More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_B5716 on replicon NC_007348
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007348  Reut_B5716  major facilitator transporter  100 
 
 		 482 aa  968    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1898  major facilitator superfamily MFS_1  30.6 
 
 		 448 aa  185  1.0000000000000001e-45  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0285  major facilitator superfamily sugar transporter  29.5 
 
 		 464 aa  173  6.999999999999999e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.192742  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5986  major facilitator transporter  31.88 
 
 		 479 aa  172  1e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6282  major facilitator transporter  31.88 
 
 		 479 aa  172  2e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.384913  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6611  major facilitator transporter  32.16 
 
 		 479 aa  158  2e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.410873  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6959  major facilitator transporter  31.8 
 
 		 479 aa  156  1e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2063  major facilitator superfamily MFS_1  29.91 
 
 		 479 aa  155  2e-36  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0432509  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6265  major facilitator transporter  27.8 
 
 		 480 aa  154  2.9999999999999998e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1565  major facilitator transporter  27.8 
 
 		 480 aa  154  2.9999999999999998e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.523471  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3228  major facilitator transporter  28.03 
 
 		 480 aa  152  8.999999999999999e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.325137 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4932  major facilitator transporter  28.03 
 
 		 480 aa  152  8.999999999999999e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.828486  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0808  major facilitator superfamily MFS_1  28.11 
 
 		 494 aa  151  2e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6741  major facilitator transporter  27.59 
 
 		 480 aa  151  3e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8056  major facilitator superfamily MFS_1  29.01 
 
 		 451 aa  150  7e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5178  major facilitator transporter  27.72 
 
 		 457 aa  149  1.0000000000000001e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1483  major facilitator superfamily MFS_1  26.23 
 
 		 456 aa  149  1.0000000000000001e-34  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1482  major facilitator superfamily MFS_1  27.79 
 
 		 451 aa  148  2.0000000000000003e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000115751  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4627  major facilitator transporter  28.36 
 
 		 475 aa  147  5e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0382  major facilitator transporter  28.78 
 
 		 472 aa  147  5e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.660441 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5153  major facilitator transporter  28.57 
 
 		 475 aa  147  6e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.507557  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0602  major facilitator superfamily MFS_1  27.09 
 
 		 459 aa  147  6e-34  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0547  major facilitator superfamily transporter  27.16 
 
 		 456 aa  145  1e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.392915  normal  0.285749 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6200  major facilitator transporter  27.57 
 
 		 492 aa  145  1e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0622411 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1414  major facilitator superfamily MFS_1  27.74 
 
 		 444 aa  144  3e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4651  major facilitator superfamily MFS_1  25.7 
 
 		 470 aa  144  3e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5283  major facilitator transporter  27.7 
 
 		 463 aa  143  7e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.591426  normal  0.763827 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4638  major facilitator superfamily MFS_1  26.23 
 
 		 451 aa  143  8e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000178504  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2754  major facilitator superfamily MFS_1  26.62 
 
 		 465 aa  142  9.999999999999999e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.182715  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3453  major facilitator transporter  28.24 
 
 		 472 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0499831  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6205  major facilitator superfamily MFS_1  25.64 
 
 		 471 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5266  major facilitator transporter  28.51 
 
 		 472 aa  141  3e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2413  major facilitator transporter  27.59 
 
 		 447 aa  141  3e-32  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000787137  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4090  major facilitator superfamily metabolite(sugar)/H(+) symporter  25.47 
 
 		 471 aa  141  3e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.94274  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5007  major facilitator transporter  28.51 
 
 		 472 aa  141  3e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3101  major facilitator transporter  28.51 
 
 		 472 aa  141  3e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.380275  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19270  putative MFS transporter  27.39 
 
 		 455 aa  140  4.999999999999999e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.149627  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0910  major facilitator family transporter  27.56 
 
 		 472 aa  140  4.999999999999999e-32  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.367874  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1660  MFS family transporter  27.51 
 
 		 455 aa  140  7e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4647  major facilitator superfamily MFS_1  28.1 
 
 		 488 aa  139  1e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.866665  normal  0.46173 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0486  major facilitator family transporter  27.95 
 
 		 472 aa  139  1e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0312823  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2070  major facilitator transporter  27.95 
 
 		 472 aa  139  1e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.376866  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0788  major facilitator family transporter  27.95 
 
 		 472 aa  138  2e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.509193  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1973  major facilitator transporter  27.95 
 
 		 472 aa  138  2e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0555  major facilitator family transporter  27.95 
 
 		 472 aa  138  2e-31  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1999  major facilitator family transporter  27.72 
 
 		 459 aa  139  2e-31  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0702699  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1857  major facilitator transporter  27.72 
 
 		 459 aa  139  2e-31  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.526363  hitchhiker  0.0000247936 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0463  major facilitator transporter  28.1 
 
 		 448 aa  138  2e-31  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0213055  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3580  hypothetical protein  26.21 
 
 		 478 aa  138  3.0000000000000003e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.024372  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1860  major facilitator family transporter  27.49 
 
