More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_4092 on replicon NC_008391
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009075  BURPS668_A1318  major facilitator family transporter  87.25 
 
 		 468 aa  769    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5602  major facilitator transporter  97.64 
 
 		 466 aa  856    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.610871 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4244  major facilitator transporter  70.02 
 
 		 467 aa  660    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4557  major facilitator transporter  99.36 
 
 		 466 aa  920    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00783301 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1325  major facilitator family transporter  86.88 
 
 		 468 aa  757    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.68992  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1245  major facilitator family transporter  86.88 
 
 		 468 aa  757    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0584  major facilitator family transporter  86.88 
 
 		 474 aa  756    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.789618  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2505  major facilitator family transporter  86.91 
 
 		 468 aa  759    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4698  major facilitator transporter  97.64 
 
 		 466 aa  856    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.585046  normal  0.168682 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0308  major facilitator family transporter  86.88 
 
 		 474 aa  756    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1116  major facilitator transporter  96.78 
 
 		 466 aa  870    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.10577  normal  0.134 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1490  major facilitator family transporter  86.88 
 
 		 468 aa  768    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0186  major facilitator transporter  71.95 
 
 		 479 aa  675    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7070  major facilitator superfamily MFS_1  71.31 
 
 		 467 aa  672    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.710966  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3995  major facilitator transporter  95.71 
 
 		 466 aa  837    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0613817 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3669  major facilitator transporter  97.64 
 
 		 466 aa  856    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4092  major facilitator transporter  100 
 
 		 466 aa  922    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.138786  normal  0.978075 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0983  major facilitator family transporter  86.88 
 
 		 468 aa  757    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.387482  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3580  hypothetical protein  66.88 
 
 		 478 aa  632  1e-180  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.024372  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4630  major facilitator superfamily MFS_1  66.29 
 
 		 467 aa  592  1e-168  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.234892  hitchhiker  0.00910919 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4498  major facilitator superfamily MFS_1  66.29 
 
 		 467 aa  592  1e-168  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0152994  normal  0.24714 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3228  major facilitator transporter  43.75 
 
 		 480 aa  353  2.9999999999999997e-96  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.325137 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4932  major facilitator transporter  43.75 
 
 		 480 aa  353  2.9999999999999997e-96  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.828486  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6741  major facilitator transporter  42.86 
 
 		 480 aa  352  8e-96  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6265  major facilitator transporter  42.41 
 
 		 480 aa  349  6e-95  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1565  major facilitator transporter  42.41 
 
 		 480 aa  349  6e-95  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.523471  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0602  major facilitator superfamily MFS_1  38.8 
 
 		 459 aa  322  9.999999999999999e-87  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0632  general substrate transporter  41.03 
 
 		 471 aa  311  1e-83  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000142658  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0070  MFS permease  38.71 
 
 		 460 aa  302  1e-80  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5283  major facilitator transporter  38.91 
 
 		 463 aa  301  2e-80  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.591426  normal  0.763827 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3160  major facilitator superfamily MFS_1  38.9 
 
 		 461 aa  300  4e-80  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0312386 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5071  major facilitator superfamily MFS_1  39.15 
 
 		 485 aa  293  3e-78  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.706796  normal  0.279172 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0914  major facilitator transporter  38.24 
 
 		 434 aa  281  1e-74  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00481205  normal  0.205021 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0909  major facilitator transporter  38.46 
 
 		 455 aa  275  2.0000000000000002e-72  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0703326  normal  0.129634 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1482  major facilitator superfamily MFS_1  32.11 
 
 		 451 aa  220  5e-56  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000115751  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4638  major facilitator superfamily MFS_1  32.9 
 
 		 451 aa  213  4.9999999999999996e-54  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000178504  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2413  major facilitator transporter  33.63 
 
 		 447 aa  213  7.999999999999999e-54  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000787137  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1660  MFS family transporter  35.19 
 
 		 455 aa  207  5e-52  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02027  metabolite transporter  35.75 
 
 		 476 aa  204  3e-51  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.158134 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19270  putative MFS transporter  33.55 
 
 		 455 aa  202  9e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.149627  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0177  major facilitator family transporter  35.23 
 
 		 478 aa  201  3e-50  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1931  major facilitator superfamily permease  35.23 
 
 		 478 aa  200  3e-50  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0979116  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1431  major facilitator family transporter  35.23 
 
 		 478 aa  201  3e-50  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.475934  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0471  major facilitator family transporter  35.23 
 
 		 478 aa  201  3e-50  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0911  major facilitator family transporter  35.23 
 
 		 478 aa  200  3.9999999999999996e-50  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.577596  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1841  major facilitator family transporter  35.23 
 
 		 478 aa  200  3.9999999999999996e-50  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0379  major facilitator family transporter  35.01 
 
 		 478 aa  199  1.0000000000000001e-49  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0670  general substrate transporter  33.48 
 
 		 459 aa  198  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.753041 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8056  major facilitator superfamily MFS_1  33.62 
 
 		 451 aa  198  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5053  major facilitator superfamily MFS_1  33.26 
 
 		 472 aa  196  1e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.122247 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1595  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  33.12 
 
 		 472 aa  194  2e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3311  major facilitator transporter  33.48 
 
