More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_0896 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011894  Mnod_0896  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 
462 aa  895    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5167  major facilitator superfamily MFS_1  52.37 
 
 
470 aa  419  1e-116  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6599  major facilitator superfamily MFS_1  46.43 
 
 
459 aa  381  1e-104  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.332731  normal  0.158495 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5972  major facilitator transporter  45.25 
 
 
462 aa  377  1e-103  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6268  major facilitator transporter  45.59 
 
 
462 aa  377  1e-103  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.492492 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0970  major facilitator superfamily transporter metabolite/H(+) symporter  43.78 
 
 
470 aa  374  1e-102  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00262609  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0828  major facilitator superfamily aromatic acid/H(+) symporter  44.75 
 
 
450 aa  372  1e-102  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.420618  normal  0.255495 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0270  major facilitator transporter  46.83 
 
 
477 aa  369  1e-101  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0250869  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0613  major facilitator superfamily MFS_1  43.71 
 
 
473 aa  370  1e-101  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0274336 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0528  major facilitator transporter  47.51 
 
 
467 aa  364  2e-99  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0826405  hitchhiker  0.00770286 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1937  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  45.43 
 
 
474 aa  362  5.0000000000000005e-99  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000000000973666  normal  0.0403058 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5172  major facilitator superfamily MFS_1  45.21 
 
 
466 aa  359  6e-98  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4087  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  43.71 
 
 
468 aa  359  6e-98  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.281632  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0967  major facilitator superfamily aromatic acid/H(+) symporter  43.08 
 
 
462 aa  354  2e-96  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0190  major facilitator superfamily MFS_1  42.73 
 
 
460 aa  353  4e-96  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000521499 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0974  major facilitator superfamily aromatic acid/H(+) symporter  42.95 
 
 
462 aa  348  1e-94  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00000109951  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5934  major facilitator transporter  47.38 
 
 
468 aa  346  6e-94  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0786793 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0987  major facilitator superfamily transporter metabolite/H(+) symporter  43.86 
 
 
461 aa  344  2e-93  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.496425 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6853  major facilitator transporter  41.36 
 
 
430 aa  313  3.9999999999999997e-84  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.854567  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0129  putative permease  35.27 
 
 
459 aa  266  7e-70  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.549779  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1853  major facilitator family transporter  33.56 
 
 
452 aa  246  4.9999999999999997e-64  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0220731  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2028  major facilitator superfamily permease  34.61 
 
 
428 aa  246  8e-64  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01738  predicted transporter  33.41 
 
 
452 aa  245  9.999999999999999e-64  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.375088  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01726  hypothetical protein  33.41 
 
 
452 aa  245  9.999999999999999e-64  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.448165  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1873  major facilitator superfamily MFS_1  33.63 
 
 
452 aa  244  1.9999999999999999e-63  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0070319  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1863  major facilitator transporter  32.2 
 
 
452 aa  244  1.9999999999999999e-63  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.369973  hitchhiker  0.0000261137 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1993  major facilitator family transporter  33.63 
 
 
452 aa  244  1.9999999999999999e-63  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.863885  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1422  major facilitator family transporter  33.11 
 
 
452 aa  243  3.9999999999999997e-63  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.452173  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2054  inner membrane metabolite transport protein YdjE  33.11 
 
 
452 aa  242  1e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.0842085 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1660  MFS family transporter  34.35 
 
 
455 aa  236  6e-61  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3220  major facilitator superfamily MFS_1  32.01 
 
 
463 aa  230  5e-59  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0542188  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0285  major facilitator superfamily sugar transporter  36.36 
 
 
464 aa  228  2e-58  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.192742  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0539  major facilitator transporter  35.52 
 
 
473 aa  227  4e-58  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19270  putative MFS transporter  31.9 
 
 
455 aa  226  6e-58  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.149627  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0471  major facilitator family transporter  35.36 
 
 
478 aa  224  3e-57  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1841  major facilitator family transporter  35.36 
 
 
478 aa  224  3e-57  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1931  major facilitator superfamily permease  35.36 
 
 
478 aa  224  3e-57  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0979116  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0177  major facilitator family transporter  35.36 
 
 
478 aa  224  3e-57  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1431  major facilitator family transporter  35.36 
 
 
478 aa  224  3e-57  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.475934  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2490  inner membrane metabolite transport protein YdjE  33.33 
 
 
416 aa  223  4e-57  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.754275 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0379  major facilitator family transporter  35.36 
 
 
478 aa  224  4e-57  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5109  major facilitator transporter  35.21 
 
 
474 aa  223  4e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0911  major facilitator family transporter  35.36 
 
 
478 aa  223  6e-57  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.577596  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1857  major facilitator transporter  31.51 
 
 
459 aa  223  6e-57  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.526363  hitchhiker  0.0000247936 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1999  major facilitator family transporter  31.51 
 
 
459 aa  223  6e-57  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0702699  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1860  major facilitator family transporter  31.51 
 
 
459 aa  222  9e-57  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0174535  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2413  major facilitator transporter  33.71 
 
 
447 aa  221  1.9999999999999999e-56  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000787137  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3259  major facilitator transporter  34.99 
 
 
474 aa  221  3e-56  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.331503  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5178  major facilitator transporter  33.93 
 