 		 459 aa  137  5e-31  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0174535  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2088  major facilitator superfamily MFS_1  25.38 
 
 		 456 aa  136  8e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.565943 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3160  major facilitator superfamily MFS_1  26.97 
 
 		 461 aa  136  8e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0312386 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1717  major facilitator transporter  28.85 
 
 		 488 aa  135  1.9999999999999998e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0920  major facilitator superfamily transporter metabolite/H(+) symporter  28.01 
 
 		 487 aa  135  1.9999999999999998e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.697574 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4015  major facilitator superfamily MFS_1  27.91 
 
 		 477 aa  134  3e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3220  major facilitator superfamily MFS_1  25.74 
 
 		 463 aa  134  3.9999999999999996e-30  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0542188  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2231  major facilitator family transporter  28.34 
 
 		 482 aa  133  6e-30  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1523  major facilitator transporter  27.58 
 
 		 438 aa  133  6e-30  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.295641  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3530  major facilitator transporter  27.68 
 
 		 469 aa  133  6e-30  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.229516  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0987  major facilitator superfamily transporter metabolite/H(+) symporter  26.06 
 
 		 461 aa  133  6.999999999999999e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.496425 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0670  general substrate transporter  27.06 
 
 		 459 aa  133  9e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.753041 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1867  major facilitator superfamily MFS_1  27.95 
 
 		 459 aa  130  4.0000000000000003e-29  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000517052  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1416  major facilitator family transporter  27.95 
 
 		 459 aa  130  4.0000000000000003e-29  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.888006  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3924  major facilitator superfamily transporter  28.18 
 
 		 438 aa  130  5.0000000000000004e-29  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.496152  normal  0.0457831 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5053  major facilitator superfamily MFS_1  27.05 
 
 		 472 aa  130  5.0000000000000004e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.122247 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2499  major facilitator family transporter  27.95 
 
 		 459 aa  130  5.0000000000000004e-29  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.465931  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0881  major facilitator superfamily MFS_1  26.32 
 
 		 448 aa  129  8.000000000000001e-29  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.202747  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5109  major facilitator transporter  27 
 
 		 474 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0070  MFS permease  27.27 
 
 		 460 aa  129  1.0000000000000001e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3259  major facilitator transporter  27 
 
 		 474 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.331503  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2304  major facilitator transporter  23.06 
 
 		 472 aa  127  3e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.759044  normal  0.046264 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1595  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  26.99 
 
 		 472 aa  128  3e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1268  MFS transporter  28.57 
 
 		 487 aa  127  4.0000000000000003e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.916286  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4993  MFS family membrane efflux protein  29.19 
 
 		 526 aa  127  4.0000000000000003e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.521864 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01744  predicted transporter  27.47 
 
 		 459 aa  127  5e-28  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.955946  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01732  hypothetical protein  27.47 
 
 		 459 aa  127  5e-28  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0667  major facilitator family transporter  27.78 
 
 		 494 aa  127  5e-28  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0482021  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2060  inner membrane metabolite transport protein YdjE  26.27 
 
 		 459 aa  127  5e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0010058 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1875  major facilitator transporter  27.45 
 
 		 459 aa  127  5e-28  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.473892  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3036  major facilitator transporter  28.57 
 
 		 487 aa  127  6e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5172  major facilitator transporter  27.49 
 
 		 474 aa  125  1e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0809503 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1856  major facilitator transporter  28.45 
 
 		 438 aa  125  1e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1414  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  25.27 
 
 		 468 aa  126  1e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000198546  normal  0.095851 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0471  major facilitator family transporter  26.15 
 
 		 478 aa  125  2e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0379  major facilitator family transporter  26.15 
 
 		 478 aa  125  2e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4340  general substrate transporter  24.13 
 
 		 477 aa  125  2e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1431  major facilitator family transporter  26.15 
 
 		 478 aa  125  2e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.475934  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1718  major facilitator transporter  26.52 
 
 		 473 aa  125  2e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.442738  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0177  major facilitator family transporter  26.15 
 
 		 478 aa  125  2e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0897  major facilitator superfamily MFS_1  30.36 
 
 		 447 aa  124  3e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0894914  normal  0.147269 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0911  major facilitator family transporter  26.15 
 
 		 478 aa  124  3e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.577596  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0539  major facilitator transporter  26.81 
 
 		 473 aa  124  3e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1931  major facilitator superfamily permease  26.15 
 
 		 478 aa  124  3e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0979116  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1841  major facilitator family transporter  26.15 
 
 		 478 aa  124  3e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3655  major facilitator superfamily MFS_1  27.4 
 
 		 447 aa  124  3e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.304643  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0434  major facilitator superfamily MFS_1  28.74 
 
 		 446 aa  124  3e-27  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000104713  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6853  major facilitator transporter  25.76 
 
 		 430 aa  124  4e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.854567  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0792  major facilitator superfamily MFS_1  25.88 
 
 		 458 aa  124  5e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.753449  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2496  major facilitator family transporter  23.16 
 
 		 472 aa  122  9.999999999999999e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.206768  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5972  major facilitator transporter  26.61 
 
 		 462 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>