More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_1898 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011830  Dhaf_1898  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 
448 aa  900    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1414  major facilitator superfamily MFS_1  34.68 
 
 
444 aa  270  5.9999999999999995e-71  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0285  major facilitator superfamily sugar transporter  35.03 
 
 
464 aa  246  8e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.192742  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3358  major facilitator superfamily MFS_1  32.82 
 
 
459 aa  217  2.9999999999999998e-55  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1482  major facilitator superfamily MFS_1  32.22 
 
 
451 aa  193  6e-48  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000115751  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1483  major facilitator superfamily MFS_1  29.44 
 
 
456 aa  175  1.9999999999999998e-42  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5716  major facilitator transporter  30 
 
 
482 aa  169  1e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0792  major facilitator superfamily MFS_1  30.44 
 
 
458 aa  167  4e-40  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.753449  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4860  major facilitator transporter  28.64 
 
 
487 aa  164  3e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0839463 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4638  major facilitator superfamily MFS_1  30.13 
 
 
451 aa  157  4e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000178504  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1626  major facilitator transporter  27.56 
 
 
485 aa  154  2.9999999999999998e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.408436  normal  0.668079 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1696  major facilitator transporter  27.29 
 
 
487 aa  153  8e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.4496  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1217  major facilitator transporter  27.29 
 
 
487 aa  153  8e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.207678  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1551  major facilitator transporter  27.53 
 
 
485 aa  152  2e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.308182  normal  0.0914413 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1668  major facilitator transporter  27.29 
 
 
487 aa  151  3e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.339414  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0463  major facilitator transporter  30.8 
 
 
448 aa  150  6e-35  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0213055  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1604  major facilitator transporter  27.07 
 
 
485 aa  149  1.0000000000000001e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8056  major facilitator superfamily MFS_1  29.52 
 
 
451 aa  147  4.0000000000000006e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4651  major facilitator superfamily MFS_1  27.13 
 
 
470 aa  146  9e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3228  major facilitator transporter  27.33 
 
 
480 aa  146  9e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.325137 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4932  major facilitator transporter  27.33 
 
 
480 aa  146  9e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.828486  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5178  major facilitator transporter  29.8 
 
 
457 aa  145  1e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2413  major facilitator transporter  27.25 
 
 
447 aa  145  1e-33  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000787137  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6741  major facilitator transporter  27.46 
 
 
480 aa  145  1e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6265  major facilitator transporter  28.27 
 
 
480 aa  145  2e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1565  major facilitator transporter  28.27 
 
 
480 aa  145  2e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.523471  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2088  major facilitator superfamily MFS_1  24.83 
 
 
456 aa  144  3e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.565943 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0670  general substrate transporter  29.44 
 
 
459 aa  144  3e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.753041 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19270  putative MFS transporter  28.38 
 
 
455 aa  143  7e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.149627  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6205  major facilitator superfamily MFS_1  27.51 
 
 
471 aa  141  3e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0547  major facilitator superfamily transporter  24.66 
 
 
456 aa  140  7e-32  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.392915  normal  0.285749 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5283  major facilitator transporter  28.05 
 
 
463 aa  139  1e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.591426  normal  0.763827 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0308  major facilitator family transporter  28.54 
 
 
474 aa  138  2e-31  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0584  major facilitator family transporter  28.54 
 
 
474 aa  138  2e-31  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.789618  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0983  major facilitator family transporter  28.54 
 
 
468 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.387482  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1325  major facilitator family transporter  28.54 
 
 
468 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.68992  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1245  major facilitator family transporter  28.54 
 
 
468 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2505  major facilitator family transporter  28.94 
 
 
468 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4090  major facilitator superfamily metabolite(sugar)/H(+) symporter  27.06 
 
 
471 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.94274  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0434  major facilitator superfamily MFS_1  27.67 
 
 
446 aa  137  4e-31  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000104713  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5172  major facilitator superfamily MFS_1  28.03 
 
 
466 aa  137  4e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0920  major facilitator superfamily transporter metabolite/H(+) symporter  26.2 
 
 
487 aa  137  5e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.697574 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0881  major facilitator superfamily MFS_1  28.22 
 
 
448 aa  136  7.000000000000001e-31  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.202747  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4993  MFS family membrane efflux protein  28.18 
 
 
526 aa  136  8e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.521864 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1660  MFS family transporter  28.38 
 
 
455 aa  135  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1318  major facilitator family transporter  28.07 
 
 
468 aa  135  1.9999999999999998e-30  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1523  major facilitator transporter  28.64 
 
 
438 aa  134  1.9999999999999998e-30  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.295641  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6200  major facilitator transporter  26.33 
 
 
492 aa  134  3e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0622411 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4647  major facilitator superfamily MFS_1  25.98 
 
 
488 aa  134  3.9999999999999996e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.866665  normal  0.46173 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1856  major facilitator transporter  27.38 
 