 
457 aa  220  5e-56  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2060  inner membrane metabolite transport protein YdjE  30.5 
 
 
459 aa  220  5e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0010058 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5172  major facilitator transporter  34.84 
 
 
474 aa  220  5e-56  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0809503 
 
 
-
 
NC_003296  RS02027  metabolite transporter  33.56 
 
 
476 aa  219  7.999999999999999e-56  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.158134 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0670  general substrate transporter  32.89 
 
 
459 aa  219  8.999999999999998e-56  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.753041 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3533  major facilitator transporter  35.36 
 
 
473 aa  217  4e-55  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3311  major facilitator transporter  33.77 
 
 
474 aa  214  2.9999999999999995e-54  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.799238  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4015  major facilitator superfamily MFS_1  31.76 
 
 
477 aa  214  2.9999999999999995e-54  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5053  major facilitator superfamily MFS_1  33.33 
 
 
472 aa  214  2.9999999999999995e-54  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.122247 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1595  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  33.19 
 
 
472 aa  214  3.9999999999999995e-54  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1867  major facilitator superfamily MFS_1  31.51 
 
 
459 aa  212  1e-53  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000517052  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2499  major facilitator family transporter  30.97 
 
 
459 aa  211  2e-53  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.465931  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2073  major facilitator superfamily transporter  35.56 
 
 
467 aa  211  2e-53  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0013865 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01744  predicted transporter  31.29 
 
 
459 aa  210  3e-53  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.955946  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4638  major facilitator superfamily MFS_1  30.54 
 
 
451 aa  211  3e-53  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000178504  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1416  major facilitator family transporter  31.43 
 
 
459 aa  211  3e-53  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.888006  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01732  hypothetical protein  31.29 
 
 
459 aa  210  3e-53  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5986  major facilitator transporter  31.72 
 
 
479 aa  210  4e-53  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6282  major facilitator transporter  31.72 
 
 
479 aa  209  6e-53  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.384913  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2088  major facilitator superfamily MFS_1  35.98 
 
 
456 aa  208  1e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.565943 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6200  major facilitator transporter  30.04 
 
 
492 aa  205  1e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0622411 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1482  major facilitator superfamily MFS_1  33.41 
 
 
451 aa  202  9.999999999999999e-51  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000115751  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0792  major facilitator superfamily MFS_1  33.26 
 
 
458 aa  201  3e-50  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.753449  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8056  major facilitator superfamily MFS_1  32.73 
 
 
451 aa  198  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2231  major facilitator family transporter  30.68 
 
 
482 aa  197  3e-49  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6205  major facilitator superfamily MFS_1  29.82 
 
 
471 aa  194  3e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2063  major facilitator superfamily MFS_1  31.12 
 
 
479 aa  194  4e-48  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0432509  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4647  major facilitator superfamily MFS_1  32.45 
 
 
488 aa  194  4e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.866665  normal  0.46173 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4651  major facilitator superfamily MFS_1  32.97 
 
 
470 aa  193  5e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1759  major facilitator superfamily MFS_1  29.24 
 
 
472 aa  193  7e-48  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0382  major facilitator transporter  30.45 
 
 
472 aa  192  7e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.660441 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1717  major facilitator transporter  32.26 
 
 
488 aa  192  8e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5266  major facilitator transporter  30.57 
 
 
472 aa  191  2e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3453  major facilitator transporter  30.23 
 
 
472 aa  191  2e-47  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0499831  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3101  major facilitator transporter  30.57 
 
 
472 aa  191  2e-47  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.380275  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5007  major facilitator transporter  30.57 
 
 
472 aa  191  2e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1718  major facilitator transporter  31.41 
 
 
473 aa  190  4e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.442738  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1412  major facilitator transporter  31.77 
 
 
465 aa  190  5e-47  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1268  MFS transporter  30.13 
 
 
487 aa  190  5.999999999999999e-47  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.916286  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3036  major facilitator transporter  29.91 
 
 
487 aa  188  1e-46  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3530  major facilitator transporter  32.6 
 
 
469 aa  189  1e-46  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.229516  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0920  major facilitator superfamily transporter metabolite/H(+) symporter  31.94 
 
 
487 aa  189  1e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.697574 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6611  major facilitator transporter  29.98 
 
 
479 aa  188  2e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.410873  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4090  major facilitator superfamily metabolite(sugar)/H(+) symporter  29.01 
 
 
471 aa  188  2e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.94274  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4340  general substrate transporter  30.82 
 
 
477 aa  186  6e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5153  major facilitator transporter  29.96 
 
 
475 aa  186  6e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.507557  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1483  major facilitator superfamily MFS_1  30.97 
 
 
456 aa  186  7e-46  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3193  major facilitator transporter  29.28 
 
 
472 aa  186  8e-46  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.9008 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4627  major facilitator transporter  30.18 
 
 
475 aa  186  1.0000000000000001e-45  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1626  major facilitator transporter  32.68 
 
 
485 aa  185  2.0000000000000003e-45  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.408436  normal  0.668079 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0547  major facilitator superfamily transporter  31.22 
 
 
456 aa  185  2.0000000000000003e-45  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.392915  normal  0.285749 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2496  major facilitator family transporter  29.76 
 
 
472 aa  184  3e-45  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.206768  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>