More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_0528 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_0528  major facilitator transporter  100 
 
 		 467 aa  905    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0826405  hitchhiker  0.00770286 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5934  major facilitator transporter  83.11 
 
 		 468 aa  649    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0786793 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5172  major facilitator superfamily MFS_1  72.32 
 
 		 466 aa  612  9.999999999999999e-175  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6599  major facilitator superfamily MFS_1  51.58 
 
 		 459 aa  431  1e-119  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.332731  normal  0.158495 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0613  major facilitator superfamily MFS_1  50.57 
 
 		 473 aa  427  1e-118  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0274336 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4087  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  49.56 
 
 		 468 aa  424  1e-117  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.281632  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5972  major facilitator transporter  51.58 
 
 		 462 aa  422  1e-117  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6268  major facilitator transporter  50.76 
 
 		 462 aa  419  1e-116  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.492492 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5167  major facilitator superfamily MFS_1  49.55 
 
 		 470 aa  405  1.0000000000000001e-112  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0828  major facilitator superfamily aromatic acid/H(+) symporter  48 
 
 		 450 aa  406  1.0000000000000001e-112  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.420618  normal  0.255495 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0987  major facilitator superfamily transporter metabolite/H(+) symporter  47.27 
 
 		 461 aa  396  1e-109  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.496425 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0970  major facilitator superfamily transporter metabolite/H(+) symporter  46.58 
 
 		 470 aa  389  1e-107  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00262609  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1937  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  46.22 
 
 		 474 aa  391  1e-107  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000000000973666  normal  0.0403058 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0974  major facilitator superfamily aromatic acid/H(+) symporter  47.83 
 
 		 462 aa  387  1e-106  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00000109951  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0190  major facilitator superfamily MFS_1  44.59 
 
 		 460 aa  379  1e-104  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000521499 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0896  major facilitator superfamily MFS_1  47.31 
 
 		 462 aa  370  1e-101  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0270  major facilitator transporter  47.94 
 
 		 477 aa  365  1e-100  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0250869  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0967  major facilitator superfamily aromatic acid/H(+) symporter  44.32 
 
 		 462 aa  365  1e-99  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6853  major facilitator transporter  42.52 
 
 		 430 aa  328  1.0000000000000001e-88  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.854567  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0129  putative permease  36.78 
 
 		 459 aa  278  1e-73  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.549779  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1422  major facilitator family transporter  38.03 
 
 		 452 aa  276  6e-73  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.452173  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1873  major facilitator superfamily MFS_1  38.53 
 
 		 452 aa  273  3e-72  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0070319  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1993  major facilitator family transporter  38.53 
 
 		 452 aa  273  4.0000000000000004e-72  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.863885  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01738  predicted transporter  38.53 
 
 		 452 aa  271  1e-71  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.375088  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01726  hypothetical protein  38.53 
 
 		 452 aa  271  1e-71  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.448165  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1863  major facilitator transporter  37.81 
 
 		 452 aa  271  2.9999999999999997e-71  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.369973  hitchhiker  0.0000261137 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1853  major facilitator family transporter  38.08 
 
 		 452 aa  270  5.9999999999999995e-71  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0220731  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2028  major facilitator superfamily permease  37.78 
 
 		 428 aa  265  8.999999999999999e-70  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2054  inner membrane metabolite transport protein YdjE  36.77 
 
 		 452 aa  262  8.999999999999999e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0842085 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6200  major facilitator transporter  33.12 
 
 		 492 aa  251  2e-65  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0622411 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3220  major facilitator superfamily MFS_1  33.18 
 
 		 463 aa  248  2e-64  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0542188  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5007  major facilitator transporter  34.49 
 
 		 472 aa  246  6.999999999999999e-64  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3101  major facilitator transporter  34.49 
 
 		 472 aa  246  6.999999999999999e-64  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.380275  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5266  major facilitator transporter  34.49 
 
 		 472 aa  246  6.999999999999999e-64  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3453  major facilitator transporter  34.43 
 
 		 472 aa  245  9.999999999999999e-64  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0499831  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0382  major facilitator transporter  34.19 
 
 		 472 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.660441 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2490  inner membrane metabolite transport protein YdjE  37.8 
 
 		 416 aa  244  3e-63  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.754275 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4627  major facilitator transporter  34.35 
 
 		 475 aa  244  3e-63  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5153  major facilitator transporter  34.13 
 
 		 475 aa  243  5e-63  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.507557  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0920  major facilitator superfamily transporter metabolite/H(+) symporter  35.59 
 
 		 487 aa  241  2e-62  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.697574 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0792  major facilitator superfamily MFS_1  34.14 
 
 		 458 aa  236  5.0000000000000005e-61  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.753449  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2063  major facilitator superfamily MFS_1  34.07 
 
 		 479 aa  235  1.0000000000000001e-60  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0432509  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0285  major facilitator superfamily sugar transporter  33.64 
 
 		 464 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.192742  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4647  major facilitator superfamily MFS_1  34.2 
 
 		 488 aa  233  4.0000000000000004e-60  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.866665  normal  0.46173 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5986  major facilitator transporter  32.17 
 
 		 479 aa  232  9e-60  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6282  major facilitator transporter  32.17 
 
 		 479 aa  232  1e-59  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.384913  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0910  major facilitator family transporter  34.7 
 
 		 472 aa  231  2e-59  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.367874  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1999  major facilitator family transporter  33.11 
 
