More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_1412 on replicon NC_009484
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009484  Acry_1412  major facilitator transporter  100 
 
 
465 aa  910    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4015  major facilitator superfamily MFS_1  49.78 
 
 
477 aa  460  9.999999999999999e-129  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0910  major facilitator family transporter  51.19 
 
 
472 aa  445  1.0000000000000001e-124  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.367874  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0788  major facilitator family transporter  50.54 
 
 
472 aa  443  1e-123  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.509193  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0486  major facilitator family transporter  50.76 
 
 
472 aa  444  1e-123  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0312823  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0555  major facilitator family transporter  50.54 
 
 
472 aa  443  1e-123  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1973  major facilitator transporter  50.54 
 
 
472 aa  443  1e-123  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2070  major facilitator transporter  50.76 
 
 
472 aa  443  1e-123  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.376866  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3453  major facilitator transporter  49.68 
 
 
472 aa  441  9.999999999999999e-123  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0499831  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6200  major facilitator transporter  50.54 
 
 
492 aa  441  9.999999999999999e-123  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0622411 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5153  major facilitator transporter  50.65 
 
 
475 aa  437  1e-121  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.507557  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0382  major facilitator transporter  49.67 
 
 
472 aa  436  1e-121  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.660441 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4647  major facilitator superfamily MFS_1  50 
 
 
488 aa  436  1e-121  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.866665  normal  0.46173 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4627  major facilitator transporter  50.43 
 
 
475 aa  436  1e-121  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5007  major facilitator transporter  49.03 
 
 
472 aa  434  1e-120  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5266  major facilitator transporter  49.03 
 
 
472 aa  434  1e-120  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3101  major facilitator transporter  49.03 
 
 
472 aa  434  1e-120  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.380275  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0920  major facilitator superfamily transporter metabolite/H(+) symporter  49.35 
 
 
487 aa  426  1e-118  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.697574 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6282  major facilitator transporter  48.59 
 
 
479 aa  422  1e-117  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.384913  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5986  major facilitator transporter  48.37 
 
 
479 aa  420  1e-116  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0808  major facilitator superfamily MFS_1  51.19 
 
 
494 aa  418  9.999999999999999e-116  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2063  major facilitator superfamily MFS_1  49.14 
 
 
479 aa  416  9.999999999999999e-116  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0432509  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3530  major facilitator transporter  50.33 
 
 
469 aa  417  9.999999999999999e-116  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.229516  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4090  major facilitator superfamily metabolite(sugar)/H(+) symporter  46 
 
 
471 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.94274  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6611  major facilitator transporter  47.69 
 
 
479 aa  398  9.999999999999999e-111  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.410873  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2496  major facilitator family transporter  47.51 
 
 
472 aa  395  1e-109  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.206768  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6205  major facilitator superfamily MFS_1  45.36 
 
 
471 aa  393  1e-108  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2304  major facilitator transporter  46.64 
 
 
472 aa  389  1e-107  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.759044  normal  0.046264 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4340  general substrate transporter  45.34 
 
 
477 aa  390  1e-107  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6959  major facilitator transporter  48.49 
 
 
479 aa  383  1e-105  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0667  major facilitator family transporter  50.38 
 
 
494 aa  383  1e-105  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0482021  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1759  major facilitator superfamily MFS_1  43.33 
 
 
472 aa  355  1e-96  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3193  major facilitator transporter  41.48 
 
 
472 aa  351  1e-95  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.9008 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1268  MFS transporter  41.95 
 
 
487 aa  344  2e-93  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.916286  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3036  major facilitator transporter  41.74 
 
 
487 aa  343  5e-93  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1269  major facilitator transporter  41.67 
 
 
466 aa  337  1.9999999999999998e-91  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1717  major facilitator transporter  41.81 
 
 
488 aa  337  1.9999999999999998e-91  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00188  MFS transporter  43.6 
 
 
471 aa  336  5.999999999999999e-91  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.103216  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2231  major facilitator family transporter  40.94 
 
 
482 aa  335  1e-90  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2576  major facilitator transporter  39.79 
 
 
475 aa  313  4.999999999999999e-84  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.634768  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1718  major facilitator transporter  41.15 
 
 
473 aa  299  7e-80  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.442738  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0792  major facilitator superfamily MFS_1  37.04 
 
 
458 aa  261  2e-68  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.753449  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4860  major facilitator transporter  33.69 
 
 
487 aa  228  2e-58  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0839463 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1483  major facilitator superfamily MFS_1  34.77 
 
 
456 aa  225  2e-57  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1668  major facilitator transporter  32.83 
 
 
487 aa  223  4e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.339414  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1626  major facilitator transporter  32.76 
 
 
485 aa  222  9e-57  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.408436  normal  0.668079 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1217  major facilitator transporter  33.05 
 
 
487 aa  222  9.999999999999999e-57  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.207678  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1696  major facilitator transporter  33.05 
 
 
487 aa  222  9.999999999999999e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.4496  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1604  major facilitator transporter  32.69 
 
 
485 aa  219  5e-56  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0463  major facilitator transporter  34.12 
 
 
448 aa  219  8.999999999999998e-56  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0213055  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1551  major facilitator transporter  32.61 
 
