More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen2424_3228 on replicon NC_008543
Organism: Burkholderia cenocepacia HI2424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008544  Bcen2424_6265  major facilitator transporter  88.54 
 
 
480 aa  852    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6741  major facilitator transporter  88.96 
 
 
480 aa  856    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3228  major facilitator transporter  100 
 
 
480 aa  962    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.325137 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1565  major facilitator transporter  88.54 
 
 
480 aa  852    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.523471  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4932  major facilitator transporter  100 
 
 
480 aa  962    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.828486  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0632  general substrate transporter  60.22 
 
 
471 aa  522  1e-147  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000142658  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5071  major facilitator superfamily MFS_1  52.83 
 
 
485 aa  467  9.999999999999999e-131  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.706796  normal  0.279172 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0602  major facilitator superfamily MFS_1  43.27 
 
 
459 aa  392  1e-108  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5283  major facilitator transporter  44.27 
 
 
463 aa  383  1e-105  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.591426  normal  0.763827 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0070  MFS permease  43.97 
 
 
460 aa  374  1e-102  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3160  major facilitator superfamily MFS_1  42.64 
 
 
461 aa  363  5.0000000000000005e-99  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0312386 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3580  hypothetical protein  41.23 
 
 
478 aa  353  2.9999999999999997e-96  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.024372  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1318  major facilitator family transporter  41.91 
 
 
468 aa  351  2e-95  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0584  major facilitator family transporter  42.06 
 
 
474 aa  349  7e-95  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.789618  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0308  major facilitator family transporter  42.06 
 
 
474 aa  349  7e-95  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1325  major facilitator family transporter  42.06 
 
 
468 aa  348  9e-95  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.68992  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2505  major facilitator family transporter  42.06 
 
 
468 aa  348  9e-95  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1245  major facilitator family transporter  42.06 
 
 
468 aa  348  9e-95  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0983  major facilitator family transporter  42.06 
 
 
468 aa  348  9e-95  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.387482  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0909  major facilitator transporter  43.53 
 
 
455 aa  348  9e-95  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0703326  normal  0.129634 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7070  major facilitator superfamily MFS_1  39.32 
 
 
467 aa  348  1e-94  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.710966  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0186  major facilitator transporter  39.32 
 
 
479 aa  346  6e-94  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1490  major facilitator family transporter  41.61 
 
 
468 aa  345  7e-94  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4244  major facilitator transporter  39.83 
 
 
467 aa  343  4e-93  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4630  major facilitator superfamily MFS_1  40.98 
 
 
467 aa  337  2.9999999999999997e-91  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.234892  hitchhiker  0.00910919 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4498  major facilitator superfamily MFS_1  40.98 
 
 
467 aa  337  2.9999999999999997e-91  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0152994  normal  0.24714 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4092  major facilitator transporter  43.75 
 
 
466 aa  336  5.999999999999999e-91  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.138786  normal  0.978075 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4557  major facilitator transporter  43.53 
 
 
466 aa  335  9e-91  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00783301 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5602  major facilitator transporter  43.62 
 
 
466 aa  334  2e-90  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.610871 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4698  major facilitator transporter  43.62 
 
 
466 aa  334  2e-90  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.585046  normal  0.168682 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3669  major facilitator transporter  43.62 
 
 
466 aa  334  2e-90  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1116  major facilitator transporter  42.95 
 
 
466 aa  332  1e-89  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.10577  normal  0.134 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3995  major facilitator transporter  42.38 
 
 
466 aa  315  9.999999999999999e-85  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0613817 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0914  major facilitator transporter  39.24 
 
 
434 aa  304  3.0000000000000004e-81  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00481205  normal  0.205021 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1482  major facilitator superfamily MFS_1  32.9 
 
 
451 aa  217  2.9999999999999998e-55  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000115751  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2413  major facilitator transporter  32.45 
 
 
447 aa  206  1e-51  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000787137  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4638  major facilitator superfamily MFS_1  32.66 
 
 
451 aa  203  6e-51  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000178504  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5178  major facilitator transporter  31.63 
 
 
457 aa  194  2e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19270  putative MFS transporter  29.96 
 
 
455 aa  193  5e-48  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.149627  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1660  MFS family transporter  30.4 
 
 
455 aa  191  2e-47  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0539  major facilitator transporter  32.52 
 
 
473 aa  191  2e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5109  major facilitator transporter  31.71 
 
 
474 aa  188  2e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5172  major facilitator transporter  31.78 
 
 
474 aa  188  2e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0809503 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3259  major facilitator transporter  31.71 
 
 
474 aa  187  5e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.331503  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0379  major facilitator family transporter  31.42 
 
 
478 aa  184  3e-45  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3311  major facilitator transporter  32.08 
 
 
474 aa  184  4.0000000000000006e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.799238  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1595  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  31.47 
 
 
472 aa  183  5.0000000000000004e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8056  major facilitator superfamily MFS_1  30.87 
 
 
451 aa  183  5.0000000000000004e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02027  metabolite transporter  31.76 
 
 
476 aa  182  8.000000000000001e-45  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.158134 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0670  general substrate transporter  30.2 
 
 
459 aa  182  9.000000000000001e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.753041 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5053  major facilitator superfamily MFS_1  31.49 
 
