More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_6599 on replicon NC_010676
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010676  Bphyt_6599  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 
459 aa  909    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.332731  normal  0.158495 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4087  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  73.27 
 
 
468 aa  653    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.281632  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0613  major facilitator superfamily MFS_1  72.47 
 
 
473 aa  661    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0274336 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5972  major facilitator transporter  68.3 
 
 
462 aa  629  1e-179  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6268  major facilitator transporter  68.3 
 
 
462 aa  629  1e-179  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.492492 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0828  major facilitator superfamily aromatic acid/H(+) symporter  55.86 
 
 
450 aa  493  9.999999999999999e-139  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.420618  normal  0.255495 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0970  major facilitator superfamily transporter metabolite/H(+) symporter  46.97 
 
 
470 aa  414  1e-114  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00262609  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5167  major facilitator superfamily MFS_1  48.16 
 
 
470 aa  412  1e-114  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0190  major facilitator superfamily MFS_1  47.2 
 
 
460 aa  411  1e-113  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000521499 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0974  major facilitator superfamily aromatic acid/H(+) symporter  48.75 
 
 
462 aa  406  1.0000000000000001e-112  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00000109951  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1937  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  49.55 
 
 
474 aa  404  1e-111  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000000000973666  normal  0.0403058 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0528  major facilitator transporter  50.9 
 
 
467 aa  400  9.999999999999999e-111  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0826405  hitchhiker  0.00770286 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0987  major facilitator superfamily transporter metabolite/H(+) symporter  47.86 
 
 
461 aa  401  9.999999999999999e-111  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.496425 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0967  major facilitator superfamily aromatic acid/H(+) symporter  44.81 
 
 
462 aa  394  1e-108  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5172  major facilitator superfamily MFS_1  48.22 
 
 
466 aa  387  1e-106  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5934  major facilitator transporter  47.88 
 
 
468 aa  368  1e-101  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0786793 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0270  major facilitator transporter  44.42 
 
 
477 aa  365  1e-100  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0250869  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6853  major facilitator transporter  45.06 
 
 
430 aa  356  5e-97  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.854567  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0896  major facilitator superfamily MFS_1  45.95 
 
 
462 aa  353  2.9999999999999997e-96  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1993  major facilitator family transporter  37.78 
 
 
452 aa  293  5e-78  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.863885  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1873  major facilitator superfamily MFS_1  37.78 
 
 
452 aa  292  1e-77  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0070319  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1422  major facilitator family transporter  37.56 
 
 
452 aa  290  3e-77  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.452173  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01738  predicted transporter  37.56 
 
 
452 aa  290  5.0000000000000004e-77  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.375088  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01726  hypothetical protein  37.56 
 
 
452 aa  290  5.0000000000000004e-77  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.448165  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1853  major facilitator family transporter  37.33 
 
 
452 aa  287  2e-76  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0220731  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1863  major facilitator transporter  37.25 
 
 
452 aa  285  8e-76  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.369973  hitchhiker  0.0000261137 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2054  inner membrane metabolite transport protein YdjE  36.65 
 
 
452 aa  281  2e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.0842085 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2490  inner membrane metabolite transport protein YdjE  36.74 
 
 
416 aa  260  3e-68  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.754275 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3220  major facilitator superfamily MFS_1  35.25 
 
 
463 aa  259  1e-67  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0542188  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2028  major facilitator superfamily permease  36.14 
 
 
428 aa  257  3e-67  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2060  inner membrane metabolite transport protein YdjE  34.74 
 
 
459 aa  248  1e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0010058 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1857  major facilitator transporter  34.67 
 
 
459 aa  246  6e-64  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.526363  hitchhiker  0.0000247936 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1999  major facilitator family transporter  34.67 
 
 
459 aa  246  6e-64  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0702699  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1860  major facilitator family transporter  34.67 
 
 
459 aa  245  1.9999999999999999e-63  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0174535  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01744  predicted transporter  34.67 
 
 
459 aa  236  9e-61  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.955946  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01732  hypothetical protein  34.67 
 
 
459 aa  236  9e-61  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1867  major facilitator superfamily MFS_1  34.67 
 
 
459 aa  235  1.0000000000000001e-60  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000517052  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1416  major facilitator family transporter  34.67 
 
 
459 aa  235  1.0000000000000001e-60  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.888006  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2499  major facilitator family transporter  34.44 
 
 
459 aa  233  5e-60  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.465931  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0129  putative permease  33.41 
 
 
459 aa  232  1e-59  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.549779  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0285  major facilitator superfamily sugar transporter  32.57 
 
 
464 aa  222  9.999999999999999e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.192742  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2413  major facilitator transporter  33.63 
 
 
447 aa  219  6e-56  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000787137  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4015  major facilitator superfamily MFS_1  30.11 
 
 
477 aa  219  8.999999999999998e-56  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0808  major facilitator superfamily MFS_1  32.67 
 
 
494 aa  213  7e-54  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5986  major facilitator transporter  30.38 
 
 
479 aa  213  7e-54  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6282  major facilitator transporter  30.38 
 
 
479 aa  213  7e-54  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.384913  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2231  major facilitator family transporter  31.95 
 
