More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LEUM_2028 on replicon NC_008531
Organism: Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008531  LEUM_2028  major facilitator superfamily permease  100 
 
 
428 aa  855    Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0129  putative permease  49.53 
 
 
459 aa  430  1e-119  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.549779  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0190  major facilitator superfamily MFS_1  34.48 
 
 
460 aa  282  8.000000000000001e-75  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000521499 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0828  major facilitator superfamily aromatic acid/H(+) symporter  35.28 
 
 
450 aa  278  2e-73  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.420618  normal  0.255495 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0970  major facilitator superfamily transporter metabolite/H(+) symporter  34.38 
 
 
470 aa  277  3e-73  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00262609  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0987  major facilitator superfamily transporter metabolite/H(+) symporter  36.3 
 
 
461 aa  273  5.000000000000001e-72  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.496425 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4087  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  35.78 
 
 
468 aa  271  2e-71  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.281632  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0613  major facilitator superfamily MFS_1  35.09 
 
 
473 aa  268  1e-70  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0274336 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1937  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  35.7 
 
 
474 aa  268  2e-70  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000000000973666  normal  0.0403058 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0974  major facilitator superfamily aromatic acid/H(+) symporter  34.47 
 
 
462 aa  266  4e-70  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00000109951  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6599  major facilitator superfamily MFS_1  34.92 
 
 
459 aa  264  2e-69  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.332731  normal  0.158495 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0528  major facilitator transporter  35.16 
 
 
467 aa  263  3e-69  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0826405  hitchhiker  0.00770286 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6268  major facilitator transporter  33.64 
 
 
462 aa  262  8e-69  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.492492 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5972  major facilitator transporter  33.41 
 
 
462 aa  260  4e-68  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0967  major facilitator superfamily aromatic acid/H(+) symporter  34.1 
 
 
462 aa  258  1e-67  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1863  major facilitator transporter  33.03 
 
 
452 aa  254  2.0000000000000002e-66  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.369973  hitchhiker  0.0000261137 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5167  major facilitator superfamily MFS_1  37.21 
 
 
470 aa  253  4.0000000000000004e-66  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01738  predicted transporter  32.81 
 
 
452 aa  253  5.000000000000001e-66  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.375088  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01726  hypothetical protein  32.81 
 
 
452 aa  253  5.000000000000001e-66  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.448165  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1873  major facilitator superfamily MFS_1  32.81 
 
 
452 aa  252  7e-66  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0070319  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1853  major facilitator family transporter  32.81 
 
 
452 aa  252  7e-66  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0220731  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1422  major facilitator family transporter  32.81 
 
 
452 aa  252  1e-65  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.452173  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1993  major facilitator family transporter  32.81 
 
 
452 aa  251  2e-65  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.863885  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5172  major facilitator superfamily MFS_1  34.62 
 
 
466 aa  250  4e-65  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5934  major facilitator transporter  36.04 
 
 
468 aa  249  1e-64  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0786793 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0896  major facilitator superfamily MFS_1  34.61 
 
 
462 aa  248  2e-64  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2054  inner membrane metabolite transport protein YdjE  31.69 
 
 
452 aa  240  2.9999999999999997e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.0842085 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6853  major facilitator transporter  35.21 
 
 
430 aa  238  2e-61  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.854567  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2490  inner membrane metabolite transport protein YdjE  33.17 
 
 
416 aa  234  3e-60  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.754275 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0270  major facilitator transporter  32.83 
 
 
477 aa  224  3e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0250869  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3220  major facilitator superfamily MFS_1  33.41 
 
 
463 aa  222  9e-57  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0542188  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2060  inner membrane metabolite transport protein YdjE  32.52 
 
 
459 aa  221  3e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0010058 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1857  major facilitator transporter  32.21 
 
 
459 aa  218  1e-55  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.526363  hitchhiker  0.0000247936 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1999  major facilitator family transporter  32.21 
 
 
459 aa  218  1e-55  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0702699  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1860  major facilitator family transporter  31.99 
 
 
459 aa  217  4e-55  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0174535  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01744  predicted transporter  32.44 
 
 
459 aa  206  9e-52  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.955946  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01732  hypothetical protein  32.44 
 
 
459 aa  206  9e-52  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1867  major facilitator superfamily MFS_1  32.44 
 
 
459 aa  204  2e-51  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000517052  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1416  major facilitator family transporter  32.44 
 
 
459 aa  204  2e-51  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.888006  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2499  major facilitator family transporter  32.34 
 
 
459 aa  201  1.9999999999999998e-50  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.465931  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0285  major facilitator superfamily sugar transporter  30.16 
 
 
464 aa  185  1.0000000000000001e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.192742  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0382  major facilitator transporter  31.75 
 
 
472 aa  183  6e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.660441 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3453  major facilitator transporter  30.89 
 
 
472 aa  182  1e-44  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0499831  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4015  major facilitator superfamily MFS_1  28.54 
 
 
477 aa  182  1e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4647  major facilitator superfamily MFS_1  29.54 
 
 
488 aa  181  2e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.866665  normal  0.46173 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5153  major facilitator transporter  31.33 
 
 
475 aa  181  2e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.507557  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5266  major facilitator transporter  31.32 
 