 		 474 aa  193  6e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.799238  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5178  major facilitator transporter  34.08 
 
 		 457 aa  192  8e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5109  major facilitator transporter  33.26 
 
 		 474 aa  192  8e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5172  major facilitator transporter  33.19 
 
 		 474 aa  192  1e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0809503 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3259  major facilitator transporter  33.26 
 
 		 474 aa  191  2e-47  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.331503  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0539  major facilitator transporter  32.97 
 
 		 473 aa  189  5.999999999999999e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1523  major facilitator transporter  32.21 
 
 		 438 aa  187  3e-46  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.295641  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2073  major facilitator superfamily transporter  33.55 
 
 		 467 aa  184  2.0000000000000003e-45  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0013865 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3655  major facilitator superfamily MFS_1  29.46 
 
 		 447 aa  182  9.000000000000001e-45  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.304643  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3533  major facilitator transporter  33.19 
 
 		 473 aa  180  4e-44  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4651  major facilitator superfamily MFS_1  30.79 
 
 		 470 aa  178  2e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3653  major facilitator superfamily MFS_1  27.6 
 
 		 446 aa  175  9.999999999999999e-43  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0970  major facilitator superfamily transporter metabolite/H(+) symporter  29.25 
 
 		 470 aa  175  1.9999999999999998e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00262609  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1414  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  30.65 
 
 		 468 aa  173  6.999999999999999e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000198546  normal  0.095851 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3933  major facilitator transporter  30.11 
 
 		 399 aa  171  2e-41  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000233422  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5972  major facilitator transporter  30.89 
 
 		 462 aa  171  2e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6599  major facilitator superfamily MFS_1  29.71 
 
 		 459 aa  171  2e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.332731  normal  0.158495 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0547  major facilitator superfamily transporter  30.33 
 
 		 456 aa  170  4e-41  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.392915  normal  0.285749 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5212  major facilitator transporter  29.75 
 
 		 399 aa  169  9e-41  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000114177  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5115  major facilitator family transporter  29.52 
 
 		 399 aa  169  1e-40  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000159613  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0987  major facilitator superfamily transporter metabolite/H(+) symporter  31.32 
 
 		 461 aa  169  1e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.496425 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5599  major facilitator family transporter  29.79 
 
 		 399 aa  167  2.9999999999999998e-40  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000105464  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5543  major facilitator family transporter  30.02 
 
 		 399 aa  167  2.9999999999999998e-40  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000723204  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5271  major facilitator family transporter  29.79 
 
 		 399 aa  167  4e-40  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000000222558  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5098  major facilitator family transporter  29.79 
 
 		 399 aa  167  4e-40  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.20566e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5668  major facilitator family transporter  29.79 
 
 		 399 aa  167  4e-40  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.0000000000480591  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5513  major facilitator family transporter  29.79 
 
 		 399 aa  167  4e-40  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0285  major facilitator superfamily sugar transporter  29.65 
 
 		 464 aa  167  5e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.192742  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5547  major facilitator family transporter  29.56 
 
 		 399 aa  165  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.00000000869498  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5409  major facilitator family transporter  29.56 
 
 		 399 aa  165  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000000725853  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2088  major facilitator superfamily MFS_1  30.09 
 
 		 456 aa  164  3e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.565943 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6268  major facilitator transporter  30.22 
 
 		 462 aa  164  3e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.492492 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1561  major facilitator transporter  33.12 
 
 		 509 aa  162  1e-38  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.141298  normal  0.174962 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2754  major facilitator superfamily MFS_1  30.02 
 
 		 465 aa  159  1e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.182715  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1885  major facilitator superfamily MFS_1  29.78 
 
 		 454 aa  158  2e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.135874  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4087  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  33.01 
 
 		 468 aa  157  5.0000000000000005e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.281632  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0613  major facilitator superfamily MFS_1  32.27 
 
 		 473 aa  156  9e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0274336 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1895  major facilitator transporter  29.82 
 
 		 451 aa  154  2.9999999999999998e-36  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.004098  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1010  major facilitator family transporter  35.36 
 
 		 398 aa  153  7e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2518  major facilitator transporter  30.37 
 
 		 437 aa  151  2e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2126  major facilitator superfamily MFS_1  29.13 
 
 		 444 aa  151  3e-35  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.647931  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2900  major facilitator transporter  29.39 
 
 		 514 aa  151  3e-35  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.473738  normal  0.0138886 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0434  major facilitator superfamily MFS_1  28 
 
 		 446 aa  149  8e-35  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000104713  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0828  major facilitator superfamily aromatic acid/H(+) symporter  28.63 
 
 		 450 aa  149  1.0000000000000001e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.420618  normal  0.255495 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3497  major facilitator superfamily MFS_1  29.73 
 
 		 398 aa  148  2.0000000000000003e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4019  major facilitator superfamily MFS_1  30.84 
 
 		 435 aa  147  3e-34  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.000381325  normal  0.201783 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6853  major facilitator transporter  29.03 
 
 		 430 aa  147  3e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.854567  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2255  major facilitator superfamily MFS_1  31.67 
 
 		 473 aa  147  5e-34  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3924  major facilitator superfamily transporter  29.37 
 
 		 438 aa  146  6e-34  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.496152  normal  0.0457831 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>