 		 459 aa  230  3e-59  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0702699  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1857  major facilitator transporter  33.11 
 
 		 459 aa  230  3e-59  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.526363  hitchhiker  0.0000247936 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1860  major facilitator family transporter  33.11 
 
 		 459 aa  229  6e-59  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0174535  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2060  inner membrane metabolite transport protein YdjE  32.89 
 
 		 459 aa  228  2e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0010058 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1660  MFS family transporter  33.85 
 
 		 455 aa  226  5.0000000000000005e-58  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4638  major facilitator superfamily MFS_1  32.35 
 
 		 451 aa  226  8e-58  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000178504  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19270  putative MFS transporter  33.77 
 
 		 455 aa  224  3e-57  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.149627  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2499  major facilitator family transporter  34.04 
 
 		 459 aa  223  4e-57  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.465931  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1416  major facilitator family transporter  34.04 
 
 		 459 aa  223  4.9999999999999996e-57  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.888006  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1867  major facilitator superfamily MFS_1  34.04 
 
 		 459 aa  223  6e-57  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000517052  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2070  major facilitator transporter  35.05 
 
 		 472 aa  223  7e-57  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.376866  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0788  major facilitator family transporter  34.84 
 
 		 472 aa  222  9.999999999999999e-57  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.509193  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2413  major facilitator transporter  34.91 
 
 		 447 aa  222  9.999999999999999e-57  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000787137  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1973  major facilitator transporter  34.84 
 
 		 472 aa  222  9.999999999999999e-57  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0555  major facilitator family transporter  34.84 
 
 		 472 aa  222  9.999999999999999e-57  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0486  major facilitator family transporter  34.84 
 
 		 472 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0312823  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0808  major facilitator superfamily MFS_1  32.96 
 
 		 494 aa  221  3e-56  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01744  predicted transporter  33.8 
 
 		 459 aa  220  3.9999999999999997e-56  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.955946  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01732  hypothetical protein  33.8 
 
 		 459 aa  220  3.9999999999999997e-56  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6611  major facilitator transporter  32.45 
 
 		 479 aa  220  5e-56  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.410873  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4015  major facilitator superfamily MFS_1  31.15 
 
 		 477 aa  217  4e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1483  major facilitator superfamily MFS_1  32.4 
 
 		 456 aa  216  5e-55  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3530  major facilitator transporter  35.04 
 
 		 469 aa  214  2.9999999999999995e-54  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.229516  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1595  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  33.62 
 
 		 472 aa  212  1e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5053  major facilitator superfamily MFS_1  33.4 
 
 		 472 aa  212  1e-53  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.122247 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5109  major facilitator transporter  33.78 
 
 		 474 aa  210  4e-53  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2496  major facilitator family transporter  30.87 
 
 		 472 aa  210  5e-53  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.206768  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6959  major facilitator transporter  32.05 
 
 		 479 aa  208  2e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3259  major facilitator transporter  33.78 
 
 		 474 aa  208  2e-52  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.331503  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4340  general substrate transporter  29.58 
 
 		 477 aa  207  3e-52  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2231  major facilitator family transporter  31.3 
 
 		 482 aa  207  3e-52  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5172  major facilitator transporter  33.63 
 
 		 474 aa  207  3e-52  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0809503 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0670  general substrate transporter  32.89 
 
 		 459 aa  207  4e-52  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.753041 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0379  major facilitator family transporter  33.86 
 
 		 478 aa  206  5e-52  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4651  major facilitator superfamily MFS_1  33.04 
 
 		 470 aa  206  6e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3533  major facilitator transporter  34.44 
 
 		 473 aa  206  6e-52  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2304  major facilitator transporter  30.3 
 
 		 472 aa  206  9e-52  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.759044  normal  0.046264 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8056  major facilitator superfamily MFS_1  33.18 
 
 		 451 aa  205  1e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1841  major facilitator family transporter  33.63 
 
 		 478 aa  204  2e-51  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1268  MFS transporter  31.97 
 
 		 487 aa  205  2e-51  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.916286  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3036  major facilitator transporter  31.67 
 
 		 487 aa  204  2e-51  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1414  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  30.95 
 
 		 468 aa  205  2e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000198546  normal  0.095851 
 
 
-
 
NC_003296  RS02027  metabolite transporter  33.41 
 
 		 476 aa  204  3e-51  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.158134 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1931  major facilitator superfamily permease  33.63 
 
 		 478 aa  204  3e-51  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0979116  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0177  major facilitator family transporter  33.63 
 
 		 478 aa  204  3e-51  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0471  major facilitator family transporter  33.63 
 
 		 478 aa  204  3e-51  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1431  major facilitator family transporter  33.63 
 
 		 478 aa  204  3e-51  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.475934  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0911  major facilitator family transporter  33.63 
 
 		 478 aa  203  5e-51  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.577596  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6205  major facilitator superfamily MFS_1  29.81 
 
 		 471 aa  202  8e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4090  major facilitator superfamily metabolite(sugar)/H(+) symporter  29.7 
 
 		 471 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.94274  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0539  major facilitator transporter  33.18 
 
 		 473 aa  199  6e-50  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0667  major facilitator family transporter  37.59 
 
 		 494 aa  199  7.999999999999999e-50  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0482021  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5178  major facilitator transporter  30.87 
 
 		 457 aa  198  1.0000000000000001e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>