 
472 aa  181  2.9999999999999997e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5007  major facilitator transporter  31.32 
 
 
472 aa  181  2.9999999999999997e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3101  major facilitator transporter  31.32 
 
 
472 aa  181  2.9999999999999997e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.380275  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6200  major facilitator transporter  27.57 
 
 
492 aa  180  4e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0622411 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4627  major facilitator transporter  31.12 
 
 
475 aa  180  4.999999999999999e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0910  major facilitator family transporter  30.26 
 
 
472 aa  179  7e-44  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.367874  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2413  major facilitator transporter  29.25 
 
 
447 aa  177  3e-43  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000787137  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0920  major facilitator superfamily transporter metabolite/H(+) symporter  29.1 
 
 
487 aa  177  3e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.697574 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0792  major facilitator superfamily MFS_1  28.41 
 
 
458 aa  176  5e-43  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.753449  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2070  major facilitator transporter  29.23 
 
 
472 aa  176  8e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.376866  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0486  major facilitator family transporter  29.01 
 
 
472 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0312823  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0555  major facilitator family transporter  28.79 
 
 
472 aa  174  2.9999999999999996e-42  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0788  major facilitator family transporter  28.79 
 
 
472 aa  174  2.9999999999999996e-42  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.509193  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1973  major facilitator transporter  28.79 
 
 
472 aa  174  2.9999999999999996e-42  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0808  major facilitator superfamily MFS_1  29.52 
 
 
494 aa  168  2e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2304  major facilitator transporter  27.03 
 
 
472 aa  166  5e-40  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.759044  normal  0.046264 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2496  major facilitator family transporter  26.87 
 
 
472 aa  166  6.9999999999999995e-40  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.206768  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6611  major facilitator transporter  29.01 
 
 
479 aa  166  6.9999999999999995e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.410873  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4638  major facilitator superfamily MFS_1  27.21 
 
 
451 aa  166  6.9999999999999995e-40  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000178504  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1483  major facilitator superfamily MFS_1  28.75 
 
 
456 aa  166  8e-40  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3193  major facilitator transporter  26.44 
 
 
472 aa  165  1.0000000000000001e-39  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.9008 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4340  general substrate transporter  25.93 
 
 
477 aa  164  3e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3530  major facilitator transporter  28.45 
 
 
469 aa  164  4.0000000000000004e-39  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.229516  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2231  major facilitator family transporter  26.39 
 
 
482 aa  163  7e-39  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3358  major facilitator superfamily MFS_1  29.19 
 
 
459 aa  162  1e-38  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5986  major facilitator transporter  27.6 
 
 
479 aa  161  2e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6282  major facilitator transporter  27.6 
 
 
479 aa  161  2e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.384913  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1759  major facilitator superfamily MFS_1  26.7 
 
 
472 aa  160  4e-38  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4090  major facilitator superfamily metabolite(sugar)/H(+) symporter  26.73 
 
 
471 aa  159  7e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.94274  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0667  major facilitator family transporter  29.72 
 
 
494 aa  158  2e-37  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0482021  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1412  major facilitator transporter  29.74 
 
 
465 aa  157  4e-37  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2576  major facilitator transporter  25.68 
 
 
475 aa  156  6e-37  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.634768  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1268  MFS transporter  25.93 
 
 
487 aa  156  8e-37  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.916286  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1717  major facilitator transporter  26.93 
 
 
488 aa  154  2e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6205  major facilitator superfamily MFS_1  25.61 
 
 
471 aa  155  2e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3036  major facilitator transporter  26.94 
 
 
487 aa  155  2e-36  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1166  major facilitator superfamily MFS_1  30.7 
 
 
450 aa  152  2e-35  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000374507 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6959  major facilitator transporter  28.2 
 
 
479 aa  151  2e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1269  major facilitator transporter  24.46 
 
 
466 aa  151  2e-35  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1718  major facilitator transporter  27.49 
 
 
473 aa  151  3e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.442738  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4860  major facilitator transporter  26.01 
 
 
487 aa  149  1.0000000000000001e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0839463 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2063  major facilitator superfamily MFS_1  26.12 
 
 
479 aa  148  2.0000000000000003e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0432509  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1217  major facilitator transporter  26.4 
 
 
487 aa  146  5e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.207678  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1604  major facilitator transporter  26.52 
 
 
485 aa  146  5e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1696  major facilitator transporter  26.4 
 
 
487 aa  146  5e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.4496  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1626  major facilitator transporter  26.07 
 
 
485 aa  145  9e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.408436  normal  0.668079 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4651  major facilitator superfamily MFS_1  29.75 
 
 
470 aa  145  1e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1668  major facilitator transporter  26.4 
 
 
487 aa  144  2e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.339414  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0070  MFS permease  26.44 
 
 
460 aa  143  6e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1551  major facilitator transporter  26.24 
 
 
485 aa  143  7e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.308182  normal  0.0914413 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5178  major facilitator transporter  26.85 
 
 
457 aa  142  8e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0668  major facilitator transporter  28.49 
 
 
474 aa  142  9e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00169534  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1490  major facilitator family transporter  28.7 
 
 
468 aa  141  3e-32  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4019  major facilitator superfamily MFS_1  29.97 
 
 
435 aa  140  3e-32  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.000381325  normal  0.201783 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>