More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_0602 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013235  Namu_0602  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 
459 aa  904    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0070  MFS permease  62.11 
 
 
460 aa  576  1.0000000000000001e-163  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3160  major facilitator superfamily MFS_1  62.28 
 
 
461 aa  558  1e-158  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0312386 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5283  major facilitator transporter  59.51 
 
 
463 aa  559  1e-158  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.591426  normal  0.763827 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3228  major facilitator transporter  43.27 
 
 
480 aa  384  1e-105  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.325137 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4932  major facilitator transporter  43.27 
 
 
480 aa  384  1e-105  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.828486  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6741  major facilitator transporter  42.64 
 
 
480 aa  381  1e-104  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6265  major facilitator transporter  42.64 
 
 
480 aa  380  1e-104  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1565  major facilitator transporter  42.64 
 
 
480 aa  380  1e-104  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.523471  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0632  general substrate transporter  41.45 
 
 
471 aa  341  2e-92  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000142658  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3580  hypothetical protein  39.13 
 
 
478 aa  323  3e-87  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.024372  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1490  major facilitator family transporter  40.45 
 
 
468 aa  320  1.9999999999999998e-86  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1318  major facilitator family transporter  39.91 
 
 
468 aa  320  3e-86  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2505  major facilitator family transporter  39.91 
 
 
468 aa  317  2e-85  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1325  major facilitator family transporter  40 
 
 
468 aa  317  4e-85  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.68992  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0983  major facilitator family transporter  40 
 
 
468 aa  317  4e-85  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.387482  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1245  major facilitator family transporter  40 
 
 
468 aa  317  4e-85  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0584  major facilitator family transporter  40 
 
 
474 aa  316  5e-85  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.789618  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0308  major facilitator family transporter  40 
 
 
474 aa  316  5e-85  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0186  major facilitator transporter  38.13 
 
 
479 aa  313  4.999999999999999e-84  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7070  major facilitator superfamily MFS_1  37.69 
 
 
467 aa  312  9e-84  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.710966  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5071  major facilitator superfamily MFS_1  39.2 
 
 
485 aa  311  2e-83  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.706796  normal  0.279172 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4244  major facilitator transporter  36.77 
 
 
467 aa  310  4e-83  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0909  major facilitator transporter  38.15 
 
 
455 aa  305  1.0000000000000001e-81  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0703326  normal  0.129634 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1116  major facilitator transporter  39.02 
 
 
466 aa  300  5e-80  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.10577  normal  0.134 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4630  major facilitator superfamily MFS_1  36.38 
 
 
467 aa  297  2e-79  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.234892  hitchhiker  0.00910919 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4092  major facilitator transporter  38.8 
 
 
466 aa  298  2e-79  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.138786  normal  0.978075 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4498  major facilitator superfamily MFS_1  36.38 
 
 
467 aa  297  2e-79  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0152994  normal  0.24714 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4557  major facilitator transporter  38.8 
 
 
466 aa  296  5e-79  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00783301 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4698  major facilitator transporter  39.14 
 
 
466 aa  295  1e-78  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.585046  normal  0.168682 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5602  major facilitator transporter  39.14 
 
 
466 aa  295  1e-78  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.610871 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3669  major facilitator transporter  39.14 
 
 
466 aa  295  1e-78  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0914  major facilitator transporter  37.5 
 
 
434 aa  288  2e-76  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00481205  normal  0.205021 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3995  major facilitator transporter  38.58 
 
 
466 aa  283  3.0000000000000004e-75  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0613817 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4638  major facilitator superfamily MFS_1  36.91 
 
 
451 aa  256  6e-67  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000178504  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8056  major facilitator superfamily MFS_1  35.31 
 
 
451 aa  235  1.0000000000000001e-60  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5178  major facilitator transporter  34.14 
 
 
457 aa  233  6e-60  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19270  putative MFS transporter  33.33 
 
 
455 aa  231  1e-59  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.149627  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0670  general substrate transporter  35.28 
 
 
459 aa  230  4e-59  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.753041 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1660  MFS family transporter  33.84 
 
 
455 aa  227  3e-58  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1482  major facilitator superfamily MFS_1  33.26 
 
 
451 aa  226  7e-58  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000115751  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1931  major facilitator superfamily permease  34.16 
 
 
478 aa  216  5.9999999999999996e-55  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0979116  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1431  major facilitator family transporter  33.93 
 
 
478 aa  216  9e-55  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.475934  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0177  major facilitator family transporter  33.93 
 
 
478 aa  216  9e-55  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0471  major facilitator family transporter  33.93 
 
 
478 aa  216  9e-55  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0911  major facilitator family transporter  33.93 
 
 
478 aa  215  9.999999999999999e-55  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.577596  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1841  major facilitator family transporter  33.93 
 
 
478 aa  215  9.999999999999999e-55  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5109  major facilitator transporter  33.11 
 
 
474 aa  215  1.9999999999999998e-54  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0379  major facilitator family transporter  33.93 
 
 
478 aa  215  1.9999999999999998e-54  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5172  major facilitator transporter  33.18 
 
 
474 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0809503 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5053  major facilitator superfamily MFS_1  33.48 
 
