More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeD_A2054 on replicon NC_011205
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009800  EcHS_A1853  major facilitator family transporter  82.3 
 
 
452 aa  748    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0220731  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01738  predicted transporter  82.74 
 
 
452 aa  751    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.375088  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1873  major facilitator superfamily MFS_1  82.74 
 
 
452 aa  751    Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0070319  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2054  inner membrane metabolite transport protein YdjE  100 
 
 
452 aa  902    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.0842085 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1863  major facilitator transporter  82.52 
 
 
452 aa  749    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.369973  hitchhiker  0.0000261137 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1422  major facilitator family transporter  82.74 
 
 
452 aa  753    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.452173  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01726  hypothetical protein  82.74 
 
 
452 aa  751    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.448165  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1993  major facilitator family transporter  82.52 
 
 
452 aa  749    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.863885  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2490  inner membrane metabolite transport protein YdjE  82.45 
 
 
416 aa  688    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.754275 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2060  inner membrane metabolite transport protein YdjE  44.89 
 
 
459 aa  376  1e-103  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0010058 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3220  major facilitator superfamily MFS_1  44.64 
 
 
463 aa  372  1e-102  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0542188  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1860  major facilitator family transporter  44.69 
 
 
459 aa  369  1e-101  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0174535  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1857  major facilitator transporter  44.25 
 
 
459 aa  370  1e-101  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.526363  hitchhiker  0.0000247936 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1999  major facilitator family transporter  44.25 
 
 
459 aa  370  1e-101  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0702699  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1416  major facilitator family transporter  44.25 
 
 
459 aa  362  7.0000000000000005e-99  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.888006  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1867  major facilitator superfamily MFS_1  44.25 
 
 
459 aa  362  9e-99  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000517052  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01744  predicted transporter  44.25 
 
 
459 aa  361  1e-98  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.955946  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01732  hypothetical protein  44.25 
 
 
459 aa  361  1e-98  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2499  major facilitator family transporter  44.03 
 
 
459 aa  359  4e-98  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.465931  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0613  major facilitator superfamily MFS_1  40.45 
 
 
473 aa  306  5.0000000000000004e-82  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0274336 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4087  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  39.15 
 
 
468 aa  298  1e-79  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.281632  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0970  major facilitator superfamily transporter metabolite/H(+) symporter  38.22 
 
 
470 aa  284  2.0000000000000002e-75  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00262609  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6599  major facilitator superfamily MFS_1  36.65 
 
 
459 aa  281  2e-74  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.332731  normal  0.158495 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0987  major facilitator superfamily transporter metabolite/H(+) symporter  36.1 
 
 
461 aa  278  1e-73  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.496425 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5167  major facilitator superfamily MFS_1  38.46 
 
 
470 aa  276  6e-73  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5972  major facilitator transporter  34.96 
 
 
462 aa  265  8.999999999999999e-70  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6268  major facilitator transporter  34.96 
 
 
462 aa  264  2e-69  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.492492 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0967  major facilitator superfamily aromatic acid/H(+) symporter  35.98 
 
 
462 aa  263  3e-69  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0974  major facilitator superfamily aromatic acid/H(+) symporter  36.95 
 
 
462 aa  264  3e-69  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00000109951  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0190  major facilitator superfamily MFS_1  34.73 
 
 
460 aa  261  2e-68  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000521499 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5172  major facilitator superfamily MFS_1  37.78 
 
 
466 aa  257  3e-67  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1937  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  36.08 
 
 
474 aa  254  3e-66  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000000000973666  normal  0.0403058 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0270  major facilitator transporter  36.3 
 
 
477 aa  253  7e-66  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0250869  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0828  major facilitator superfamily aromatic acid/H(+) symporter  33.18 
 
 
450 aa  249  9e-65  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.420618  normal  0.255495 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0528  major facilitator transporter  35.87 
 
 
467 aa  242  1e-62  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0826405  hitchhiker  0.00770286 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2028  major facilitator superfamily permease  31.69 
 
 
428 aa  227  3e-58  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0896  major facilitator superfamily MFS_1  33.41 
 
 
462 aa  226  8e-58  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0129  putative permease  34.39 
 
 
459 aa  223  7e-57  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.549779  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5934  major facilitator transporter  35.49 
 
 
468 aa  214  1.9999999999999998e-54  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0786793 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6853  major facilitator transporter  32.92 
 
 
430 aa  212  1e-53  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.854567  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0285  major facilitator superfamily sugar transporter  28.85 
 
 
464 aa  184  3e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.192742  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4638  major facilitator superfamily MFS_1  29.58 
 
 
451 aa  167  2.9999999999999998e-40  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000178504  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4647  major facilitator superfamily MFS_1  29.06 
 
 
488 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.866665  normal  0.46173 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3453  major facilitator transporter  29.45 
 
 
472 aa  164  3e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0499831  normal 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8056  major facilitator superfamily MFS_1  29.05 
 
 
451 aa  164  4.0000000000000004e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0910  major facilitator family transporter  28.76 
 
