More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_2754 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013093  Amir_2754  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 
465 aa  912    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.182715  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2088  major facilitator superfamily MFS_1  55.41 
 
 
456 aa  483  1e-135  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.565943 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1414  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  52.56 
 
 
468 aa  444  1e-123  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000198546  normal  0.095851 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0547  major facilitator superfamily transporter  49.89 
 
 
456 aa  432  1e-120  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.392915  normal  0.285749 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4651  major facilitator superfamily MFS_1  51.79 
 
 
470 aa  432  1e-120  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2413  major facilitator transporter  41.41 
 
 
447 aa  327  3e-88  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000787137  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1482  major facilitator superfamily MFS_1  38.83 
 
 
451 aa  316  5e-85  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000115751  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1523  major facilitator transporter  38.58 
 
 
438 aa  306  5.0000000000000004e-82  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.295641  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19270  putative MFS transporter  39.82 
 
 
455 aa  298  2e-79  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.149627  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4019  major facilitator superfamily MFS_1  44.95 
 
 
435 aa  295  1e-78  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.000381325  normal  0.201783 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0670  general substrate transporter  40.31 
 
 
459 aa  293  6e-78  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.753041 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5053  major facilitator superfamily MFS_1  38.26 
 
 
472 aa  292  9e-78  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.122247 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4638  major facilitator superfamily MFS_1  37 
 
 
451 aa  291  1e-77  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000178504  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1595  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  38.26 
 
 
472 aa  291  1e-77  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1660  MFS family transporter  40.04 
 
 
455 aa  291  2e-77  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29790  sugar phosphate permease  39.39 
 
 
485 aa  278  2e-73  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5409  major facilitator family transporter  36.74 
 
 
399 aa  277  3e-73  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000000725853  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5547  major facilitator family transporter  36.05 
 
 
399 aa  276  7e-73  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.00000000869498  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5271  major facilitator family transporter  36.05 
 
 
399 aa  276  7e-73  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000000222558  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5098  major facilitator family transporter  36.05 
 
 
399 aa  276  7e-73  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.20566e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5668  major facilitator family transporter  36.05 
 
 
399 aa  276  7e-73  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.0000000000480591  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5513  major facilitator family transporter  36.05 
 
 
399 aa  276  7e-73  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5543  major facilitator family transporter  36.05 
 
 
399 aa  276  8e-73  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000723204  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5115  major facilitator family transporter  36.28 
 
 
399 aa  275  1.0000000000000001e-72  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000159613  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5599  major facilitator family transporter  36.05 
 
 
399 aa  275  1.0000000000000001e-72  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000105464  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5212  major facilitator transporter  35.81 
 
 
399 aa  275  1.0000000000000001e-72  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000114177  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02027  metabolite transporter  36.3 
 
 
476 aa  275  2.0000000000000002e-72  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.158134 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5109  major facilitator transporter  37.21 
 
 
474 aa  273  4.0000000000000004e-72  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2255  major facilitator superfamily MFS_1  39.29 
 
 
473 aa  273  5.000000000000001e-72  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0539  major facilitator transporter  37.09 
 
 
473 aa  273  6e-72  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5172  major facilitator transporter  37.22 
 
 
474 aa  273  6e-72  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0809503 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0379  major facilitator family transporter  38.11 
 
 
478 aa  271  2e-71  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3259  major facilitator transporter  36.44 
 
 
474 aa  271  2.9999999999999997e-71  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.331503  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8056  major facilitator superfamily MFS_1  38 
 
 
451 aa  269  8.999999999999999e-71  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3497  major facilitator superfamily MFS_1  39.9 
 
 
398 aa  268  1e-70  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0471  major facilitator family transporter  37.89 
 
 
478 aa  268  2e-70  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0177  major facilitator family transporter  37.89 
 
 
478 aa  268  2e-70  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1431  major facilitator family transporter  37.89 
 
 
478 aa  268  2e-70  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.475934  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1931  major facilitator superfamily permease  37.89 
 
 
478 aa  268  2e-70  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0979116  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3311  major facilitator transporter  36.95 
 
 
474 aa  268  2e-70  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.799238  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1841  major facilitator family transporter  37.67 
 
 
478 aa  267  4e-70  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3933  major facilitator transporter  35.81 
 
 
399 aa  266  4e-70  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000233422  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0911  major facilitator family transporter  37.67 
 
 
478 aa  266  7e-70  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.577596  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0897  major facilitator superfamily MFS_1  40.2 
 
 
447 aa  261  2e-68  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0894914  normal  0.147269 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5178  major facilitator transporter  36.62 
 
 
457 aa  261  2e-68  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3374  major facilitator superfamily MFS_1  36.51 
 
 
398 aa  256  4e-67  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000527195  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3533  major facilitator transporter  36.22 
 
 
473 aa  254  3e-66  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1377  major facilitator superfamily MFS_1  40.11 
 
 
445 aa  248  1e-64  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2073  major facilitator superfamily transporter  36.7 
 
 
467 aa  245  9.999999999999999e-64  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0013865 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1875  major facilitator transporter  31.91 
 
 
459 aa  233  4.0000000000000004e-60  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.473892  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21330  sugar phosphate permease  37.68 
 