 
472 aa  213  3.9999999999999995e-54  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.122247 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3259  major facilitator transporter  33.11 
 
 
474 aa  213  4.9999999999999996e-54  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.331503  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1595  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  33.48 
 
 
472 aa  210  4e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0539  major facilitator transporter  33.04 
 
 
473 aa  210  5e-53  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2413  major facilitator transporter  32.59 
 
 
447 aa  207  3e-52  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000787137  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3533  major facilitator transporter  33.62 
 
 
473 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3311  major facilitator transporter  32.51 
 
 
474 aa  197  4.0000000000000005e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.799238  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS02027  metabolite transporter  33.86 
 
 
476 aa  196  5.000000000000001e-49  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.158134 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2073  major facilitator superfamily transporter  32.04 
 
 
467 aa  190  4e-47  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0013865 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0285  major facilitator superfamily sugar transporter  29.58 
 
 
464 aa  190  4e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.192742  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1523  major facilitator transporter  32.96 
 
 
438 aa  190  5e-47  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.295641  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2088  major facilitator superfamily MFS_1  28.26 
 
 
456 aa  187  3e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.565943 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2900  major facilitator transporter  29.98 
 
 
514 aa  182  1e-44  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.473738  normal  0.0138886 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5547  major facilitator family transporter  32.18 
 
 
399 aa  180  4.999999999999999e-44  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.00000000869498  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5599  major facilitator family transporter  32.18 
 
 
399 aa  179  1e-43  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000105464  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5271  major facilitator family transporter  31.95 
 
 
399 aa  179  1e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000000222558  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5098  major facilitator family transporter  31.95 
 
 
399 aa  179  1e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.20566e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5668  major facilitator family transporter  31.95 
 
 
399 aa  179  1e-43  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.0000000000480591  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5513  major facilitator family transporter  31.95 
 
 
399 aa  179  1e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5115  major facilitator family transporter  31.95 
 
 
399 aa  178  2e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000159613  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5543  major facilitator family transporter  31.49 
 
 
399 aa  176  6e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000723204  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5409  major facilitator family transporter  31.49 
 
 
399 aa  176  9.999999999999999e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000000725853  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0987  major facilitator superfamily transporter metabolite/H(+) symporter  30.2 
 
 
461 aa  174  2.9999999999999996e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.496425 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5212  major facilitator transporter  31.26 
 
 
399 aa  174  2.9999999999999996e-42  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000114177  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1414  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  29.14 
 
 
468 aa  171  2e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000198546  normal  0.095851 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0547  major facilitator superfamily transporter  27.57 
 
 
456 aa  171  3e-41  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.392915  normal  0.285749 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3655  major facilitator superfamily MFS_1  28.54 
 
 
447 aa  170  4e-41  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.304643  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3933  major facilitator transporter  30.96 
 
 
399 aa  169  8e-41  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000233422  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1561  major facilitator transporter  30.93 
 
 
509 aa  167  5e-40  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.141298  normal  0.174962 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1010  major facilitator family transporter  33.33 
 
 
398 aa  166  6.9999999999999995e-40  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6599  major facilitator superfamily MFS_1  29.35 
 
 
459 aa  166  1.0000000000000001e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.332731  normal  0.158495 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5172  major facilitator superfamily MFS_1  29.69 
 
 
466 aa  166  1.0000000000000001e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1875  major facilitator transporter  28.22 
 
 
459 aa  165  1.0000000000000001e-39  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.473892  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2754  major facilitator superfamily MFS_1  31.72 
 
 
465 aa  165  2.0000000000000002e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.182715  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1166  major facilitator superfamily MFS_1  30.72 
 
 
450 aa  164  3e-39  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000374507 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0613  major facilitator superfamily MFS_1  30.11 
 
 
473 aa  164  4.0000000000000004e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0274336 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2063  major facilitator superfamily MFS_1  28.27 
 
 
479 aa  163  7e-39  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0432509  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4651  major facilitator superfamily MFS_1  27.27 
 
 
470 aa  163  8.000000000000001e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4087  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  30.56 
 
 
468 aa  162  9e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.281632  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0828  major facilitator superfamily aromatic acid/H(+) symporter  30.04 
 
 
450 aa  162  2e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.420618  normal  0.255495 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3497  major facilitator superfamily MFS_1  30.8 
 
 
398 aa  161  2e-38  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1408  major facilitator transporter  28.69 
 
 
484 aa  161  3e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  decreased coverage  0.0000966462  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5972  major facilitator transporter  29.02 
 
 
462 aa  161  3e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3374  major facilitator superfamily MFS_1  30.56 
 
 
398 aa  161  3e-38  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000527195  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1483  major facilitator superfamily MFS_1  29.63 
 
 
456 aa  160  5e-38  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1412  major facilitator transporter  26.88 
 
 
465 aa  159  1e-37  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6611  major facilitator transporter  28.17 
 
 
479 aa  158  2e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.410873  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4015  major facilitator superfamily MFS_1  26.16 
 
 
477 aa  158  2e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6200  major facilitator transporter  28.14 
 
 
492 aa  157  3e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0622411 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6268  major facilitator transporter  29.19 
 
 
462 aa  157  3e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.492492 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>