 
472 aa  164  4.0000000000000004e-39  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.367874  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1412  major facilitator transporter  29.88 
 
 
465 aa  163  5.0000000000000005e-39  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1973  major facilitator transporter  28.42 
 
 
472 aa  162  8.000000000000001e-39  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0788  major facilitator family transporter  28.42 
 
 
472 aa  162  8.000000000000001e-39  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.509193  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0555  major facilitator family transporter  28.42 
 
 
472 aa  162  8.000000000000001e-39  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0486  major facilitator family transporter  28.42 
 
 
472 aa  162  8.000000000000001e-39  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0312823  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2413  major facilitator transporter  28.26 
 
 
447 aa  162  1e-38  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000787137  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2070  major facilitator transporter  28.42 
 
 
472 aa  162  1e-38  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.376866  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1660  MFS family transporter  29.87 
 
 
455 aa  159  9e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6200  major facilitator transporter  29.03 
 
 
492 aa  159  1e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0622411 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0382  major facilitator transporter  29.18 
 
 
472 aa  159  1e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.660441 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0920  major facilitator superfamily transporter metabolite/H(+) symporter  29 
 
 
487 aa  159  1e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.697574 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19270  putative MFS transporter  29.44 
 
 
455 aa  159  1e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.149627  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0808  major facilitator superfamily MFS_1  30.49 
 
 
494 aa  157  3e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5007  major facilitator transporter  28.54 
 
 
472 aa  157  3e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3101  major facilitator transporter  28.54 
 
 
472 aa  157  3e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.380275  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5153  major facilitator transporter  28.39 
 
 
475 aa  157  3e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.507557  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5266  major facilitator transporter  28.54 
 
 
472 aa  157  3e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4627  major facilitator transporter  28.39 
 
 
475 aa  157  3e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3358  major facilitator superfamily MFS_1  29.12 
 
 
459 aa  157  5.0000000000000005e-37  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5178  major facilitator transporter  27.53 
 
 
457 aa  152  1e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6282  major facilitator transporter  27.9 
 
 
479 aa  151  2e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.384913  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5109  major facilitator transporter  29.49 
 
 
474 aa  151  2e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5986  major facilitator transporter  27.68 
 
 
479 aa  151  2e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5172  major facilitator transporter  29.62 
 
 
474 aa  151  3e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0809503 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3259  major facilitator transporter  29.49 
 
 
474 aa  150  5e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.331503  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1523  major facilitator transporter  30.75 
 
 
438 aa  148  2.0000000000000003e-34  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.295641  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1414  major facilitator superfamily MFS_1  27.58 
 
 
444 aa  148  2.0000000000000003e-34  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2231  major facilitator family transporter  26.3 
 
 
482 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1595  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  29.41 
 
 
472 aa  146  6e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2063  major facilitator superfamily MFS_1  27.9 
 
 
479 aa  146  7.0000000000000006e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0432509  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0539  major facilitator transporter  28.86 
 
 
473 aa  146  9e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1431  major facilitator family transporter  28.12 
 
 
478 aa  145  1e-33  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.475934  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0471  major facilitator family transporter  28.12 
 
 
478 aa  145  1e-33  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1931  major facilitator superfamily permease  28.12 
 
 
478 aa  145  1e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0979116  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0177  major facilitator family transporter  28.12 
 
 
478 aa  145  1e-33  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1483  major facilitator superfamily MFS_1  29.27 
 
 
456 aa  145  1e-33  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5053  major facilitator superfamily MFS_1  29.82 
 
 
472 aa  145  1e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.122247 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0911  major facilitator family transporter  28.12 
 
 
478 aa  144  2e-33  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.577596  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0379  major facilitator family transporter  28.12 
 
 
478 aa  144  3e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1841  major facilitator family transporter  27.9 
 
 
478 aa  144  3e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3533  major facilitator transporter  29.84 
 
 
473 aa  144  3e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0792  major facilitator superfamily MFS_1  26.71 
 
 
458 aa  144  4e-33  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.753449  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1414  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  27.15 
 
 
468 aa  143  7e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000198546  normal  0.095851 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3311  major facilitator transporter  27.68 
 
 
474 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.799238  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3530  major facilitator transporter  30.69 
 
 
469 aa  142  9.999999999999999e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.229516  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3036  major facilitator transporter  26.25 
 
 
487 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4090  major facilitator superfamily metabolite(sugar)/H(+) symporter  26.39 
 
 
471 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.94274  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1268  MFS transporter  26.03 
 
 
487 aa  142  1.9999999999999998e-32  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.916286  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4015  major facilitator superfamily MFS_1  25 
 
 
477 aa  140  7e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1269  major facilitator transporter  28.48 
 
 
466 aa  139  7e-32  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6205  major facilitator superfamily MFS_1  26.13 
 
 
471 aa  139  7.999999999999999e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1482  major facilitator superfamily MFS_1  27.35 
 
 
451 aa  137  5e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000115751  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2073  major facilitator superfamily transporter  29.2 
 
 
467 aa  135  9.999999999999999e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0013865 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1717  major facilitator transporter  26.26 
 
 
488 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>