 
472 aa  181  2e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.122247 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0471  major facilitator family transporter  31.19 
 
 
478 aa  181  2.9999999999999997e-44  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0177  major facilitator family transporter  31.19 
 
 
478 aa  181  2.9999999999999997e-44  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1431  major facilitator family transporter  31.19 
 
 
478 aa  181  2.9999999999999997e-44  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.475934  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3533  major facilitator transporter  31.93 
 
 
473 aa  180  4e-44  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0911  major facilitator family transporter  31.19 
 
 
478 aa  180  4.999999999999999e-44  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.577596  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1931  major facilitator superfamily permease  31.19 
 
 
478 aa  180  4.999999999999999e-44  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0979116  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4651  major facilitator superfamily MFS_1  30.77 
 
 
470 aa  179  8e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1841  major facilitator family transporter  31.19 
 
 
478 aa  179  1e-43  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2088  major facilitator superfamily MFS_1  30.51 
 
 
456 aa  178  2e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.565943 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1523  major facilitator transporter  31.74 
 
 
438 aa  178  2e-43  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.295641  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6599  major facilitator superfamily MFS_1  29.56 
 
 
459 aa  177  4e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.332731  normal  0.158495 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0547  major facilitator superfamily transporter  30.44 
 
 
456 aa  176  8e-43  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.392915  normal  0.285749 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2255  major facilitator superfamily MFS_1  31.21 
 
 
473 aa  176  9e-43  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5972  major facilitator transporter  30.46 
 
 
462 aa  173  5e-42  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0613  major facilitator superfamily MFS_1  28.63 
 
 
473 aa  172  2e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0274336 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2073  major facilitator superfamily transporter  31.36 
 
 
467 aa  172  2e-41  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0013865 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21330  sugar phosphate permease  31.17 
 
 
477 aa  170  5e-41  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.428425  hitchhiker  0.00018034 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6268  major facilitator transporter  30.02 
 
 
462 aa  169  9e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.492492 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4087  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  29.98 
 
 
468 aa  168  2e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.281632  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0987  major facilitator superfamily transporter metabolite/H(+) symporter  28.51 
 
 
461 aa  164  3e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.496425 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0828  major facilitator superfamily aromatic acid/H(+) symporter  29.04 
 
 
450 aa  164  3e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.420618  normal  0.255495 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3655  major facilitator superfamily MFS_1  27.33 
 
 
447 aa  163  6e-39  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.304643  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1414  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  29.67 
 
 
468 aa  163  6e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000198546  normal  0.095851 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3497  major facilitator superfamily MFS_1  32.14 
 
 
398 aa  163  8.000000000000001e-39  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0792  major facilitator superfamily MFS_1  28.51 
 
 
458 aa  162  1e-38  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.753449  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5271  major facilitator family transporter  30.16 
 
 
399 aa  161  2e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000000222558  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5098  major facilitator family transporter  30.16 
 
 
399 aa  161  2e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.20566e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5668  major facilitator family transporter  30.16 
 
 
399 aa  161  2e-38  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.0000000000480591  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5513  major facilitator family transporter  30.16 
 
 
399 aa  161  2e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5543  major facilitator family transporter  30.16 
 
 
399 aa  161  3e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000723204  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5547  major facilitator family transporter  29.93 
 
 
399 aa  160  4e-38  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.00000000869498  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5409  major facilitator family transporter  29.7 
 
 
399 aa  160  6e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000000725853  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5115  major facilitator family transporter  30.16 
 
 
399 aa  160  7e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000159613  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5599  major facilitator family transporter  30.16 
 
 
399 aa  160  7e-38  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000105464  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4019  major facilitator superfamily MFS_1  32.08 
 
 
435 aa  159  9e-38  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.000381325  normal  0.201783 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5212  major facilitator transporter  30.05 
 
 
399 aa  159  1e-37  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000114177  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0285  major facilitator superfamily sugar transporter  28.14 
 
 
464 aa  156  9e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.192742  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2754  major facilitator superfamily MFS_1  29.28 
 
 
465 aa  155  1e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.182715  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3653  major facilitator superfamily MFS_1  27.49 
 
 
446 aa  155  1e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0434  major facilitator superfamily MFS_1  26.41 
 
 
446 aa  153  5.9999999999999996e-36  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000104713  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0970  major facilitator superfamily transporter metabolite/H(+) symporter  28.07 
 
 
470 aa  153  5.9999999999999996e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00262609  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3933  major facilitator transporter  30.85 
 
 
399 aa  152  1e-35  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000233422  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1875  major facilitator transporter  27.83 
 
 
459 aa  151  2e-35  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.473892  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3358  major facilitator superfamily MFS_1  28.24 
 
 
459 aa  150  6e-35  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0897  major facilitator superfamily MFS_1  31.11 
 
 
447 aa  149  8e-35  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0894914  normal  0.147269 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1898  major facilitator superfamily MFS_1  27.33 
 
 
448 aa  147  3e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2078  major facilitator superfamily MFS_1  31.12 
 
 
404 aa  146  8.000000000000001e-34  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4993  MFS family membrane efflux protein  29.6 
 
 
526 aa  146  8.000000000000001e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.521864 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1408  major facilitator transporter  26.44 
 
 
484 aa  146  9e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  decreased coverage  0.0000966462  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>