 
482 aa  210  4e-53  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4638  major facilitator superfamily MFS_1  30.13 
 
 
451 aa  210  5e-53  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000178504  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0382  major facilitator transporter  30.73 
 
 
472 aa  209  1e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.660441 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5007  major facilitator transporter  30.73 
 
 
472 aa  208  2e-52  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5266  major facilitator transporter  30.73 
 
 
472 aa  208  2e-52  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3101  major facilitator transporter  30.73 
 
 
472 aa  208  2e-52  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.380275  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5153  major facilitator transporter  30.73 
 
 
475 aa  207  3e-52  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.507557  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1269  major facilitator transporter  32.53 
 
 
466 aa  206  9e-52  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4647  major facilitator superfamily MFS_1  31.18 
 
 
488 aa  205  1e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.866665  normal  0.46173 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0920  major facilitator superfamily transporter metabolite/H(+) symporter  31.33 
 
 
487 aa  205  1e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.697574 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4627  major facilitator transporter  30.51 
 
 
475 aa  205  1e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2063  major facilitator superfamily MFS_1  29.27 
 
 
479 aa  204  2e-51  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0432509  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6611  major facilitator transporter  29.17 
 
 
479 aa  204  3e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.410873  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1414  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  33.19 
 
 
468 aa  204  3e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000198546  normal  0.095851 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0910  major facilitator family transporter  30.73 
 
 
472 aa  204  4e-51  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.367874  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3453  major facilitator transporter  30.07 
 
 
472 aa  203  6e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0499831  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0788  major facilitator family transporter  30.63 
 
 
472 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.509193  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1717  major facilitator transporter  31.75 
 
 
488 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1412  major facilitator transporter  31.62 
 
 
465 aa  202  9.999999999999999e-51  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0555  major facilitator family transporter  30.63 
 
 
472 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1973  major facilitator transporter  30.63 
 
 
472 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1660  MFS family transporter  30.97 
 
 
455 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1268  MFS transporter  30.77 
 
 
487 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.916286  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4090  major facilitator superfamily metabolite(sugar)/H(+) symporter  29.67 
 
 
471 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.94274  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6200  major facilitator transporter  30.22 
 
 
492 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0622411 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0486  major facilitator family transporter  30.42 
 
 
472 aa  201  3e-50  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0312823  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2070  major facilitator transporter  30.42 
 
 
472 aa  201  3e-50  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.376866  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6959  major facilitator transporter  31.81 
 
 
479 aa  200  3.9999999999999996e-50  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3036  major facilitator transporter  30.55 
 
 
487 aa  200  3.9999999999999996e-50  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3530  major facilitator transporter  32.29 
 
 
469 aa  199  1.0000000000000001e-49  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.229516  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6205  major facilitator superfamily MFS_1  29.23 
 
 
471 aa  199  1.0000000000000001e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5053  major facilitator superfamily MFS_1  31.5 
 
 
472 aa  198  2.0000000000000003e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.122247 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4651  major facilitator superfamily MFS_1  33.11 
 
 
470 aa  198  2.0000000000000003e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19270  putative MFS transporter  30.16 
 
 
455 aa  198  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.149627  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0792  major facilitator superfamily MFS_1  30.07 
 
 
458 aa  197  3e-49  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.753449  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8056  major facilitator superfamily MFS_1  31.01 
 
 
451 aa  197  5.000000000000001e-49  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1595  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  31.8 
 
 
472 aa  196  1e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5109  major facilitator transporter  31.74 
 
 
474 aa  193  6e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1523  major facilitator transporter  33.71 
 
 
438 aa  191  2e-47  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.295641  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3259  major facilitator transporter  31.52 
 
 
474 aa  190  4e-47  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.331503  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0667  major facilitator family transporter  32.15 
 
 
494 aa  189  1e-46  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0482021  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0670  general substrate transporter  30.33 
 
 
459 aa  188  2e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.753041 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5172  major facilitator transporter  31.4 
 
 
474 aa  187  3e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0809503 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3193  major facilitator transporter  29.11 
 
 
472 aa  186  6e-46  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.9008 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2255  major facilitator superfamily MFS_1  32.6 
 
 
473 aa  186  7e-46  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1482  major facilitator superfamily MFS_1  30.67 
 
 
451 aa  185  1.0000000000000001e-45  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000115751  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2088  major facilitator superfamily MFS_1  31.85 
 
 
456 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.565943 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3311  major facilitator transporter  31.35 
 
 
474 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.799238  normal 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1431  major facilitator family transporter  31.07 
 
 
478 aa  183  5.0000000000000004e-45  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.475934  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0471  major facilitator family transporter  31.07 
 
 
478 aa  183  5.0000000000000004e-45  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0177  major facilitator family transporter  31.07 
 
 
478 aa  183  5.0000000000000004e-45  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0379  major facilitator family transporter  31.07 
 
 
478 aa  183  7e-45  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1931  major facilitator superfamily permease  31.07 
 
 
478 aa  182  7e-45  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0979116  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1841  major facilitator family transporter  31.07 
 
 
478 aa  182  8.000000000000001e-45  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>