 
477 aa  232  9e-60  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.428425  hitchhiker  0.00018034 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0285  major facilitator superfamily sugar transporter  32.66 
 
 
464 aa  231  2e-59  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.192742  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2078  major facilitator superfamily MFS_1  33.79 
 
 
404 aa  227  4e-58  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0245  putative permease  36.71 
 
 
449 aa  218  2e-55  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0461827  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3564  major facilitator transporter  32.84 
 
 
436 aa  208  2e-52  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1326  major facilitator transporter  35.28 
 
 
464 aa  204  2e-51  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.367254  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1010  major facilitator family transporter  35.66 
 
 
398 aa  203  7e-51  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1561  major facilitator transporter  33.62 
 
 
509 aa  202  9e-51  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.141298  normal  0.174962 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6599  major facilitator superfamily MFS_1  32.29 
 
 
459 aa  200  3.9999999999999996e-50  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.332731  normal  0.158495 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0914  major facilitator transporter  31.69 
 
 
434 aa  199  1.0000000000000001e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00481205  normal  0.205021 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0532  major facilitator family transporter  32.67 
 
 
436 aa  197  2.0000000000000003e-49  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0462  major facilitator family transporter  32.67 
 
 
436 aa  197  2.0000000000000003e-49  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.450318  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5283  major facilitator transporter  31.26 
 
 
463 aa  196  8.000000000000001e-49  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.591426  normal  0.763827 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5986  major facilitator transporter  31.4 
 
 
479 aa  195  1e-48  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6282  major facilitator transporter  31.4 
 
 
479 aa  195  1e-48  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.384913  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5172  major facilitator superfamily MFS_1  32.33 
 
 
466 aa  195  2e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0613  major facilitator superfamily MFS_1  30.8 
 
 
473 aa  195  2e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0274336 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1671  major facilitator transporter  32.75 
 
 
381 aa  193  4e-48  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    decreased coverage  0.0000914056 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1543  major facilitator transporter  32.44 
 
 
382 aa  194  4e-48  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.0259552 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3924  major facilitator superfamily transporter  30.11 
 
 
438 aa  193  5e-48  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.496152  normal  0.0457831 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1856  major facilitator transporter  31.18 
 
 
438 aa  193  7e-48  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1683  major facilitator transporter  31.48 
 
 
415 aa  190  5e-47  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.249309  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6200  major facilitator transporter  31.13 
 
 
492 aa  190  5e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0622411 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4647  major facilitator superfamily MFS_1  31.18 
 
 
488 aa  190  5e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.866665  normal  0.46173 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0920  major facilitator superfamily transporter metabolite/H(+) symporter  31.18 
 
 
487 aa  189  8e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.697574 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0828  major facilitator superfamily aromatic acid/H(+) symporter  32.3 
 
 
450 aa  189  8e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.420618  normal  0.255495 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1414  major facilitator transporter  30.43 
 
 
424 aa  189  1e-46  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0602  major facilitator superfamily MFS_1  31.72 
 
 
459 aa  189  1e-46  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3580  hypothetical protein  29.48 
 
 
478 aa  189  1e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.024372  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5972  major facilitator transporter  32.03 
 
 
462 aa  188  2e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4993  MFS family membrane efflux protein  30.48 
 
 
526 aa  187  3e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.521864 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3655  major facilitator superfamily MFS_1  30.79 
 
 
447 aa  185  1.0000000000000001e-45  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.304643  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2900  major facilitator transporter  39.02 
 
 
514 aa  185  1.0000000000000001e-45  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.473738  normal  0.0138886 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2518  major facilitator transporter  30.11 
 
 
437 aa  184  2.0000000000000003e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0911  major facilitator superfamily permease  27.31 
 
 
388 aa  185  2.0000000000000003e-45  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.000338401  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4015  major facilitator superfamily MFS_1  30 
 
 
477 aa  184  3e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6268  major facilitator transporter  31.59 
 
 
462 aa  184  3e-45  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.492492 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0909  major facilitator transporter  30.96 
 
 
455 aa  183  5.0000000000000004e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0703326  normal  0.129634 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3453  major facilitator transporter  30.74 
 
 
472 aa  182  8.000000000000001e-45  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0499831  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5153  major facilitator transporter  30.97 
 
 
475 aa  182  1e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.507557  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0382  major facilitator transporter  30.97 
 
 
472 aa  181  2e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.660441 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5083  major facilitator transporter  32.27 
 
 
437 aa  181  2e-44  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.418338  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4627  major facilitator transporter  30.97 
 
 
475 aa  181  2e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5266  major facilitator transporter  31.18 
 
 
472 aa  181  2.9999999999999997e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0070  MFS permease  30.4 
 
 
460 aa  181  2.9999999999999997e-44  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5007  major facilitator transporter  31.18 
 
 
472 aa  181  2.9999999999999997e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3101  major facilitator transporter  31.18 
 
 
472 aa  181  2.9999999999999997e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.380275  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3653  major facilitator superfamily MFS_1  27.09 
 
 
446 aa  181  2.9999999999999997e-44  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0808  major facilitator superfamily MFS_1  31.1 
 
 
494 aa  180  4.999999999999999e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1992  major facilitator transporter  31.23 
 
 
436 aa  180  5.999999999999999e-44  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.252047  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>