 
438 aa  134  5e-30  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0987  major facilitator superfamily transporter metabolite/H(+) symporter  26.75 
 
 
461 aa  133  6.999999999999999e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.496425 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1490  major facilitator family transporter  27.08 
 
 
468 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3924  major facilitator superfamily transporter  27.59 
 
 
438 aa  132  2.0000000000000002e-29  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.496152  normal  0.0457831 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6853  major facilitator transporter  27.92 
 
 
430 aa  132  2.0000000000000002e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.854567  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3580  hypothetical protein  26.58 
 
 
478 aa  131  3e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.024372  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2518  major facilitator transporter  26.87 
 
 
437 aa  130  5.0000000000000004e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3234  general substrate transporter  28.54 
 
 
445 aa  130  7.000000000000001e-29  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5986  major facilitator transporter  25.98 
 
 
479 aa  129  8.000000000000001e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6611  major facilitator transporter  27.85 
 
 
479 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.410873  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5143  major facilitator transporter  27.37 
 
 
482 aa  129  1.0000000000000001e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2863  major facilitator superfamily MFS_1  26.53 
 
 
423 aa  128  2.0000000000000002e-28  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.82901  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2754  major facilitator superfamily MFS_1  24.45 
 
 
465 aa  128  2.0000000000000002e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.182715  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6282  major facilitator transporter  25.76 
 
 
479 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.384913  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3655  major facilitator superfamily MFS_1  28.68 
 
 
447 aa  128  2.0000000000000002e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.304643  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1414  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  25.06 
 
 
468 aa  127  3e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000198546  normal  0.095851 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3160  major facilitator superfamily MFS_1  28.27 
 
 
461 aa  127  3e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0312386 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0070  MFS permease  28.6 
 
 
460 aa  127  4.0000000000000003e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0602  major facilitator superfamily MFS_1  26.13 
 
 
459 aa  127  4.0000000000000003e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1269  major facilitator transporter  28.76 
 
 
466 aa  127  5e-28  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5602  major facilitator transporter  28.5 
 
 
466 aa  126  8.000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.610871 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5212  major facilitator transporter  27.4 
 
 
399 aa  126  8.000000000000001e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000114177  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3669  major facilitator transporter  28.5 
 
 
466 aa  126  8.000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4698  major facilitator transporter  28.5 
 
 
466 aa  126  8.000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.585046  normal  0.168682 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0349  benzoate transport protein  27.61 
 
 
436 aa  125  1e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0186  major facilitator transporter  26.5 
 
 
479 aa  125  1e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5153  major facilitator transporter  27.29 
 
 
475 aa  125  2e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.507557  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0808  major facilitator superfamily MFS_1  25.83 
 
 
494 aa  125  2e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2255  major facilitator superfamily MFS_1  25.85 
 
 
473 aa  125  2e-27  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0909  major facilitator transporter  30.79 
 
 
455 aa  124  2e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0703326  normal  0.129634 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5266  major facilitator transporter  26.7 
 
 
472 aa  124  2e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3101  major facilitator transporter  26.7 
 
 
472 aa  124  2e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.380275  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5007  major facilitator transporter  26.7 
 
 
472 aa  124  2e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2255  general substrate transporter  24.72 
 
 
446 aa  125  2e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.000684239  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4627  major facilitator transporter  27.29 
 
 
475 aa  125  2e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1895  major facilitator transporter  25.61 
 
 
451 aa  124  3e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.004098  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0398  putative benzoate transport protein  27.34 
 
 
433 aa  124  3e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0364  benzoate transport protein  27.59 
 
 
433 aa  124  3e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4019  major facilitator superfamily MFS_1  28.91 
 
 
435 aa  124  3e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.000381325  normal  0.201783 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2681  general substrate transporter  29.27 
 
 
438 aa  124  3e-27  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.31051 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4092  major facilitator transporter  28.21 
 
 
466 aa  124  3e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.138786  normal  0.978075 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0335  sugar transporter; benzoate transport protein  27.32 
 
 
436 aa  124  4e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4557  major facilitator transporter  28.44 
 
 
466 aa  124  4e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00783301 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0896  major facilitator superfamily MFS_1  30.3 
 
 
462 aa  124  4e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0828  major facilitator superfamily aromatic acid/H(+) symporter  25.95 
 
 
450 aa  124  4e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.420618  normal  0.255495 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0323  major facilitator superfamily MFS_1  29.98 
 
 
488 aa  123  7e-27  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7070  major facilitator superfamily MFS_1  26.28 
 
 
467 aa  123  7e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.710966  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5543  major facilitator family transporter  26.93 
 
 
399 aa  123  8e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000723204  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0382  major facilitator transporter  26.04 
 
 
472 aa  123  9e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.660441 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6599  major facilitator superfamily MFS_1  25.5 
 
 
459 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.332731  normal  0.158495 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1116  major facilitator transporter  28.04 
 
 
466 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.10577  normal  0.134 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>