More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_5934 on replicon NC_010510
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010510  Mrad2831_5934  major facilitator transporter  100 
 
 
468 aa  904    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0786793 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0528  major facilitator transporter  83.11 
 
 
467 aa  696    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0826405  hitchhiker  0.00770286 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5172  major facilitator superfamily MFS_1  70.41 
 
 
466 aa  618  1e-176  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0828  major facilitator superfamily aromatic acid/H(+) symporter  50.78 
 
 
450 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.420618  normal  0.255495 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5972  major facilitator transporter  49.67 
 
 
462 aa  408  1.0000000000000001e-112  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6599  major facilitator superfamily MFS_1  49.22 
 
 
459 aa  404  1e-111  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.332731  normal  0.158495 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5167  major facilitator superfamily MFS_1  47.74 
 
 
470 aa  402  1e-111  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6268  major facilitator transporter  49.67 
 
 
462 aa  405  1e-111  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.492492 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0613  major facilitator superfamily MFS_1  46.19 
 
 
473 aa  397  1e-109  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0274336 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0974  major facilitator superfamily aromatic acid/H(+) symporter  46.12 
 
 
462 aa  394  1e-108  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00000109951  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4087  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  47.73 
 
 
468 aa  389  1e-107  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.281632  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0190  major facilitator superfamily MFS_1  44.81 
 
 
460 aa  390  1e-107  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000521499 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0987  major facilitator superfamily transporter metabolite/H(+) symporter  47.49 
 
 
461 aa  387  1e-106  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.496425 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1937  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  45.55 
 
 
474 aa  388  1e-106  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000000000973666  normal  0.0403058 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0970  major facilitator superfamily transporter metabolite/H(+) symporter  46.29 
 
 
470 aa  382  1e-105  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00262609  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0896  major facilitator superfamily MFS_1  48.16 
 
 
462 aa  362  1e-98  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0967  major facilitator superfamily aromatic acid/H(+) symporter  43.64 
 
 
462 aa  360  4e-98  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0270  major facilitator transporter  44.84 
 
 
477 aa  352  1e-95  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0250869  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6853  major facilitator transporter  43.6 
 
 
430 aa  323  4e-87  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.854567  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0129  putative permease  37.35 
 
 
459 aa  274  2.0000000000000002e-72  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.549779  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2028  major facilitator superfamily permease  36.61 
 
 
428 aa  264  2e-69  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1993  major facilitator family transporter  37.5 
 
 
452 aa  261  3e-68  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.863885  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1422  major facilitator family transporter  37.08 
 
 
452 aa  260  4e-68  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.452173  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1873  major facilitator superfamily MFS_1  37.5 
 
 
452 aa  259  5.0000000000000005e-68  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0070319  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01738  predicted transporter  37.5 
 
 
452 aa  258  1e-67  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.375088  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01726  hypothetical protein  37.5 
 
 
452 aa  258  1e-67  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.448165  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1863  major facilitator transporter  37.28 
 
 
452 aa  256  5e-67  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.369973  hitchhiker  0.0000261137 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1853  major facilitator family transporter  37.5 
 
 
452 aa  256  8e-67  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0220731  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2054  inner membrane metabolite transport protein YdjE  36.61 
 
 
452 aa  251  3e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.0842085 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3453  major facilitator transporter  34.49 
 
 
472 aa  237  3e-61  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0499831  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3220  major facilitator superfamily MFS_1  34.15 
 
 
463 aa  237  3e-61  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0542188  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2060  inner membrane metabolite transport protein YdjE  34.07 
 
 
459 aa  236  8e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0010058 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0792  major facilitator superfamily MFS_1  33.62 
 
 
458 aa  233  4.0000000000000004e-60  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.753449  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2490  inner membrane metabolite transport protein YdjE  36.93 
 
 
416 aa  233  4.0000000000000004e-60  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.754275 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1857  major facilitator transporter  33.77 
 
 
459 aa  231  2e-59  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.526363  hitchhiker  0.0000247936 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1999  major facilitator family transporter  33.77 
 
 
459 aa  231  2e-59  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0702699  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1860  major facilitator family transporter  33.77 
 
 
459 aa  230  3e-59  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0174535  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5007  major facilitator transporter  33.41 
 
 
472 aa  226  1e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5266  major facilitator transporter  33.41 
 
 
472 aa  226  1e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3101  major facilitator transporter  33.41 
 
 
472 aa  226  1e-57  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.380275  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5986  major facilitator transporter  32.69 
 
 
479 aa  223  4e-57  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6282  major facilitator transporter  32.62 
 
 
479 aa  223  8e-57  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.384913  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2413  major facilitator transporter  35.43 
 
 
447 aa  222  9.999999999999999e-57  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000787137  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1867  major facilitator superfamily MFS_1  33.77 
 
 
459 aa  221  1.9999999999999999e-56  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000517052  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1416  major facilitator family transporter  33.77 
 
 
459 aa  221  1.9999999999999999e-56  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.888006  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0920  major facilitator superfamily transporter metabolite/H(+) symporter  34.16 
 
 
487 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.697574 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0382  major facilitator transporter  33.19 
 
