More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_A4090 on replicon NC_007951
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010676  Bphyt_6205  major facilitator superfamily MFS_1  95.12 
 
 
471 aa  895    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4090  major facilitator superfamily metabolite(sugar)/H(+) symporter  100 
 
 
471 aa  938    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.94274  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1269  major facilitator transporter  51.92 
 
 
466 aa  480  1e-134  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4015  major facilitator superfamily MFS_1  49.35 
 
 
477 aa  450  1e-125  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2063  major facilitator superfamily MFS_1  49.12 
 
 
479 aa  446  1.0000000000000001e-124  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0432509  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0920  major facilitator superfamily transporter metabolite/H(+) symporter  50.44 
 
 
487 aa  439  9.999999999999999e-123  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.697574 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5153  major facilitator transporter  49.46 
 
 
475 aa  436  1e-121  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.507557  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4647  major facilitator superfamily MFS_1  48.61 
 
 
488 aa  435  1e-121  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.866665  normal  0.46173 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0555  major facilitator family transporter  49.67 
 
 
472 aa  433  1e-120  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2070  major facilitator transporter  49.89 
 
 
472 aa  434  1e-120  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.376866  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0788  major facilitator family transporter  49.67 
 
 
472 aa  433  1e-120  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.509193  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5007  major facilitator transporter  49.34 
 
 
472 aa  432  1e-120  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0486  major facilitator family transporter  49.89 
 
 
472 aa  434  1e-120  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0312823  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1973  major facilitator transporter  49.67 
 
 
472 aa  433  1e-120  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0382  major facilitator transporter  49.12 
 
 
472 aa  433  1e-120  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.660441 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5266  major facilitator transporter  49.34 
 
 
472 aa  432  1e-120  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0910  major facilitator family transporter  48.73 
 
 
472 aa  434  1e-120  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.367874  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3101  major facilitator transporter  49.34 
 
 
472 aa  432  1e-120  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.380275  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4627  major facilitator transporter  49.24 
 
 
475 aa  434  1e-120  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3453  major facilitator transporter  48.9 
 
 
472 aa  433  1e-120  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0499831  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5986  major facilitator transporter  47.05 
 
 
479 aa  425  1e-118  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6200  major facilitator transporter  48.36 
 
 
492 aa  426  1e-118  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0622411 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6282  major facilitator transporter  46.83 
 
 
479 aa  424  1e-117  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.384913  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6611  major facilitator transporter  46.12 
 
 
479 aa  419  1e-116  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.410873  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0808  major facilitator superfamily MFS_1  48.36 
 
 
494 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1412  major facilitator transporter  46 
 
 
465 aa  399  9.999999999999999e-111  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3530  major facilitator transporter  45.71 
 
 
469 aa  389  1e-107  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.229516  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6959  major facilitator transporter  45.08 
 
 
479 aa  390  1e-107  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3193  major facilitator transporter  42.32 
 
 
472 aa  384  1e-105  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.9008 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2496  major facilitator family transporter  41.58 
 
 
472 aa  374  1e-102  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.206768  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2304  major facilitator transporter  42.23 
 
 
472 aa  374  1e-102  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.759044  normal  0.046264 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4340  general substrate transporter  41.58 
 
 
477 aa  370  1e-101  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0667  major facilitator family transporter  49.1 
 
 
494 aa  362  6e-99  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0482021  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1717  major facilitator transporter  41.23 
 
 
488 aa  358  9e-98  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1268  MFS transporter  41.98 
 
 
487 aa  357  1.9999999999999998e-97  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.916286  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3036  major facilitator transporter  42.2 
 
 
487 aa  357  2.9999999999999997e-97  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1759  major facilitator superfamily MFS_1  39.96 
 
 
472 aa  347  2e-94  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2231  major facilitator family transporter  41.1 
 
 
482 aa  340  2.9999999999999998e-92  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1718  major facilitator transporter  39.18 
 
 
473 aa  319  6e-86  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.442738  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00188  MFS transporter  39.7 
 
 
471 aa  316  5e-85  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.103216  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0792  major facilitator superfamily MFS_1  38.68 
 
 
458 aa  301  2e-80  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.753449  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2576  major facilitator transporter  35.82 
 
 
475 aa  295  1e-78  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.634768  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1483  major facilitator superfamily MFS_1  36.5 
 
 
456 aa  254  3e-66  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0285  major facilitator superfamily sugar transporter  34.73 
 
 
464 aa  251  2e-65  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.192742  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0881  major facilitator superfamily MFS_1  34.2 
 
 
448 aa  244  1.9999999999999999e-63  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.202747  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0463  major facilitator transporter  34.2 
 
 
448 aa  243  7e-63  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0213055  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0668  major facilitator transporter  34.27 
 
 
474 aa  231  2e-59  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00169534  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1551  major facilitator transporter  32.34 
 
 
485 aa  227  3e-58  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.308182  normal  0.0914413 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0987  major facilitator superfamily transporter metabolite/H(+) symporter  34.28 
 