 
485 aa  218  2e-55  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.308182  normal  0.0914413 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0881  major facilitator superfamily MFS_1  32.47 
 
 
448 aa  210  4e-53  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.202747  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0285  major facilitator superfamily sugar transporter  33.26 
 
 
464 aa  210  4e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.192742  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0828  major facilitator superfamily aromatic acid/H(+) symporter  33.83 
 
 
450 aa  206  6e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.420618  normal  0.255495 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0668  major facilitator transporter  35.58 
 
 
474 aa  206  7e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00169534  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6599  major facilitator superfamily MFS_1  31.62 
 
 
459 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.332731  normal  0.158495 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0613  major facilitator superfamily MFS_1  33.41 
 
 
473 aa  190  4e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0274336 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5972  major facilitator transporter  32.1 
 
 
462 aa  189  5.999999999999999e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6268  major facilitator transporter  31.81 
 
 
462 aa  189  1e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.492492 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4087  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  32.72 
 
 
468 aa  188  2e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.281632  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0967  major facilitator superfamily aromatic acid/H(+) symporter  31.09 
 
 
462 aa  186  6e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0896  major facilitator superfamily MFS_1  32.86 
 
 
462 aa  181  2.9999999999999997e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8056  major facilitator superfamily MFS_1  31.2 
 
 
451 aa  178  2e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0987  major facilitator superfamily transporter metabolite/H(+) symporter  32.9 
 
 
461 aa  178  2e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.496425 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2413  major facilitator transporter  27.84 
 
 
447 aa  176  9.999999999999999e-43  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000787137  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5167  major facilitator superfamily MFS_1  32.29 
 
 
470 aa  176  9.999999999999999e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1414  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  31.06 
 
 
468 aa  174  2.9999999999999996e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000198546  normal  0.095851 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4638  major facilitator superfamily MFS_1  28.24 
 
 
451 aa  173  6.999999999999999e-42  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000178504  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5178  major facilitator transporter  31.77 
 
 
457 aa  171  2e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0528  major facilitator transporter  29.85 
 
 
467 aa  170  5e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0826405  hitchhiker  0.00770286 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5172  major facilitator transporter  32.19 
 
 
474 aa  170  5e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0809503 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5109  major facilitator transporter  31.94 
 
 
474 aa  169  8e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0970  major facilitator superfamily transporter metabolite/H(+) symporter  30.02 
 
 
470 aa  169  9e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00262609  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0190  major facilitator superfamily MFS_1  31.26 
 
 
460 aa  169  1e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000521499 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1595  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  31.5 
 
 
472 aa  168  2e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0539  major facilitator transporter  32.1 
 
 
473 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3259  major facilitator transporter  31.94 
 
 
474 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.331503  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3311  major facilitator transporter  31.8 
 
 
474 aa  166  6.9999999999999995e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.799238  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1482  major facilitator superfamily MFS_1  27.08 
 
 
451 aa  166  1.0000000000000001e-39  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000115751  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0270  major facilitator transporter  31.7 
 
 
477 aa  166  1.0000000000000001e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0250869  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19270  putative MFS transporter  30.13 
 
 
455 aa  166  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.149627  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3358  major facilitator superfamily MFS_1  30.04 
 
 
459 aa  165  1.0000000000000001e-39  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3220  major facilitator superfamily MFS_1  28.36 
 
 
463 aa  165  2.0000000000000002e-39  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0542188  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5053  major facilitator superfamily MFS_1  30.77 
 
 
472 aa  165  2.0000000000000002e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.122247 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0974  major facilitator superfamily aromatic acid/H(+) symporter  32.3 
 
 
462 aa  164  3e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00000109951  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5172  major facilitator superfamily MFS_1  31 
 
 
466 aa  164  3e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1999  major facilitator family transporter  28.66 
 
 
459 aa  164  4.0000000000000004e-39  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0702699  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1857  major facilitator transporter  28.66 
 
 
459 aa  164  4.0000000000000004e-39  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.526363  hitchhiker  0.0000247936 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2054  inner membrane metabolite transport protein YdjE  29.88 
 
 
452 aa  163  5.0000000000000005e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.0842085 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2088  major facilitator superfamily MFS_1  30.82 
 
 
456 aa  162  1e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.565943 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1860  major facilitator family transporter  28.45 
 
 
459 aa  162  1e-38  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0174535  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2060  inner membrane metabolite transport protein YdjE  28.51 
 
 
459 aa  161  2e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0010058 
 
 
-
 
NC_003296  RS02027  metabolite transporter  31.36 
 
 
476 aa  160  5e-38  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.158134 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3533  major facilitator transporter  31.38 
 
 
473 aa  160  5e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0443  major facilitator superfamily MFS_1  28.18 
 
 
461 aa  160  5e-38  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0602  major facilitator superfamily MFS_1  26.88 
 
 
459 aa  159  1e-37  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5283  major facilitator transporter  27.81 
 
 
463 aa  159  1e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.591426  normal  0.763827 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1937  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  31.39 
 
 
474 aa  159  1e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000000000973666  normal  0.0403058 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1660  MFS family transporter  29.72 
 
 
455 aa  158  2e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1931  major facilitator superfamily permease  30.74 
 
 
478 aa  157  4e-37  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0979116  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>