More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_4993 on replicon NC_007974
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007347  Reut_A2518  major facilitator transporter  79.21 
 
 
437 aa  688    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1856  major facilitator transporter  82.45 
 
 
438 aa  721    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3924  major facilitator superfamily transporter  81.76 
 
 
438 aa  709    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.496152  normal  0.0457831 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4993  MFS family membrane efflux protein  100 
 
 
526 aa  1040    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.521864 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0532  major facilitator family transporter  57.08 
 
 
436 aa  476  1e-133  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0462  major facilitator family transporter  56.85 
 
 
436 aa  474  1e-132  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.450318  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3564  major facilitator transporter  55.61 
 
 
436 aa  461  9.999999999999999e-129  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5083  major facilitator transporter  58.18 
 
 
437 aa  451  1e-125  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.418338  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1992  major facilitator transporter  56.47 
 
 
436 aa  446  1.0000000000000001e-124  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.252047  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1326  major facilitator transporter  43.54 
 
 
464 aa  321  1.9999999999999998e-86  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.367254  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1875  major facilitator transporter  42.09 
 
 
459 aa  306  6e-82  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.473892  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1482  major facilitator superfamily MFS_1  35.45 
 
 
451 aa  263  8e-69  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000115751  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2413  major facilitator transporter  34.5 
 
 
447 aa  261  3e-68  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000787137  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2255  major facilitator superfamily MFS_1  35.87 
 
 
473 aa  241  2e-62  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4638  major facilitator superfamily MFS_1  33.33 
 
 
451 aa  241  2.9999999999999997e-62  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000178504  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5543  major facilitator family transporter  34.77 
 
 
399 aa  237  3e-61  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000723204  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8056  major facilitator superfamily MFS_1  35.81 
 
 
451 aa  237  5.0000000000000005e-61  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5409  major facilitator family transporter  34.29 
 
 
399 aa  236  7e-61  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000000725853  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5547  major facilitator family transporter  34.53 
 
 
399 aa  236  7e-61  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.00000000869498  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5271  major facilitator family transporter  34.77 
 
 
399 aa  236  7e-61  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000000222558  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5098  major facilitator family transporter  34.77 
 
 
399 aa  236  7e-61  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.20566e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5668  major facilitator family transporter  34.77 
 
 
399 aa  236  7e-61  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.0000000000480591  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1377  major facilitator superfamily MFS_1  40.34 
 
 
445 aa  236  7e-61  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5513  major facilitator family transporter  34.77 
 
 
399 aa  236  7e-61  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5115  major facilitator family transporter  34.53 
 
 
399 aa  235  2.0000000000000002e-60  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000159613  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5599  major facilitator family transporter  34.53 
 
 
399 aa  234  2.0000000000000002e-60  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000105464  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0670  general substrate transporter  33.49 
 
 
459 aa  228  2e-58  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.753041 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5212  major facilitator transporter  33.57 
 
 
399 aa  228  2e-58  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000114177  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29790  sugar phosphate permease  35.98 
 
 
485 aa  226  8e-58  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1660  MFS family transporter  32.96 
 
 
455 aa  225  2e-57  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5178  major facilitator transporter  31.65 
 
 
457 aa  224  3e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19270  putative MFS transporter  32.77 
 
 
455 aa  224  4e-57  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.149627  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3497  major facilitator superfamily MFS_1  34.81 
 
 
398 aa  222  1.9999999999999999e-56  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3933  major facilitator transporter  32.13 
 
 
399 aa  220  5e-56  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000233422  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21330  sugar phosphate permease  35.41 
 
 
477 aa  220  5e-56  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.428425  hitchhiker  0.00018034 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3374  major facilitator superfamily MFS_1  32.62 
 
 
398 aa  218  2e-55  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000527195  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5172  major facilitator transporter  33.49 
 
 
474 aa  217  2.9999999999999998e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0809503 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5109  major facilitator transporter  33.49 
 
 
474 aa  218  2.9999999999999998e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0539  major facilitator transporter  33.41 
 
 
473 aa  217  2.9999999999999998e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0897  major facilitator superfamily MFS_1  35.81 
 
 
447 aa  217  4e-55  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0894914  normal  0.147269 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3259  major facilitator transporter  33.49 
 
 
474 aa  216  9e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.331503  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3533  major facilitator transporter  34.46 
 
 
473 aa  213  4.9999999999999996e-54  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4019  major facilitator superfamily MFS_1  35.59 
 
 
435 aa  212  1e-53  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.000381325  normal  0.201783 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0177  major facilitator family transporter  32.72 
 
 
478 aa  210  7e-53  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0471  major facilitator family transporter  32.72 
 
 
478 aa  210  7e-53  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1431  major facilitator family transporter  32.72 
 
 
478 aa  210  7e-53  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.475934  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3311  major facilitator transporter  32.3 
 
 
474 aa  209  8e-53  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.799238  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1931  major facilitator superfamily permease  32.49 
 
 
478 aa  209  9e-53  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0979116  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0911  major facilitator family transporter  32.72 
 
 
478 aa  209  1e-52  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.577596  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0379  major facilitator family transporter  32.72 
 