 
461 aa  225  1e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.496425 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4860  major facilitator transporter  32.75 
 
 
487 aa  225  2e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0839463 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1668  major facilitator transporter  31.49 
 
 
487 aa  219  7.999999999999999e-56  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.339414  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1604  major facilitator transporter  32.68 
 
 
485 aa  218  2e-55  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1696  major facilitator transporter  31.49 
 
 
487 aa  217  4e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.4496  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1217  major facilitator transporter  31.49 
 
 
487 aa  217  4e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.207678  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1626  major facilitator transporter  32.24 
 
 
485 aa  216  5.9999999999999996e-55  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.408436  normal  0.668079 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5972  major facilitator transporter  31.67 
 
 
462 aa  206  8e-52  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6268  major facilitator transporter  31.45 
 
 
462 aa  202  9e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.492492 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6599  major facilitator superfamily MFS_1  29.67 
 
 
459 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.332731  normal  0.158495 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0828  major facilitator superfamily aromatic acid/H(+) symporter  30.35 
 
 
450 aa  202  1.9999999999999998e-50  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.420618  normal  0.255495 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0613  major facilitator superfamily MFS_1  31.3 
 
 
473 aa  200  3.9999999999999996e-50  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0274336 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0970  major facilitator superfamily transporter metabolite/H(+) symporter  32.33 
 
 
470 aa  199  7e-50  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00262609  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4638  major facilitator superfamily MFS_1  32.17 
 
 
451 aa  198  2.0000000000000003e-49  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000178504  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4087  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  30.98 
 
 
468 aa  196  6e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.281632  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0270  major facilitator transporter  31 
 
 
477 aa  192  1e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0250869  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3358  major facilitator superfamily MFS_1  29.11 
 
 
459 aa  191  2.9999999999999997e-47  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5178  major facilitator transporter  32.9 
 
 
457 aa  189  7e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5172  major facilitator superfamily MFS_1  29.8 
 
 
466 aa  187  4e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0967  major facilitator superfamily aromatic acid/H(+) symporter  29.69 
 
 
462 aa  185  2.0000000000000003e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2413  major facilitator transporter  30.75 
 
 
447 aa  181  2e-44  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000787137  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1482  major facilitator superfamily MFS_1  28.36 
 
 
451 aa  181  2.9999999999999997e-44  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000115751  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0528  major facilitator transporter  29.06 
 
 
467 aa  179  1e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0826405  hitchhiker  0.00770286 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3311  major facilitator transporter  33.16 
 
 
474 aa  177  3e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.799238  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0896  major facilitator superfamily MFS_1  29.14 
 
 
462 aa  177  5e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5053  major facilitator superfamily MFS_1  31.55 
 
 
472 aa  176  7e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.122247 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1595  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  30.47 
 
 
472 aa  173  5e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3533  major facilitator transporter  32.32 
 
 
473 aa  172  1e-41  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8056  major facilitator superfamily MFS_1  30.52 
 
 
451 aa  172  2e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5109  major facilitator transporter  31.38 
 
 
474 aa  171  3e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1660  MFS family transporter  30.26 
 
 
455 aa  170  5e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3259  major facilitator transporter  31.38 
 
 
474 aa  169  9e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.331503  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1857  major facilitator transporter  29.57 
 
 
459 aa  168  2e-40  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.526363  hitchhiker  0.0000247936 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0539  major facilitator transporter  31.63 
 
 
473 aa  168  2e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1999  major facilitator family transporter  29.57 
 
 
459 aa  168  2e-40  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0702699  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5172  major facilitator transporter  30.95 
 
 
474 aa  168  2e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0809503 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5934  major facilitator transporter  28.23 
 
 
468 aa  168  2e-40  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0786793 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0177  major facilitator family transporter  31.75 
 
 
478 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0471  major facilitator family transporter  31.75 
 
 
478 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0911  major facilitator family transporter  31.75 
 
 
478 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.577596  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0670  general substrate transporter  31.4 
 
 
459 aa  167  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.753041 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1431  major facilitator family transporter  31.75 
 
 
478 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.475934  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1841  major facilitator family transporter  31.1 
 
 
478 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5167  major facilitator superfamily MFS_1  29.98 
 
 
470 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19270  putative MFS transporter  29.98 
 
 
455 aa  167  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.149627  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1931  major facilitator superfamily permease  31.1 
 
 
478 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0979116  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2060  inner membrane metabolite transport protein YdjE  30.44 
 
 
459 aa  167  4e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0010058 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1860  major facilitator family transporter  29.57 
 
 
459 aa  167  4e-40  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0174535  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0379  major facilitator family transporter  31.75 
 
 
478 aa  167  5e-40  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4019  major facilitator superfamily MFS_1  33.12 
 
 
435 aa  164  3e-39  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.000381325  normal  0.201783 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0974  major facilitator superfamily aromatic acid/H(+) symporter  28.63 
 
 
462 aa  162  2e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00000109951  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3220  major facilitator superfamily MFS_1  28.04 
 
 
463 aa  161  2e-38  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0542188  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>