator superfamily MFS_1  30.11 
 
 
459 aa  192  1e-47  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5178  major facilitator transporter  31.51 
 
 
457 aa  190  5e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0987  major facilitator superfamily transporter metabolite/H(+) symporter  29.78 
 
 
461 aa  189  7e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.496425 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5167  major facilitator superfamily MFS_1  30.39 
 
 
470 aa  189  1e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19270  putative MFS transporter  31.28 
 
 
455 aa  187  3e-46  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.149627  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1660  MFS family transporter  31.26 
 
 
455 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0670  general substrate transporter  31.97 
 
 
459 aa  182  1e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.753041 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0896  major facilitator superfamily MFS_1  31.52 
 
 
462 aa  181  2.9999999999999997e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1595  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  31.19 
 
 
472 aa  176  9.999999999999999e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5053  major facilitator superfamily MFS_1  30.69 
 
 
472 aa  174  2.9999999999999996e-42  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.122247 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0129  putative permease  29.57 
 
 
459 aa  172  1e-41  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.549779  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02027  metabolite transporter  32.27 
 
 
476 aa  171  2e-41  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.158134 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3311  major facilitator transporter  31.7 
 
 
474 aa  171  2e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.799238  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5172  major facilitator transporter  31.19 
 
 
474 aa  171  3e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0809503 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3533  major facilitator transporter  31.46 
 
 
473 aa  171  3e-41  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5109  major facilitator transporter  31.11 
 
 
474 aa  171  3e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8056  major facilitator superfamily MFS_1  30.84 
 
 
451 aa  169  8e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3259  major facilitator transporter  31.11 
 
 
474 aa  169  8e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.331503  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1993  major facilitator family transporter  28.87 
 
 
452 aa  169  1e-40  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.863885  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1873  major facilitator superfamily MFS_1  28.87 
 
 
452 aa  168  2e-40  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0070319  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1422  major facilitator family transporter  28.99 
 
 
452 aa  167  2.9999999999999998e-40  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.452173  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0539  major facilitator transporter  30.69 
 
 
473 aa  166  8e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0443  major facilitator superfamily MFS_1  27.43 
 
 
461 aa  166  9e-40  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01738  predicted transporter  28.66 
 
 
452 aa  166  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.375088  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01726  hypothetical protein  28.66 
 
 
452 aa  166  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.448165  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0602  major facilitator superfamily MFS_1  28.27 
 
 
459 aa  165  2.0000000000000002e-39  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1853  major facilitator family transporter  28.45 
 
 
452 aa  165  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0220731  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1414  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  28.73 
 
 
468 aa  164  3e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000198546  normal  0.095851 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5283  major facilitator transporter  28.48 
 
 
463 aa  164  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.591426  normal  0.763827 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1863  major facilitator transporter  28.48 
 
 
452 aa  164  5.0000000000000005e-39  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.369973  hitchhiker  0.0000261137 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>