 
472 aa  220  3e-56  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.660441 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0285  major facilitator superfamily sugar transporter  32.31 
 
 
464 aa  221  3e-56  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.192742  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2063  major facilitator superfamily MFS_1  32.76 
 
 
479 aa  220  5e-56  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0432509  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2499  major facilitator family transporter  33.55 
 
 
459 aa  220  5e-56  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.465931  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01744  predicted transporter  33.63 
 
 
459 aa  219  7e-56  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.955946  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01732  hypothetical protein  33.63 
 
 
459 aa  219  7e-56  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4647  major facilitator superfamily MFS_1  33.71 
 
 
488 aa  219  8.999999999999998e-56  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.866665  normal  0.46173 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5153  major facilitator transporter  32.89 
 
 
475 aa  218  2e-55  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.507557  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6200  major facilitator transporter  31.1 
 
 
492 aa  218  2e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0622411 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4627  major facilitator transporter  32.89 
 
 
475 aa  218  2.9999999999999998e-55  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4015  major facilitator superfamily MFS_1  31.32 
 
 
477 aa  217  2.9999999999999998e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5178  major facilitator transporter  32.96 
 
 
457 aa  214  2.9999999999999995e-54  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5109  major facilitator transporter  34.41 
 
 
474 aa  214  2.9999999999999995e-54  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1595  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  33.92 
 
 
472 aa  213  5.999999999999999e-54  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3259  major facilitator transporter  34.41 
 
 
474 aa  212  1e-53  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.331503  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4638  major facilitator superfamily MFS_1  30.02 
 
 
451 aa  211  2e-53  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000178504  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0910  major facilitator family transporter  33.48 
 
 
472 aa  211  2e-53  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.367874  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02027  metabolite transporter  33.77 
 
 
476 aa  211  3e-53  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.158134 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5053  major facilitator superfamily MFS_1  32.83 
 
 
472 aa  209  6e-53  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.122247 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1660  MFS family transporter  33.48 
 
 
455 aa  209  9e-53  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2088  major facilitator superfamily MFS_1  33.63 
 
 
456 aa  209  1e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.565943 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5172  major facilitator transporter  34 
 
 
474 aa  208  2e-52  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0809503 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6611  major facilitator transporter  30.91 
 
 
479 aa  207  4e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.410873  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2070  major facilitator transporter  33.98 
 
 
472 aa  206  9e-52  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.376866  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19270  putative MFS transporter  32.45 
 
 
455 aa  205  1e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.149627  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3533  major facilitator transporter  33.98 
 
 
473 aa  205  2e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0539  major facilitator transporter  34.31 
 
 
473 aa  205  2e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3530  major facilitator transporter  35.89 
 
 
469 aa  204  3e-51  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.229516  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0555  major facilitator family transporter  33.7 
 
 
472 aa  204  3e-51  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0788  major facilitator family transporter  33.7 
 
 
472 aa  204  3e-51  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.509193  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0486  major facilitator family transporter  33.7 
 
 
472 aa  204  3e-51  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0312823  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1973  major facilitator transporter  33.7 
 
 
472 aa  204  3e-51  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1483  major facilitator superfamily MFS_1  30.37 
 
 
456 aa  202  9e-51  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0670  general substrate transporter  32.97 
 
 
459 aa  202  9.999999999999999e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.753041 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0379  major facilitator family transporter  33.78 
 
 
478 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6959  major facilitator transporter  31.99 
 
 
479 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2231  major facilitator family transporter  31.81 
 
 
482 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3311  major facilitator transporter  33.26 
 
 
474 aa  199  6e-50  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.799238  normal 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8056  major facilitator superfamily MFS_1  33.48 
 
 
451 aa  198  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2304  major facilitator transporter  31.47 
 
 
472 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.759044  normal  0.046264 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1931  major facilitator superfamily permease  33.56 
 
 
478 aa  198  2.0000000000000003e-49  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0979116  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1841  major facilitator family transporter  33.56 
 
 
478 aa  198  2.0000000000000003e-49  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0177  major facilitator family transporter  33.56 
 
 
478 aa  197  3e-49  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0911  major facilitator family transporter  33.56 
 
 
478 aa  197  3e-49  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.577596  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0471  major facilitator family transporter  33.56 
 
 
478 aa  197  3e-49  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1431  major facilitator family transporter  33.56 
 
 
478 aa  197  3e-49  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.475934  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6205  major facilitator superfamily MFS_1  29.55 
 
 
471 aa  197  4.0000000000000005e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0808  major facilitator superfamily MFS_1  31.47 
 
 
494 aa  196  5.000000000000001e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4090  major facilitator superfamily metabolite(sugar)/H(+) symporter  29.32 
 
 
471 aa  196  6e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.94274  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2496  major facilitator family transporter  31.03 
 
 
472 aa  196  9e-49  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.206768  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1414  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  31.69 
 
 
468 aa  194  2e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000198546  normal  0.095851 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4340  general substrate transporter  29.3 
 
 
477 aa  194  4e-48  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1482  major facilitator superfamily MFS_1  33.19 
 
 
451 aa  193  5e-48  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000115751  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1268  MFS transporter  30.97 
 
 
487 aa  192  1e-47  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.916286  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>