 
478 aa  209  1e-52  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1841  major facilitator family transporter  32.87 
 
 
478 aa  209  1e-52  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1523  major facilitator transporter  34.5 
 
 
438 aa  206  6e-52  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.295641  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02027  metabolite transporter  32.81 
 
 
476 aa  206  1e-51  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.158134 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5053  major facilitator superfamily MFS_1  31.89 
 
 
472 aa  203  5e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.122247 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1595  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  31.98 
 
 
472 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2078  major facilitator superfamily MFS_1  32.3 
 
 
404 aa  200  6e-50  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1671  major facilitator transporter  34.39 
 
 
381 aa  199  1.0000000000000001e-49  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    decreased coverage  0.0000914056 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0245  putative permease  35.15 
 
 
449 aa  199  1.0000000000000001e-49  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0461827  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1266  major facilitator transporter  32.71 
 
 
422 aa  197  3e-49  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.693096  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1189  major facilitator transporter  32.94 
 
 
422 aa  197  3e-49  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00252456  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2073  major facilitator superfamily transporter  31.98 
 
 
467 aa  194  4e-48  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0013865 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1166  major facilitator superfamily MFS_1  34.1 
 
 
450 aa  189  1e-46  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000374507 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1414  major facilitator transporter  31.95 
 
 
424 aa  187  6e-46  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2088  major facilitator superfamily MFS_1  29.63 
 
 
456 aa  184  4.0000000000000006e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.565943 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4651  major facilitator superfamily MFS_1  28.47 
 
 
470 aa  182  2e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0911  major facilitator superfamily permease  29.08 
 
 
388 aa  179  1e-43  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.000338401  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0547  major facilitator superfamily transporter  29.06 
 
 
456 aa  179  2e-43  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.392915  normal  0.285749 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1561  major facilitator transporter  29.8 
 
 
509 aa  178  3e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.141298  normal  0.174962 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1089  major facilitator transporter  33.49 
 
 
450 aa  177  5e-43  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.10347  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1543  major facilitator transporter  32.28 
 
 
382 aa  176  9.999999999999999e-43  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.0259552 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0285  major facilitator superfamily sugar transporter  29.07 
 
 
464 aa  172  2e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.192742  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04490  sugar phosphate permease  31.72 
 
 
469 aa  171  3e-41  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_45672  predicted protein  26.55 
 
 
557 aa  170  7e-41  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2754  major facilitator superfamily MFS_1  31.66 
 
 
465 aa  168  2e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.182715  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1414  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  26.96 
 
 
468 aa  167  4e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000198546  normal  0.095851 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1683  major facilitator transporter  34.8 
 
 
415 aa  167  5e-40  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.249309  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2900  major facilitator transporter  29.8 
 
 
514 aa  167  5e-40  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.473738  normal  0.0138886 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1548  major facilitator superfamily MFS_1  29.59 
 
 
380 aa  166  9e-40  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0090  major facilitator transporter  28.24 
 
 
422 aa  166  1.0000000000000001e-39  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.000497214  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1010  major facilitator family transporter  33.04 
 
 
398 aa  160  7e-38  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0434  major facilitator superfamily MFS_1  28.8 
 
 
446 aa  159  1e-37  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000104713  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6268  major facilitator transporter  30.65 
 
 
462 aa  159  1e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.492492 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1972  major facilitator transporter  31.93 
 
 
372 aa  157  6e-37  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.106436  hitchhiker  0.000000141049 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5972  major facilitator transporter  30.18 
 
 
462 aa  156  7e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04482  sugar transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G03500)  27.05 
 
 
579 aa  155  2e-36  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.289204 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0967  major facilitator superfamily aromatic acid/H(+) symporter  28.4 
 
 
462 aa  152  1e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0792  major facilitator superfamily MFS_1  29.74 
 
 
458 aa  151  2e-35  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.753449  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0195  major facilitator transporter  31.95 
 
 
465 aa  150  4e-35  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3655  major facilitator superfamily MFS_1  27.79 
 
 
447 aa  150  5e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.304643  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3653  major facilitator superfamily MFS_1  27.08 
 
 
446 aa  149  1.0000000000000001e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1076  major facilitator transporter  31.3 
 
 
382 aa  149  1.0000000000000001e-34  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.197988  normal  0.0589295 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0613  major facilitator superfamily MFS_1  30.61 
 
 
473 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0274336 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0325  major facilitator superfamily MFS_1  30.14 
 
 
477 aa  148  2.0000000000000003e-34  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.184754  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4087  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  31.58 
 
 
468 aa  148  3e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.281632  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0070  MFS permease  27.32 
 
 
460 aa  147  4.0000000000000006e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5470  major facilitator transporter  27.19 
 
 
461 aa  147  5e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0602  major facilitator superfamily MFS_1  29.21 
 
 
459 aa  147  7.0000000000000006e-34  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5283  major facilitator transporter  28.7 
 
 
463 aa  145  1e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.591426  normal  0.763827 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0190  major facilitator superfamily MFS_1  30.24 
 
 
460 aa  145  1e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000521499 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_38010  MFS family transporter: sugar  27.56 
 
 
576 aa  145  2e-33  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.286894 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>